src/nf_modules/BWA/indexing.config

src/nf_modules/BWA/mapping_paired.config

src/nf_modules/Bowtie/indexing.config

src/nf_modules/Bowtie/mapping_paired.config

src/nf_modules/Bowtie/mapping_single.config

src/nf_modules/Bowtie2/indexing.config

src/nf_modules/Bowtie2/mapping_paired.config

src/nf_modules/Bowtie2/mapping_single.config

src/nf_modules/FastQC/fastqc_paired.config

src/nf_modules/FastQC/fastqc_single.config

src/nf_modules/HTSeq/htseq.config

src/nf_modules/MUSIC/peak_calling_single.config

src/nf_modules/MultiQC/multiqc_paired.config

src/nf_modules/MultiQC/multiqc_single.config

src/nf_modules/RSEM/indexing.config

src/nf_modules/RSEM/quantification_paired.config

src/nf_modules/RSEM/quantification_single.config

src/nf_modules/SAMtools/filter_bams.config

src/nf_modules/SAMtools/index_bams.config

src/nf_modules/SAMtools/sort_bams.config