Mise à jour de CQ bam

src/bolero.nf

@@ -239,7 +239,6 @@ workflow {
         concatenate(tuple_sample)
       }
       control_basecalling(basecall_fast5_gpu.out.sequencing_summary)
-      control_bam(basecall_fast5_gpu.out.sequencing_summary.collect(), sort_index_bam.out.indexed_bam)
 
     }
     else {
@@ -278,7 +277,7 @@ workflow {
   hbv_genome(cut_5pRACE.out.fastq_cutadapt, genome.collect())
   sort_index_bam(hbv_genome.out.bam)
   //il faut ajouter une boucle if pour le mode cpu/gpu
-  //control_bam(ss.collect(), sort_index_bam.out.indexed_bam)
+  control_bam(basecall_fast5_gpu.out.sequencing_summary.collect(), sort_index_bam.out.indexed_bam)
 
   //###################### START POSITIONS #######################