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##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Raw read depth">
##INFO=<ID=DP4,Number=4,Type=Integer,Description="# high-quality ref-forward bases, ref-reverse, alt-forward and alt-reverse bases">
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##INFO=<ID=AC1,Number=1,Type=Float,Description="Max-likelihood estimate of the first ALT allele count (no HWE assumption)">
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##INFO=<ID=HWE,Number=1,Type=Float,Description="Chi^2 based HWE test P-value based on G3">
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##INFO=<ID=PC2,Number=2,Type=Integer,Description="Phred probability of the nonRef allele frequency in group1 samples being larger (,smaller) than in group2.">
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##INFO=<ID=QCHI2,Number=1,Type=Integer,Description="Phred scaled PCHI2.">
##INFO=<ID=PR,Number=1,Type=Integer,Description="# permutations yielding a smaller PCHI2.">
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##FORMAT=<ID=GL,Number=3,Type=Float,Description="Likelihoods for RR,RA,AA genotypes (R=ref,A=alt)">
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#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT PAN/Pan_paniscus-A914_Hortense PAN/Pan_paniscus-A915_Kosana PAN/Pan_paniscus-A917_Dzeeta PAN/Pan_paniscus-A918_Hermien PAN/Pan_paniscus-A919_Desmond PAN/Pan_paniscus-A922_Catherine PAN/Pan_paniscus-A924_Chipita PAN/Pan_paniscus-A925_Bono PAN/Pan_paniscus-A926_Natalie PAN/Pan_paniscus-A927_Salonga PAN/Pan_paniscus-A928_Kumbuka PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Akwaya_Jean PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Banyo PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Basho PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Damian PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Julie PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Kopongo PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Koto PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Paquita PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Taweh PAN/Pan_troglodytes_ellioti-Tobi PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-100037_Vincent PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-100040_Andromeda PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-9729_Harriet PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-A910_Bwambalea PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-A911_Kidongo PAN/Pan_troglodytes_schweinfurthii-A912_Nakuu PAN/Pan_troglodytes_troglodytes-A957_Vaillant PAN/Pan_troglodytes_troglodytes-A958_Doris PAN/Pan_troglodytes_troglodytes-A959_Julie PAN/Pan_troglodytes_troglodytes-A960_Clara PAN/Pan_troglodytes_verus-9668_Bosco PAN/Pan_troglodytes_verus-9730_Donald PAN/Pan_troglodytes_verus-A956_Jimmie PAN/Pan_troglodytes_verus-Clint PAN/Pan_troglodytes_verus-X00100_Koby
chr12 6952402 . C T 999 . DP=866;VDB=0.0433;AF1=0.08573;AC1=6;DP4=433,292,46,35;MQ=60;FQ=999;PV4=0.63,0.0001,0.17,0.3 GT:PL:GQ 0/0:0,51,255:58 0/0:0,63,255:70 0/0:0,51,255:58 0/0:0,84,255:91 0/0:0,102,255:99 0/0:0,57,255:64 0/0:0,51,255:58 0/0:0,51,255:58 0/0:0,63,255:70 0/0:0,57,255:64 0/0:0,78,255:85 0/0:0,60,255:67 0/1:148,0,50:63 0/0:0,0,0:8 0/0:0,45,255:52 0/0:0,93,255:99 0/0:0,42,255:49 0/0:0,84,255:91 0/0:0,24,207:31 0/0:0,63,255:70 0/0:0,75,255:82 0/1:218,0,175:99 0/0:0,69,255:76 0/0:0,27,229:34 0/0:0,84,255:91 0/1:233,0,242:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,54,255:61 1/1:255,111,0:98 0/0:0,126,255:99 0/1:85,0,248:78 0/0:0,39,255:46 0/0:0,54,255:61 0/0:0,117,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,66,255:73
chr12 6952443 . G T 999 . DP=789;VDB=0.0284;AF1=0.2336;G3=0.708,0.1211,0.1709;HWE=0.000285;AC1=17;DP4=232,239,54,46;MQ=60;FQ=999;PV4=0.44,1.2e-38,1,1 GT:PL:GQ 0/1:81,0,134:79 0/1:137,0,131:99 1/1:146,27,0:19 1/1:145,24,0:16 1/1:255,84,0:76 1/1:137,18,0:10 1/1:133,24,0:16 1/1:185,33,0:25 0/1:110,0,48:56 0/1:107,0,230:99 0/0:0,42,255:44 0/0:0,57,255:59 0/0:2,0,154:3 0/0:0,0,0:4 0/0:0,54,255:56 0/0:0,60,255:62 0/0:0,24,229:26 0/0:0,63,255:65 0/0:0,39,242:41 0/0:0,51,255:53 0/0:0,48,255:50 0/0:0,57,255:59 0/0:0,75,255:77 0/0:0,27,219:29 0/0:0,69,255:71 0/0:0,60,255:62 0/0:0,75,255:77 0/0:0,54,255:56 0/0:0,66,255:68 0/0:0,81,255:83 0/0:0,15,153:17 0/0:0,36,233:38 0/0:0,63,255:65 0/0:0,69,255:71 0/0:0,81,255:83 0/0:0,51,255:53
chr12 6952463 . C T 25.6 . DP=799;VDB=0.0132;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=314,260,3,1;MQ=60;FQ=25.7;PV4=0.63,0.29,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,36,238:51 0/0:0,57,255:72 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,255:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,184:39 0/0:0,24,190:39 0/1:71,0,77:56 0/0:0,24,228:39 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,255:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/0:0,33,255:48 0/0:0,66,255:81 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,255:54 0/0:0,69,255:84 0/0:0,84,255:99 0/0:0,18,164:33 0/0:0,60,255:75 0/0:0,75,255:90 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,15,115:30 0/0:0,27,155:42 0/0:0,57,255:72 0/0:0,69,255:84 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,253:54
chr12 6952685 . T C 999 . DP=932;VDB=0.0336;AF1=0.07148;AC1=5;DP4=471,368,24,23;MQ=60;FQ=999;PV4=0.55,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,66,255:74 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,75,255:83 0/0:0,78,255:86 0/0:0,72,255:80 0/0:0,60,255:68 0/0:0,57,255:65 0/0:0,39,255:47 0/0:0,27,244:35 0/0:0,0,0:9 0/0:0,51,255:59 0/0:0,54,255:62 0/0:0,18,166:26 0/0:0,39,255:47 0/0:0,21,207:29 0/0:0,114,255:99 0/0:0,51,255:59 0/0:0,78,255:86 0/0:0,87,255:95 0/0:0,21,199:29 0/0:0,151,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,27,234:35 0/1:255,0,162:99 0/1:183,0,80:94 0/0:0,135,255:99 0/1:251,0,255:99 1/1:255,42,0:28
chr12 6952739 . G A 999 . DP=898;VDB=0.0331;AF1=0.05722;AC1=4;DP4=398,368,28,21;MQ=60;FQ=999;PV4=0.56,0.0015,0.34,0.37 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,108,255:99 0/1:192,0,243:99 0/0:0,84,255:93 0/1:255,0,156:99 0/1:177,0,255:99 0/1:204,0,214:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:78 0/0:0,36,255:45 0/0:0,51,255:60 0/0:0,57,255:66 0/0:0,21,213:30 0/0:0,0,0:10 0/0:0,48,255:57 0/0:0,30,255:39 0/0:0,18,192:27 0/0:0,36,255:45 0/0:0,33,255:42 0/0:0,90,255:99 0/0:0,18,193:27 0/0:0,45,255:54 0/0:0,75,255:84 0/0:0,27,236:36 0/0:0,99,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,45,255:54 0/0:0,63,255:72 0/0:0,51,255:60 0/0:0,132,255:99 0/0:0,84,255:93 0/0:0,39,255:48
chr12 6952751 . T G 117 . DP=914;VDB=0.0388;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=404,407,5,4;MQ=60;FQ=117;PV4=0.75,0.017,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,78,255:93 0/0:0,84,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,24,228:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,33,255:48 0/0:0,18,191:33 0/0:0,30,249:45 0/0:0,27,247:42 0/0:0,81,255:96 0/0:0,24,220:39 0/0:0,42,255:57 0/0:0,78,255:93 0/0:0,27,242:42 0/0:0,93,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,57,255:72 0/1:162,0,194:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,123,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,42,255:57
chr12 6952756 . A G 999 . DP=917;VDB=0.0365;AF1=0.3148;G3=0.6857,9.788e-09,0.3143;HWE=4.24e-11;AC1=22;DP4=277,277,132,145;MQ=60;FQ=999;PV4=0.56,0.27,0.29,1 GT:PL:GQ 1/1:255,93,0:87 1/1:255,105,0:99 1/1:255,60,0:54 1/1:255,81,0:75 1/1:255,66,0:60 1/1:255,84,0:78 1/1:255,75,0:69 1/1:255,99,0:93 1/1:255,66,0:60 1/1:255,51,0:45 1/1:255,51,0:45 0/0:0,39,255:39 0/0:0,27,245:27 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:48 0/0:0,30,255:30 0/0:0,15,176:15 0/0:0,36,255:36 0/0:0,27,235:27 0/0:0,81,255:81 0/0:0,27,248:27 0/0:0,42,255:42 0/0:0,75,255:75 0/0:0,27,233:27 0/0:0,108,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,54,255:54 0/0:0,54,255:54 0/0:0,60,255:60 0/0:0,123,255:99 0/0:0,81,255:81 0/0:0,42,255:42
chr12 6952887 . A G 10 . DP=1056;VDB=0.0388;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=593,418,5,2;MQ=60;FQ=10.1;PV4=0.71,3.9e-25,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,102,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,72,255:88 0/0:0,66,255:82 0/0:0,60,255:76 0/0:0,69,255:85 0/0:0,54,255:70 0/0:0,51,255:67 0/0:0,21,204:37 0/0:0,0,0:16 0/0:0,90,255:99 0/0:0,39,255:55 0/0:0,39,237:55 0/0:0,66,255:82 0/0:0,42,255:58 0/0:0,42,255:58 0/0:0,54,255:70 0/1:55,0,255:39 0/0:0,66,255:82 0/0:0,36,255:52 0/0:0,166,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,54,255:70 0/0:0,36,255:52 0/0:0,96,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,48,255:64
chr12 6952892 . C T 108 . DP=1062;VDB=0.0384;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=593,430,5,2;MQ=60;FQ=108;PV4=0.71,0.039,0.21,0.0037 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,21,206:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,84,255:99 0/1:153,0,209:99 0/0:0,39,238:54 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,255:60 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,78,255:93 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,160,255:99 0/0:0,163,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,33,255:48 0/0:0,96,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,48,255:63
chr12 6953037 . A G 117 . DP=1012;VDB=0.0274;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=434,533,10,6;MQ=60;FQ=117;PV4=0.21,8.8e-33,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,66,255:81 0/1:162,0,240:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,90,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,27,255:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,66,255:81 0/0:0,42,255:57 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,255:51 0/0:0,39,255:54 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,255:54 0/0:0,120,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,36,255:51 0/0:0,60,255:75 0/0:0,105,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,39,255:54
chr12 6953054 . C T 999 . DP=1034;VDB=0.0364;AF1=0.3144;G3=0.6857,2.712e-07,0.3143;HWE=4.11e-11;AC1=22;DP4=310,347,157,171;MQ=60;FQ=999;PV4=0.89,1.2e-287,1,1 GT:PL:GQ 1/1:242,93,0:87 1/1:255,108,0:99 1/1:255,108,0:99 1/1:250,117,0:99 1/1:253,132,0:99 1/1:238,63,0:57 1/1:218,66,0:60 1/1:216,51,0:45 1/1:232,81,0:75 1/1:243,69,0:63 1/1:244,90,0:84 0/0:0,96,255:96 0/0:0,21,214:21 0/0:0,0,0:3 0/0:0,66,255:66 0/0:0,60,255:60 0/0:0,36,255:36 0/0:0,54,255:54 0/0:0,54,255:54 0/0:0,45,255:45 0/0:0,42,255:42 0/0:0,57,255:57 0/0:0,42,255:42 0/0:0,42,255:42 0/0:0,129,255:99 0/0:0,86,255:86 0/0:0,163,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,75,255:75 0/0:0,48,255:48 0/0:0,60,255:60 0/0:0,117,255:99 0/0:0,163,255:99 0/0:0,42,255:42
chr12 6953100 . G A 34.6 . DP=1077;VDB=0.0252;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=543,494,2,2;MQ=60;FQ=34.6;PV4=1,0.045,0.17,0.0029 GT:PL:GQ 0/0:0,123,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,60,255:75 0/1:80,0,186:65 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,75,255:90 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/0:0,24,222:39 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,36,255:51 0/0:0,126,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,36,242:51 0/0:0,90,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,27,245:42
chr12 6953162 . T C 999 . DP=1051;VDB=0.0393;AF1=0.1;G3=0.8571,0.08574,0.05714;HWE=0.0151;AC1=7;DP4=440,459,67,49;MQ=60;FQ=999;PV4=0.077,3.4e-183,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,99,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,57,255:64 0/0:0,72,255:79 0/0:0,54,255:61 0/0:0,21,208:28 0/0:0,0,0:7 0/0:0,66,255:73 0/0:0,72,255:79 0/0:0,33,255:40 0/0:0,102,255:99 0/0:0,42,255:49 0/0:0,51,255:58 0/0:0,33,255:40 0/1:158,0,103:99 1/1:206,42,0:29 0/0:0,48,255:55 0/1:166,0,255:99 0/1:190,0,255:99 1/1:255,105,0:92 0/0:0,187,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,48,255:55 0/0:0,51,255:58 0/0:0,99,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,87,255:94 0/0:0,48,255:55
chr12 6953173 . G A 44.6 . DP=1029;VDB=0.0149;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=492,508,6,5;MQ=60;FQ=44.6;PV4=0.77,1e-35,1,0.00059 GT:PL:GQ 0/0:0,117,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,93,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,78,255:93 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,244:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,72,255:87 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,102,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,255:54 0/0:0,66,255:81 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,148,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,120,255:99 0/1:90,0,239:75 0/0:0,54,255:69 0/0:0,87,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66
chr12 6953209 . C A 160 . DP=1097;VDB=0.0374;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=469,591,4,7;MQ=60;FQ=160;PV4=0.76,0.038,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,102,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,81,255:96 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,72,255:87 0/0:0,69,255:84 0/0:0,54,255:69 0/0:0,84,255:99 0/0:0,30,255:45 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,29,255:44 0/0:0,187,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,187,255:99 0/1:205,0,251:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,66,255:81 0/0:0,148,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,60,255:75
chr12 6953268 . C T 999 . DP=1048;VDB=0.0376;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.59e-07,0.3143;HWE=4.09e-11;AC1=22;DP4=324,334,160,171;MQ=60;FQ=999;PV4=0.84,0,0.1,1 GT:PL:GQ 1/1:232,117,0:99 1/1:203,96,0:90 1/1:231,126,0:99 1/1:207,72,0:66 1/1:222,157,0:99 1/1:204,60,0:54 1/1:208,90,0:84 1/1:196,78,0:72 1/1:205,96,0:90 1/1:175,42,0:36 1/1:203,60,0:54 0/0:0,69,255:69 0/0:0,33,255:33 0/0:0,0,0:3 0/0:0,66,255:66 0/0:0,90,255:90 0/0:0,42,255:42 0/0:0,99,255:99 0/0:0,39,255:39 0/0:0,66,255:66 0/0:0,51,255:51 0/0:0,81,255:81 0/0:0,60,255:60 0/0:0,33,255:33 0/0:0,169,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,93,255:93 0/0:0,132,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,72,255:72 0/0:0,60,255:60 0/0:0,60,255:60 0/0:0,135,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,45,255:45
chr12 6953302 . G C 61.6 . DP=952;VDB=0.0388;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=466,393,4,6;MQ=60;FQ=61.6;PV4=0.53,6.8e-17,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,105,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,255:66 0/0:0,93,255:99 0/0:0,33,250:48 0/1:107,0,146:92 0/0:0,66,255:81 0/0:0,24,184:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,255:69 0/0:0,36,255:51 0/0:0,120,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,42,255:57
chr12 6953352 . C T 121 . DP=888;VDB=0.0335;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=393,382,7,7;MQ=60;FQ=121;PV4=1,1.4e-11,0.47,0.49 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,96,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,15,142:30 0/0:0,0,0:15 0/1:166,0,241:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,21,199:36 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,226:39 0/0:0,54,255:69 0/0:0,30,255:45 0/0:0,72,255:87 0/0:0,66,255:81 0/0:0,27,236:42 0/0:0,96,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,126,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75 0/0:0,66,255:81 0/0:0,72,255:87 0/0:0,54,255:69 0/0:0,57,255:72
chr12 6953389 . C T 999 . DP=863;VDB=0.0357;AF1=0.3158;G3=0.6857,1.771e-08,0.3143;HWE=4.58e-11;AC1=23;DP4=267,248,99,133;MQ=60;FQ=999;PV4=0.022,5.1e-180,1,1 GT:PL:GQ 1/1:236,105,0:99 1/1:234,96,0:90 1/1:194,51,0:45 1/1:215,51,0:45 1/1:216,63,0:57 1/1:193,48,0:42 1/1:150,42,0:36 1/1:223,57,0:51 1/1:241,93,0:87 1/1:184,42,0:36 1/1:191,45,0:39 0/0:0,48,255:48 0/0:0,30,255:30 0/0:0,0,0:3 0/0:0,81,255:81 0/0:0,69,255:69 0/0:0,33,255:33 0/0:0,63,255:63 0/0:0,42,255:42 0/0:0,48,255:48 0/0:0,45,255:45 0/0:0,69,255:69 0/0:0,69,255:69 0/0:0,9,104:10 0/0:0,87,255:87 0/0:0,123,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:66 0/0:0,45,255:45 0/0:0,123,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,39,255:39 0/0:0,54,255:54 0/0:0,69,255:69 0/0:0,60,255:60 0/0:0,72,255:72
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chr12 6953583 . A G 72.6 . DP=983;VDB=0.0281;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=464,443,7,7;MQ=60;FQ=72.6;PV4=1,1.9e-27,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,69,255:84 0/0:0,63,255:78 0/0:0,87,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,48,255:63 0/0:0,66,255:81 0/0:0,48,255:63 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,39,255:54 0/0:0,39,255:54 0/0:0,36,255:51 0/0:0,72,255:87 0/0:0,39,255:54 0/1:118,0,226:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,36,255:51 0/0:0,178,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,75,255:90 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,120,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75
chr12 6953597 . G A 88.6 . DP=958;VDB=0.0388;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=442,452,7,4;MQ=60;FQ=88.6;PV4=0.38,1.4e-27,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,126,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,72,255:87 0/0:0,75,255:90 0/0:0,87,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,66,255:81 0/0:0,51,255:66 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,30,255:45 0/0:0,54,255:69 0/0:0,33,255:48 0/0:0,69,255:84 0/0:0,36,255:51 0/0:0,75,255:90 0/0:0,81,255:96 0/0:0,36,255:51 0/0:0,178,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:99 0/1:134,0,208:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,114,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,255:69
chr12 6953639 . C T 999 . DP=867;VDB=0.0275;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=278,429,4,12;MQ=60;FQ=999;PV4=0.31,0.044,1,0.44 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:81 0/0:0,72,255:87 0/0:0,54,255:69 0/0:0,78,255:93 0/0:0,84,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,63,255:78 0/0:0,81,255:96 0/0:0,90,255:99 0/0:0,21,180:36 0/0:0,42,255:57 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,255:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,30,255:45 0/0:0,39,255:54 0/0:0,27,213:42 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,245:45 0/0:0,57,255:72 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,84,255:99 0/0:0,57,255:72 0/1:227,0,200:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,255:66
chr12 6953649 . G A 69.6 . DP=841;VDB=0.0229;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=252,435,7,3;MQ=60;FQ=69.6;PV4=0.045,8.8e-13,1,0.021 GT:PL:GQ 0/0:0,57,255:72 0/0:0,75,255:90 0/0:0,54,255:69 0/0:0,72,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,42,250:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,87,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,24,208:39 0/0:0,60,255:75 0/0:0,57,255:72 0/0:0,27,239:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,39,255:54 0/0:0,36,255:51 0/0:0,39,255:54 0/0:0,15,133:30 0/0:0,63,255:78 0/0:0,30,233:45 0/0:0,69,255:84 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,251:51 0/0:0,105,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,63,255:78 0/1:115,0,88:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,255:66 0/0:0,93,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,54,255:69
chr12 6953664 . G A 999 . DP=856;VDB=0.0368;AF1=0.04183;G3=0.9427,0.02875,0.02851;HWE=0.024;AC1=3;DP4=259,425,11,14;MQ=60;FQ=999;PV4=0.54,3.9e-14,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:98 0/0:0,69,255:80 0/0:0,63,255:74 0/0:0,66,255:77 0/0:0,75,255:86 0/0:0,27,193:38 0/0:0,42,255:53 0/0:0,87,255:98 0/0:0,90,255:99 0/0:0,24,208:35 0/0:0,66,255:77 0/0:0,54,255:65 0/0:0,24,233:35 0/0:0,0,0:11 0/0:0,75,255:86 0/0:0,39,255:50 0/0:0,36,255:47 0/0:0,30,226:41 0/0:0,9,78:20 0/0:0,54,255:65 0/0:0,33,243:44 0/0:0,69,255:80 0/0:0,63,255:74 1/1:158,27,0:11 0/1:150,0,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,81,255:92 0/0:0,84,255:95 0/0:0,63,255:74 0/0:0,75,255:86 0/0:0,42,255:53 0/0:0,78,255:89 0/0:0,57,255:68 0/0:0,87,255:98 0/0:0,75,255:86 0/0:0,48,255:59
chr12 6953757 . A G 999 . DP=824;VDB=0.0344;AF1=0.3143;G3=0.6857,1.299e-08,0.3143;HWE=4.49e-11;AC1=22;DP4=213,264,82,111;MQ=60;FQ=999;PV4=0.67,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,81,0:75 1/1:255,66,0:60 1/1:255,57,0:51 1/1:243,45,0:39 1/1:255,48,0:42 1/1:191,21,0:15 1/1:211,27,0:21 1/1:255,60,0:54 1/1:255,81,0:75 1/1:203,30,0:24 1/1:255,63,0:57 0/0:0,60,255:60 0/0:0,21,196:21 0/0:0,0,0:3 0/0:0,90,255:90 0/0:0,42,255:42 0/0:0,33,255:33 0/0:0,48,255:48 0/0:0,15,143:16 0/0:0,75,255:75 0/0:0,21,201:21 0/0:0,51,255:51 0/0:0,63,255:63 0/0:0,36,255:36 0/0:0,81,255:81 0/0:0,117,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:75 0/0:0,51,253:51 0/0:0,93,255:93 0/0:0,87,255:87 0/0:0,48,255:48 0/0:0,30,220:30 0/0:0,66,255:66 0/0:0,72,255:72 0/0:0,45,255:45
chr12 6953766 . C A 999 . DP=852;VDB=0.0385;AF1=1;AC1=72;DP4=2,0,243,413;MQ=60;FQ=-44.5;PV4=0.14,0.0073,0.44,0.13 GT:PL:GQ 1/1:177,81,0:99 1/1:191,72,0:99 1/1:184,69,0:99 1/1:125,7,0:37 1/1:157,57,0:87 1/1:125,27,0:57 1/1:120,27,0:57 1/1:174,51,0:81 1/1:200,93,0:99 1/1:117,30,0:60 1/1:179,60,0:90 1/1:155,51,0:81 1/1:98,18,0:48 1/1:0,0,0:30 1/1:187,87,0:99 1/1:130,39,0:69 1/1:119,33,0:63 1/1:144,45,0:75 1/1:76,21,0:51 1/1:189,81,0:99 1/1:105,27,0:57 1/1:156,45,0:75 1/1:170,57,0:87 1/1:134,30,0:60 1/1:181,81,0:99 1/1:185,90,0:99 1/1:184,58,0:88 1/1:187,69,0:99 1/1:174,60,0:90 1/1:156,81,0:99 1/1:165,102,0:99 1/1:173,48,0:78 1/1:135,36,0:66 1/1:146,63,0:93 1/1:188,81,0:99 1/1:151,48,0:78
chr12 6953799 . T C 999 . DP=843;VDB=0.0524;AF1=0.05676;AC1=4;DP4=278,424,16,17;MQ=60;FQ=999;PV4=0.36,3e-39,1.8e-21,0.013 GT:PL:GQ 0/0:0,81,255:90 0/0:0,75,255:84 0/0:0,69,255:78 0/0:0,51,255:60 0/0:0,63,255:72 0/0:0,27,238:36 0/0:0,30,250:39 0/0:0,51,255:60 0/0:0,87,255:96 0/0:0,21,170:30 0/0:0,63,255:72 0/0:0,66,255:75 0/0:0,33,255:42 0/0:0,0,0:10 0/1:136,0,255:99 0/1:130,0,116:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,69,255:78 0/0:0,15,173:24 0/0:0,75,255:84 1/1:158,30,0:15 0/0:0,84,255:93 0/0:0,51,255:60 0/0:0,33,255:42 0/0:0,108,255:99 0/0:0,81,255:90 0/0:0,105,255:99 0/0:0,78,255:87 0/0:0,57,255:66 0/0:0,96,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:75 0/0:0,57,255:66 0/0:0,39,255:48 0/0:0,78,255:87 0/0:0,54,255:63
chr12 6953804 . A T 999 . DP=844;VDB=0.0334;AF1=0.1286;AC1=9;DP4=239,371,56,64;MQ=60;FQ=999;PV4=0.13,3.6e-09,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:77 0/0:0,69,255:74 0/0:0,72,255:77 0/0:0,51,255:56 0/0:0,63,255:68 0/0:0,30,231:35 0/0:0,30,233:35 0/0:0,45,255:50 0/0:0,90,255:95 0/0:0,27,176:32 0/0:0,60,255:65 0/0:0,66,255:71 0/0:0,36,246:41 0/0:0,0,0:6 0/0:0,90,255:95 0/0:0,51,255:56 0/0:0,69,255:74 0/0:0,75,255:80 0/0:0,30,245:35 0/0:0,69,255:74 0/0:0,42,255:47 0/1:255,0,185:99 1/1:255,42,0:31 0/0:0,30,240:35 0/1:208,0,255:99 0/1:231,0,203:99 1/1:255,102,0:91 0/0:0,59,255:64 0/1:138,0,159:99 0/1:227,0,192:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,63,255:68 0/0:0,57,255:62 0/0:0,33,241:38 0/0:0,78,255:83 0/0:0,57,255:62
chr12 6953851 . G A 320 . DP=832;VDB=0.0363;AF1=0.07142;AC1=5;DP4=378,308,22,27;MQ=60;FQ=321;PV4=0.18,5.5e-108,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:83 0/0:0,48,255:56 0/0:0,72,255:80 0/0:0,66,255:74 0/0:0,66,255:74 0/0:0,30,250:38 0/0:0,33,214:41 0/0:0,36,255:44 0/0:0,90,255:98 0/0:0,36,255:44 0/0:0,60,255:68 0/0:0,54,255:62 0/0:0,30,232:38 0/0:0,0,0:9 0/0:0,78,255:86 0/0:0,78,255:86 0/0:0,42,255:50 0/0:0,66,255:74 0/0:0,60,255:68 0/0:0,72,255:80 0/0:0,39,255:47 0/0:0,90,255:98 0/0:0,54,255:62 0/0:0,30,242:38 0/0:0,151,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,81,255:89 0/0:0,48,255:56 0/0:0,72,255:80 0/0:0,51,255:59 0/1:37,0,247:29 0/1:130,0,159:99 0/0:0,48,255:56 0/1:58,0,244:50 1/1:194,66,0:52
chr12 6953891 . G C 999 . DP=862;VDB=0.0387;AF1=0.1001;AC1=7;DP4=399,269,37,30;MQ=60;FQ=999;PV4=0.52,3.1e-50,3.4e-05,1 GT:PL:GQ 0/1:94,0,245:87 0/0:0,75,255:82 0/1:100,0,223:93 0/0:0,84,255:91 0/1:144,0,211:99 0/1:90,0,112:83 0/0:0,20,255:27 0/0:0,45,255:52 0/1:69,0,255:62 0/1:116,0,107:99 0/1:151,0,180:99 0/0:0,45,255:52 0/0:0,27,234:34 0/0:0,0,0:7 0/0:0,66,255:73 0/0:0,66,255:73 0/0:0,27,246:34 0/0:0,48,255:55 0/0:0,18,170:25 0/0:0,90,255:97 0/0:0,21,165:28 0/0:0,66,255:73 0/0:0,63,255:70 0/0:0,24,225:31 0/0:0,135,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,57,255:64 0/0:0,78,255:85 0/0:0,57,255:64 0/0:0,57,255:64 0/0:0,51,255:58 0/0:0,69,255:76 0/0:0,84,255:91 0/0:0,48,255:55
chr12 6953928 . T C 999 . DP=821;VDB=0.0358;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,297,361;MQ=59;FQ=-43.2 GT:PL:GQ 1/1:255,78,0:99 1/1:255,60,0:89 1/1:227,57,0:86 1/1:255,78,0:99 1/1:226,63,0:92 1/1:144,21,0:50 1/1:186,39,0:68 1/1:223,42,0:71 1/1:255,66,0:95 1/1:252,57,0:86 1/1:236,66,0:95 1/1:155,30,0:59 1/1:62,9,0:38 1/1:0,0,0:29 1/1:230,51,0:80 1/1:164,27,0:56 1/1:156,30,0:59 1/1:203,39,0:68 1/1:21,3,0:32 1/1:247,84,0:99 1/1:121,18,0:47 1/1:194,39,0:68 1/1:167,51,0:80 1/1:169,27,0:56 1/1:255,135,0:99 1/1:255,81,0:99 1/1:255,111,0:99 1/1:255,108,0:99 1/1:229,57,0:86 1/1:243,57,0:86 1/1:245,72,0:99 1/1:180,45,0:74 1/1:253,63,0:92 1/1:255,90,0:99 1/1:255,87,0:99 1/1:180,33,0:62
chr12 6954016 . G A 101 . DP=740;VDB=0.0124;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=356,311,12,3;MQ=52;FQ=101;PV4=0.063,1.4e-13,0.47,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,247:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,66,255:81 0/0:0,69,255:84 0/0:0,24,206:39 0/0:0,33,253:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,18,91:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,39,255:54 0/0:0,81,255:96 0/0:0,36,142:51 0/0:0,42,255:57 0/0:0,21,143:36 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,99:42 0/0:0,63,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,24,225:39 0/0:0,96,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,54,255:69 0/1:146,0,133:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,30,246:45 0/0:0,39,255:54 0/0:0,75,255:90 0/0:0,60,255:75 0/0:0,57,255:72
chr12 6954022 . tc t 999 . INDEL;DP=727;VDB=0.0365;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,11,16;MQ=54;FQ=-34.3 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:15,3,0:11 1/1:59,6,0:14 1/1:13,3,0:11 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:24,15,0:22 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:148,36,0:43 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:0,0,0:8 1/1:66,18,0:25 1/1:0,0,0:8
chr12 6954023 . ct c 999 . INDEL;DP=717;VDB=0.0359;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,146,180;MQ=56;FQ=-49.6 GT:PL:GQ 1/1:150,36,0:64 1/1:148,24,0:52 1/1:165,30,0:58 1/1:128,21,0:49 1/1:165,42,0:70 1/1:104,12,0:40 1/1:105,21,0:49 1/1:155,36,0:64 1/1:184,33,0:61 1/1:59,6,0:34 1/1:135,30,0:58 1/1:81,12,0:40 1/1:11,6,0:34 1/1:0,0,0:28 1/1:58,12,0:40 1/1:143,51,0:79 1/1:24,15,0:43 1/1:59,15,0:43 1/1:8,6,0:34 1/1:174,39,0:67 1/1:37,15,0:43 1/1:150,36,0:64 1/1:163,33,0:61 1/1:94,15,0:43 1/1:212,66,0:94 1/1:221,54,0:82 1/1:174,45,0:73 1/1:106,30,0:58 1/1:158,33,0:61 1/1:180,39,0:67 1/1:98,24,0:52 1/1:134,21,0:49 1/1:143,30,0:58 1/1:188,45,0:73 1/1:67,18,0:46 1/1:120,27,0:55
chr12 6954030 . cttt cTttt 6.81 . INDEL;DP=729;VDB=0.0368;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,1,2;MQ=40;FQ=-32.3 GT:PL:GQ 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 1/1:13,3,0:4 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 1/1:17,3,0:4 1/1:18,3,0:4 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3
chr12 6954033 . tcc tCcc 999 . INDEL;DP=732;VDB=0.0372;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,191,149;MQ=51;FQ=-50.2 GT:PL:GQ 1/1:178,51,0:79 1/1:132,33,0:61 1/1:114,24,0:52 1/1:146,36,0:64 1/1:138,30,0:58 1/1:81,15,0:43 1/1:127,30,0:58 1/1:146,33,0:61 1/1:132,27,0:55 1/1:91,15,0:43 1/1:117,24,0:52 1/1:54,9,0:37 1/1:25,9,0:37 1/1:0,0,0:28 1/1:88,21,0:49 1/1:122,33,0:61 1/1:10,6,0:34 1/1:114,24,0:52 1/1:30,9,0:37 1/1:145,36,0:64 1/1:22,9,0:37 1/1:156,36,0:64 1/1:107,27,0:55 1/1:105,18,0:46 1/1:178,54,0:82 1/1:168,51,0:79 1/1:159,39,0:67 1/1:144,42,0:70 1/1:115,27,0:55 1/1:145,39,0:67 1/1:150,33,0:61 1/1:132,24,0:52 1/1:161,36,0:64 1/1:188,54,0:82 1/1:143,42,0:70 1/1:111,24,0:52
chr12 6954048 . A G 5.88 . DP=734;VDB=0.0392;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=392,238,7,1;MQ=44;FQ=5.93;PV4=0.27,1.9e-10,0.2,1 GT:PL:GQ 0/0:0,81,255:98 0/0:0,60,255:77 0/0:0,66,255:83 0/0:0,63,255:80 0/0:0,48,255:65 0/0:0,30,207:47 0/0:0,51,255:68 0/0:0,78,255:95 0/0:0,57,255:74 0/0:0,27,189:44 0/0:0,36,233:53 0/0:0,42,162:59 0/0:0,27,26:44 0/0:0,0,0:17 0/0:0,51,225:68 0/0:0,81,255:98 0/0:0,30,32:47 0/0:0,51,255:68 0/0:0,39,45:56 0/1:50,0,144:33 0/0:0,24,33:41 0/0:0,57,255:74 0/0:0,45,255:62 0/0:0,21,182:38 0/0:0,96,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:89 0/0:0,51,255:68 0/0:0,60,255:77 0/0:0,57,234:74 0/0:0,33,231:50 0/0:0,45,255:62 0/0:0,87,255:99 0/0:0,60,255:77 0/0:0,57,255:74
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chr12 6954502 . T C 999 . DP=715;VDB=0.0296;AF1=0.0286;AC1=2;DP4=338,304,17,9;MQ=55;FQ=999;PV4=0.23,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:75 0/0:0,75,255:87 0/0:0,75,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,39,255:51 0/0:0,36,255:48 0/0:0,39,255:51 0/0:0,51,255:63 0/0:0,39,255:51 0/0:0,42,255:54 0/0:0,57,255:69 0/0:0,18,108:30 0/0:0,0,0:12 0/0:0,57,255:69 0/0:0,33,234:45 0/0:0,27,199:39 0/0:0,60,255:72 0/0:0,21,214:33 0/0:0,57,255:69 0/0:0,33,184:45 0/0:0,69,255:81 0/0:0,48,255:60 0/0:0,24,211:36 0/0:0,87,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,90,255:99 0/1:210,0,212:99 0/0:0,57,255:69 0/0:0,84,255:96 0/0:0,48,255:60 0/0:0,48,255:60 0/1:200,0,178:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,69,255:81 0/0:0,48,255:60
chr12 6954504 . T C 117 . DP=706;VDB=0.0168;AF1=0.02859;AC1=2;DP4=340,297,1,9;MQ=55;FQ=117;PV4=0.008,1,0.43,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:75 0/0:0,72,255:84 0/0:0,75,255:87 0/0:0,84,255:96 0/1:88,0,214:76 0/1:90,0,187:78 0/0:0,36,253:48 0/0:0,39,255:51 0/0:0,45,255:57 0/0:0,36,255:48 0/0:0,36,243:48 0/0:0,51,255:63 0/0:0,18,106:30 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,33,241:45 0/0:0,33,204:45 0/0:0,57,255:69 0/0:0,39,231:51 0/0:0,57,255:69 0/0:0,27,156:39 0/0:0,66,255:78 0/0:0,48,255:60 0/0:0,24,215:36 0/0:0,90,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,54,255:66 0/0:0,84,255:96 0/0:0,48,255:60 0/0:0,45,255:57 0/0:0,63,255:75 0/0:0,84,255:96 0/0:0,57,255:69 0/0:0,54,255:66
chr12 6954516 . T C 999 . DP=969;VDB=0.0262;AF1=0.0433;AC1=3;DP4=518,328,24,16;MQ=46;FQ=999;PV4=0.87,4.7e-55,1,0.29 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,111,255:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,63,250:73 0/0:0,63,254:73 0/0:0,87,255:97 0/0:0,93,193:99 0/0:0,48,248:58 0/0:0,72,223:82 0/0:0,48,255:58 0/0:0,15,44:25 0/0:0,0,0:11 0/0:0,5,192:16 0/1:67,0,96:57 0/0:0,45,144:55 0/0:0,60,255:70 0/0:0,30,176:40 0/1:76,0,207:66 0/0:0,36,115:46 0/0:0,72,255:82 0/0:0,72,255:82 0/0:0,24,208:34 0/0:0,120,255:99 0/1:94,0,200:84 0/0:0,93,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,108,255:99 0/0:0,54,243:64 0/0:0,51,255:61 0/0:0,81,255:91 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:88 0/0:0,75,255:85
chr12 6954599 . A C 72.4 . DP=635;VDB=0.0214;AF1=0.02912;AC1=2;DP4=210,279,3,15;MQ=55;FQ=72.5;PV4=0.029,5.7e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:78 0/0:0,15,104:27 0/0:0,39,188:51 0/0:0,24,162:36 0/0:0,42,255:54 0/0:0,39,242:51 0/0:0,12,86:24 0/0:0,48,252:60 0/0:0,24,163:36 0/0:0,4,147:16 0/0:0,45,255:57 0/0:0,72,255:84 0/0:0,45,255:57 0/0:0,0,0:12 0/0:0,48,255:60 0/0:0,39,253:51 0/0:0,39,195:51 0/0:0,57,255:69 0/0:0,33,232:45 0/0:0,54,255:66 0/0:0,7,165:19 0/0:0,42,242:54 0/0:0,54,255:66 0/1:37,0,120:25 0/1:96,0,175:84 0/0:0,57,255:69 0/0:0,54,255:66 0/0:0,66,255:78 0/0:0,24,190:36 0/0:0,51,255:63 0/0:0,30,218:42 0/0:0,40,255:52 0/0:0,45,255:57 0/0:0,48,255:60 0/0:0,37,234:49 0/0:0,45,255:57
chr12 6954843 . C G 73.6 . DP=720;VDB=0.0225;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=272,334,5,2;MQ=60;FQ=73.6;PV4=0.25,0.0011,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,36,255:51 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,255:69 0/0:0,27,223:42 0/0:0,30,211:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,63,255:78 0/0:0,57,255:72 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/0:0,54,255:69 0/0:0,36,255:51 0/0:0,18,175:33 0/0:0,78,255:93 0/0:0,126,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,72,255:87 0/0:0,36,232:51 0/0:0,87,255:99 0/1:119,0,237:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,239:42
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chr12 6955082 . C T 999 . DP=762;VDB=0.0213;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=301,372,9,7;MQ=60;FQ=999;PV4=0.45,0.0032,1,0.36 GT:PL:GQ 0/0:0,57,255:69 0/0:0,51,255:63 0/0:0,51,255:63 0/0:0,57,255:69 0/0:0,48,255:60 0/0:0,36,255:48 0/0:0,30,227:42 0/0:0,66,255:78 0/0:0,63,255:75 0/0:0,33,232:45 0/0:0,69,255:81 0/0:0,63,255:75 0/0:0,30,255:42 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,48,255:60 0/0:0,60,255:72 0/0:0,72,255:84 0/0:0,78,255:90 0/0:0,42,255:54 0/0:0,42,255:54 0/0:0,66,255:78 0/0:0,78,255:90 0/0:0,24,159:36 0/0:0,87,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,63,255:75 0/1:201,0,193:99 0/1:63,0,223:51 0/0:0,120,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,33,227:45 0/0:0,48,255:60 0/0:0,75,255:87 0/0:0,66,255:78 0/0:0,93,255:99
chr12 6955136 . A G 999 . DP=870;VDB=0.0306;AF1=0.07143;AC1=5;DP4=341,377,56,37;MQ=60;FQ=999;PV4=0.027,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:80 0/0:0,60,255:68 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:62 0/0:0,36,255:44 0/0:0,57,255:65 0/0:0,72,255:80 0/0:0,78,255:86 0/0:0,33,228:41 0/0:0,72,255:80 0/0:0,60,255:68 0/0:0,42,255:50 0/0:0,0,0:9 0/0:0,51,255:59 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:47 0/0:0,48,255:56 0/0:0,48,242:56 0/0:0,39,255:47 0/0:0,45,255:53 0/1:249,0,187:99 0/1:255,0,244:99 0/0:0,54,255:62 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,232:99 0/1:255,0,207:99 0/0:0,87,255:95 0/0:0,60,255:68 0/0:0,154,255:99 0/0:0,63,255:71 0/0:0,36,255:44 0/0:0,42,255:50 0/0:0,90,255:98 0/0:0,48,255:56 0/0:0,108,255:99
chr12 6955147 . A C 999 . DP=875;VDB=0.0322;AF1=0.314;G3=0.6857,2.833e-07,0.3143;HWE=4.18e-11;AC1=22;DP4=299,297,110,119;MQ=60;FQ=999;PV4=0.59,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,78,0:72 1/1:255,60,0:54 1/1:255,84,0:78 1/1:255,102,0:96 1/1:255,54,0:48 1/1:215,24,0:18 1/1:255,42,0:36 1/1:255,72,0:66 1/1:255,81,0:75 1/1:255,30,0:24 1/1:255,57,0:51 0/0:0,63,255:63 0/0:0,48,255:48 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:48 0/0:0,93,255:93 0/0:0,42,255:42 0/0:0,54,255:54 0/0:0,51,255:51 0/0:0,45,255:45 0/0:0,42,255:42 0/0:0,63,255:63 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:63 0/0:0,120,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,90,255:90 0/0:0,69,255:69 0/0:0,141,255:99 0/0:0,75,255:75 0/0:0,42,255:42 0/0:0,45,255:45 0/0:0,90,255:90 0/0:0,51,255:51 0/0:0,99,255:99
chr12 6955271 . GTCTCTCTC GTCTCTCTCTC,GTCTCTCTCTCTC 999 . INDEL;DP=730;VDB=0.0384;AF1=0.9695;AC1=70;DP4=9,2,279,275;MQ=59;FQ=999;PV4=0.063,1,0.21,1 GT:PL:GQ 1/1:255,51,0,255,51,255:63 1/1:255,39,0,255,39,255:51 1/1:255,45,0,255,45,255:57 1/1:255,255,255,255,0,255:12 1/1:255,255,255,255,0,255:12 1/1:255,57,30,251,0,248:39 1/1:255,162,147,183,0,174:27 1/1:255,57,24,255,0,255:45 1/1:255,42,0,255,42,255:54 1/1:255,183,174,121,0,109:21 1/1:255,42,0,255,42,255:54 1/1:255,39,0,255,39,255:51 1/1:246,21,0,246,21,246:33 1/1:0,0,0,0,0,0:12 1/1:255,27,0,255,27,255:39 1/1:255,42,0,255,42,255:54 1/1:255,24,0,255,24,255:36 1/1:255,75,0,255,75,255:87 1/1:255,27,0,255,27,255:39 1/1:255,36,0,255,36,255:48 1/1:255,42,0,255,42,255:54 1/1:255,63,0,255,63,255:75 1/1:255,63,0,255,63,255:75 1/1:255,48,0,255,48,255:60 1/1:255,63,0,255,63,255:75 1/1:255,81,0,255,81,255:93 1/1:255,60,0,255,60,255:72 1/1:255,90,0,255,90,255:99 1/1:255,54,0,255,54,255:66 1/1:255,72,0,255,72,255:84 1/1:255,48,0,255,48,255:60 0/1:255,0,145,255,166,255:99 1/1:255,42,0,255,42,255:54 1/1:255,57,0,255,57,255:69 0/1:255,0,150,255,186,255:99 1/1:255,81,0,255,81,255:93
chr12 6955272 . TC TCCC 999 . INDEL;DP=770;VDB=0.0386;AF1=0.5777;G3=0.03602,0.768,0.196;HWE=0.00142;AC1=42;DP4=51,46,159,155;MQ=60;FQ=999;PV4=0.82,4.7e-73,0.18,1 GT:PL:GQ 0/1:87,0,19:21 0/1:63,0,78:67 0/1:78,0,20:22 0/1:43,0,41:41 0/1:60,0,77:64 1/1:88,18,0:16 0/1:38,0,47:41 1/1:93,21,0:19 1/1:106,30,0:28 1/1:29,6,0:6 0/1:73,0,115:77 0/1:56,0,104:60 0/1:16,0,11:12 0/1:0,0,0:3 0/1:52,0,93:56 0/1:77,0,15:17 0/0:0,18,151:14 0/1:89,0,39:41 0/0:0,12,97:8 0/1:90,0,24:26 0/1:0,3,30:4 0/1:81,0,49:51 1/1:98,33,0:31 0/1:72,0,16:18 0/1:123,0,36:38 1/1:115,19,0:17 0/1:76,0,47:49 0/1:131,0,24:26 0/1:63,0,60:61 1/1:153,54,0:52 0/1:74,1,0:3 0/1:49,0,171:53 0/1:70,0,0:4 0/1:128,0,15:17 0/1:69,0,202:73 0/1:67,0,78:71
chr12 6955273 . CT CTAT 999 . INDEL;DP=769;VDB=0.0388;AF1=0.5838;G3=0.02278,0.7951,0.1821;HWE=0.000626;AC1=42;DP4=49,49,155,140;MQ=60;FQ=999;PV4=0.73,5.2e-77,0.18,1 GT:PL:GQ 0/1:71,0,30:32 0/1:59,0,98:63 0/1:60,0,50:51 0/1:9,0,79:14 0/1:58,0,78:62 1/1:54,12,0:11 0/1:36,0,44:39 0/1:81,0,8:10 1/1:103,30,0:28 1/1:39,6,0:6 0/1:77,0,114:81 0/1:65,0,78:69 1/1:22,3,0:4 0/1:0,0,0:3 0/1:43,0,93:47 0/1:50,0,24:26 0/0:0,15,136:11 0/1:83,0,22:24 0/0:0,12,97:8 0/1:95,1,0:3 0/1:7,0,24:12 0/1:72,0,50:52 1/1:95,33,0:31 0/1:72,0,41:43 0/1:97,0,38:40 0/1:94,0,5:7 0/1:58,0,51:52 0/1:96,0,16:18 0/1:61,0,74:65 1/1:137,48,0:46 1/1:127,27,0:25 0/1:52,0,171:56 1/1:57,6,0:6 0/1:86,0,24:26 0/1:58,0,200:62 0/1:69,0,66:67
chr12 6955274 . TC TCCC 999 . INDEL;DP=760;VDB=0.0399;AF1=0.5771;G3=0.02198,0.8051,0.1729;HWE=0.000362;AC1=42;DP4=44,49,159,156;MQ=60;FQ=999;PV4=0.64,3e-83,0.2,1 GT:PL:GQ 0/1:73,0,35:37 0/1:81,0,49:51 0/1:72,0,49:51 0/1:33,0,68:37 0/1:65,0,62:63 1/1:66,15,0:14 0/1:33,0,44:37 0/1:94,0,5:8 1/1:105,30,0:28 1/1:28,6,0:6 0/1:93,0,93:93 0/1:69,0,56:58 1/1:13,3,0:4 0/1:0,0,0:3 0/1:43,0,93:47 0/1:59,0,21:23 0/0:0,15,136:11 0/1:88,0,50:52 0/0:0,12,97:8 0/1:79,0,27:29 0/1:12,0,53:16 0/1:71,0,31:33 1/1:94,39,0:37 0/1:73,0,23:25 0/1:114,0,33:35 0/1:95,0,12:14 0/1:66,0,50:52 0/1:115,0,8:10 0/1:71,0,48:50 1/1:139,51,0:49 1/1:99,30,0:28 0/1:49,0,171:53 1/1:64,3,0:4 0/1:86,0,11:13 0/1:53,0,205:57 0/1:62,0,65:63
chr12 6955276 . TC TCCC 999 . INDEL;DP=746;VDB=0.0406;AF1=0.5722;G3=3.209e-05,0.8235,0.1764;HWE=0.000181;AC1=41;DP4=41,41,154,166;MQ=60;FQ=999;PV4=0.8,1.1e-75,0.27,1 GT:PL:GQ 0/1:73,0,19:21 0/1:123,0,64:66 0/1:70,0,16:18 0/1:29,0,38:32 0/1:44,0,60:48 0/1:40,0,17:19 0/1:33,0,16:18 0/1:76,0,2:5 1/1:85,30,0:28 1/1:31,6,0:6 0/1:85,0,96:89 0/1:67,0,36:38 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:58,0,60:59 0/1:70,0,15:17 0/0:0,12,111:8 0/1:85,0,50:52 0/0:0,6,55:4 0/1:75,0,27:29 0/1:0,3,32:4 0/1:84,0,21:23 1/1:109,39,0:37 0/1:74,0,50:52 0/1:92,0,27:29 0/1:93,0,32:34 0/1:97,0,33:35 1/1:166,57,0:55 0/1:70,0,44:46 1/1:147,51,0:49 1/1:88,27,0:25 0/1:49,0,173:53 1/1:93,5,0:5 0/1:91,0,20:22 0/1:59,0,205:63 0/1:66,0,63:64
chr12 6955296 . C G 7.45 . DP=684;VDB=0.0285;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=279,303,2,5;MQ=60;FQ=7.5;PV4=0.45,4.6e-13,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,51,255:67 0/0:0,42,255:58 0/0:0,42,255:58 0/0:0,81,255:97 0/0:0,57,255:73 0/0:0,33,251:49 0/0:0,33,255:49 0/0:0,39,255:55 0/0:0,45,255:61 0/0:0,18,155:34 0/0:0,51,255:67 0/0:0,33,255:49 0/0:0,24,214:40 0/0:0,0,0:16 0/0:0,42,255:58 0/0:0,51,255:67 0/0:0,30,237:46 0/0:0,72,255:88 0/0:0,36,255:52 0/0:0,60,255:76 0/0:0,33,244:49 0/0:0,69,255:85 0/0:0,54,255:70 0/0:0,48,255:64 0/0:0,57,255:73 0/0:0,93,255:99 0/0:0,60,255:76 0/1:52,0,255:36 0/0:0,72,255:88 0/0:0,81,255:97 0/0:0,33,254:49 0/0:0,30,255:46 0/0:0,51,255:67 0/0:0,60,255:76 0/0:0,48,255:64 0/0:0,69,255:85
chr12 6955488 . T C 999 . DP=691;VDB=0.0299;AF1=0.3084;G3=0.6857,1.496e-07,0.3143;HWE=8.36e-11;AC1=22;DP4=192,214,74,99;MQ=59;FQ=999;PV4=0.36,2.2e-77,1,1 GT:PL:GQ 1/1:204,39,0:32 1/1:250,63,0:56 1/1:205,45,0:38 1/1:255,72,0:65 1/1:220,60,0:53 1/1:182,36,0:29 1/1:230,51,0:44 1/1:207,45,0:38 1/1:201,42,0:35 1/1:148,7,0:3 1/1:186,33,0:26 0/0:0,51,255:52 0/0:0,18,181:19 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:49 0/0:0,63,255:64 0/0:0,24,226:25 0/0:0,57,255:58 0/0:0,15,134:16 0/0:0,78,255:79 0/0:0,33,255:34 0/0:0,27,229:28 0/0:0,45,255:46 0/0:0,33,252:34 0/0:0,99,255:99 0/0:0,84,255:85 0/0:0,66,255:67 0/0:0,72,255:73 0/0:0,63,255:64 0/0:0,69,255:70 0/0:0,45,255:46 0/0:0,18,179:19 0/0:0,36,255:37 0/0:0,90,255:91 0/0:0,42,255:43 0/0:0,39,255:40
chr12 6955685 . A C 92.6 . DP=784;VDB=0.0278;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=338,304,7,8;MQ=60;FQ=92.6;PV4=0.8,2.2e-21,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/1:138,0,202:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,21,191:36 0/0:0,42,255:57 0/0:0,39,255:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,255:48 0/0:0,54,255:69 0/0:0,87,255:99 0/0:0,36,255:51 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,42,255:57 0/0:0,57,255:72 0/0:0,42,255:57 0/0:0,63,255:78 0/0:0,42,255:57 0/0:0,36,255:51 0/0:0,54,255:69 0/0:0,18,175:33 0/0:0,87,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,84,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,66,255:81 0/0:0,102,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,36,255:51 0/0:0,30,247:45 0/0:0,99,255:99 0/0:0,30,248:45 0/0:0,48,255:63
chr12 6955707 . Ggagagagagagagagagag GGAgagagagagagagagagag 999 . INDEL;DP=801;VDB=0.0414;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=340,188,24,8;MQ=58;FQ=999;PV4=0.26,1,9.2e-10,1 GT:PL:GQ 0/0:0,48,255:63 0/0:0,42,255:57 0/1:255,0,191:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,27,242:42 0/0:0,27,239:42 0/0:0,39,255:54 0/0:0,51,255:66 0/0:15,36,178:36 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,27,255:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,72,255:87 0/0:0,21,214:36 0/0:0,36,255:51 0/0:0,21,228:36 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,248:39 0/0:0,45,255:60 0/0:0,51,255:66 0/0:0,15,176:30 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,96,255:99 0/0:0,24,224:39 0/0:0,24,240:39 0/0:0,21,217:36 0/0:0,75,255:90 0/0:0,18,193:33 0/0:0,39,255:54
chr12 6955712 . G C 138 . DP=823;VDB=0.0355;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=429,249,6,3;MQ=57;FQ=138;PV4=1,0.052,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,99,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,255:48 0/0:0,39,255:54 0/0:0,45,240:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,27,217:42 0/0:0,60,255:75 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,93,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,63,255:78 0/0:0,48,255:63 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,18,183:33 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,57,255:72 0/0:0,105,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,30,244:45 0/0:0,24,199:39 0/0:0,108,255:99 0/0:0,30,243:45 0/1:183,0,97:99
chr12 6955819 . CTAGG CTAGGTAGG 999 . INDEL;DP=841;VDB=0.0360;AF1=0.02714;AC1=2;DP4=372,361,10,6;MQ=60;FQ=999;PV4=0.45,1,0.21,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,255:99 0/1:22,0,255:10 0/0:0,57,255:70 0/0:0,96,255:99 0/0:0,63,255:76 0/0:0,36,255:49 0/0:0,45,255:58 0/0:0,63,255:76 0/0:0,45,255:58 0/0:0,36,255:49 0/0:0,81,255:94 0/0:0,60,255:73 0/0:0,27,255:40 0/0:0,0,0:13 0/0:0,33,255:46 0/0:0,57,255:70 0/0:0,24,255:37 0/0:0,42,255:55 0/0:0,45,255:58 0/0:0,72,255:85 0/0:0,42,255:55 0/0:0,45,255:58 0/0:0,81,255:94 0/0:0,18,255:31 0/0:0,93,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:73 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,255:55 0/0:0,45,255:58 0/0:0,105,255:99 0/0:0,69,255:82 0/0:0,63,255:76
chr12 6955941 . C T 136 . DP=791;VDB=0.0355;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=390,334,6,4;MQ=60;FQ=136;PV4=0.76,0.0032,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,93,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,226:39 0/0:0,48,255:63 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,69,255:84 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,42,255:57 0/0:0,66,255:81 0/0:0,33,255:48 0/0:0,54,255:69 0/0:0,30,255:45 0/0:0,96,255:99 0/0:0,21,188:36 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,30,240:45 0/0:0,93,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,90,255:99 0/1:181,0,252:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,33,255:48 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,255:60
chr12 6956072 . T C 999 . DP=959;VDB=0.0315;AF1=0.05736;AC1=4;DP4=406,449,20,23;MQ=60;FQ=999;PV4=1,1.8e-53,0.00064,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,42,255:51 0/0:0,30,236:39 0/0:0,66,255:75 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:48 0/0:0,81,255:90 0/0:0,63,255:72 0/0:0,51,255:60 0/0:0,0,0:10 0/0:0,81,255:90 0/0:0,72,255:81 0/0:0,45,255:54 0/0:0,66,255:75 0/0:0,33,255:42 0/0:0,60,255:69 0/0:0,45,255:54 0/0:0,120,255:99 0/1:154,0,255:99 0/0:0,9,91:18 0/0:0,114,255:99 0/1:149,0,255:99 0/1:42,0,255:33 0/0:0,75,255:84 0/1:84,0,222:75 0/0:0,190,255:99 0/0:0,63,255:72 0/0:0,30,244:39 0/0:0,54,255:63 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:90 0/0:0,81,255:90
chr12 6956188 . G C 151 . DP=880;VDB=0.0308;AF1=0.02858;G3=0.9714,3.393e-08,0.02857;HWE=0.00258;AC1=2;DP4=364,424,16,23;MQ=60;FQ=151;PV4=0.62,8.3e-59,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:75 0/0:0,60,255:72 0/0:0,114,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,57,255:69 0/0:0,60,255:72 0/0:0,30,190:42 0/0:0,75,255:87 0/0:0,72,255:84 0/0:0,54,233:66 0/0:0,69,255:81 0/0:0,72,255:84 0/0:0,48,255:60 0/0:0,0,0:12 0/0:0,60,255:72 0/0:0,66,255:78 0/0:0,51,255:63 0/0:0,63,255:75 0/0:0,33,255:45 0/0:0,69,255:81 0/0:0,36,255:48 0/0:0,84,255:96 0/0:0,84,255:96 0/0:0,24,187:36 0/0:0,90,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,111,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,33,255:45 0/0:0,45,255:57 1/1:218,93,0:75 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:66
chr12 6956374 . C T 106 . DP=847;VDB=0.0355;AF1=0.02861;G3=0.9714,3.989e-08,0.02857;HWE=0.00259;AC1=2;DP4=343,395,10,8;MQ=53;FQ=106;PV4=0.48,1.2e-48,0.087,1 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,144,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,54,255:66 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,48,255:60 0/0:0,48,255:60 0/0:0,66,255:78 0/0:0,33,233:45 0/0:0,0,0:12 0/0:0,42,255:54 0/0:0,51,255:63 0/0:0,45,239:57 0/0:0,66,255:78 0/0:0,36,255:48 0/0:0,66,255:78 0/0:0,36,232:48 0/0:0,48,255:60 0/0:0,69,255:81 0/0:0,18,167:30 0/0:0,75,255:87 0/0:0,126,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,114,255:99 0/0:0,69,255:81 1/1:173,54,0:36 0/0:0,57,231:69 0/0:0,18,183:30 0/0:0,21,183:33 0/0:0,42,255:54 0/0:0,108,255:99 0/0:0,24,223:36
chr12 6956393 . Ttatctatctatctatctatctatct TTATCTATCTATCATCtatctatctatctatctatctatct 999 . INDEL;DP=795;VDB=0.0356;AF1=0.7092;G3=0.3125,1.387e-05,0.6875;HWE=6.91e-05;AC1=51;DP4=82,44,138,84;MQ=42;FQ=999;PV4=0.64,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,18,0:19 1/1:255,25,0:26 1/1:255,44,0:45 1/1:255,87,0:88 1/1:255,13,0:14 1/1:161,18,0:19 1/1:250,13,0:14 1/1:255,18,0:19 1/1:246,14,0:15 1/1:158,5,0:7 1/1:240,8,0:9 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:9,9,9:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 0/0:76,110,255:27 1/1:23,23,23:3 1/1:7,7,7:3 1/1:49,49,49:3 0/1:0,6,120:3 0/0:0,9,151:4 1/1:11,11,11:3 0/0:0,90,255:83 0/0:0,12,196:7
chr12 6956402 . tatc tATCatc 999 . INDEL;DP=947;VDB=0.0419;AF1=0.2781;G3=0.6743,0.03474,0.291;HWE=9.11e-07;AC1=20;DP4=272,197,114,71;MQ=45;FQ=999;PV4=0.43,3.7e-09,1,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,13:20 1/1:245,21,0:14 1/1:255,34,0:27 1/1:255,76,0:69 1/1:255,12,0:6 1/1:158,15,0:8 1/1:213,8,0:3 1/1:253,12,0:6 1/1:223,11,0:5 0/1:87,4,0:5 1/1:235,8,0:3 0/0:0,45,255:46 0/0:0,15,113:16 0/0:0,0,0:3 0/0:0,33,223:34 0/0:0,45,250:46 0/0:0,27,183:28 0/0:0,45,255:46 0/0:0,24,219:25 0/0:0,42,255:43 0/0:0,12,107:13 0/0:0,39,255:40 0/0:0,69,255:70 0/0:0,18,160:19 0/0:0,108,255:99 0/0:0,93,255:94 0/0:0,90,255:91 0/0:0,78,255:79 0/0:0,72,255:73 0/0:0,54,255:55 0/0:0,57,227:58 0/1:11,0,111:10 0/0:0,27,255:28 0/0:0,30,199:31 0/0:0,105,255:99 0/0:0,24,255:25
chr12 6956405 . ctatctatctatct catctatctatct 999 . INDEL;DP=944;VDB=0.0426;AF1=0.3046;G3=0.6584,3.725e-06,0.3416;HWE=1.28e-07;AC1=22;DP4=159,66,120,75;MQ=42;FQ=999;PV4=0.05,1,1,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,4:11 1/1:217,18,0:12 1/1:255,34,0:27 1/1:255,73,0:66 1/1:244,12,0:6 1/1:156,18,0:12 1/1:189,7,0:3 1/1:222,12,0:6 1/1:217,11,0:6 0/1:49,3,0:5 1/1:207,7,0:3 0/0:24,27,32:5 0/0:27,30,29:4 0/0:0,0,0:3 0/0:0,12,75:13 0/0:0,9,70:10 0/0:0,9,27:10 0/0:4,7,5:4 0/0:0,0,0:3 0/0:0,12,34:13 0/0:0,6,43:7 0/0:0,15,115:16 0/0:0,12,81:13 0/0:0,15,117:16 0/0:0,45,174:46 0/0:0,30,90:31 0/0:13,40,130:28 0/0:0,30,212:31 0/0:0,27,93:28 0/0:16,31,61:16 0/0:28,46,81:19 0/0:0,9,106:10 0/0:0,15,124:16 0/0:23,32,70:10 0/0:0,90,255:91 0/0:0,15,140:16
chr12 6956413 . ct c 30.1 . INDEL;DP=964;VDB=0.0416;AF1=0.01458;AC1=1;DP4=280,176,5,4;MQ=42;FQ=30.2;PV4=0.74,0.061,0.19,0.024 GT:PL:GQ 0/0:0,54,54:69 0/0:0,9,9:24 0/0:0,24,20:39 0/0:0,6,17:21 0/0:0,48,11:47 0/0:0,12,13:27 0/0:0,18,17:33 0/0:0,27,17:42 0/0:0,21,15:36 0/0:0,21,15:36 0/0:0,18,17:33 0/0:0,33,179:48 0/0:0,12,63:27 0/0:0,0,0:15 0/0:0,24,109:39 0/0:0,42,186:57 0/0:0,21,113:36 0/0:0,48,215:63 0/0:0,12,90:27 0/1:83,0,175:68 0/0:0,15,97:30 0/0:0,27,211:42 0/0:0,57,255:72 0/0:0,18,148:33 0/0:0,120,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,75,235:90 0/0:0,54,234:69 0/0:0,57,176:72 0/0:0,18,153:33 0/0:0,27,215:42 0/0:0,45,209:60 0/0:0,96,255:99 0/0:0,24,187:39
chr12 6956416 . tct tCTAGCTATCTACct 27.5 . INDEL;DP=953;VDB=0.0428;AF1=0.01595;AC1=1;DP4=179,88,7,8;MQ=40;FQ=27.6;PV4=0.16,1,1,0.23 GT:PL:GQ 0/0:0,54,48:69 0/0:0,9,9:24 0/0:0,24,20:39 0/0:0,3,4:18 0/0:0,42,10:46 0/0:2,11,7:24 0/0:0,18,17:33 0/0:0,27,17:42 0/0:0,21,11:36 0/0:0,21,11:36 0/0:0,18,17:33 0/0:0,9,49:24 0/0:0,3,4:18 0/0:0,0,0:15 0/0:0,18,79:33 0/0:0,12,76:27 0/0:0,12,29:27 0/0:0,18,38:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,9,36:24 0/0:0,12,66:27 0/0:0,21,163:36 0/0:0,24,151:39 0/0:0,15,123:30 0/0:0,69,241:84 0/0:0,2,64:17 0/0:0,36,164:51 0/1:80,0,113:65 0/0:0,10,88:25 0/0:0,18,75:33 0/0:0,21,78:36 0/0:0,18,134:33 0/0:0,21,145:36 0/0:0,24,124:39 0/0:0,93,255:99 0/0:0,24,160:39
chr12 6956417 . ctttttttttttttt cTTtttttttttttttt 999 . INDEL;DP=948;VDB=0.0430;AF1=0.3136;G3=0.6504,4.231e-06,0.3496;HWE=2.06e-08;AC1=23;DP4=93,62,53,53;MQ=43;FQ=999;PV4=0.13,1,2.7e-05,1 GT:PL:GQ 0/1:84,82,80:3 1/1:85,33,0:27 1/1:91,78,60:12 1/1:49,27,0:21 0/1:32,19,13:3 0/0:57,60,51:3 1/1:56,18,3:9 1/1:52,21,9:7 1/1:69,39,28:6 1/1:69,53,40:7 1/1:71,27,0:21 0/0:0,9,17:10 0/0:0,3,4:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,18,22:18 0/0:0,18,47:19 0/0:0,12,12:12 0/0:0,18,21:18 0/0:0,0,0:3 0/0:0,12,17:12 0/0:0,15,34:16 0/0:0,21,38:21 0/0:0,24,52:24 0/0:0,15,29:16 0/0:0,60,62:60 0/0:0,15,35:16 0/0:0,33,33:33 0/1:5,0,4:5 0/0:0,27,33:27 0/1:19,1,0:6 0/0:0,12,20:13 0/0:0,15,20:15 0/0:0,15,30:16 0/0:0,15,13:14 0/0:0,60,66:60 0/0:0,27,39:27
chr12 6956509 . C T 78.5 . DP=840;VDB=0.0361;AF1=0.02811;AC1=2;DP4=416,267,5,4;MQ=57;FQ=78.6;PV4=0.74,0.35,0.019,0.35 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,54,255:66 0/0:0,105,255:99 0/0:0,57,255:69 0/0:0,54,255:66 0/0:0,33,255:45 0/0:0,36,231:48 0/0:0,60,255:72 0/0:0,33,216:45 0/0:0,57,255:69 0/0:0,81,255:93 0/0:0,21,127:33 0/0:0,0,0:13 0/0:0,42,236:54 0/0:0,84,255:96 0/0:0,21,156:33 0/0:0,33,221:45 0/0:0,33,177:45 0/1:112,0,255:99 0/1:27,0,84:15 0/0:0,30,232:42 0/0:0,54,255:66 0/0:0,36,255:48 0/0:0,78,255:90 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,78,255:90 0/0:0,90,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,36,255:48 0/0:0,48,255:60 0/0:0,90,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:75
chr12 6956619 . C T 999 . DP=841;VDB=0.0355;AF1=0.3096;G3=0.6857,4.237e-08,0.3143;HWE=6.14e-11;AC1=22;DP4=248,273,121,98;MQ=41;FQ=999;PV4=0.064,2.1e-118,1,1 GT:PL:GQ 1/1:213,53,0:46 1/1:242,51,0:44 1/1:246,75,0:68 1/1:226,66,0:59 1/1:182,19,0:13 1/1:193,32,0:26 1/1:182,30,0:24 1/1:235,35,0:29 1/1:148,12,0:7 1/1:152,18,0:12 1/1:231,64,0:57 0/0:0,60,255:60 0/0:0,18,66:19 0/0:0,0,0:3 0/0:0,66,255:66 0/0:0,48,241:48 0/0:0,36,104:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,24,131:24 0/0:0,66,255:66 0/0:0,27,149:27 0/0:0,30,200:30 0/0:0,51,255:51 0/0:0,33,255:33 0/0:0,84,255:84 0/0:0,105,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,69,255:69 0/0:0,84,255:84 0/0:0,87,255:87 0/0:0,87,255:87 0/0:0,48,255:48 0/0:0,27,191:27 0/0:0,93,255:93 0/0:0,96,255:96 0/0:0,54,255:54
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chr12 6956677 . ttctatctatctatctatttatctatctatctatctatctatctatctat tTCTAtctatctatctatctatttatctatctatctatctatctatctatctat 999 . INDEL;DP=743;VDB=0.0388;AF1=0.08472;AC1=6;DP4=131,139,22,15;MQ=50;FQ=999;PV4=0.22,7.5e-06,0.035,0.15 GT:PL:GQ 0/0:0,15,90:22 0/0:0,0,0:8 0/1:19,0,144:12 0/0:0,39,255:46 0/0:0,21,209:28 0/0:0,0,0:8 0/0:0,33,255:40 0/0:0,21,149:28 0/0:0,6,66:14 0/0:11,20,73:16 0/0:0,0,0:8 0/0:0,24,243:31 0/0:0,9,101:16 0/0:0,0,0:8 0/0:0,33,255:40 0/0:0,30,255:37 0/0:0,18,198:25 0/0:38,62,255:31 0/0:0,12,132:19 0/0:0,21,142:28 0/0:0,18,158:25 0/1:209,0,103:99 0/1:147,44,32:4 0/0:0,3,32:11 0/1:52,0,49:45 0/1:23,8,97:8 0/0:48,90,255:49 0/0:0,36,255:43 0/0:0,21,147:28 0/0:0,72,255:79 0/0:0,24,165:31 0/0:0,36,255:43 0/0:0,30,255:37 0/0:0,51,255:58 0/0:0,75,255:82 0/0:0,21,255:28
chr12 6956683 . ctatctat cTATCTATTtatctat 124 . INDEL;DP=760;VDB=0.0403;AF1=0.05483;AC1=4;DP4=206,222,9,13;MQ=50;FQ=125;PV4=0.66,0.026,0.00073,7.9e-12 GT:PL:GQ 0/0:0,18,161:27 0/0:0,51,225:60 0/0:0,25,255:34 0/0:0,48,255:57 0/0:0,30,255:39 0/0:0,12,78:21 0/0:0,39,255:48 0/0:0,33,255:42 0/0:0,12,147:21 0/0:0,15,127:24 0/0:0,39,234:48 0/0:0,30,255:39 0/0:0,18,156:27 0/0:0,0,0:10 0/0:0,42,255:51 0/0:0,33,255:42 0/0:0,18,222:27 0/1:99,0,255:90 0/0:0,24,149:33 0/0:0,30,159:39 0/0:0,24,176:33 0/1:69,0,147:60 0/0:0,6,56:16 0/1:15,0,45:7 0/0:0,21,233:30 0/0:0,21,203:30 0/0:0,84,255:93 0/0:0,42,255:51 0/0:0,16,255:25 0/0:0,78,255:87 0/1:31,0,255:22 0/0:0,36,255:45 0/0:0,33,255:42 0/0:0,51,255:60 0/0:0,84,255:93 0/0:0,24,255:33
chr12 6956691 . C T 23.6 . DP=800;VDB=0.0102;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=321,322,3,3;MQ=46;FQ=23.7;PV4=1,2.2e-07,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:81 0/0:0,57,229:72 0/0:0,84,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,211:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,48,255:63 0/0:0,27,181:42 0/0:0,33,183:48 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,237:60 0/0:0,18,129:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,57,252:72 0/1:69,0,116:54 0/0:0,18,170:33 0/0:0,51,231:66 0/0:0,27,131:42 0/0:0,42,157:57 0/0:0,33,169:48 0/0:0,27,194:42 0/0:0,27,243:42 0/0:0,12,108:27 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,148,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,120,255:99 0/0:0,24,232:39
chr12 6956691 . ctatttat ctat 999 . INDEL;DP=800;VDB=0.0409;AF1=0.164;AC1=12;DP4=166,168,29,33;MQ=48;FQ=999;PV4=0.68,0.057,1,0.026 GT:PL:GQ 0/0:0,15,65:19 0/0:0,0,0:5 0/1:10,0,216:7 0/1:52,0,225:48 0/1:39,0,197:35 0/0:0,12,63:16 0/1:38,0,224:34 0/0:0,21,73:25 0/0:0,15,63:19 0/0:0,6,35:11 0/0:3,0,68:4 0/0:0,21,138:25 0/0:0,15,80:19 0/0:0,0,0:5 0/0:0,13,220:17 0/0:0,30,255:34 0/0:0,18,138:22 0/0:0,24,167:28 0/0:0,21,98:25 0/0:4,0,92:3 0/0:0,27,127:31 0/1:27,0,137:23 0/1:80,6,0:6 0/0:0,6,67:11 0/1:116,0,33:43 0/1:184,0,54:64 0/1:255,0,255:99 0/0:0,23,196:27 0/0:0,54,255:58 0/0:0,87,226:91 0/0:0,27,255:31 0/1:12,0,255:9 0/0:0,23,255:27 0/0:0,66,255:70 0/0:0,73,255:77 0/0:0,27,255:31
chr12 6956695 . T C 999 . DP=788;VDB=0.0242;AF1=0.38;G3=0.2737,0.6694,0.05697;HWE=0.0173;AC1=27;DP4=199,209,109,102;MQ=46;FQ=999;PV4=0.5,5.8e-151,0.31,0.00011 GT:PL:GQ 0/1:87,0,125:88 1/1:151,45,0:40 0/1:105,0,221:99 0/0:0,18,255:17 0/1:35,0,245:36 0/1:51,0,92:52 0/1:25,0,255:26 0/1:65,0,174:66 0/1:54,0,72:55 0/1:58,0,71:59 1/1:142,33,0:28 0/0:0,12,152:11 0/0:0,15,83:14 0/1:0,0,0:3 0/1:1,0,177:4 0/0:0,25,241:24 0/0:0,18,170:17 0/1:1,0,183:4 0/0:0,15,109:14 0/1:0,0,86:3 0/0:0,16,136:15 0/1:40,0,153:41 0/1:39,0,89:40 0/1:31,0,30:30 0/1:124,0,199:99 0/1:43,0,255:44 0/1:42,0,255:43 0/1:10,0,203:11 0/1:119,0,154:99 0/1:61,0,236:62 0/1:136,0,79:84 0/1:18,0,222:19 0/1:3,0,255:5 0/1:41,0,245:42 0/0:0,72,255:71 0/0:0,30,251:29
chr12 6956695 . ttatctatctatctatctatctatctatctat tTATCtatctatctatctatctatctatctatctat 999 . INDEL;DP=788;VDB=0.0406;AF1=0.5639;AC1=41;DP4=41,44,97,96;MQ=39;FQ=999;PV4=0.8,1,4.3e-07,1 GT:PL:GQ 1/1:85,21,0:19 0/1:0,0,0:3 1/1:101,50,14:34 0/0:23,50,196:23 0/0:0,33,204:29 1/1:120,3,0:4 0/1:28,0,157:32 0/1:49,49,49:3 1/1:44,32,29:3 0/1:24,24,24:3 0/1:0,0,0:3 1/1:24,24,21:3 0/0:0,6,7:3 0/1:0,0,0:3 0/1:21,21,21:3 0/1:30,0,121:34 0/1:0,0,0:3 1/1:103,85,82:4 0/0:0,5,5:2 1/1:59,65,59:3 0/1:0,3,9:3 0/1:88,42,58:18 1/1:166,12,0:10 0/1:56,56,56:3 1/1:122,21,0:19 1/1:255,48,0:46 1/1:230,167,155:10 1/1:93,72,69:4 0/0:64,91,255:23 1/1:72,15,3:10 0/0:75,87,208:9 0/1:35,25,221:14 0/1:128,65,255:67 0/1:47,47,47:3 0/1:112,113,255:5 0/0:0,21,241:17
chr12 6956711 . ctat cTATAtat 999 . INDEL;DP=877;VDB=0.0412;AF1=0.04385;AC1=3;DP4=241,252,25,10;MQ=45;FQ=999;PV4=0.013,1,0.014,1 GT:PL:GQ 0/0:0,11,173:21 0/0:0,51,192:61 0/0:0,7,199:17 0/0:0,72,255:82 0/0:0,84,255:94 0/1:65,0,113:55 0/0:0,66,255:76 0/0:0,36,153:46 0/0:0,28,165:38 0/0:0,30,148:40 0/0:0,66,240:76 0/0:0,30,141:40 0/0:0,12,29:22 0/0:0,0,0:11 0/0:0,45,181:55 0/0:0,33,209:43 0/0:0,6,30:16 0/0:0,27,129:37 0/0:0,15,44:25 0/0:0,45,201:55 0/0:0,24,80:34 0/0:0,28,187:38 0/1:135,0,86:99 0/0:0,9,60:19 0/0:0,27,148:37 0/1:255,0,184:99 0/0:0,60,232:70 0/0:0,57,199:67 0/0:0,60,255:70 0/0:0,99,247:99 0/0:0,30,226:40 0/0:0,45,199:55 0/0:0,30,204:40 0/0:0,72,255:82 0/0:0,48,255:58 0/0:0,33,241:43
chr12 6956715 . ct c 148 . INDEL;DP=870;VDB=0.0410;AF1=0.02872;AC1=2;DP4=296,327,5,5;MQ=46;FQ=148;PV4=1,0.41,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:87 0/0:0,69,239:81 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,102,255:99 0/0:0,39,214:51 0/0:0,81,255:93 0/0:0,48,241:60 0/0:0,48,242:60 0/0:0,39,216:51 0/0:0,72,255:84 0/0:0,36,153:48 0/0:0,12,29:24 0/0:0,0,0:12 0/0:0,54,254:66 0/0:0,51,255:63 0/0:0,9,69:21 0/0:0,42,247:54 0/0:0,21,81:33 0/0:0,51,237:63 0/0:0,33,110:45 0/0:0,39,253:51 0/0:0,12,141:24 0/1:35,0,61:23 0/1:181,0,152:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,69,255:81 0/0:0,114,255:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,54,255:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,78,255:90 0/0:0,57,255:69 0/0:0,33,255:45
chr12 6956716 . tatctatc tATCatctatc 999 . INDEL;DP=866;VDB=0.0412;AF1=0.05833;AC1=4;DP4=221,278,29,16;MQ=45;FQ=999;PV4=0.012,1,0.0079,1 GT:PL:GQ 0/0:0,20,254:29 0/0:0,45,227:54 0/0:0,72,255:81 0/0:0,63,255:72 0/0:0,99,255:99 0/1:47,0,135:38 0/0:0,54,255:63 0/0:0,33,241:42 0/0:0,25,231:34 0/0:0,36,218:45 0/0:0,66,255:75 0/0:0,30,139:39 0/0:0,9,11:18 0/0:0,0,0:9 0/0:0,39,206:48 0/0:0,39,255:48 0/0:0,6,70:15 0/0:0,39,254:48 0/0:0,15,76:24 0/0:0,36,229:45 0/0:0,21,76:30 0/0:0,33,255:42 0/1:81,0,99:72 0/0:8,14,66:15 0/1:145,0,132:99 0/1:125,0,255:99 0/0:0,57,255:66 0/0:0,66,255:75 0/0:0,66,255:75 0/0:0,90,255:99 0/0:0,39,255:48 0/0:0,51,255:60 0/0:58,94,255:45 0/0:0,60,255:69 0/0:48,96,255:57 0/0:0,30,255:39
chr12 6956723 . ctatttat ctat 999 . INDEL;DP=843;VDB=0.0364;AF1=0.1103;AC1=8;DP4=177,191,17,21;MQ=46;FQ=999;PV4=0.74,1,0.22,0.0016 GT:PL:GQ 0/1:90,4,0:9 0/1:16,3,0:6 0/0:0,21,77:27 0/0:0,24,126:30 0/0:6,0,223:3 0/1:18,0,23:12 0/0:0,33,235:39 0/1:19,0,0:10 0/0:0,6,16:12 0/0:0,0,0:7 0/1:103,12,0:3 0/0:0,42,203:48 0/0:0,5,32:11 0/0:0,0,0:7 0/0:0,27,146:33 0/0:0,18,205:24 0/0:0,9,87:15 0/0:0,36,205:42 0/0:0,12,62:18 0/0:0,51,213:57 0/0:0,27,89:33 0/0:0,0,139:7 0/0:0,9,81:15 0/0:0,12,79:18 0/1:65,0,102:59 0/0:0,12,235:18 0/0:0,9,199:15 0/0:0,31,195:37 0/0:0,54,255:60 0/0:0,99,250:99 0/0:0,39,244:45 0/0:0,54,241:60 0/0:0,48,254:54 0/0:0,57,242:63 0/0:0,16,255:22 0/0:0,30,226:36
chr12 6956727 . T C 999 . DP=845;VDB=0.0181;AF1=0.3928;G3=0.5791,0.107,0.314;HWE=1.29e-05;AC1=28;DP4=211,211,119,118;MQ=46;FQ=999;PV4=1,1.7e-201,0.11,1 GT:PL:GQ 1/1:175,39,0:34 1/1:133,33,0:28 1/1:223,66,0:61 1/1:209,66,0:61 1/1:226,73,0:68 1/1:113,15,0:10 1/1:192,72,0:67 1/1:129,39,0:34 1/1:154,51,0:46 1/1:126,27,0:22 1/1:168,45,0:40 0/0:0,28,210:27 0/0:0,5,39:5 0/1:0,0,0:3 0/0:0,36,197:35 0/0:0,45,255:44 0/0:0,9,102:9 0/0:0,54,255:53 0/0:0,18,69:17 0/0:0,35,255:34 0/0:0,27,105:26 0/1:84,0,150:85 0/0:0,27,229:26 0/1:2,0,136:5 0/0:0,105,255:99 0/0:0,92,255:91 0/1:10,0,255:11 0/1:1,0,253:4 0/1:9,0,255:11 0/1:28,0,255:29 0/0:0,60,255:59 0/0:0,30,255:29 0/0:0,44,255:43 0/0:0,40,255:39 0/0:0,53,255:52 0/0:0,33,255:32
chr12 6956771 . ttatgtat ttat 999 . INDEL;DP=848;VDB=0.0358;AF1=0.2827;G3=0.6851,0.05855,0.2563;HWE=3.97e-07;AC1=20;DP4=249,190,96,97;MQ=56;FQ=999;PV4=0.12,8.2e-23,6.6e-25,1 GT:PL:GQ 1/1:255,66,0:59 1/1:255,33,0:26 1/1:255,96,0:89 0/1:255,0,255:99 1/1:255,84,0:77 1/1:255,39,0:32 0/1:255,0,255:99 1/1:255,57,0:50 1/1:255,45,0:38 1/1:255,9,0:4 1/1:255,54,0:47 0/0:0,39,255:40 0/0:0,15,255:16 0/0:0,0,0:3 0/0:0,27,255:28 0/0:0,30,255:31 0/0:0,24,255:25 0/0:0,84,255:85 0/0:0,9,105:10 0/0:0,51,255:52 0/0:0,42,255:43 0/0:0,30,255:31 0/0:0,18,255:19 0/0:0,12,220:13 0/0:0,93,255:94 0/0:0,117,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,75,255:76 0/0:0,75,255:76 0/0:0,96,255:97 0/0:0,69,255:70 0/0:0,54,255:55 0/0:0,60,255:61 0/0:0,51,255:52 0/0:0,48,255:49 0/0:0,24,255:25
chr12 6956775 . G C 999 . DP=578;VDB=0.0329;AF1=0.1451;G3=0.7946,0.03794,0.1675;HWE=0.000264;AC1=10;DP4=279,192,12,14;MQ=56;FQ=999;PV4=0.22,8.4e-29,7.5e-63,7.7e-16 GT:PL:GQ 1/1:74,18,0:8 1/1:66,15,0:6 0/1:36,6,0:6 0/0:0,35,255:40 0/1:17,3,0:7 0/1:56,6,0:6 0/0:0,16,255:21 0/0:0,0,0:6 0/1:46,9,0:4 0/0:1,0,128:5 0/1:61,0,25:36 0/0:0,48,255:53 0/0:0,15,161:20 0/0:0,0,0:6 0/0:0,33,255:38 0/0:0,33,255:38 0/0:0,24,230:29 0/0:0,75,255:80 0/0:0,12,131:17 0/0:0,48,255:53 0/0:0,42,255:47 0/0:0,36,255:41 0/0:0,21,204:26 0/0:0,21,202:26 0/0:0,93,255:98 0/0:0,144,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,87,255:92 0/0:0,69,255:74 0/0:0,99,255:99 0/0:0,72,255:77 0/0:0,54,255:59 0/0:0,54,255:59 0/0:0,54,255:59 0/0:0,51,255:56 0/0:0,24,223:29
chr12 6956802 . atctt at 999 . INDEL;DP=794;VDB=0.0366;AF1=0.2275;G3=0.6832,0.1534,0.1634;HWE=0.00331;AC1=16;DP4=211,101,24,29;MQ=50;FQ=999;PV4=0.0029,7.6e-15,6.9e-21,1 GT:PL:GQ 1/1:99,18,0:10 1/1:96,21,0:13 1/1:75,15,0:8 0/1:31,0,71:29 0/1:43,0,25:33 0/1:57,8,0:3 0/1:32,0,42:30 1/1:62,15,3:5 0/1:19,0,23:17 1/1:66,21,9:5 0/1:26,0,24:23 0/0:0,27,184:29 0/0:0,9,70:12 0/0:0,0,0:4 0/0:0,18,167:20 0/0:0,18,134:20 0/0:0,12,110:14 0/0:0,45,234:47 0/0:0,6,63:9 0/0:0,27,182:29 0/0:0,30,190:32 0/0:0,9,81:12 0/0:0,15,96:17 0/0:0,15,123:17 0/0:0,63,255:65 0/0:0,63,255:65 0/0:0,69,255:71 0/0:0,75,255:77 0/0:0,84,255:86 0/0:0,72,255:74 0/0:0,39,202:41 0/0:0,36,236:38 0/0:0,39,229:41 0/0:0,54,230:56 0/0:0,42,236:44 0/0:0,12,100:14
chr12 6956804 . ctttttttttttttttt cttttttttttttt 999 . INDEL;DP=770;VDB=0.0361;AF1=0.3706;G3=0.6428,1.067e-06,0.3572;HWE=7.82e-09;AC1=26;DP4=93,37,65,33;MQ=43;FQ=999;PV4=0.47,1,5.2e-14,1 GT:PL:GQ 1/1:108,24,0:19 1/1:114,33,0:28 1/1:95,21,0:16 1/1:96,25,0:20 1/1:64,15,0:10 1/1:47,9,0:5 1/1:53,22,7:10 1/1:85,21,0:16 1/1:42,17,11:3 1/1:57,18,3:10 1/1:70,18,0:13 0/0:0,9,14:9 0/0:0,6,16:6 0/1:0,0,0:3 0/0:0,12,19:11 0/0:0,6,12:6 0/0:0,3,6:4 0/0:0,9,16:9 0/0:0,3,6:4 0/0:0,3,6:4 0/1:0,0,0:3 0/0:0,9,16:9 0/0:0,6,11:6 0/0:0,9,16:9 0/0:0,33,33:31 0/0:1,4,4:4 0/0:0,39,21:25 0/0:0,36,33:33 0/0:0,51,32:36 0/0:0,27,36:26 0/0:0,33,38:32 0/0:0,6,12:6 0/0:0,18,29:17 0/0:0,21,24:20 0/0:0,18,25:17 0/1:0,0,0:3
chr12 6956818 . tttg t 999 . INDEL;DP=799;VDB=0.0373;AF1=0.1939;G3=0.6848,0.1342,0.1809;HWE=0.0303;AC1=14;DP4=214,101,34,17;MQ=43;FQ=999;PV4=0.87,2.6e-14,0.015,1 GT:PL:GQ 1/1:87,15,0:7 0/1:44,1,0:9 0/1:33,0,2:11 0/1:57,0,23:32 0/1:44,1,0:9 0/1:23,3,0:7 0/1:26,0,3:12 0/1:57,8,0:4 0/1:24,2,0:8 0/1:47,9,0:3 0/1:33,0,17:25 0/0:0,36,72:39 0/0:0,12,36:15 0/0:0,0,0:5 0/0:0,27,86:30 0/0:0,15,58:18 0/0:0,27,27:30 0/0:0,24,88:27 0/0:0,30,21:30 0/0:0,18,60:21 0/0:0,33,30:35 0/0:0,15,69:18 0/0:0,18,77:21 0/0:0,9,44:12 0/0:0,75,152:78 0/0:0,44,152:47 0/0:0,57,154:60 0/0:0,63,146:66 0/0:0,81,158:84 0/0:0,57,145:60 0/0:0,39,136:42 0/0:0,27,124:30 0/0:0,30,122:33 0/0:0,60,142:63 0/0:0,42,131:45 0/0:0,15,77:18
chr12 6956859 . A G 999 . DP=741;VDB=0.0298;AF1=0.9464;G3=0.08693,0.03318,0.8799;HWE=0.00224;AC1=69;DP4=177,45,151,185;MQ=16;FQ=126;PV4=1.2e-16,7e-100,1,1 GT:PL:GQ 1/1:138,53,0:62 1/1:132,15,0:24 1/1:112,14,0:23 1/1:74,15,0:24 1/1:122,15,0:24 1/1:100,13,0:22 1/1:69,5,0:14 1/1:171,26,0:35 1/1:125,16,0:25 1/1:90,11,0:20 1/1:82,7,0:16 1/1:43,8,0:17 1/1:0,18,12:10 1/1:0,0,0:9 1/1:12,19,0:27 1/1:50,5,0:14 1/1:0,21,18:6 1/1:37,7,0:16 1/1:0,36,11:13 1/1:40,4,0:13 0/0:0,54,33:10 1/1:86,21,0:30 1/1:77,8,0:17 1/1:42,2,0:11 1/1:137,42,0:51 1/1:131,37,0:46 1/1:93,8,0:17 1/1:103,17,0:26 1/1:65,17,0:26 1/1:89,25,0:34 1/1:14,5,0:14 1/1:8,1,0:10 1/1:92,15,0:24 1/1:52,8,0:17 0/1:35,0,166:50 1/1:64,18,0:27
chr12 6956864 . G A 33.6 . DP=754;VDB=0.0156;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=351,206,5,9;MQ=16;FQ=33.7;PV4=0.05,2.4e-09,1,0.00019 GT:PL:GQ 0/0:0,66,150:81 0/0:0,51,169:66 0/0:0,51,121:66 0/0:0,60,96:75 0/0:0,63,140:78 0/0:0,36,85:51 0/0:0,24,78:39 0/0:0,75,231:90 0/0:0,27,108:42 0/0:0,30,118:45 0/0:0,32,88:47 0/0:0,66,54:81 0/0:0,24,13:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,52:75 0/0:0,45,65:60 0/0:0,21,13:36 0/0:0,66,64:81 0/0:0,42,11:47 0/0:0,39,64:54 0/0:0,36,11:46 0/0:0,57,153:72 0/0:0,42,93:57 0/0:0,15,61:30 0/0:0,57,165:72 0/0:0,54,158:69 0/0:0,114,142:99 0/1:79,0,47:62 0/0:0,72,94:87 0/0:0,72,100:87 0/0:0,18,52:33 0/0:0,21,45:36 0/0:0,48,116:63 0/0:0,37,90:52 0/0:0,63,219:78 0/0:0,18,86:33
chr12 6957035 . T C 55.6 . DP=1115;VDB=0.0248;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=561,354,8,5;MQ=32;FQ=55.6;PV4=1,2.2e-05,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,93,255:99 0/1:101,0,211:86 0/0:0,66,227:81 0/0:0,48,231:63 0/0:0,141,255:99 0/0:0,60,92:75 0/0:0,33,25:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,75,255:90 0/0:0,63,162:78 0/0:0,15,12:30 0/0:0,54,168:69 0/0:0,36,19:50 0/0:0,54,244:69 0/0:0,54,25:61 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,204:42 0/0:0,123,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,57,255:72 0/0:0,81,255:96 0/0:0,99,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,99,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,33,183:48
chr12 6957084 . C T 108 . DP=1100;VDB=0.0057;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=496,391,39,49;MQ=42;FQ=108;PV4=0.043,1e-80,1.4e-41,0.21 GT:PL:GQ 0/0:0,42,255:57 0/0:0,102,255:99 0/0:0,47,255:62 0/0:0,23,255:38 0/0:0,22,255:37 0/0:0,58,248:73 0/0:0,20,255:35 0/0:0,38,255:53 0/0:0,18,255:33 0/0:0,32,255:47 0/0:0,37,255:52 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,231:51 0/0:0,0,0:15 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,210:63 0/0:0,54,255:69 0/0:0,39,180:54 0/0:0,84,255:99 0/0:0,48,243:63 0/1:153,0,230:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,24,217:39 0/0:0,138,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,108,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,255:51 0/0:0,96,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,42,230:57
chr12 6957101 . C A 999 . DP=957;VDB=0.0308;AF1=0.02857;G3=0.9714,3.337e-08,0.02857;HWE=0.00258;AC1=2;DP4=506,327,17,21;MQ=44;FQ=999;PV4=0.062,0.041,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,54,233:66 0/0:0,78,255:90 0/0:0,78,253:90 0/0:0,45,240:57 0/0:0,63,255:75 0/0:0,57,255:69 0/0:0,42,255:54 0/0:0,111,255:99 0/0:0,57,255:69 0/0:0,42,255:54 0/0:0,0,0:12 0/0:0,54,255:66 0/0:0,57,255:69 0/0:0,51,233:63 0/0:0,63,255:75 0/0:0,42,202:54 0/0:0,78,255:90 0/0:0,57,255:69 0/0:0,93,255:99 0/0:0,69,255:81 0/0:0,27,232:39 0/0:0,138,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,81,255:93 1/1:255,114,0:96 0/0:0,102,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,81,255:93 0/0:0,108,255:99 0/0:0,45,255:57
chr12 6957105 . ctttttttttt cTTtttttttttt 999 . INDEL;DP=942;VDB=0.0425;AF1=0.2891;G3=0.7047,3.835e-07,0.2953;HWE=4.38e-10;AC1=21;DP4=258,192,118,64;MQ=44;FQ=999;PV4=0.089,1,3.4e-22,1 GT:PL:GQ 1/1:124,58,16:35 1/1:159,84,0:77 1/1:126,30,0:23 1/1:115,85,77:4 1/1:140,54,0:47 1/1:121,51,0:44 0/0:161,161,161:3 1/1:152,113,95:11 1/1:145,51,0:44 1/1:125,80,65:9 1/1:190,138,111:20 0/0:0,45,79:46 0/0:0,36,70:37 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,72:58 0/0:0,48,70:49 0/0:0,33,44:34 0/0:0,48,62:49 0/0:0,21,39:22 0/0:0,51,73:52 0/0:0,48,58:49 0/0:0,84,89:85 0/0:0,66,79:67 0/0:0,27,62:28 0/0:0,105,96:99 0/0:0,102,80:88 0/0:0,84,80:83 0/0:0,69,64:68 0/0:0,60,74:61 0/0:0,93,92:93 0/0:0,78,90:79 0/0:0,54,75:55 0/0:0,27,58:28 0/0:0,3,10:5 0/0:0,69,91:70 0/0:0,39,78:40
chr12 6957107 . tt tTAt 79.7 . INDEL;DP=977;VDB=0.0410;AF1=0.0966;AC1=7;DP4=339,262,27,12;MQ=46;FQ=80.2;PV4=0.13,9.7e-39,0.00013,1 GT:PL:GQ 0/1:44,0,68:37 0/1:27,0,84:20 0/1:10,0,56:5 0/0:0,2,44:9 0/1:16,0,64:10 0/1:23,0,52:16 0/0:0,9,49:16 0/0:0,1,44:8 0/1:54,0,14:27 0/1:17,0,25:11 0/0:0,14,81:21 0/0:0,51,171:58 0/0:0,39,153:46 0/0:0,0,0:7 0/0:0,57,162:64 0/0:0,57,164:64 0/0:0,45,100:52 0/0:0,57,159:64 0/0:0,33,109:40 0/0:0,69,175:76 0/0:0,54,141:61 0/0:0,96,199:99 0/0:0,69,178:76 0/0:0,30,131:37 0/0:0,129,209:99 0/0:0,126,194:99 0/0:0,93,193:99 0/0:0,84,170:91 0/0:0,78,187:85 0/0:0,111,208:99 0/0:0,87,201:94 0/0:0,63,168:70 0/0:0,33,144:40 0/0:0,21,100:28 0/0:0,102,202:99 0/0:0,42,161:49
chr12 6957128 . T C 999 . DP=1124;VDB=0.0198;AF1=0.3115;G3=0.6857,2.411e-08,0.3143;HWE=5.28e-11;AC1=22;DP4=403,240,177,120;MQ=32;FQ=999;PV4=0.39,3.4e-149,2.7e-27,1 GT:PL:GQ 1/1:157,73,0:67 1/1:186,58,0:52 1/1:139,19,0:13 1/1:92,24,0:18 1/1:162,53,0:47 1/1:127,37,0:31 1/1:150,32,0:26 1/1:114,23,0:17 1/1:143,58,0:52 1/1:91,15,0:9 1/1:140,48,0:42 0/0:0,53,255:53 0/0:0,21,98:21 0/0:0,0,0:3 0/0:0,69,255:69 0/0:0,75,230:75 0/0:0,39,104:39 0/0:0,56,214:56 0/0:0,33,76:33 0/0:0,25,188:25 0/0:0,66,122:66 0/0:0,114,255:99 0/0:0,56,255:56 0/0:0,27,213:27 0/0:0,79,255:79 0/0:0,78,255:78 0/0:0,45,255:45 0/0:0,87,255:87 0/0:0,48,255:48 0/0:0,77,255:77 0/0:0,53,255:53 0/0:0,53,255:53 0/0:0,23,245:23 0/0:0,21,222:21 0/0:0,72,255:72 0/0:0,32,255:32
chr12 6957166 . C T 10 . DP=1328;VDB=0.0236;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=558,413,11,4;MQ=21;FQ=10.1;PV4=0.29,4.1e-17,1,0.029 GT:PL:GQ 0/0:0,105,216:99 0/0:0,99,183:99 0/0:0,57,197:73 0/0:0,75,168:91 0/0:0,78,127:94 0/0:0,66,93:82 0/0:0,66,160:82 0/0:0,63,187:79 0/0:0,72,184:88 0/0:0,33,119:49 0/0:0,108,106:99 0/0:0,87,164:99 0/0:0,51,13:51 0/0:0,0,0:16 0/0:0,117,232:99 0/0:0,123,202:99 0/0:0,69,19:57 0/0:0,78,206:94 0/0:0,39,20:53 0/0:0,84,161:99 0/0:0,75,22:60 0/0:0,84,255:99 0/0:0,78,234:94 0/0:0,12,105:28 0/0:0,141,255:99 0/0:0,144,255:99 0/1:55,0,168:39 0/0:0,105,229:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,117,245:99 0/0:0,105,239:99 0/0:0,63,255:79 0/0:0,69,228:85 0/0:0,72,104:88 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,224:91
chr12 6957282 . G C 999 . DP=997;VDB=0.0355;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=547,382,8,14;MQ=39;FQ=999;PV4=0.047,0.31,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:87 0/0:0,78,255:93 0/0:0,81,255:96 0/0:0,78,255:93 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,78,255:93 0/0:0,87,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,81,255:96 0/0:0,87,255:99 0/0:0,45,73:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,80:75 0/0:0,69,167:84 0/0:0,66,77:81 0/0:0,69,221:84 0/0:0,72,67:87 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,21,209:36 0/0:0,111,255:99 0/0:0,187,255:99 0/0:0,126,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,48,255:63 0/0:0,51,255:66 0/0:0,78,255:93 0/0:0,66,255:81 0/0:0,54,255:69
chr12 6957437 . T C 999 . DP=1117;VDB=0.0370;AF1=0.05715;AC1=4;DP4=418,558,41,34;MQ=60;FQ=999;PV4=0.053,7.9e-161,0.094,1 GT:PL:GQ 0/0:0,132,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:69 0/0:0,81,255:90 0/0:0,99,255:99 0/0:0,87,255:96 0/0:0,36,255:45 0/0:0,105,255:99 0/0:0,69,255:78 0/0:0,27,252:36 0/0:0,0,0:10 0/0:0,84,255:93 0/0:0,60,255:69 0/0:0,66,255:75 0/0:0,105,255:99 0/0:0,57,255:66 0/0:0,66,255:75 0/0:0,63,255:72 0/1:98,0,255:89 0/1:57,0,255:48 0/0:0,27,236:36 0/1:132,0,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,148,255:99 0/1:135,0,255:99 0/0:0,75,255:84 0/0:0,132,255:99 0/0:0,87,255:96 0/0:0,45,255:54 0/0:0,57,255:66 0/0:0,88,255:97 0/0:0,108,255:99 0/0:0,75,255:84
chr12 6957465 . A G 999 . DP=1115;VDB=0.0015;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=523,498,10,5;MQ=59;FQ=999;PV4=0.3,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,144,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,81,255:96 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,66,255:81 0/0:0,111,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,27,252:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,87,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/0:0,63,255:78 0/0:0,78,255:93 0/0:0,63,255:78 0/0:0,24,220:39 0/0:0,190,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,117,255:99 0/1:255,0,192:99 0/0:0,163,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,42,255:57 0/0:0,57,255:72 0/0:0,99,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,63,255:78
chr12 6957501 . Gttttgtttttttt GTTTTGTTTTttttgtttttttt 999 . INDEL;DP=1122;VDB=0.0428;AF1=0.3154;G3=0.6857,2.177e-08,0.3143;HWE=4.79e-11;AC1=23;DP4=293,205,128,92;MQ=51;FQ=999;PV4=0.87,1,3.7e-26,1 GT:PL:GQ 1/1:255,75,0:69 1/1:255,99,0:93 1/1:250,27,0:21 1/1:255,78,0:72 1/1:255,54,0:48 1/1:255,54,0:48 1/1:198,22,0:16 1/1:255,81,0:75 1/1:255,51,0:45 1/1:255,57,24:27 1/1:255,75,0:69 0/0:0,42,194:42 0/0:0,9,68:10 0/0:0,0,0:3 0/0:0,51,211:51 0/0:0,66,216:66 0/0:0,36,173:36 0/0:0,78,241:78 0/0:0,33,166:33 0/0:0,42,163:42 0/0:0,39,190:39 0/0:0,54,226:54 0/0:0,45,198:45 0/0:0,21,114:21 0/0:0,105,219:99 0/0:0,63,238:63 0/0:0,111,255:99 0/0:0,93,209:93 0/0:0,129,241:99 0/0:0,132,198:99 0/0:0,69,216:69 0/0:0,33,179:33 0/0:0,45,187:45 0/0:0,78,226:78 0/0:0,75,236:75 0/0:0,45,206:45
chr12 6957506 . gtttttttttt gTTTTTTTTTtttttttttt 999 . INDEL;DP=1196;VDB=0.0441;AF1=0.2196;G3=0.6855,0.1334,0.1812;HWE=0.00296;AC1=16;DP4=322,221,138,100;MQ=47;FQ=999;PV4=0.75,1,9.9e-05,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,22:31 1/1:255,46,0:37 0/1:188,37,53:25 1/1:255,15,0:7 0/1:255,0,1:10 0/1:255,0,5:14 0/1:179,0,1:10 1/1:255,33,0:24 0/1:255,6,0:4 0/1:200,0,9:18 1/1:255,19,0:11 0/0:0,48,77:51 0/0:0,18,31:21 0/0:0,0,0:4 0/0:0,51,71:54 0/0:0,54,74:57 0/0:0,36,67:39 0/0:0,69,83:71 0/0:0,39,64:42 0/0:0,39,57:41 0/0:0,42,66:45 0/0:0,48,84:51 0/0:0,39,74:42 0/0:0,21,39:24 0/0:32,89,51:30 0/0:0,66,89:69 0/0:0,96,91:97 0/0:0,87,67:78 0/0:0,120,86:97 0/0:0,132,44:55 0/0:0,60,75:62 0/0:0,30,69:33 0/0:0,42,64:45 0/0:0,63,68:65 0/0:0,69,75:71 0/0:0,42,81:45
chr12 6957507 . tttttttt tTTTTTTTGttttttt 999 . INDEL;DP=1171;VDB=0.0443;AF1=0.1583;AC1=11;DP4=379,261,90,76;MQ=48;FQ=999;PV4=0.25,0.00038,0.052,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,87:97 0/1:255,0,2:13 0/1:142,0,35:45 0/1:255,0,17:27 0/1:255,0,52:62 0/1:255,0,31:41 0/1:142,0,35:45 0/1:255,0,8:18 0/1:255,0,66:76 0/1:186,0,55:65 0/1:255,0,48:58 0/0:0,51,255:55 0/0:0,18,140:22 0/0:0,0,0:5 0/0:0,60,255:64 0/0:0,72,255:76 0/0:0,39,255:43 0/0:0,84,255:88 0/0:0,39,255:43 0/0:0,48,255:52 0/0:0,45,255:49 0/0:0,57,255:61 0/0:0,51,255:55 0/0:0,24,255:28 0/0:0,69,255:73 0/0:0,102,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,78,255:82 0/0:0,33,255:37 0/0:0,48,255:52 0/0:0,84,255:88 0/0:0,78,255:82 0/0:0,54,255:58
chr12 6957521 . tagag tag 999 . INDEL;DP=1181;VDB=0.0426;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=511,301,12,14;MQ=41;FQ=999;PV4=0.1,0.1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,191:87 0/0:0,51,160:66 0/0:0,54,165:69 0/0:0,36,158:51 0/0:0,42,133:57 0/0:0,36,136:51 0/0:0,36,167:51 0/0:0,42,242:57 0/0:0,39,201:54 0/0:0,21,117:36 0/0:0,36,150:51 0/0:0,84,255:99 0/0:0,48,22:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,90,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,69,254:84 0/0:0,114,255:99 0/0:0,81,196:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,243:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,255:39 0/0:0,148,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,33,255:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,72,255:87 0/0:0,75,255:90 0/0:0,60,255:75
chr12 6957560 . G A 999 . DP=1029;VDB=0.0268;AF1=0.314;G3=0.6857,1.08e-08,0.3143;HWE=4.37e-11;AC1=22;DP4=313,191,148,98;MQ=38;FQ=999;PV4=0.63,5.7e-06,8.1e-10,1 GT:PL:GQ 1/1:246,69,0:63 1/1:211,54,0:48 1/1:239,75,0:69 1/1:246,81,0:75 1/1:255,72,0:66 1/1:182,48,0:42 1/1:255,60,0:54 1/1:255,50,0:44 1/1:236,57,0:51 1/1:125,20,0:14 1/1:240,78,0:72 0/0:0,66,253:66 0/0:0,48,158:48 0/0:0,0,0:3 0/0:0,84,255:84 0/0:0,51,166:51 0/0:0,51,177:51 0/0:0,75,255:75 0/0:0,45,43:44 0/0:0,69,184:69 0/0:0,33,101:33 0/0:0,66,255:66 0/0:0,42,255:42 0/0:0,18,163:18 0/0:0,120,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,75,255:75 0/0:0,102,255:99 0/0:0,69,255:69 0/0:0,30,189:30 0/0:0,30,255:30 0/0:0,21,169:21 0/0:0,45,255:45 0/0:0,72,255:72 0/0:0,45,255:45
chr12 6957604 . C T 72.1 . DP=892;VDB=0.0745;AF1=0.02524;G3=0.9714,2.909e-07,0.02857;HWE=0.00341;AC1=2;DP4=421,256,3,6;MQ=51;FQ=72.2;PV4=0.092,1,7.7e-09,0.046 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,75,255:88 0/0:0,69,255:82 0/0:0,108,255:99 0/0:0,84,255:97 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,69,255:82 0/0:0,51,255:64 0/0:0,20,178:33 0/0:0,60,255:73 0/0:0,66,255:79 0/0:0,33,237:46 0/0:0,0,0:13 0/0:0,84,255:97 0/0:0,39,255:52 0/0:0,24,129:37 0/0:0,51,255:64 1/1:137,24,0:6 0/0:0,36,255:49 0/0:0,24,192:37 0/0:0,60,255:73 0/0:0,48,247:61 0/0:0,21,190:34 0/0:0,81,255:94 0/0:0,117,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:91 0/0:0,48,253:61 0/0:0,81,255:94 0/0:0,33,208:46 0/0:0,27,223:40 0/0:0,21,192:34 0/0:0,42,255:55 0/0:0,60,255:73 0/0:0,30,240:43
chr12 6957619 . T A 999 . DP=920;VDB=0.0352;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.654e-07,0.3143;HWE=4.11e-11;AC1=22;DP4=287,284,147,149;MQ=56;FQ=999;PV4=0.89,5.3e-194,1.1e-06,1 GT:PL:GQ 1/1:255,84,0:78 1/1:239,75,0:69 1/1:249,90,0:84 1/1:255,117,0:99 1/1:255,99,0:93 1/1:247,102,0:96 1/1:234,72,0:66 1/1:254,87,0:81 1/1:238,69,0:63 1/1:152,30,0:24 1/1:225,60,0:54 0/0:0,69,255:69 0/0:0,39,255:39 0/0:0,0,0:3 0/0:0,87,255:87 0/0:0,54,255:54 0/0:0,36,251:36 0/0:0,57,255:57 0/0:0,39,255:39 0/0:0,42,255:42 0/0:0,33,255:33 0/0:0,69,255:69 0/0:0,60,255:60 0/0:0,36,255:36 0/0:0,111,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,144,255:99 0/0:0,42,255:42 0/0:0,33,255:33 0/0:0,36,255:36 0/0:0,75,255:75 0/0:0,72,255:72 0/0:0,45,255:45
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chr12 6957810 . GTCtct GTCTCTCtct 999 . INDEL;DP=821;VDB=0.0359;AF1=0.09844;AC1=7;DP4=239,269,35,38;MQ=49;FQ=999;PV4=0.9,1,2.4e-07,1 GT:PL:GQ 0/0:0,78,255:85 0/0:0,60,255:67 0/0:0,63,255:70 0/0:0,66,235:73 0/0:0,69,204:76 0/0:0,54,253:61 0/0:0,33,201:40 0/0:0,39,220:46 0/0:0,42,215:49 0/0:0,27,184:34 0/0:0,84,255:91 0/1:196,0,234:99 0/0:0,21,135:28 0/0:0,0,0:7 0/0:0,51,240:58 0/0:0,60,255:67 0/0:0,48,255:55 0/0:0,8,243:15 0/0:0,33,218:40 0/0:0,21,154:28 0/0:0,15,112:22 0/1:26,0,159:19 0/0:2,0,164:6 0/1:21,0,42:15 0/1:198,0,169:99 0/0:0,117,255:99 0/1:117,0,91:99 0/0:67,103,225:43 0/1:9,0,45:4 0/0:0,60,236:67 0/0:0,24,175:31 0/1:157,0,35:48 0/0:0,39,217:46 0/0:0,30,189:37 0/0:0,72,255:79 0/0:0,33,195:40
chr12 6957812 . Ctctatctatctatctatctatctatctatctatct CTCTCTCTAtctatctatctatctatctatctatctatctatct 999 . INDEL;DP=820;VDB=0.0359;AF1=0.4292;G3=0.5013,3.607e-05,0.4986;HWE=0.00154;AC1=31;DP4=11,23,59,74;MQ=40;FQ=999;PV4=0.25,1,0.024,1 GT:PL:GQ 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:37,37,37:3 0/1:0,0,0:3 0/1:20,20,20:3 0/1:0,0,0:3 0/1:60,60,60:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/0:0,18,117:17 0/0:0,15,95:14 0/0:45,69,176:23 0/1:0,0,0:3 1/1:167,84,78:4 0/0:0,6,40:6 0/1:31,31,31:3 0/0:0,12,90:11 0/1:64,42,39:4 1/1:255,102,21:76 0/1:165,165,165:3 1/1:233,101,74:22 0/1:171,155,152:4 0/1:77,77,77:3 0/1:186,186,186:3 0/1:35,3,0:4 0/1:29,29,29:3 0/1:106,106,106:3 0/1:0,0,0:3 0/0:72,100,255:27 0/1:31,31,31:3
chr12 6957813 . tcta tCTAGcta 999 . INDEL;DP=1061;VDB=0.0409;AF1=0.04323;AC1=3;DP4=283,332,17,13;MQ=50;FQ=999;PV4=0.27,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,78,255:88 0/0:0,48,246:58 0/0:0,51,247:61 0/0:0,66,240:76 0/0:0,57,180:67 0/0:0,51,253:61 0/0:0,33,203:43 0/0:0,36,213:46 0/0:0,39,215:49 0/0:0,24,173:34 0/0:0,78,255:88 0/1:200,0,233:99 0/0:0,18,105:28 0/0:0,0,0:11 0/0:0,51,237:61 0/0:0,60,255:70 0/0:0,48,255:58 0/0:0,7,241:18 0/0:0,33,221:43 0/0:0,21,154:31 0/0:0,15,115:25 0/0:0,28,175:38 0/0:0,51,255:61 0/0:0,18,121:28 0/0:0,90,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,78,249:88 0/1:255,0,93:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,27,197:37 0/1:157,0,89:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,18,137:28 0/0:0,87,255:97 0/0:0,36,201:46
chr12 6957816 . A C 999 . DP=1063;VDB=0.0156;AF1=0.05729;AC1=4;DP4=387,438,14,11;MQ=48;FQ=999;PV4=0.42,0.012,1,0.011 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,66,255:75 0/0:0,69,255:78 0/0:0,69,255:78 0/0:0,75,255:84 0/0:0,48,255:57 0/0:0,154,255:99 0/0:0,60,255:69 0/0:0,24,165:33 0/0:0,0,0:10 0/0:0,54,255:63 0/0:0,69,255:78 0/0:0,51,255:60 0/0:0,60,255:69 0/0:0,36,255:45 0/0:0,33,230:42 0/0:0,18,124:27 0/0:0,51,239:60 0/1:73,0,204:64 0/0:0,15,123:24 0/1:69,0,238:60 0/0:0,193,255:99 0/1:73,0,255:64 0/1:112,0,255:99 0/0:0,48,255:57 0/0:0,175,255:99 0/0:0,30,215:39 0/0:0,15,150:24 0/0:0,63,255:72 0/0:0,39,227:48 0/0:0,99,255:99 0/0:0,42,255:51
chr12 6957820 . atctatctatctatctatctatct aTCTATCTATCTGtctatctatctatctatctatct 999 . INDEL;DP=1047;VDB=0.0422;AF1=0.1507;AC1=11;DP4=222,261,28,41;MQ=46;FQ=999;PV4=0.44,1,0.00029,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,249:71 0/0:0,19,186:24 0/0:0,16,210:21 0/0:0,33,147:38 0/0:0,21,127:26 0/0:0,42,242:47 0/0:0,27,173:32 0/0:0,1,126:7 0/0:0,10,171:15 0/0:0,18,119:23 0/0:0,46,216:51 0/0:0,30,183:35 0/0:0,12,30:17 0/0:0,0,0:6 0/0:0,30,161:35 0/0:0,27,178:32 0/0:4,0,91:3 0/1:69,0,98:64 0/0:0,18,111:23 0/1:108,0,50:61 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,126:6 0/0:0,51,230:56 0/1:27,0,120:22 0/1:24,0,238:20 0/0:0,18,227:23 0/1:40,0,233:35 0/1:28,0,203:23 0/1:26,0,209:22 0/0:0,50,255:55 0/0:0,33,217:38 0/1:17,0,78:13 0/1:46,0,205:41 0/0:0,12,90:17 0/0:0,26,255:31 0/0:0,0,147:6
chr12 6957832 . A G 98.4 . DP=1103;VDB=0.0399;AF1=0.05637;AC1=4;DP4=390,458,4,12;MQ=48;FQ=98.7;PV4=0.13,0.25,0.011,7.1e-05 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,66,255:75 0/0:0,69,255:78 0/0:0,69,255:78 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:66 0/0:0,151,255:99 0/0:0,54,255:63 0/0:0,24,129:33 0/0:0,0,0:10 0/0:0,42,247:51 0/0:0,3,242:13 0/1:37,0,126:28 0/1:86,0,201:77 0/0:0,27,171:36 0/1:40,0,198:31 0/1:18,0,104:9 0/0:0,39,197:48 0/0:0,51,255:60 0/0:0,24,188:33 0/0:0,87,255:96 0/0:0,175,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,84,255:93 0/0:0,157,255:99 0/0:0,48,255:57 0/0:0,12,116:21 0/0:0,60,255:69 0/0:0,36,180:45 0/0:0,87,255:96 0/0:0,39,243:48
chr12 6957839 . tatctatct tAatctatct 999 . INDEL;DP=1113;VDB=0.0387;AF1=0.3201;G3=0.6851,1.106e-07,0.3149;HWE=6.13e-11;AC1=23;DP4=154,171,188,194;MQ=50;FQ=999;PV4=0.65,1,7.6e-08,1 GT:PL:GQ 1/1:255,57,3:48 1/1:255,87,0:81 1/1:255,141,66:69 1/1:255,255,207:39 1/1:255,240,138:96 1/1:255,148,112:30 1/1:255,57,0:51 1/1:255,57,6:45 1/1:255,255,190:56 1/1:255,33,0:27 1/1:255,86,5:75 0/0:186,216,255:30 0/0:0,21,128:21 0/0:0,0,0:3 0/0:0,33,224:33 0/0:42,60,186:18 0/0:0,6,63:7 0/0:1,25,183:24 0/0:0,18,145:18 0/0:30,57,235:27 0/0:0,27,188:27 0/0:0,24,149:24 0/0:0,27,214:27 0/0:0,24,174:24 0/0:0,75,255:75 0/0:0,132,255:99 0/0:32,111,255:79 0/0:242,255,255:13 0/0:0,72,255:72 0/0:139,253,255:99 0/0:0,24,197:24 0/0:132,144,217:13 0/0:0,33,215:33 0/0:13,28,109:15 0/0:10,64,255:54 0/0:0,21,163:21
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chr12 6958030 . G A 999 . DP=1015;VDB=0.0367;AF1=0.1858;AC1=13;DP4=434,316,128,76;MQ=60;FQ=999;PV4=0.23,6.7e-05,0.009,1 GT:PL:GQ 0/1:188,0,255:99 1/1:255,123,0:99 0/1:255,0,202:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:128,0,255:99 0/1:208,0,185:99 0/1:255,0,253:99 0/1:192,0,255:99 0/1:144,0,107:99 1/1:255,69,0:60 0/0:0,66,255:69 0/0:0,30,255:33 0/0:0,0,0:5 0/0:0,57,255:60 0/0:0,57,255:60 0/0:0,21,218:24 0/0:0,66,255:69 0/0:0,45,255:48 0/0:0,75,255:78 0/0:0,45,255:48 0/0:0,27,236:30 0/0:0,60,255:63 0/0:0,24,230:27 0/0:0,178,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,72,255:75 0/0:0,157,255:99 0/0:0,87,255:90 0/0:0,57,255:60 0/0:0,54,255:57 0/0:0,105,255:99 0/0:0,63,255:66 0/0:0,48,255:51
chr12 6958145 . C T 999 . DP=902;VDB=0.0308;AF1=0.1286;AC1=9;DP4=345,385,51,60;MQ=60;FQ=999;PV4=0.84,1e-175,0.0051,1 GT:PL:GQ 0/1:122,0,201:99 1/1:200,69,0:58 0/1:102,0,255:97 0/0:0,93,255:98 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:59 0/1:99,0,216:94 0/1:93,0,159:88 0/1:103,0,255:98 0/1:56,0,113:51 0/1:84,0,255:79 0/0:0,48,255:53 0/0:0,24,223:29 0/0:0,0,0:6 0/0:0,81,255:86 0/0:0,51,255:56 0/0:0,25,255:30 0/0:0,84,255:89 0/0:0,42,252:47 0/0:0,66,255:71 0/0:0,42,255:47 0/0:0,36,255:41 0/0:0,63,255:68 0/0:0,39,255:44 0/0:0,87,255:92 0/0:0,178,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,63,255:68 0/0:0,132,255:99 0/0:0,39,255:44 0/0:0,39,255:44 0/0:0,57,255:62 0/0:0,105,255:99 0/0:0,81,255:86 0/0:0,45,255:50
chr12 6958343 . A G 999 . DP=1059;VDB=0.0276;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=469,455,15,12;MQ=60;FQ=999;PV4=0.7,1.2e-12,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,69,255:84 0/0:0,87,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,66,255:81 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,228:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,81,255:96 0/0:0,45,255:60 0/0:0,51,255:66 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,39,255:54 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,30,241:45 0/0:0,175,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,123,255:99 0/1:220,0,211:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,129,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,75,255:90 0/0:0,36,255:51 0/0:0,116,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:96
chr12 6958404 . T G 999 . DP=897;VDB=0.0282;AF1=0.4035;G3=0.596,0.03215,0.3718;HWE=5.83e-09;AC1=29;DP4=75,321,91,255;MQ=60;FQ=999;PV4=0.017,1.5e-144,0.076,1 GT:PL:GQ 1/1:231,117,0:99 1/1:198,126,0:99 1/1:208,96,0:91 1/1:212,123,0:99 1/1:171,87,0:82 1/1:216,51,0:46 1/1:120,27,0:22 1/1:195,54,0:49 1/1:233,87,0:82 1/1:133,24,0:19 1/1:220,78,0:73 0/0:0,66,255:65 0/1:0,1,110:3 0/1:0,0,0:3 0/0:0,57,255:56 0/0:0,39,255:38 0/1:69,0,29:34 0/0:0,69,255:68 1/1:139,30,0:25 0/0:0,51,255:50 0/1:3,0,120:6 0/0:0,30,172:29 0/0:0,27,207:26 0/0:0,24,174:23 0/0:0,92,255:91 0/0:0,75,255:74 0/0:0,72,255:71 0/0:0,69,255:68 0/0:0,39,186:38 1/1:231,82,0:77 0/0:0,87,255:86 0/0:0,48,199:47 0/0:0,22,227:21 0/0:0,108,255:99 0/0:0,67,255:66 0/0:0,54,255:53
chr12 6958639 . G A 45.6 . DP=523;VDB=0.0230;AF1=0.0144;AC1=1;DP4=94,342,1,4;MQ=60;FQ=45.7;PV4=1,0.034,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,36,241:51 0/0:0,39,252:54 0/0:0,51,255:66 0/0:0,42,179:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,18,170:33 0/0:0,27,162:42 0/0:0,45,255:60 0/1:91,0,35:56 0/0:0,24,192:39 0/0:0,54,233:69 0/0:0,15,122:30 0/0:0,9,79:24 0/0:0,0,0:15 0/0:0,33,255:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,33,255:48 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,39,255:54 0/0:0,15,164:30 0/0:0,39,243:54 0/0:0,27,223:42 0/0:0,18,126:33 0/0:0,54,255:69 0/0:0,102,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,63,196:78 0/0:0,18,190:33 0/0:0,42,215:57 0/0:0,21,195:36 0/0:0,27,169:42 0/0:0,21,159:36 0/0:0,54,255:69 0/0:0,45,193:60 0/0:0,36,255:51
chr12 6958696 . T C 999 . DP=834;VDB=0.0296;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=290,438,6,20;MQ=60;FQ=999;PV4=0.1,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:96 0/0:0,108,255:99 0/0:0,81,255:93 0/1:255,0,93:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,39,255:51 0/1:150,0,205:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,45,255:57 0/0:0,33,190:45 0/0:0,75,255:87 0/0:0,69,255:81 0/0:0,45,255:57 0/0:0,0,0:12 0/0:0,45,255:57 0/0:0,57,255:69 0/0:0,39,255:51 0/0:0,42,255:54 0/0:0,57,255:69 0/0:0,72,255:84 0/0:0,33,255:45 0/0:0,39,255:51 0/0:0,36,237:48 0/0:0,24,187:36 0/0:0,129,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,114,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,33,255:45 0/0:0,63,255:75 0/0:0,66,255:78 0/0:0,33,251:45 0/0:0,66,255:78
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chr12 6958829 . C G 999 . DP=907;VDB=0.0272;AF1=0.1143;AC1=8;DP4=471,228,47,19;MQ=60;FQ=999;PV4=0.58,0.091,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:96 0/0:0,54,234:60 0/0:0,72,255:78 0/0:0,66,255:72 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,255:48 0/0:0,36,215:42 0/0:0,90,255:96 0/0:0,63,255:69 0/0:0,33,255:39 0/0:0,99,255:99 0/0:0,57,255:63 0/0:0,42,255:48 0/0:0,0,0:7 0/0:0,87,255:93 0/0:0,72,255:78 0/0:0,48,255:54 0/0:0,69,255:75 0/0:0,57,255:63 0/0:0,72,255:78 0/0:0,42,255:48 0/0:0,66,255:72 0/1:128,0,172:99 0/1:108,0,124:99 0/1:219,0,254:99 0/0:0,108,255:99 0/1:233,0,239:99 0/1:156,0,255:99 0/1:148,0,194:99 0/0:0,102,255:99 0/1:82,0,255:76 0/0:0,42,255:48 0/1:165,0,194:99 0/0:0,63,255:69 0/0:0,72,255:78 0/0:0,51,255:57
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chr12 6959163 . C T 999 . DP=929;VDB=0.0483;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=373,464,5,26;MQ=60;FQ=999;PV4=0.0014,8e-52,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,57,255:67 0/0:0,33,255:43 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:67 0/0:0,27,214:37 0/0:0,120,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,54,255:64 0/0:0,0,0:11 0/0:0,84,255:94 0/0:0,75,255:85 0/1:79,0,124:69 0/0:0,51,255:61 0/0:0,48,255:58 0/0:0,60,255:70 0/0:0,42,255:52 0/0:0,81,255:91 0/0:0,69,255:79 0/1:46,0,164:36 0/1:119,0,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,51,255:61 0/0:0,21,207:31 0/0:0,36,255:46 0/0:0,93,255:99 0/0:0,84,255:94 0/0:0,63,255:73
chr12 6959189 . A G 87.7 . DP=911;VDB=0.0388;AF1=0.01455;AC1=1;DP4=332,479,4,28;MQ=60;FQ=87.7;PV4=0.0008,2.3e-48,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,253:51 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,255:69 0/0:0,30,244:45 0/0:0,105,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,0,0:15 0/0:0,78,255:93 0/0:0,99,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,57,255:72 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,255:69 0/0:0,69,255:84 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,255:45 0/0:0,141,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,57,255:72 0/1:137,4,0:17 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,225:39 0/0:0,39,255:54 0/0:0,114,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,63,255:78
chr12 6959194 . A T 999 . DP=921;VDB=0.0307;AF1=0.05738;AC1=4;DP4=312,468,27,32;MQ=60;FQ=999;PV4=0.41,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,33,222:42 0/0:0,90,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,24,217:33 0/0:0,111,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,0,0:10 0/0:0,81,255:90 0/0:0,96,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,57,255:66 0/0:0,36,255:45 0/0:0,39,255:48 0/0:0,48,255:57 0/0:0,81,255:90 0/1:159,0,242:99 0/0:0,24,209:33 0/0:0,123,255:99 0/1:233,0,255:99 0/1:255,0,168:99 0/0:0,90,255:99 0/1:185,0,222:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,9,245:18 0/0:0,24,209:33 0/0:0,39,234:48 0/0:0,108,255:99 0/0:0,60,255:69 0/0:0,63,255:72
chr12 6959240 . C A 47.6 . DP=956;VDB=0.0315;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=386,505,4,9;MQ=60;FQ=47.6;PV4=0.41,1.7e-20,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,126,255:99 0/1:93,0,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,54,255:69 0/0:0,93,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,27,228:42 0/0:0,111,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,57,255:72 0/0:0,45,255:60 0/0:0,99,255:99 0/0:0,24,207:39 0/0:0,72,255:87 0/0:0,36,255:51 0/0:0,72,255:87 0/0:0,87,255:99 0/0:0,21,198:36 0/0:0,120,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,88,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,27,243:42 0/0:0,63,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72
chr12 6959251 . C G 999 . DP=928;VDB=0.0261;AF1=0.02857;AC1=2;DP4=391,456,10,19;MQ=60;FQ=999;PV4=0.26,0.11,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,84,255:96 0/0:0,111,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,57,255:69 0/0:0,81,255:93 0/0:0,66,255:78 0/0:0,30,248:42 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,42,255:54 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,66,255:78 0/0:0,54,255:66 0/0:0,102,255:99 0/0:0,30,252:42 0/0:0,63,255:75 0/0:0,42,255:54 0/0:0,66,255:78 0/0:0,69,255:81 0/1:79,0,108:67 0/1:255,0,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,120,255:99 0/0:0,36,251:48 0/0:0,30,255:42 0/0:0,57,255:69 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:66
chr12 6959259 . C T 999 . DP=921;VDB=0.0453;AF1=0.04288;AC1=3;DP4=379,469,20,13;MQ=60;FQ=999;PV4=0.077,3e-53,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,78,255:88 0/0:0,81,255:91 0/0:0,105,255:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,81,255:91 0/0:0,54,255:64 0/0:0,81,255:91 0/0:0,66,255:76 0/0:0,39,255:49 0/0:0,108,255:99 0/0:0,93,255:99 0/1:55,0,182:45 0/0:0,0,0:11 0/0:0,48,255:58 0/0:0,63,255:73 0/0:0,54,255:64 0/0:0,96,255:99 0/0:0,36,255:46 0/0:0,54,255:64 0/0:0,33,255:43 0/1:137,0,179:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,18,177:28 0/0:0,117,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,111,255:99 0/1:186,0,205:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,120,255:99 0/0:0,42,255:52 0/0:0,36,255:46 0/0:0,66,255:76 0/0:0,105,255:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,63,255:73
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chr12 6959638 . T C 49.6 . DP=875;VDB=0.0404;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=393,402,7,3;MQ=60;FQ=49.6;PV4=0.22,1.2e-13,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,132,255:99 0/1:95,0,174:80 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,48,255:63 0/0:0,54,255:69 0/0:0,63,255:78 0/0:0,24,213:39 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,255:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,63,255:78 0/0:0,45,255:60 0/0:0,51,255:66 0/0:0,72,255:87 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,78,255:93 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,255:48 0/0:0,87,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,66,255:81 0/0:0,39,244:54 0/0:0,45,255:60 0/0:0,48,255:63 0/0:0,114,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,69,255:84
chr12 6959719 . C T 94.6 . DP=909;VDB=0.0599;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=439,405,6,2;MQ=60;FQ=94.6;PV4=0.29,0.07,0.15,0.48 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,81,255:96 0/0:0,66,255:81 0/0:0,87,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,57,255:72 0/0:0,30,254:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,57,255:72 0/1:140,0,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,75,255:90 0/0:0,69,255:84 0/0:0,96,255:99 0/0:0,33,255:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,78,255:93 0/0:0,21,171:36 0/0:0,87,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,111,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,157,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,36,255:51 0/0:0,51,255:66 0/0:0,93,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,66,255:81
chr12 6959762 . A C 999 . DP=916;VDB=0.0228;AF1=0.1001;AC1=7;DP4=418,218,47,35;MQ=60;FQ=999;PV4=0.14,3.2e-35,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:91 0/0:0,54,255:61 0/0:0,63,255:70 0/0:0,126,255:99 0/0:0,51,255:58 0/0:0,45,255:52 0/0:0,48,255:55 0/0:0,69,255:76 0/0:0,42,224:49 0/0:0,36,250:43 0/0:0,48,187:55 0/0:0,57,255:64 0/0:0,36,255:43 0/0:0,0,0:7 0/0:0,60,255:67 0/0:0,81,255:88 0/0:0,45,255:52 0/0:0,48,255:55 0/0:0,51,255:58 0/0:0,81,255:88 0/0:0,39,255:46 0/0:0,30,234:37 0/1:123,0,207:99 0/0:0,18,147:25 0/1:125,0,200:99 0/0:0,81,255:88 0/0:0,66,255:73 0/1:127,0,216:99 0/1:115,0,103:99 0/0:0,172,255:99 1/1:204,66,0:53 0/0:0,39,245:46 0/1:75,0,62:68 0/0:0,60,255:67 0/0:0,81,255:88 0/0:0,54,255:61
chr12 6959781 . T C 999 . DP=889;VDB=0.0240;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=408,314,10,18;MQ=59;FQ=999;PV4=0.034,5.1e-14,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:84 0/1:192,0,249:99 0/0:0,57,255:69 0/1:129,0,130:99 0/0:0,42,255:54 0/0:0,72,255:84 0/0:0,57,255:69 0/0:0,42,255:54 0/0:0,54,255:66 0/0:0,54,255:66 0/0:0,33,255:45 0/0:0,0,0:12 0/0:0,66,255:78 0/0:0,81,255:93 0/0:0,42,255:54 0/0:0,66,255:78 0/0:0,39,255:51 0/0:0,72,255:84 0/0:0,33,255:45 0/0:0,30,239:42 0/0:0,72,255:84 0/0:0,24,193:36 0/0:0,78,255:90 0/0:0,81,255:93 0/0:0,60,255:72 0/0:0,72,255:84 0/0:0,84,255:96 0/0:0,193,255:99 0/0:0,69,255:81 0/0:0,60,255:72 0/0:0,33,243:45 0/0:0,51,255:63 0/0:0,78,255:90 0/0:0,51,255:63
chr12 6959843 . C T 999 . DP=810;VDB=0.0342;AF1=0.315;G3=0.6857,1.101e-08,0.3143;HWE=4.31e-11;AC1=22;DP4=222,278,121,113;MQ=60;FQ=999;PV4=0.068,1.4e-156,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,99,0:93 1/1:231,60,0:54 1/1:253,78,0:72 1/1:253,78,0:72 1/1:242,72,0:66 1/1:222,51,0:45 1/1:208,42,0:36 1/1:234,57,0:51 1/1:206,48,0:42 1/1:219,45,0:39 1/1:249,72,0:66 0/0:0,57,255:57 0/0:0,18,185:18 0/0:0,0,0:3 0/0:0,54,255:54 0/0:0,57,255:57 0/0:0,21,202:21 0/0:0,48,255:48 0/0:0,36,255:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,48,255:48 0/0:0,48,255:48 0/0:0,96,255:96 0/0:0,15,165:15 0/0:0,87,255:87 0/0:0,81,255:81 0/0:0,96,255:96 0/0:0,78,255:78 0/0:0,81,255:81 0/0:0,144,255:99 0/0:0,60,255:60 0/0:0,60,255:60 0/0:0,30,229:30 0/0:0,66,255:66 0/0:0,81,255:81 0/0:0,72,255:72
chr12 6959903 . A G 999 . DP=704;VDB=0.0275;AF1=0.0287;AC1=2;DP4=332,222,9,4;MQ=60;FQ=999;PV4=0.58,0.006,1,1 GT:PL:GQ 0/1:164,0,158:99 0/0:0,30,217:42 0/0:0,51,255:63 0/0:0,57,255:69 0/0:0,54,255:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,24,186:36 0/0:0,63,255:75 0/1:63,0,169:51 0/0:0,51,255:63 0/0:0,75,255:87 0/0:0,51,255:63 0/0:0,18,196:30 0/0:0,0,0:12 0/0:0,63,255:75 0/0:0,57,255:69 0/0:0,42,255:54 0/0:0,60,255:72 0/0:0,42,255:54 0/0:0,63,255:75 0/0:0,36,255:48 0/0:0,36,200:48 0/0:0,51,255:63 0/0:0,9,104:21 0/0:0,69,255:81 0/0:0,72,255:84 0/0:0,75,255:87 0/0:0,45,255:57 0/0:0,27,236:39 0/0:0,72,255:84 0/0:0,45,255:57 0/0:0,45,255:57 0/0:0,30,246:42 0/0:0,54,255:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,60,255:72
chr12 6959943 . C G 22.6 . DP=764;VDB=0.0534;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=344,320,3,5;MQ=60;FQ=22.7;PV4=0.49,3.7e-19,0.00078,1 GT:PL:GQ 0/0:0,45,255:60 0/0:0,72,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,87,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,24,219:39 0/0:0,0,0:15 0/1:68,0,137:53 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,36,255:51 0/0:0,66,255:81 0/0:0,33,246:48 0/0:0,36,255:51 0/0:0,51,255:66 0/0:0,27,238:42 0/0:0,87,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,78,255:93 0/0:0,75,255:90 0/0:0,69,255:84 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,84,255:99 0/0:0,57,255:72
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chr12 6960391 . C T 999 . DP=1128;VDB=0.0381;AF1=0.02857;AC1=2;DP4=623,444,9,3;MQ=59;FQ=999;PV4=0.38,0.022,0.004,1 GT:PL:GQ 0/0:0,102,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,69,255:81 0/0:0,84,255:96 0/0:0,90,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,123,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,39,255:51 0/0:0,0,0:12 0/0:0,75,255:87 0/0:0,63,255:75 0/0:0,66,255:78 0/0:0,54,255:66 0/0:0,54,255:66 0/0:0,60,255:72 0/0:0,48,255:60 0/0:0,99,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,24,219:36 0/0:0,141,255:99 0/0:0,196,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,148,255:99 0/1:88,0,94:76 0/0:0,57,255:69 0/1:141,0,249:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,78,255:90
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chr12 6960530 . T C 999 . DP=918;VDB=0.0404;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=322,518,13,9;MQ=57;FQ=999;PV4=0.074,0.35,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,230:66 0/0:0,63,255:78 0/0:0,93,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,75,255:90 0/0:0,72,255:87 0/0:0,48,255:63 0/0:0,66,255:81 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,255:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,84,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,66,255:81 0/0:0,42,255:57 0/0:0,60,255:75 0/0:0,57,255:72 0/0:0,90,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,33,247:48 0/0:0,99,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,144,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,78,255:93 0/0:0,51,255:66 0/0:0,120,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99
chr12 6960544 . T C 999 . DP=903;VDB=0.0334;AF1=0.05715;AC1=4;DP4=309,468,17,25;MQ=58;FQ=999;PV4=1,2.2e-56,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:75 0/0:0,48,255:57 0/1:71,0,138:62 0/1:124,0,182:99 0/0:0,81,255:90 0/0:0,51,252:60 0/0:0,33,255:42 0/1:143,0,192:99 0/0:0,63,255:72 0/1:86,0,187:77 0/0:0,66,255:75 0/0:0,75,255:84 0/0:0,39,255:48 0/0:0,0,0:10 0/0:0,78,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,54,255:63 0/0:0,57,255:66 0/0:0,39,255:48 0/0:0,54,255:63 0/0:0,48,255:57 0/0:0,96,255:99 0/0:0,87,255:96 0/0:0,30,222:39 0/0:0,81,255:90 0/0:0,111,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,135,255:99 0/0:0,45,255:54 0/0:0,75,255:84 0/0:0,54,255:63 0/0:0,114,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:93
chr12 6960571 . C T 999 . DP=886;VDB=0.0312;AF1=0.1143;AC1=8;DP4=270,455,35,50;MQ=54;FQ=999;PV4=0.48,1,1.8e-22,0.018 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:81 0/0:0,60,255:66 0/0:0,39,250:45 0/0:0,81,255:87 0/0:0,84,255:90 0/0:0,51,255:57 0/0:0,30,235:36 0/0:0,90,255:96 0/0:0,75,255:81 0/0:0,45,255:51 0/0:0,96,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,36,236:42 0/0:0,0,0:7 0/1:127,0,201:99 1/1:255,96,0:84 0/0:0,45,255:51 0/1:138,0,255:99 0/0:0,45,255:51 0/1:95,0,150:89 0/1:151,0,72:84 0/0:0,78,255:84 0/0:0,78,255:84 0/0:0,21,181:27 0/0:0,90,255:96 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,72,255:78 0/0:0,48,255:54 0/0:0,117,255:99 0/0:0,39,255:45 0/1:163,0,249:99 0/0:0,51,255:57 0/0:0,111,255:99 0/0:0,120,255:99 0/1:193,0,246:99
chr12 6960588 . ccttcttctt ccttctt 135 . INDEL;DP=879;VDB=0.0420;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=289,488,1,7;MQ=49;FQ=135;PV4=0.27,0.042,0.027,0.39 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:87 0/0:0,69,255:84 0/0:0,69,255:84 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,27,255:42 0/1:188,0,104:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,54,255:69 0/0:0,90,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,30,170:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,96,255:99 0/0:0,21,130:36 0/0:0,54,255:69 0/0:0,39,233:54 0/0:0,39,255:54 0/0:0,48,213:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,69,255:84 0/0:0,24,255:39 0/0:0,108,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,51,255:66 0/0:0,111,255:99 0/0:0,30,255:45 0/0:0,63,255:78 0/0:0,60,255:75 0/0:0,111,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,72,255:87
chr12 6960606 . C T 20.6 . DP=846;VDB=0.0453;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=290,469,4,4;MQ=46;FQ=20.7;PV4=0.49,1.6e-16,0.0016,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,255:66 0/0:0,72,255:87 0/0:0,108,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,24,148:39 0/0:0,42,217:57 0/0:0,75,255:90 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,105,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,30,141:45 0/0:0,0,0:16 0/1:66,0,191:51 0/0:0,99,255:99 0/0:0,39,139:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,182:48 0/0:0,69,255:84 0/0:0,48,200:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,72,255:87 0/0:0,24,181:39 0/0:0,102,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,120,255:99 0/0:0,24,174:39 0/0:0,78,255:93 0/0:0,45,255:60 0/0:0,105,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,60,255:75
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chr12 6960664 . G A 94 . DP=1244;VDB=0.0078;AF1=0.1502;AC1=11;DP4=402,372,199,115;MQ=22;FQ=94.7;PV4=0.0006,2.2e-118,5.9e-43,1 GT:PL:GQ 0/1:39,0,141:34 0/0:0,20,111:25 0/0:0,8,145:13 0/0:0,49,133:54 0/0:0,37,128:42 0/0:0,0,90:6 0/1:15,0,128:11 0/0:0,45,236:50 0/0:0,0,101:6 0/0:0,1,96:7 0/0:0,19,144:24 0/0:0,93,212:98 0/0:0,69,47:62 0/0:0,0,0:6 0/0:0,31,193:36 0/0:0,32,213:37 0/0:0,90,128:95 0/0:0,56,219:61 0/0:0,69,73:73 0/0:0,45,205:50 0/0:0,66,92:71 0/1:6,0,218:4 0/0:0,15,255:20 0/1:11,0,183:7 0/1:22,0,183:17 0/1:24,0,212:19 0/0:0,0,208:6 0/0:0,13,253:18 0/1:28,0,107:23 0/1:27,0,255:22 0/0:0,2,114:7 0/0:0,10,195:15 0/0:0,2,210:7 0/1:26,0,227:21 0/1:9,0,242:6 0/0:0,15,242:20
chr12 6960676 . C T 999 . DP=1202;VDB=0.0194;AF1=0.4508;G3=0.4591,0.2266,0.3143;HWE=0.00309;AC1=32;DP4=218,235,328,313;MQ=24;FQ=999;PV4=0.33,1.2e-196,9.9e-128,1 GT:PL:GQ 1/1:162,148,0:99 1/1:130,78,0:74 1/1:162,157,0:99 1/1:123,163,0:99 1/1:138,157,0:99 1/1:153,90,0:86 1/1:178,90,0:86 1/1:158,93,0:89 1/1:156,87,0:83 1/1:143,81,0:77 1/1:156,96,0:92 0/0:0,78,252:76 0/0:0,33,77:31 0/1:0,0,0:3 0/0:0,25,178:23 0/0:0,18,231:16 0/0:0,60,151:58 0/0:0,39,236:37 0/0:0,39,101:37 0/0:0,26,217:24 0/0:0,33,125:31 0/1:1,0,255:5 0/0:0,12,255:10 0/1:13,0,184:15 0/1:16,0,236:18 0/1:22,0,242:24 0/1:0,2,243:3 0/0:0,19,255:17 0/1:21,0,120:23 0/1:27,0,255:29 0/1:0,2,122:3 0/0:0,10,233:9 0/1:2,0,220:6 0/1:27,0,238:29 0/1:7,0,255:10 0/0:0,21,255:19
chr12 6960682 . G T 79.6 . DP=1196;VDB=0.0154;AF1=0.1529;AC1=11;DP4=318,393,243,139;MQ=24;FQ=80.3;PV4=3.2e-09,1e-205,3.7e-95,1 GT:PL:GQ 0/1:37,0,107:33 0/0:0,14,108:19 0/0:3,0,125:4 0/0:0,28,115:33 0/0:0,15,106:20 0/0:1,0,103:5 0/1:17,0,134:13 0/0:0,17,191:22 0/0:0,7,114:12 0/0:0,0,107:6 0/0:0,24,175:29 0/0:0,72,255:76 0/0:0,36,73:40 0/0:0,0,0:6 0/0:0,27,216:32 0/0:0,24,233:29 0/0:0,66,140:70 0/0:0,30,233:35 0/0:0,51,91:55 0/0:0,22,231:27 0/0:0,30,120:35 0/0:2,0,255:4 0/0:0,10,255:15 0/1:14,0,177:10 0/1:17,0,247:13 0/1:19,0,232:15 0/0:0,3,228:8 0/0:0,21,255:26 0/1:20,0,129:16 0/1:27,0,255:23 0/0:0,1,101:7 0/0:0,10,226:15 0/0:2,0,211:4 0/1:27,0,250:23 0/1:8,0,253:5 0/0:0,21,255:26
chr12 6960722 . G A 49.9 . DP=989;VDB=0.0379;AF1=0.0406;AC1=3;DP4=374,473,5,14;MQ=32;FQ=50.1;PV4=0.16,9.1e-19,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,252:99 0/0:0,51,174:62 0/0:0,129,255:99 0/0:0,111,194:99 0/0:0,87,198:98 0/0:0,63,222:74 0/0:0,63,212:74 0/0:0,69,233:80 0/0:0,69,244:80 0/0:0,51,166:62 0/0:0,66,255:77 0/0:0,75,255:86 0/0:0,30,34:41 0/0:0,0,0:11 0/0:0,84,255:95 0/0:0,60,255:71 0/0:0,54,84:65 0/0:0,78,208:89 0/0:0,48,62:59 0/0:0,63,235:74 0/0:0,45,102:56 0/0:0,63,255:74 0/1:18,0,199:8 0/0:0,45,232:56 0/0:0,105,255:99 0/1:49,0,209:38 0/1:55,0,189:44 0/0:0,84,255:95 0/0:0,105,255:99 0/0:0,66,255:77 0/0:0,45,223:56 0/0:0,45,222:56 0/0:0,69,255:80 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:74
chr12 6960724 . G C 15.7 . DP=964;VDB=0.0371;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=352,482,7,6;MQ=33;FQ=15.8;PV4=0.41,3.2e-25,0.1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,255:99 0/0:0,51,165:66 0/0:0,126,253:99 0/0:0,102,193:99 0/0:0,87,197:99 0/0:0,60,225:75 0/0:0,63,221:78 0/0:0,69,233:84 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,171:60 0/0:0,63,255:78 0/0:0,69,255:84 0/0:0,27,34:42 0/0:0,0,0:16 0/0:0,81,248:96 0/0:0,48,249:63 0/0:0,48,91:63 0/0:0,84,228:99 0/0:0,42,89:57 0/1:61,0,123:46 0/0:0,10,74:25 0/0:0,63,255:78 0/0:0,54,255:69 0/0:0,45,231:60 0/0:0,102,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,42,234:57 0/0:0,42,229:57 0/0:0,69,255:84 0/0:0,123,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:78
chr12 6960834 . G C 999 . DP=846;VDB=0.0287;AF1=0.3157;G3=0.6857,1.87e-08,0.3143;HWE=4.63e-11;AC1=23;DP4=215,273,63,162;MQ=41;FQ=999;PV4=4.9e-05,6.5e-128,1.4e-38,1 GT:PL:GQ 1/1:223,60,0:54 1/1:211,63,0:57 1/1:212,90,0:84 1/1:200,81,0:75 1/1:192,69,0:63 1/1:198,63,0:57 1/1:162,27,0:21 1/1:196,39,0:33 1/1:175,63,0:57 1/1:170,36,0:30 1/1:252,81,0:75 0/0:0,57,255:57 0/0:0,27,187:27 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:48 0/0:0,54,255:54 0/0:0,45,255:45 0/0:0,39,255:39 0/0:0,45,224:45 0/0:0,42,255:42 0/0:0,48,255:48 0/0:0,36,255:36 0/0:0,39,255:39 0/0:0,9,92:10 0/0:0,93,255:93 0/0:0,135,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,63,255:63 0/0:0,123,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,51,255:51 0/0:0,30,239:30 0/0:0,39,255:39 0/0:0,72,255:72 0/0:0,75,255:75 0/0:0,39,255:39
chr12 6960855 . C A 999 . DP=637;VDB=0.0310;AF1=0.4329;G3=0.5093,0.1222,0.3685;HWE=6.54e-06;AC1=31;DP4=163,108,85,138;MQ=43;FQ=999;PV4=1.5e-06,3e-121,5.2e-14,1 GT:PL:GQ 1/1:143,39,0:35 1/1:126,33,0:29 1/1:150,51,0:47 1/1:131,33,0:29 1/1:147,51,0:47 1/1:112,33,0:29 1/1:133,33,0:29 1/1:145,36,0:32 1/1:74,18,0:14 1/1:124,27,0:23 1/1:167,60,0:56 0/0:0,39,248:37 0/0:0,15,133:13 0/1:0,0,0:3 0/0:0,24,202:22 0/0:0,51,255:49 0/0:0,36,255:34 0/0:0,24,206:22 0/0:0,15,125:13 0/0:0,30,242:28 0/0:0,36,252:34 0/0:0,30,157:28 1/1:54,5,0:3 0/0:0,3,38:4 0/1:42,0,181:44 0/1:122,0,205:99 0/1:45,0,225:47 0/0:0,7,255:6 1/1:170,93,0:89 0/0:0,96,255:94 0/0:0,18,255:16 0/0:0,39,255:37 0/1:49,0,134:51 0/0:0,54,255:52 0/0:0,51,255:49 0/0:0,24,102:22
chr12 6960856 . ctttttttttttttttttttt ctttttttttttttttt,cttttttttttttttt 999 . INDEL;DP=620;VDB=0.0365;AF1=0.742;G3=0.4073,1.169e-05,0.5927;HWE=0.000144;AC1=72;DP4=8,25,24,56;MQ=26;FQ=-31.7;PV4=0.65,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:98,50,37,62,0,54:15 1/1:70,52,48,22,0,17:7 1/1:43,24,19,24,0,19:7 1/1:48,39,36,17,2,8:6 1/1:68,29,8,64,0,52:23 1/1:69,21,0,69,21,69:23 1/1:73,15,0,73,15,73:17 1/1:60,22,7,45,0,42:17 1/1:18,8,6,24,9,20:5 1/1:54,44,38,18,0,12:8 1/1:84,38,17,66,0,57:23 0/0:0,9,12,9,12,12:3 1/1:0,3,4,3,4,4:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 0/0:0,12,14,12,14,14:4 1/1:0,3,4,3,4,4:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,6,7,6,7,7:2 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:5,1,0,8,3,7:4 1/1:0,3,4,3,4,4:3 0/1:0,6,8,6,8,8:2 1/1:0,0,0,0,0,0:3 0/1:0,6,8,6,8,8:2 0/1:0,3,5,3,5,5:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,3,4,3,4,4:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,6,7,6,7,7:2 1/1:6,12,12,12,12,12:3 1/1:0,3,4,3,4,4:3 0/1:0,3,5,3,5,5:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3 1/1:0,0,0,0,0,0:3
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chr12 6960950 . C G 999 . DP=548;VDB=0.0158;AF1=0.1668;G3=0.7502,1.135e-06,0.2498;HWE=1.09e-06;AC1=12;DP4=240,148,20,11;MQ=33;FQ=999;PV4=0.85,2.7e-48,8.4e-12,0.0091 GT:PL:GQ 0/1:20,9,0:3 1/1:37,12,0:4 0/0:0,3,4:8 0/1:18,6,0:5 0/0:7,6,0:4 0/0:0,0,0:5 0/1:14,5,0:4 0/1:22,9,0:3 0/1:18,9,0:3 1/1:61,12,0:4 0/1:32,5,0:6 0/0:0,45,250:49 0/0:0,18,46:22 0/0:0,0,0:5 0/0:0,36,249:40 0/0:0,81,255:85 0/0:0,30,81:34 0/0:0,60,255:64 0/0:0,27,62:31 0/0:0,36,178:40 0/0:0,27,105:31 0/0:0,12,111:16 0/0:0,42,201:46 0/0:0,6,38:11 0/0:0,72,255:76 0/0:0,87,255:91 0/0:0,87,255:91 0/0:0,81,255:85 0/0:0,60,255:64 0/0:0,87,255:91 0/0:0,33,222:37 0/0:0,24,195:28 0/0:0,27,176:31 0/0:0,66,255:70 0/0:0,81,255:85 0/0:0,21,175:25
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chr12 6960960 . A G 999 . DP=535;VDB=0.0200;AF1=0.156;G3=0.7654,2.066e-06,0.2346;HWE=2e-06;AC1=11;DP4=227,117,24,7;MQ=34;FQ=999;PV4=0.23,0.43,3.8e-10,0.022 GT:PL:GQ 1/1:22,15,0:4 1/1:44,15,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:4,3,0:5 0/1:17,9,0:3 0/0:0,0,0:6 0/1:11,3,0:4 0/1:25,9,0:4 0/0:7,6,0:4 0/1:46,9,0:4 0/1:33,5,0:7 0/0:0,45,238:50 0/0:0,21,48:26 0/0:0,0,0:6 0/0:0,45,228:50 0/0:0,75,255:80 0/0:0,18,75:23 0/0:0,63,250:68 0/0:0,18,42:23 0/0:0,27,156:32 0/0:0,24,106:29 0/0:0,9,76:14 0/0:0,39,173:44 0/0:0,9,45:14 0/0:0,48,212:53 0/0:0,72,255:77 0/0:0,87,255:92 0/0:0,69,251:74 0/0:0,48,197:53 0/0:0,72,249:77 0/0:0,30,185:35 0/0:0,27,188:32 0/0:0,27,164:32 0/0:0,44,255:49 0/0:0,75,249:80 0/0:0,24,161:29
chr12 6960987 . T C 999 . DP=583;VDB=0.0386;AF1=0.03269;AC1=2;DP4=254,204,15,11;MQ=30;FQ=999;PV4=1,1,1,0.45 GT:PL:GQ 0/0:0,24,32:36 0/0:0,24,61:36 0/0:0,18,47:30 0/0:0,18,45:30 0/0:0,12,33:24 0/0:0,3,14:15 0/0:0,12,24:24 0/0:0,12,24:24 0/0:0,27,62:39 0/0:0,15,47:27 0/0:0,27,95:39 0/1:219,12,0:7 0/0:0,28,15:38 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,149:63 0/0:0,78,255:90 0/0:0,18,12:29 0/1:116,0,133:99 0/0:0,5,4:17 0/0:0,39,225:51 0/0:0,33,19:43 0/0:0,21,143:33 0/0:0,66,186:78 0/0:0,15,102:27 0/0:0,42,213:54 0/0:0,57,240:69 0/0:0,99,255:99 0/0:0,57,227:69 0/0:0,63,213:75 0/0:0,117,255:99 0/0:0,48,205:60 0/0:0,27,201:39 0/0:0,27,173:39 0/0:0,75,255:87 0/0:0,87,255:99 0/0:0,36,220:48
chr12 6960995 . T A 999 . DP=590;VDB=0.0201;AF1=0.4362;G3=0.4584,0.1833,0.3583;HWE=0.000294;AC1=31;DP4=147,145,102,68;MQ=32;FQ=999;PV4=0.053,0.38,6e-17,1 GT:PL:GQ 1/1:32,24,0:19 1/1:77,27,0:23 1/1:41,8,0:5 1/1:51,10,0:7 1/1:33,12,0:8 1/1:43,12,0:9 0/1:13,3,0:3 1/1:82,18,0:14 1/1:62,27,0:23 1/1:29,9,0:6 1/1:87,42,0:38 0/0:0,45,226:43 0/0:0,33,31:29 0/1:0,0,0:3 0/0:0,51,201:49 0/0:0,72,255:70 0/0:0,15,14:12 0/0:0,63,253:61 0/0:0,15,17:12 0/0:0,42,231:40 0/0:0,33,50:31 0/0:0,27,180:25 1/1:202,66,0:62 0/0:0,12,120:11 0/1:125,0,113:99 0/1:113,0,58:62 0/1:107,0,238:99 0/1:14,0,118:16 1/1:206,57,0:53 0/0:0,23,255:21 0/1:60,0,103:62 0/0:0,33,222:31 0/1:43,0,87:45 0/0:0,44,255:42 0/0:0,87,255:85 0/0:0,33,202:31
chr12 6961004 . G A 33.6 . DP=607;VDB=0.0172;AF1=0.0144;AC1=1;DP4=287,201,3,2;MQ=33;FQ=33.7;PV4=1,1,0.48,1 GT:PL:GQ 0/0:0,24,32:39 0/0:0,30,82:45 0/0:0,21,82:36 0/0:0,21,75:36 0/0:0,12,32:27 0/0:0,21,86:36 0/0:0,12,24:27 0/0:0,24,104:39 0/0:0,33,85:48 0/0:0,15,60:30 0/0:0,42,133:57 0/0:0,51,232:66 0/0:0,51,24:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,239:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,21,17:36 0/0:0,63,211:78 0/0:0,24,21:39 0/0:0,57,236:72 0/0:0,39,49:54 0/0:0,21,145:36 0/0:0,60,180:75 0/0:0,12,113:27 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,186:54 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,239:69 0/0:0,45,171:60 0/0:0,78,224:93 0/0:0,51,222:66 0/1:79,0,137:64 0/0:0,27,170:42 0/0:0,72,255:87 0/0:0,99,255:99 0/0:0,33,178:48
chr12 6961040 . T G 999 . DP=658;VDB=0.0361;AF1=0.0823;G3=0.8927,0.03107,0.07619;HWE=0.00102;AC1=6;DP4=331,220,23,19;MQ=39;FQ=999;PV4=0.52,2.8e-86,0.0018,0.017 GT:PL:GQ 0/0:0,36,158:43 0/0:0,39,97:46 0/0:0,63,205:70 0/0:0,42,179:49 0/0:0,30,117:37 0/0:0,30,121:37 0/0:0,21,136:28 0/0:0,42,218:49 0/0:0,45,161:52 0/0:0,30,175:37 0/0:0,87,213:94 1/1:114,39,0:25 0/1:15,5,0:4 0/0:0,0,0:8 0/0:0,60,255:67 0/0:0,75,255:82 0/0:0,39,193:46 0/1:50,0,199:43 1/1:102,48,0:34 0/0:0,54,255:61 0/0:0,45,237:52 0/0:0,39,255:46 0/0:0,51,220:58 0/0:0,15,149:23 0/0:0,72,255:79 0/0:0,51,255:58 0/0:0,75,255:82 0/0:0,69,255:76 0/0:0,72,255:79 0/0:0,66,255:73 0/0:0,60,255:67 0/0:0,33,254:40 0/0:0,36,225:43 0/0:0,69,255:76 0/0:0,148,255:99 0/0:0,24,224:31
chr12 6961060 . G A 999 . DP=674;VDB=0.0270;AF1=0.3139;G3=0.6857,1.384e-08,0.3143;HWE=4.56e-11;AC1=22;DP4=282,157,112,31;MQ=39;FQ=999;PV4=0.0019,0.0048,2.3e-24,1 GT:PL:GQ 1/1:170,39,0:33 1/1:120,42,0:36 1/1:180,57,0:51 1/1:168,45,0:39 1/1:132,27,0:21 1/1:110,21,0:15 1/1:142,24,0:18 1/1:231,48,0:42 1/1:161,33,0:27 1/1:163,30,0:24 1/1:199,60,0:54 0/0:0,48,255:48 0/0:0,15,73:16 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:57 0/0:0,87,255:87 0/0:0,36,196:36 0/0:0,57,255:57 0/0:0,60,223:60 0/0:0,51,255:51 0/0:0,51,218:51 0/0:0,42,255:42 0/0:0,42,255:42 0/0:0,21,169:21 0/0:0,102,255:99 0/0:0,69,255:69 0/0:0,57,255:57 0/0:0,72,255:72 0/0:0,63,246:63 0/0:0,60,255:60 0/0:0,57,255:57 0/0:0,30,224:30 0/0:0,33,228:33 0/0:0,48,255:48 0/0:0,126,255:99 0/0:0,24,220:24
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chr12 6961174 . G T 999 . DP=830;VDB=0.0413;AF1=0.08633;AC1=6;DP4=474,245,35,15;MQ=59;FQ=999;PV4=0.64,1,0.00017,0.37 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:82 0/0:0,51,255:58 0/0:0,69,255:76 0/0:0,72,255:79 0/0:0,60,255:67 0/0:0,72,255:79 0/0:0,36,232:43 0/0:0,39,255:46 0/0:0,54,255:61 0/0:0,57,255:64 0/0:0,72,255:79 0/0:0,63,255:70 0/0:0,36,255:43 0/0:0,0,0:8 0/1:241,0,244:99 1/1:255,39,0:26 0/0:0,48,241:55 0/1:175,0,255:99 0/0:0,45,255:52 0/1:199,0,144:99 0/1:130,0,150:99 0/0:0,54,255:61 0/0:0,54,255:61 0/0:0,6,208:13 0/0:0,117,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,69,255:76 0/0:0,89,255:96 0/0:0,90,255:97 0/0:0,166,255:99 0/0:0,33,255:40 0/0:0,54,255:61 0/0:0,66,255:73 0/0:0,60,255:67 0/0:0,114,255:99 0/0:0,66,255:73
chr12 6961231 . G A 999 . DP=1067;VDB=0.0140;AF1=0.1182;AC1=9;DP4=482,352,77,95;MQ=42;FQ=999;PV4=0.0023,2.7e-171,1.2e-60,1 GT:PL:GQ 0/1:9,0,255:5 0/1:50,0,255:44 0/1:25,0,243:19 0/1:67,0,255:61 0/1:64,0,188:58 0/0:0,23,254:29 0/1:44,0,255:38 0/0:0,13,255:19 0/1:54,0,231:48 0/1:66,0,197:60 0/1:7,0,255:4 0/0:0,57,173:63 0/0:0,12,42:18 0/0:0,0,0:7 0/0:0,42,174:48 0/0:0,63,246:69 0/0:0,33,97:39 0/0:0,60,255:66 0/0:0,63,158:69 0/0:0,57,255:63 0/0:0,33,120:39 0/0:0,72,255:78 0/0:0,87,255:93 0/0:0,48,255:54 0/0:0,160,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,72,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,48,255:54 0/0:0,51,255:57 0/0:0,66,255:72 0/0:0,90,255:96 0/0:0,90,255:96 0/0:0,93,255:99
chr12 6961237 . G T 999 . DP=1090;VDB=0.0167;AF1=0.1289;AC1=9;DP4=470,354,84,116;MQ=40;FQ=999;PV4=0.00014,4.6e-179,6.9e-52,1 GT:PL:GQ 0/1:50,0,255:45 0/1:52,0,255:47 0/1:47,0,230:42 0/1:84,0,232:79 0/1:89,0,187:84 0/0:0,8,247:13 0/1:61,0,240:56 0/0:0,6,255:12 0/1:65,0,210:60 0/1:76,0,202:71 0/1:15,0,255:10 0/0:0,60,174:65 0/0:0,18,60:23 0/0:0,0,0:6 0/0:0,42,153:47 0/0:0,66,246:71 0/0:0,30,85:35 0/0:0,54,249:59 0/0:0,66,147:71 0/0:0,51,255:56 0/0:0,33,93:38 0/0:0,72,255:77 0/0:0,99,255:99 0/0:0,48,255:53 0/0:0,160,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,72,255:77 0/0:0,90,255:95 0/0:0,102,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,66,255:71 0/0:0,45,255:50 0/0:0,66,255:71 0/0:0,93,255:98 0/0:0,81,255:86 0/0:0,93,255:98
chr12 6961268 . G A 999 . DP=1578;VDB=0.0292;AF1=0.1457;AC1=10;DP4=753,471,120,177;MQ=23;FQ=999;PV4=6.7e-11,0,0.0012,1 GT:PL:GQ 0/1:55,0,207:50 0/1:41,0,200:36 0/1:50,0,134:45 0/1:78,0,120:73 0/1:77,0,114:72 0/0:0,2,212:8 0/1:64,0,164:59 0/1:27,0,170:22 0/1:65,0,182:60 0/1:82,0,99:77 0/1:69,0,180:64 0/0:0,135,62:77 0/0:0,126,8:23 0/0:0,0,0:6 0/0:0,111,58:73 0/0:0,135,165:99 0/0:0,87,9:24 0/0:0,141,129:99 0/0:0,135,14:29 0/0:0,108,129:99 0/0:0,63,9:24 0/0:0,93,220:98 0/0:0,138,255:99 0/0:0,48,193:53 0/0:0,181,255:99 0/0:0,157,250:99 0/0:0,123,230:99 0/0:0,120,197:99 0/0:0,132,188:99 0/0:0,138,196:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,42,112:47 0/0:0,66,248:71 0/0:0,132,255:99 0/0:0,99,235:99 0/0:0,117,255:99
chr12 6961364 . C A 999 . DP=993;VDB=0.0301;AF1=0.05714;AC1=4;DP4=479,362,35,33;MQ=48;FQ=999;PV4=0.45,8.5e-85,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:87 0/0:0,132,255:99 0/0:0,27,208:36 0/0:0,36,239:45 0/0:0,48,255:57 0/0:0,84,255:93 0/0:0,63,255:72 0/0:0,66,255:75 0/0:0,72,255:81 0/0:0,42,254:51 0/0:0,0,0:10 0/0:0,75,255:84 0/0:0,51,255:60 0/0:0,45,255:54 0/0:0,105,255:99 0/0:0,63,255:72 0/0:0,81,255:90 0/0:0,57,255:66 0/0:0,45,255:54 0/1:131,0,165:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,126,255:99 0/1:144,0,144:99 0/1:146,0,223:99 0/0:0,108,255:99 0/1:46,0,255:37 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:66 0/0:0,75,255:84 0/0:0,60,255:69 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:87 0/0:0,75,255:84
chr12 6961455 . C T 31.6 . DP=897;VDB=0.0297;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=394,409,7,7;MQ=60;FQ=31.6;PV4=1,4.5e-53,1,0.27 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/1:77,0,239:62 0/0:0,39,255:54 0/0:0,72,255:87 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,27,236:42 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,27,224:42 0/0:0,126,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,117,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,255:60 0/0:0,36,255:51 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,51,255:66
chr12 6961642 . G A 999 . DP=913;VDB=0.0330;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=432,388,15,14;MQ=60;FQ=999;PV4=1,0.33,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,81,255:91 0/1:233,0,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,66,255:76 0/1:146,0,170:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,108,255:99 0/1:153,0,196:99 0/0:0,84,255:94 0/0:0,57,255:67 0/0:0,48,255:58 0/0:0,0,0:11 0/0:0,48,255:58 0/0:0,48,255:58 0/0:0,36,255:46 0/0:0,60,255:70 0/0:0,36,255:46 0/0:0,99,255:99 0/0:0,24,237:34 0/0:0,93,255:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,21,189:31 0/0:0,175,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,66,255:76 0/0:0,78,255:88 0/0:0,45,255:55 0/0:0,48,255:58 0/0:0,45,255:55 0/0:0,84,255:94 0/0:0,69,255:79 0/0:0,51,255:61
chr12 6961694 . TCC TC 113 . INDEL;DP=901;VDB=0.0401;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=414,402,6,6;MQ=60;FQ=113;PV4=1,0.0029,0.00036,0.4 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:84 0/0:0,135,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:1,37,255:51 0/0:0,66,255:81 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,72,255:87 0/0:0,78,255:93 0/0:0,36,252:51 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,45,255:60 0/0:0,27,229:42 0/1:166,0,255:99 0/0:0,24,215:39 0/0:0,96,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,21,188:36 0/0:0,138,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,255:66
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chr12 6962007 . C T 131 . DP=1043;VDB=0.0363;AF1=0.04286;AC1=3;DP4=482,455,24,13;MQ=60;FQ=131;PV4=0.13,8.1e-89,0.095,1 GT:PL:GQ 0/1:87,0,255:77 0/0:0,92,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,255:85 0/1:70,0,202:60 0/0:0,84,255:94 0/0:0,96,255:99 0/1:47,0,97:37 0/0:0,69,255:79 0/0:0,63,255:73 0/0:0,51,255:61 0/0:0,0,0:11 0/0:0,75,255:85 0/0:0,66,255:76 0/0:0,39,255:49 0/0:0,93,255:99 0/0:0,54,255:64 0/0:0,75,255:85 0/0:0,66,255:76 0/0:0,90,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,24,227:34 0/0:0,157,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,60,255:70 0/0:0,42,255:52 0/0:0,90,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,90,255:99
chr12 6962056 . G T 96.6 . DP=973;VDB=0.0246;AF1=0.01439;AC1=1;DP4=436,442,15,18;MQ=58;FQ=96.7;PV4=0.72,6.5e-66,1,0.46 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,105,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,63,255:78 0/0:0,90,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,33,255:48 0/0:0,87,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,24,146:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,75,255:90 0/0:0,51,255:66 0/0:0,54,255:69 0/0:0,87,255:99 0/0:0,39,202:54 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,33,255:48 0/0:0,120,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,23,255:38 0/0:0,93,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/1:142,0,0:21 0/0:0,99,255:99 0/0:0,69,255:84
chr12 6962124 . G A 999 . DP=1002;VDB=0.0379;AF1=0.9571;G3=0.02857,0.02858,0.9429;HWE=0.0216;AC1=69;DP4=14,23,374,506;MQ=59;FQ=999;PV4=0.61,0.2,0.063,1 GT:PL:GQ 1/1:255,84,0:94 1/1:255,84,0:94 1/1:255,108,0:99 1/1:255,114,0:99 1/1:255,117,0:99 1/1:255,54,0:64 1/1:255,57,0:67 1/1:255,93,0:99 1/1:255,96,0:99 1/1:255,48,0:58 1/1:255,81,0:91 1/1:255,81,0:91 1/1:238,30,0:40 1/1:0,0,0:11 0/1:158,0,255:99 1/1:219,27,0:37 1/1:255,30,0:40 1/1:255,69,0:79 1/1:251,30,0:40 1/1:255,60,0:70 1/1:255,33,0:43 1/1:255,69,0:79 1/1:255,51,0:61 1/1:255,33,0:43 1/1:255,141,0:99 1/1:255,154,0:99 1/1:255,160,0:99 1/1:255,105,0:99 1/1:255,102,0:99 1/1:255,154,0:99 1/1:255,87,0:97 1/1:255,39,0:49 1/1:252,27,0:37 1/1:255,129,0:99 0/0:0,69,255:53 1/1:255,69,0:79
chr12 6962132 . C T 999 . DP=995;VDB=0.0285;AF1=0.1429;AC1=10;DP4=352,453,46,95;MQ=59;FQ=999;PV4=0.016,0.018,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:95 0/0:0,81,255:86 0/0:0,102,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,57,255:62 0/0:0,63,255:68 0/0:0,87,255:92 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:59 0/0:0,84,255:89 0/0:0,87,255:92 0/0:0,24,192:29 0/0:0,0,0:6 0/0:0,72,255:77 0/0:0,39,255:44 0/0:0,33,255:38 0/0:0,69,255:74 0/0:0,21,179:26 0/0:0,66,255:71 0/0:0,39,255:44 0/0:0,69,255:74 1/1:255,51,0:40 0/0:0,33,255:38 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:157,0,255:99 0/1:255,0,255:99 1/1:255,90,0:79 0/0:0,160,255:99 0/1:202,0,255:99 0/0:0,39,255:44 0/1:139,0,129:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,63,255:68 0/0:0,75,255:80
chr12 6962200 . G A 999 . DP=845;VDB=0.0207;AF1=0.02097;AC1=2;DP4=422,362,6,9;MQ=56;FQ=999;PV4=0.31,0.088,0.49,0.34 GT:PL:GQ 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,63,255:77 0/0:0,84,255:98 0/0:0,63,255:77 0/0:0,96,255:99 0/0:0,30,240:44 0/0:0,151,255:99 0/0:0,78,255:92 0/0:0,21,218:35 0/0:0,0,0:14 0/0:0,36,255:50 0/0:0,24,220:38 0/0:13,0,157:4 0/0:0,51,255:65 0/0:0,27,246:41 0/0:0,54,255:68 0/0:0,18,127:32 0/0:0,39,255:53 0/0:0,54,255:68 0/0:0,9,107:23 0/1:232,0,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,72,255:86 0/0:0,54,255:68 0/0:0,120,255:99 0/0:0,69,255:83 0/0:0,30,231:44 0/0:0,21,195:35 0/0:0,93,255:99 0/0:0,45,255:59 0/0:0,33,255:47
chr12 6962277 . A G 999 . DP=383;VDB=0.0077;AF1=0.793;G3=0.1864,0.09939,0.7143;HWE=0.00331;AC1=57;DP4=57,37,76,96;MQ=35;FQ=999;PV4=0.015,0.49,1,1 GT:PL:GQ 1/1:0,3,4:3 1/1:0,0,0:4 1/1:30,3,0:7 1/1:0,0,0:4 1/1:0,3,4:3 1/1:0,0,0:4 1/1:15,1,0:5 1/1:29,3,0:7 1/1:19,3,0:7 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:191,8,0:11 1/1:0,6,7:3 1/1:0,0,0:4 1/1:112,7,0:10 1/1:75,3,0:7 1/1:0,9,9:3 1/1:148,2,0:6 0/0:0,18,12:3 1/1:174,15,0:18 1/1:0,6,7:3 1/1:181,18,0:21 1/1:165,18,0:21 1/1:0,3,4:3 1/1:255,43,0:45 1/1:255,32,0:34 1/1:233,33,0:35 1/1:255,45,0:47 1/1:228,51,0:53 1/1:255,45,0:47 1/1:111,12,0:15 0/1:24,0,51:32 1/1:125,15,0:18 0/0:0,69,255:60 0/0:0,39,248:31 0/1:72,0,180:81
chr12 6962284 . C T 999 . DP=515;VDB=0.0014;AF1=0.2958;G3=0.6904,1.664e-07,0.3096;HWE=6.38e-10;AC1=21;DP4=152,141,59,36;MQ=36;FQ=999;PV4=0.097,2.3e-42,0.0038,1 GT:PL:GQ 1/1:145,31,0:24 1/1:134,33,0:26 1/1:133,23,0:16 1/1:93,24,0:17 0/1:37,5,0:4 0/1:7,6,0:2 1/1:97,12,0:6 1/1:103,27,0:20 1/1:172,45,0:38 1/1:59,18,0:12 1/1:141,27,0:20 0/0:0,57,230:58 0/0:0,12,11:12 0/0:0,0,0:3 0/0:0,21,135:22 0/0:0,39,130:40 0/0:0,15,12:14 0/0:0,39,195:40 0/0:0,15,12:14 0/0:0,33,197:34 0/0:0,9,9:9 0/0:0,30,198:31 0/0:0,27,175:28 0/0:0,3,33:5 0/0:0,56,255:57 0/0:0,54,255:55 0/0:0,45,232:46 0/0:0,72,255:73 0/0:0,54,255:55 0/0:0,63,255:64 0/0:0,21,116:22 0/0:0,12,126:13 0/0:0,12,104:13 0/0:0,81,255:82 0/0:0,33,255:34 0/0:0,45,255:46
chr12 6962376 . T C 999 . DP=822;VDB=0.0322;AF1=0.4771;G3=0.4352,0.1795,0.3852;HWE=0.000127;AC1=34;DP4=158,179,150,266;MQ=33;FQ=999;PV4=0.0029,1.3e-264,4.4e-18,1 GT:PL:GQ 1/1:172,117,0:99 1/1:188,72,0:69 1/1:192,108,0:99 1/1:195,108,0:99 1/1:203,123,0:99 1/1:102,42,0:39 1/1:125,33,0:30 1/1:194,90,0:87 1/1:179,69,0:66 1/1:87,15,0:12 1/1:181,78,0:75 0/0:0,45,255:42 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/0:0,39,214:36 0/0:0,51,213:48 0/0:0,18,124:16 0/0:0,57,255:54 0/0:0,6,8:4 0/0:0,57,255:54 0/0:0,18,71:16 0/0:0,66,255:63 1/1:157,39,0:36 0/0:0,30,155:27 0/1:98,0,232:99 0/1:139,0,129:99 0/1:65,0,255:68 0/1:91,0,255:94 1/1:182,70,0:67 0/0:0,117,255:99 0/1:45,0,159:48 0/0:0,39,252:36 0/1:25,0,74:28 0/0:0,60,255:57 0/0:0,66,255:63 0/0:0,54,255:51
chr12 6962447 . C G 47.6 . DP=877;VDB=0.0103;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=418,341,6,3;MQ=31;FQ=47.6;PV4=0.74,7.8e-25,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,117,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,238:51 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,200:81 0/0:0,66,255:81 0/0:0,87,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,18,123:33 0/0:0,60,248:75 0/0:0,69,183:84 0/0:0,33,34:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,39,128:54 0/0:0,72,184:87 0/0:0,48,41:63 0/0:0,60,199:75 0/0:0,66,49:80 0/0:0,51,194:66 0/0:0,36,32:51 0/0:0,69,255:84 0/1:93,0,71:77 0/0:0,27,175:42 0/0:0,123,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,63,225:78 0/0:0,75,255:90 0/0:0,72,249:87 0/0:0,27,182:42 0/0:0,30,187:45 0/0:0,81,255:96 0/0:0,69,255:84 0/0:0,66,255:81
chr12 6962509 . C T 82.6 . DP=777;VDB=0.0337;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=343,318,6,7;MQ=53;FQ=82.6;PV4=0.78,5.3e-20,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:81 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,63,255:78 0/0:0,66,255:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,21,197:36 0/1:128,0,250:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,18,175:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,30,240:45 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,230:60 0/0:0,54,255:69 0/0:0,33,236:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,33,158:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,27,244:42 0/0:0,21,187:36 0/0:0,126,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,245:51 0/0:0,96,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,36,247:51 0/0:0,42,255:57 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,60,255:75
chr12 6962617 . A C 13.2 . DP=813;VDB=0.0193;AF1=0.1143;AC1=8;DP4=324,170,20,80;MQ=60;FQ=13.7;PV4=2.6e-17,5.3e-24,8.7e-06,1 GT:PL:GQ 0/0:213,237,255:30 0/1:16,0,229:10 0/0:0,6,215:13 0/0:227,222,255:4 0/0:3,0,235:5 0/0:0,2,151:9 0/1:19,0,212:13 0/0:0,72,255:78 0/0:131,170,255:45 0/0:0,10,184:16 0/0:0,45,255:51 0/1:23,0,230:17 0/0:6,0,159:3 0/0:0,0,0:7 0/0:0,54,255:60 0/0:0,55,255:61 0/0:0,32,255:38 0/0:0,51,255:57 0/1:18,0,184:12 0/0:0,23,255:29 0/1:9,0,169:5 0/0:0,4,207:11 0/1:11,0,217:6 0/0:0,24,182:30 0/0:0,22,249:28 0/0:0,3,255:10 0/0:5,0,225:4 0/0:0,2,170:9 0/0:0,36,245:42 0/0:0,21,255:27 0/0:0,2,179:9 0/0:0,32,255:38 0/0:0,11,206:17 0/0:2,0,255:6 0/0:0,44,255:50 0/0:0,48,255:54
chr12 6962643 . C A 211 . DP=854;VDB=0.0313;AF1=0.04286;AC1=3;DP4=359,350,11,10;MQ=60;FQ=211;PV4=1,9.4e-17,0.07,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:70 0/0:0,87,255:97 0/0:0,84,255:94 0/0:0,114,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:55 0/0:0,72,255:82 0/0:0,66,255:76 0/0:0,78,255:88 0/0:0,33,255:43 0/0:0,84,255:94 0/0:0,93,255:99 0/0:0,24,237:34 0/0:0,0,0:11 0/0:0,54,255:64 0/0:0,78,255:88 0/0:0,36,255:46 0/0:0,63,255:73 0/0:0,51,255:61 0/0:0,39,255:49 0/0:0,33,255:43 0/0:0,63,255:73 0/0:0,39,255:49 0/0:0,36,255:46 0/0:0,96,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,60,255:70 0/0:0,57,255:67 0/0:0,54,255:64 0/0:0,36,255:46 0/1:110,0,203:99 0/1:103,0,84:92 0/0:0,75,255:85 0/0:0,69,255:79 0/1:71,0,219:61
chr12 6962742 . G A 999 . DP=798;VDB=0.0618;AF1=0.05715;AC1=4;DP4=254,367,16,14;MQ=60;FQ=999;PV4=0.19,0.2,3.4e-48,0.45 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:54 0/0:0,45,254:54 0/0:0,54,255:63 0/0:0,66,255:75 0/0:0,66,255:75 0/0:0,33,255:42 0/0:0,72,255:81 0/0:0,60,255:69 0/0:0,33,252:42 0/0:0,54,255:63 1/1:255,51,0:36 0/1:163,0,151:99 0/0:0,0,0:10 0/0:0,51,255:60 0/0:0,57,255:66 0/0:0,33,255:42 0/1:131,0,215:99 0/0:0,27,245:36 0/0:0,63,255:72 0/0:0,36,255:45 0/0:0,57,255:66 0/0:0,33,235:42 0/0:0,36,255:45 0/0:0,78,255:87 0/0:0,42,251:51 0/0:0,60,255:69 0/0:0,117,255:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,105,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,45,255:54 0/0:0,39,255:48 0/0:0,102,255:99 0/0:0,45,255:54 0/0:0,42,255:51
chr12 6962815 . A G 999 . DP=826;VDB=0.0329;AF1=0.3144;G3=0.6857,9.52e-09,0.3143;HWE=4.26e-11;AC1=22;DP4=295,185,119,99;MQ=60;FQ=999;PV4=0.096,1,0.013,1 GT:PL:GQ 1/1:255,87,0:81 1/1:255,69,0:63 1/1:255,63,0:57 1/1:255,57,0:51 1/1:255,84,0:78 1/1:255,48,0:42 1/1:255,45,0:39 1/1:255,78,0:72 1/1:255,51,0:45 1/1:206,24,0:18 1/1:255,45,0:39 0/0:0,72,255:72 0/0:0,36,244:36 0/0:0,0,0:3 0/0:0,54,255:54 0/0:0,57,255:57 0/0:0,33,255:33 0/0:0,63,255:63 0/0:0,57,255:57 0/0:0,72,255:72 0/0:0,21,205:21 0/0:0,48,255:48 0/0:0,30,249:30 0/0:0,18,147:18 0/0:0,105,255:99 0/0:0,72,255:72 0/0:0,90,255:90 0/0:0,87,255:87 0/0:0,96,255:96 0/0:0,78,255:78 0/0:0,57,255:57 0/0:0,36,255:36 0/0:0,45,255:45 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:66 0/0:0,45,255:45
chr12 6962852 . C T 999 . DP=793;VDB=0.0349;AF1=0.3146;G3=0.6857,1.269e-08,0.3143;HWE=4.44e-11;AC1=22;DP4=224,239,88,106;MQ=59;FQ=999;PV4=0.49,2.4e-191,1,1 GT:PL:GQ 1/1:201,69,0:63 1/1:188,69,0:63 1/1:140,33,0:27 1/1:163,48,0:42 1/1:219,75,0:69 1/1:110,24,0:18 1/1:158,54,0:48 1/1:178,63,0:57 1/1:199,51,0:45 1/1:136,27,0:21 1/1:194,69,0:63 0/0:0,60,255:60 0/0:0,36,255:36 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:57 0/0:0,63,255:63 0/0:0,18,196:18 0/0:0,45,255:45 0/0:0,21,161:21 0/0:0,81,255:81 0/0:0,15,152:15 0/0:0,45,255:45 0/0:0,36,247:36 0/0:0,27,237:27 0/0:0,120,255:99 0/0:0,81,255:81 0/0:0,87,255:87 0/0:0,78,255:78 0/0:0,69,255:69 0/0:0,87,255:87 0/0:0,33,251:33 0/0:0,39,255:39 0/0:0,57,255:57 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:81 0/0:0,51,255:51
chr12 6963043 . A G 999 . DP=808;VDB=0.0299;AF1=0.4864;G3=0.4282,0.1718,0.4;HWE=5.32e-05;AC1=35;DP4=216,68,268,38;MQ=60;FQ=999;PV4=0.00037,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:224,57,0:54 1/1:255,66,0:63 1/1:255,60,0:57 1/1:197,45,0:42 1/1:255,48,0:45 1/1:247,42,0:39 1/1:239,33,0:30 1/1:255,51,0:48 1/1:255,69,0:66 1/1:213,27,0:24 1/1:216,45,0:42 0/0:0,51,255:48 0/0:0,27,213:24 0/1:0,0,0:3 0/0:0,51,255:48 0/0:0,75,255:72 0/0:0,18,144:15 0/0:0,51,255:48 0/0:0,48,255:45 0/0:0,39,255:36 0/0:0,24,214:21 0/0:0,45,255:42 1/1:255,48,0:45 0/0:0,27,186:24 0/1:208,0,181:99 0/1:152,0,216:99 0/1:145,0,153:99 0/1:141,0,191:99 1/1:246,57,0:54 1/1:255,54,0:51 0/1:144,0,199:99 0/0:0,24,204:21 0/1:186,0,147:99 0/0:0,84,255:81 0/0:0,45,255:42 0/0:0,27,233:24
chr12 6963186 . A G 95.6 . DP=1026;VDB=0.0399;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=539,431,9,10;MQ=60;FQ=95.6;PV4=0.49,2.5e-51,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,90,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,78,255:93 0/0:0,48,255:63 0/0:0,27,222:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,81,255:96 0/0:0,33,255:48 0/0:0,96,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,87,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,30,255:45 0/0:0,135,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,114,255:99 0/1:141,0,13:34 0/0:0,93,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,63,255:78 0/0:0,141,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,84,255:99
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chr12 6963322 . G C 999 . DP=933;VDB=0.0124;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=396,492,6,9;MQ=60;FQ=999;PV4=0.8,0.26,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,105,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,54,255:69 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,39,255:54 0/0:0,84,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,24,245:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,66,255:81 0/0:0,39,255:54 0/0:0,81,255:96 0/0:0,18,158:33 0/0:0,45,255:60 0/0:0,24,174:39 0/0:0,69,255:84 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60 0/0:0,154,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,157,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,105,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,72,255:87 0/0:0,99,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,69,255:84
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chr12 6963365 . G T 999 . DP=962;VDB=0.0323;AF1=0.02859;AC1=2;DP4=372,529,14,9;MQ=60;FQ=999;PV4=0.085,1.8e-54,1,0.49 GT:PL:GQ 0/0:0,141,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,105,255:99 0/0:0,48,255:60 0/0:0,48,255:60 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,84,255:96 0/0:0,51,255:63 0/0:0,24,220:36 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,51,255:63 0/0:0,21,222:33 0/1:141,0,255:99 0/0:0,24,172:36 0/1:105,0,117:93 0/0:0,30,192:42 0/0:0,60,255:72 0/0:0,33,251:45 0/0:0,30,245:42 0/0:0,135,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,50,255:62 0/0:0,135,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,63,255:75 0/0:0,126,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,63,255:75
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chr12 6963595 . A G 999 . DP=924;VDB=0.0234;AF1=0.07151;AC1=5;DP4=219,465,14,60;MQ=57;FQ=999;PV4=0.024,3.4e-18,1,0.38 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:95 0/0:0,60,255:68 0/0:0,78,255:86 0/1:163,0,208:99 0/1:190,0,53:67 0/1:112,0,123:99 0/1:86,0,179:78 0/0:0,48,253:56 0/0:0,69,255:77 0/1:97,0,47:61 0/0:0,57,255:65 0/0:0,54,255:62 0/0:0,18,89:26 0/0:0,0,0:9 0/0:0,51,251:59 0/0:0,63,255:71 0/0:0,21,80:29 0/0:0,78,255:86 0/0:0,24,102:32 0/0:0,72,255:80 0/0:0,21,42:29 0/0:0,51,255:59 0/0:0,57,255:65 0/0:0,33,207:41 0/0:0,117,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,75,255:83 0/0:0,60,251:68 0/0:0,87,255:95 0/0:0,33,225:41 0/0:0,33,215:41 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,57,255:65
chr12 6963638 . T A 999 . DP=776;VDB=0.0228;AF1=0.08635;AC1=6;DP4=216,433,22,35;MQ=59;FQ=999;PV4=0.47,4.3e-104,0.0029,1 GT:PL:GQ 0/0:0,93,255:99 0/0:0,54,252:61 0/0:0,78,255:85 0/0:0,81,255:88 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:52 0/1:81,0,149:74 0/0:0,42,255:49 0/0:0,42,255:49 0/0:0,21,190:28 0/0:0,42,255:49 0/0:0,36,255:43 0/0:0,3,41:11 0/0:0,0,0:8 0/1:37,0,246:30 0/0:0,66,255:73 0/0:0,21,209:28 0/0:0,63,255:70 0/0:0,15,140:22 0/0:0,48,255:55 0/0:0,36,255:43 0/1:71,0,89:64 0/0:0,45,255:52 0/1:20,0,174:13 0/0:0,129,255:99 0/0:0,102,255:99 0/1:62,0,218:55 0/1:51,0,255:44 0/0:0,96,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:46 0/0:0,36,255:43 0/0:0,93,255:99 0/0:0,87,255:94 0/0:0,39,255:46
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chr12 6964012 . G T 999 . DP=299;VDB=0.0186;AF1=1;AC1=72;DP4=2,0,70,170;MQ=47;FQ=-41.4;PV4=0.088,0.0056,1,0.45 GT:PL:GQ 1/1:74,27,0:54 1/1:70,15,0:42 1/1:62,12,0:39 1/1:86,27,0:54 1/1:67,18,0:45 1/1:63,18,0:45 1/1:63,15,0:42 1/1:55,12,0:39 1/1:74,15,0:42 1/1:60,15,0:42 1/1:89,24,0:51 1/1:57,18,0:45 1/1:93,24,0:51 1/1:0,0,0:27 1/1:101,21,0:48 1/1:57,27,0:54 1/1:54,18,0:45 1/1:118,28,0:55 1/1:56,8,0:35 1/1:93,24,0:51 1/1:17,3,0:30 1/1:96,27,0:54 1/1:72,15,0:42 1/1:37,6,0:33 1/1:66,24,0:51 1/1:61,21,0:48 1/1:68,21,0:48 1/1:81,36,0:63 1/1:47,9,0:36 1/1:101,21,0:48 1/1:68,24,0:51 1/1:99,18,0:45 1/1:84,18,0:45 1/1:93,39,0:66 1/1:164,39,0:66 1/1:79,21,0:48
chr12 6964018 . G A 44.8 . DP=256;VDB=0.0006;AF1=0.01506;AC1=1;DP4=65,150,2,4;MQ=46;FQ=44.9;PV4=1,9.5e-07,0.079,1 GT:PL:GQ 0/0:0,21,149:36 0/0:0,9,88:24 0/0:0,9,94:24 0/0:0,24,159:39 0/0:0,18,148:33 0/0:0,12,114:27 0/0:0,18,140:33 0/0:0,9,97:24 0/0:0,15,152:30 0/0:0,15,105:30 0/0:0,24,165:39 0/0:0,18,87:33 0/0:0,21,78:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,21,126:36 0/0:0,30,112:45 0/0:0,18,56:33 0/0:0,39,216:54 0/0:0,9,32:24 0/0:0,21,131:36 0/0:0,3,17:18 0/0:0,24,158:39 0/0:0,15,152:30 0/0:0,6,76:21 0/0:0,24,157:39 0/0:0,21,137:36 0/0:0,12,114:27 0/0:0,36,184:51 0/0:0,9,91:24 0/1:90,0,18:39 0/0:0,18,141:33 0/0:0,18,142:33 0/0:0,18,143:33 0/0:0,33,180:48 0/0:0,36,255:51 0/0:0,18,96:33
chr12 6964398 . ctttttttttttttt cTtttttttttttttt 999 . INDEL;DP=1061;VDB=0.0390;AF1=0.9916;AC1=71;DP4=61,32,281,168;MQ=8;FQ=-34.2;PV4=0.64,1,0.25,1 GT:PL:GQ 1/1:26,22,0:34 1/1:25,33,0:45 1/1:20,22,0:34 1/1:20,27,0:39 1/1:0,4,16:3 1/1:5,0,0:12 1/1:23,22,0:34 1/1:14,20,0:32 1/1:18,31,0:42 1/1:13,13,0:25 1/1:36,50,0:61 1/1:10,3,0:15 1/1:13,4,0:16 1/1:0,0,0:12 1/1:21,12,0:24 1/1:15,14,5:21 1/1:1,0,1:11 1/1:5,0,1:11 1/1:0,12,20:5 1/1:7,0,1:11 1/1:5,7,2:17 1/1:23,15,0:27 1/1:21,8,0:20 1/1:22,12,0:24 1/1:25,49,0:54 1/1:18,15,0:27 1/1:30,40,0:51 1/1:21,34,0:45 1/1:33,48,0:58 1/1:31,68,0:61 1/1:6,4,0:16 1/1:28,36,0:48 1/1:24,15,0:27 1/1:44,44,0:56 1/1:1,0,10:4 1/1:14,15,0:27
chr12 6964633 . G T 999 . DP=1003;VDB=0.0270;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=461,438,9,13;MQ=50;FQ=999;PV4=0.39,0.0079,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,132,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,54,255:69 0/0:0,39,236:54 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,229:45 0/1:255,0,167:99 0/0:0,66,236:81 0/0:0,18,37:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,78,255:93 0/0:0,75,245:90 0/0:0,51,116:66 0/0:0,39,233:54 0/0:0,57,146:72 0/0:0,57,211:72 0/0:0,54,104:69 0/0:0,69,255:84 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,189:42 0/0:0,193,255:99 0/0:0,178,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,163,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,39,255:54 0/0:0,87,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,57,255:72
chr12 6964742 . G T 41.6 . DP=1264;VDB=0.0469;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=496,717,4,3;MQ=59;FQ=41.6;PV4=0.45,9.5e-19,3.8e-07,0.093 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,117,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:96 0/1:87,0,105:72 0/0:0,0,0:15 0/0:0,57,255:72 0/0:0,96,255:99 0/0:0,30,241:45 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,60,255:75 0/0:0,57,255:72 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,30,252:45 0/0:0,142,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,220,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,123,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,75,255:90
chr12 6964816 . Ctttttt CTtttttt 999 . INDEL;DP=1169;VDB=0.0399;AF1=0.4288;G3=0.4856,0.1715,0.3429;HWE=6.81e-05;AC1=31;DP4=259,244,245,256;MQ=58;FQ=999;PV4=0.45,1,0.13,1 GT:PL:GQ 1/1:164,93,0:89 1/1:184,126,0:99 1/1:160,120,0:99 1/1:163,120,0:99 1/1:153,138,0:99 1/1:153,57,0:53 1/1:170,75,0:71 1/1:163,66,0:62 1/1:152,81,0:77 1/1:171,99,0:95 1/1:157,66,0:62 0/0:0,78,162:76 0/0:0,24,98:22 0/1:0,0,0:3 0/0:0,78,164:76 0/0:0,63,160:61 0/0:0,30,115:28 0/0:0,93,160:91 0/0:0,30,97:28 0/0:0,48,142:46 0/0:0,57,143:55 0/0:0,78,165:76 0/1:65,0,42:46 0/0:0,30,105:28 0/0:0,157,167:99 0/1:114,0,77:81 0/1:102,0,92:96 0/1:93,0,110:95 1/1:165,146,0:99 0/0:0,166,183:99 0/1:41,0,67:43 0/0:0,27,111:25 0/1:86,0,46:50 0/0:0,99,162:97 0/0:0,108,181:99 0/0:0,45,129:43
chr12 6964837 . G A 999 . DP=1068;VDB=0.0373;AF1=0.3287;G3=0.6571,0.02858,0.3143;HWE=2.74e-09;AC1=23;DP4=355,296,176,173;MQ=53;FQ=999;PV4=0.23,9.4e-231,0.18,1 GT:PL:GQ 1/1:227,54,0:48 1/1:255,126,0:99 1/1:255,110,0:99 1/1:255,114,0:99 1/1:245,117,0:99 1/1:229,66,0:60 1/1:254,87,0:81 1/1:230,60,0:54 1/1:226,66,0:60 1/1:252,87,0:81 1/1:255,72,0:66 0/0:0,99,255:99 0/0:0,30,207:30 0/0:0,0,0:3 0/1:104,0,225:99 0/0:0,84,255:84 0/0:0,45,243:45 0/0:0,60,255:60 0/0:0,33,191:33 0/0:0,63,255:63 0/0:0,51,253:51 0/0:0,84,255:84 0/0:0,51,255:51 0/0:0,24,207:24 0/0:0,126,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,145,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,66,255:66 0/0:0,39,255:39 0/0:0,57,255:57 0/0:0,105,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,45,255:45
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chr12 6965341 . T C 999 . DP=603;VDB=0.0376;AF1=0.9579;G3=0.07984,6.957e-07,0.9202;HWE=0.000892;AC1=69;DP4=53,18,157,295;MQ=23;FQ=999;PV4=2.7e-10,1.5e-92,1,1 GT:PL:GQ 1/1:144,42,0:52 1/1:132,23,0:33 1/1:150,35,0:45 1/1:67,0,9:3 1/1:125,20,0:30 1/1:56,7,0:17 1/1:88,18,0:28 1/1:147,42,0:52 1/1:199,48,0:58 1/1:129,24,0:34 1/1:171,48,0:58 1/1:166,20,0:30 1/1:0,3,4:9 1/1:0,0,0:10 1/1:160,28,0:38 1/1:124,18,0:28 1/1:0,9,9:10 1/1:140,20,0:30 1/1:0,15,14:9 1/1:80,4,0:14 1/1:0,12,11:10 1/1:214,70,0:80 1/1:189,56,0:66 1/1:91,15,0:25 1/1:178,58,0:68 1/1:154,30,0:40 1/1:164,47,0:57 1/1:197,71,0:81 1/1:176,63,0:73 1/1:180,75,0:85 1/1:122,33,0:43 1/1:127,24,0:34 1/1:193,54,0:64 1/1:194,72,0:82 0/0:0,75,255:59 1/1:188,75,0:85
chr12 6965370 . G A 8.97 . DP=671;VDB=0.0180;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=215,394,9,7;MQ=32;FQ=9.08;PV4=0.11,5.4e-41,0.03,0.32 GT:PL:GQ 0/0:0,51,219:64 0/0:0,54,247:67 0/0:0,72,156:85 0/0:0,30,214:43 0/0:0,48,225:61 0/0:0,21,117:34 0/0:0,21,188:34 0/0:0,36,207:49 0/0:0,42,225:55 0/0:0,24,137:37 0/0:0,54,209:67 0/0:0,87,239:99 0/0:0,15,17:28 0/0:0,0,0:13 0/1:37,0,76:24 0/0:0,45,139:58 0/0:0,48,13:45 0/0:0,60,162:73 0/0:0,21,15:34 0/1:32,0,105:19 0/0:0,8,6:21 0/0:0,84,255:97 0/0:0,90,255:99 0/0:0,18,143:31 0/0:0,78,238:91 0/0:0,63,219:76 0/0:0,78,255:91 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,234:85 0/0:0,72,232:85 0/0:0,42,217:55 0/0:0,30,208:43 0/0:0,63,255:76 0/0:0,72,237:85 0/0:0,75,255:88 0/0:0,69,253:82
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chr12 6966222 . C T 999 . DP=172;VDB=0.0116;AF1=1;AC1=72;DP4=20,2,21,89;MQ=12;FQ=-28.5;PV4=1.8e-10,1.9e-26,1,1 GT:PL:GQ 1/1:15,6,0:20 1/1:49,12,0:26 1/1:43,10,0:24 1/1:8,0,13:4 1/1:42,7,0:21 1/1:55,13,0:27 1/1:22,6,0:20 1/1:20,3,0:17 1/1:87,27,0:41 1/1:35,6,0:20 1/1:9,3,0:17 1/1:0,9,9:14 1/1:0,0,0:14 1/1:0,0,0:14 1/1:33,5,0:19 1/1:11,0,0:14 1/1:4,3,0:17 1/1:7,3,0:17 1/1:0,0,0:14 1/1:26,8,0:22 1/1:0,3,4:13 1/1:38,9,0:23 1/1:15,1,0:15 1/1:14,3,0:17 1/1:4,3,0:17 1/1:29,9,0:23 1/1:24,12,0:26 1/1:49,18,0:32 1/1:45,9,0:23 1/1:20,9,0:23 1/1:41,21,0:35 1/1:34,9,0:23 1/1:41,12,0:26 1/1:0,0,0:14 1/1:51,15,0:29 1/1:84,27,0:41
chr12 6966246 . C T 999 . DP=202;VDB=0.0207;AF1=1;AC1=72;DP4=18,5,36,90;MQ=13;FQ=-33.9;PV4=1e-05,3.1e-14,1,1 GT:PL:GQ 1/1:44,12,0:30 1/1:67,18,0:36 1/1:50,18,0:36 1/1:18,16,4:30 1/1:44,9,0:27 1/1:60,23,0:41 1/1:22,6,0:24 1/1:50,12,0:30 1/1:96,25,0:43 1/1:35,6,0:24 1/1:14,3,0:21 1/1:0,5,5:18 1/1:0,0,0:18 1/1:0,0,0:18 1/1:34,8,0:26 1/1:20,3,0:21 1/1:0,3,4:17 1/1:11,5,0:23 1/1:0,9,11:16 1/1:31,9,0:27 1/1:0,18,12:23 1/1:38,9,0:27 1/1:28,3,0:21 1/1:25,6,0:24 1/1:24,6,0:24 1/1:29,9,0:27 1/1:24,12,0:30 1/1:55,21,0:39 1/1:50,12,0:30 1/1:13,3,0:21 1/1:43,12,0:30 1/1:39,12,0:30 1/1:41,12,0:30 1/1:0,0,0:18 1/1:51,15,0:33 1/1:89,27,0:45
chr12 6966323 . TTTATTATTATTATTAttatta TTTATTATTATTAttatta 999 . INDEL;DP=420;VDB=0.0364;AF1=0.6558;AC1=47;DP4=13,43,72,93;MQ=40;FQ=999;PV4=0.0069,1,2.1e-10,0.23 GT:PL:GQ 1/1:255,48,0:48 1/1:239,60,0:60 1/1:157,30,0:30 1/1:143,57,0:57 1/1:255,57,0:57 1/1:38,12,0:12 1/1:146,21,0:21 1/1:149,27,0:27 1/1:11,12,0:11 1/1:175,21,0:21 1/1:146,33,0:33 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:44,44,44:3 0/1:0,0,0:3 0/0:0,12,138:7 0/1:0,3,44:5 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/0:0,6,40:3 0/1:68,0,155:74 0/1:153,0,127:99 0/1:121,0,186:99 0/1:71,0,159:77 1/1:100,12,0:12 0/0:0,21,193:15 0/1:93,0,48:48 0/0:0,9,110:5 0/1:86,0,255:92 0/1:37,37,37:3 0/0:0,21,231:15 0/1:0,0,0:3
chr12 6966329 . A G 93.8 . DP=412;VDB=0.0173;AF1=0.03778;G3=0.9645,1.697e-06,0.03545;HWE=0.00466;AC1=2;DP4=42,117,1,8;MQ=37;FQ=94;PV4=0.45,0.0036,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,12,27:23 0/0:0,6,7:17 0/0:0,0,0:11 0/0:0,12,72:23 0/0:0,36,147:47 0/0:0,9,45:20 0/0:0,12,33:23 0/0:0,6,7:17 0/0:0,6,41:17 0/0:0,15,58:26 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,14:14 0/0:0,0,0:11 0/0:0,6,56:17 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,19:14 0/0:0,15,122:26 0/0:0,3,5:14 0/0:0,15,122:26 0/0:0,9,71:20 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,18,141:29 0/0:0,33,222:44 0/0:0,24,160:35 0/0:0,27,179:38 0/0:0,24,164:35 0/0:0,21,62:32 1/1:157,27,0:10 0/0:0,12,98:23 0/0:0,15,129:26 0/0:0,21,175:32 0/0:0,75,255:86 0/0:0,36,209:47 0/0:0,3,25:14
chr12 6966342 . ttagt tt 79.7 . INDEL;DP=361;VDB=0.0353;AF1=0.3031;AC1=22;DP4=33,46,6,27;MQ=43;FQ=81.3;PV4=0.018,5.3e-16,1,1 GT:PL:GQ 0/1:32,3,0:5 0/1:8,0,0:5 1/1:32,9,0:4 0/1:14,2,0:5 1/1:39,7,0:3 0/0:0,1,0:3 0/1:13,1,0:6 0/1:18,1,0:7 0/0:0,3,4:5 0/1:18,2,0:6 0/1:8,1,0:5 0/0:0,3,30:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,9,46:10 0/0:0,3,23:5 0/0:0,12,111:13 0/0:0,3,36:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,9,45:10 0/1:6,0,58:6 0/0:0,2,76:5 0/0:0,9,71:10 0/0:0,18,94:19 0/1:45,38,35:4 0/0:0,9,84:10 0/1:9,0,30:9 0/0:0,6,64:8 0/0:0,21,190:22 0/0:0,12,77:13 0/0:0,21,165:22 0/0:0,0,0:3
chr12 6966344 . agt at 999 . INDEL;DP=355;VDB=0.0349;AF1=0.04958;G3=0.9582,5.207e-06,0.04183;HWE=0.00576;AC1=3;DP4=32,43,10,12;MQ=40;FQ=999;PV4=0.81,0.023,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,12,11:22 0/0:0,6,7:16 0/0:0,0,0:10 0/0:0,3,4:13 0/0:0,18,24:28 0/0:0,3,4:13 0/0:0,9,9:19 0/0:0,12,11:22 0/0:0,3,4:13 0/0:0,9,9:19 0/0:0,6,7:16 0/0:0,3,30:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:16,22,34:16 0/0:0,3,23:13 0/0:0,12,117:22 0/0:0,3,40:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,6,51:16 0/0:0,9,82:19 0/0:0,15,106:25 0/0:0,9,76:19 0/0:0,18,111:28 0/0:0,0,0:10 0/0:0,9,94:19 0/0:0,3,40:13 0/0:0,6,65:16 0/0:0,21,203:31 1/1:255,57,3:38 0/0:0,21,181:31 0/0:0,0,0:10
chr12 6966345 . gtttatttatttatttatttatttatttatttatttatttattt gtttatttatttatttatttatttatttatttatttattt 125 . INDEL;DP=344;VDB=0.0366;AF1=0.2863;G3=0.6672,4.801e-05,0.3327;HWE=0.00932;AC1=20;DP4=7,15,8,6;MQ=39;FQ=127;PV4=0.18,1,0.19,0.4 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,6,7:8 0/0:0,0,0:3 0/0:0,3,4:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,3,4:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,3,2:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:15,24,119:11 0/0:0,6,46:8 0/1:35,3,0:6 0/0:126,126,126:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 1/1:96,12,0:6 0/0:0,0,0:3 1/1:71,9,0:4 0/0:0,18,255:19 0/0:0,0,0:3 0/0:0,15,177:16 0/0:0,0,0:3
chr12 6966385 . atttttt aTTTATtttttt 3.69 . INDEL;DP=580;VDB=0.0094;AF1=0.01902;AC1=1;DP4=382,10,13,5;MQ=9;FQ=3.74;PV4=0.00021,1,1,7.6e-12 GT:PL:GQ 0/0:0,54,8:47 0/0:0,63,6:45 0/0:0,135,6:45 0/0:0,87,6:45 0/0:0,78,7:46 0/0:0,21,13:37 0/0:0,42,11:50 0/0:0,30,12:45 0/0:0,51,9:48 0/0:0,42,9:48 0/0:0,57,9:48 0/0:0,0,0:17 0/0:0,0,0:17 0/0:0,0,0:17 0/0:0,3,4:20 0/0:0,12,11:29 0/0:0,0,0:17 0/0:0,18,12:34 0/0:0,0,0:17 0/0:0,0,0:17 0/0:0,0,0:17 0/0:0,3,4:20 0/0:0,3,4:20 0/0:5,14,18:26 0/1:58,5,0:18 0/0:0,27,13:43 0/0:0,57,22:61 0/0:0,72,6:45 0/0:0,24,13:40 0/0:0,66,8:47 0/0:0,69,11:50 0/0:0,30,26:47 0/0:0,39,75:56 0/0:0,30,12:45 0/0:0,36,94:53 0/0:0,9,19:26
chr12 6966467 . G A 71.7 . DP=901;VDB=0.0021;AF1=0.1414;AC1=10;DP4=526,92,104,37;MQ=16;FQ=72.3;PV4=0.0018,2.5e-71,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,15,12:19 0/0:0,37,9:25 0/0:0,9,4:13 0/0:0,26,11:25 0/1:9,4,0:3 0/1:15,3,0:6 0/0:4,0,0:3 0/0:4,6,0:7 0/1:22,2,0:9 0/0:0,9,15:14 0/0:8,8,0:5 0/0:3,0,30:4 0/0:0,33,12:27 0/0:0,0,0:6 0/0:0,40,74:45 0/0:0,23,26:28 0/0:0,45,10:26 0/1:26,0,82:21 0/0:0,45,10:26 0/0:0,52,128:57 0/0:0,60,11:27 0/0:0,18,143:23 0/1:5,0,86:3 0/0:0,2,60:8 0/1:18,0,108:13 0/0:0,31,110:36 0/0:0,10,103:15 0/0:0,83,158:88 0/1:9,0,23:5 0/0:0,25,83:30 0/0:0,8,29:13 0/0:0,17,125:22 0/1:58,0,57:53 0/0:0,50,129:55 0/0:0,28,143:33 0/1:19,0,137:14
chr12 6966490 . C T 48.4 . DP=746;VDB=0.0223;AF1=0.02921;AC1=2;DP4=524,100,19,5;MQ=17;FQ=48.5;PV4=0.57,1.9e-25,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,42,28:53 0/0:0,42,15:45 0/0:0,48,47:60 0/0:0,39,23:49 0/0:0,36,30:48 0/0:0,39,33:51 0/0:0,12,25:24 0/0:0,24,39:36 0/0:0,30,39:42 0/0:0,27,34:39 0/0:0,33,31:45 0/0:0,33,101:45 0/0:0,30,12:39 0/0:0,0,0:12 0/0:2,4,0:14 0/0:0,23,15:35 0/0:0,39,13:43 0/1:60,0,85:48 0/0:0,48,10:40 0/1:49,0,61:37 0/0:0,27,7:35 0/0:0,63,198:75 0/0:0,78,160:90 0/0:0,27,115:39 0/0:0,72,153:84 0/0:0,105,145:99 0/0:0,78,177:90 0/0:0,108,162:99 0/0:0,75,70:87 0/0:0,154,156:99 0/0:0,39,55:51 0/0:0,27,151:39 0/0:0,69,150:81 0/0:0,93,148:99 0/0:0,81,161:93 0/0:0,60,235:72
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chr12 6966657 . G A 26.6 . DP=728;VDB=0.0333;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=426,205,6,0;MQ=51;FQ=26.7;PV4=0.18,4.4e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,36,255:51 0/0:0,69,255:84 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,48,217:63 0/0:0,48,255:63 0/1:72,0,149:57 0/0:0,45,255:60 0/0:0,42,234:57 0/0:0,63,255:78 0/0:0,60,255:75 0/0:0,51,197:66 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,213:60 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,128:42 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,192:54 0/0:0,72,255:87 0/0:0,45,224:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,63,255:78 0/0:0,15,166:30 0/0:0,87,203:99 0/0:0,57,199:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,66,255:81 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,24,170:39 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,69,236:84 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75
chr12 6966671 . A C 23.9 . DP=722;VDB=0.0348;AF1=0.1007;G3=0.8133,9.252e-06,0.1867;HWE=0.00221;AC1=7;DP4=289,156,9,4;MQ=53;FQ=24.3;PV4=1,1.8e-15,0.5,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:7 0/1:29,6,0:7 0/0:0,0,0:7 0/1:14,3,0:5 0/1:19,3,0:7 0/0:0,0,0:7 0/1:51,20,14:7 0/0:0,0,0:7 0/0:0,0,0:7 0/1:40,18,15:9 0/1:13,3,0:4 0/0:0,45,231:52 0/0:0,39,210:46 0/0:0,0,0:7 0/0:0,42,235:49 0/0:0,60,255:67 0/0:0,45,240:52 0/0:0,69,255:76 0/0:0,36,203:43 0/0:0,60,255:67 0/0:0,51,255:58 0/0:0,33,238:40 0/0:0,69,255:76 0/0:0,15,158:22 0/0:0,75,192:82 0/0:0,63,233:70 0/0:0,60,253:67 0/0:0,47,241:54 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:82 0/0:0,21,158:28 0/0:0,42,255:49 0/0:0,51,255:58 0/0:0,69,199:76 0/0:0,81,255:88 0/0:0,51,255:58
chr12 6966672 . C T 23.4 . DP=727;VDB=0.0355;AF1=0.1037;G3=0.8487,3.321e-05,0.1512;HWE=0.0104;AC1=7;DP4=303,162,7,4;MQ=53;FQ=23.8;PV4=1,1.7e-36,0.1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:7 0/1:34,6,0:7 0/1:16,3,0:6 0/1:14,3,0:5 0/1:33,6,0:7 0/0:0,0,0:7 0/1:7,0,35:3 0/0:0,0,0:7 0/0:0,0,0:7 0/1:8,0,21:4 0/1:28,6,0:7 0/0:0,48,255:55 0/0:0,39,212:46 0/0:0,0,0:7 0/0:0,39,234:46 0/0:0,63,255:70 0/0:0,51,255:58 0/0:0,66,255:73 0/0:0,36,221:43 0/0:0,66,255:73 0/0:0,54,255:61 0/0:0,30,255:37 0/0:0,66,255:73 0/0:0,15,163:22 0/0:0,78,205:85 0/0:0,63,246:70 0/0:0,63,255:70 0/0:0,72,255:79 0/0:0,129,255:99 0/0:0,75,255:82 0/0:0,24,168:31 0/0:0,45,255:52 0/0:0,48,255:55 0/0:0,69,207:76 0/0:0,84,255:91 0/0:0,60,255:67
chr12 6966691 . cttttttttttttt cTttttttttttttt 96.1 . INDEL;DP=808;VDB=0.0387;AF1=0.3694;G3=0.5854,9.312e-06,0.4146;HWE=2.35e-07;AC1=27;DP4=210,64,120,70;MQ=57;FQ=98.1;PV4=0.0018,1,1.5e-14,0.44 GT:PL:GQ 0/0:0,27,34:26 0/0:0,60,44:48 0/0:0,51,37:41 0/0:0,47,44:44 0/0:0,63,43:48 0/0:0,30,48:29 0/0:0,12,18:11 0/0:0,8,22:8 0/0:0,30,45:29 0/0:0,25,25:23 0/0:0,17,19:16 1/1:39,18,0:13 0/1:10,3,0:4 0/1:0,0,0:3 1/1:25,11,0:7 1/1:42,43,37:2 1/1:45,38,21:11 1/1:36,35,23:6 1/1:24,6,0:3 1/1:29,23,10:8 1/1:52,46,28:12 0/1:13,0,2:7 0/1:10,0,5:8 0/1:7,6,7:3 1/1:22,32,0:17 0/0:34,61,45:16 0/0:0,5,12:6 0/0:0,1,17:3 0/0:0,40,41:39 1/1:43,21,0:16 0/1:10,1,0:5 1/1:16,6,0:3 0/0:0,6,17:6 0/0:0,44,20:25 0/0:0,37,57:36 0/0:26,33,37:7
chr12 6966704 . tg tNg 999 . INDEL;DP=875;VDB=0.0380;AF1=0.3981;AC1=29;DP4=171,74,74,57;MQ=57;FQ=999;PV4=0.012,1,1.1e-15,0.001 GT:PL:GQ 0/0:0,30,124:29 0/0:0,48,165:47 0/0:0,33,139:32 0/0:0,24,166:23 0/0:0,24,164:23 0/0:0,30,127:29 0/0:0,15,61:14 0/0:0,21,124:20 0/0:0,14,125:13 0/1:0,0,71:4 0/1:12,0,60:13 1/1:141,21,0:16 0/1:50,0,2:8 0/1:0,0,0:3 0/1:82,1,0:5 1/1:54,6,0:4 0/1:147,3,0:4 1/1:75,12,0:8 0/1:121,0,24:29 1/1:67,12,0:8 1/1:124,6,0:4 0/1:109,0,45:50 0/1:112,0,73:78 0/1:27,0,20:23 1/1:139,5,0:3 0/0:0,27,114:26 0/1:92,0,122:93 0/1:88,0,119:89 0/1:27,0,153:28 0/1:169,0,12:17 0/1:63,0,25:30 0/1:86,0,11:16 0/1:39,0,96:40 0/0:0,33,119:32 0/0:0,23,175:22 0/1:53,0,80:54
chr12 6966717 . C T 999 . DP=891;VDB=0.0284;AF1=0.1557;AC1=11;DP4=369,209,98,37;MQ=54;FQ=999;PV4=0.057,2.7e-54,1,1 GT:PL:GQ 0/1:103,0,120:99 1/1:250,105,0:95 0/1:157,0,183:99 0/0:0,96,255:99 0/1:180,0,255:99 0/1:126,0,207:99 0/1:58,0,121:54 0/1:165,0,59:69 0/0:0,72,255:76 0/1:13,0,202:9 1/1:206,81,0:71 0/0:0,51,255:55 0/0:0,21,166:25 0/0:0,0,0:5 0/0:0,42,232:46 0/0:0,39,229:43 0/0:0,48,255:52 0/0:0,45,255:49 0/0:0,45,255:49 0/0:0,27,195:31 0/0:0,63,255:67 0/0:0,36,255:40 0/0:0,57,255:61 0/0:0,15,142:19 0/0:0,69,255:73 0/0:0,81,255:85 0/0:0,84,255:88 0/0:0,96,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,90,255:94 0/0:0,21,190:25 0/0:0,24,215:28 0/0:0,60,255:64 0/0:0,75,255:79 0/0:0,81,255:85 0/0:0,60,255:64
chr12 6966849 . G A 999 . DP=997;VDB=0.0273;AF1=0.08698;AC1=6;DP4=405,499,21,23;MQ=40;FQ=999;PV4=0.76,1.9e-59,0.049,0.0075 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:94 0/0:0,93,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:97 0/0:0,84,255:91 0/0:0,66,255:73 0/0:0,69,255:76 0/0:0,66,255:73 0/0:0,78,255:85 0/0:0,60,255:67 0/0:0,105,255:99 1/1:159,18,0:6 0/0:0,0,42:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,51,215:58 0/0:0,63,219:70 0/1:25,0,51:18 0/1:68,0,147:61 0/1:118,7,0:7 0/0:0,84,255:91 0/0:0,75,227:82 0/0:0,60,255:67 0/1:73,0,115:66 0/0:0,21,179:28 0/0:0,108,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,72,255:79 0/0:0,27,193:34 0/0:0,54,255:61 0/0:0,141,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,48,255:55
chr12 6966868 . A G 7.45 . DP=993;VDB=0.0074;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=437,499,2,4;MQ=44;FQ=7.5;PV4=0.69,1.7e-15,0.015,0.092 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:85 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:85 0/0:0,78,255:94 0/0:0,69,255:85 0/0:0,63,255:79 0/0:0,105,255:99 0/0:0,54,255:70 0/0:0,33,206:49 0/0:0,0,0:16 0/0:0,42,255:58 0/1:52,0,213:36 0/0:0,36,171:52 0/0:0,84,255:99 0/0:0,48,255:64 0/0:0,81,255:97 0/0:0,60,255:76 0/0:0,66,255:82 0/0:0,54,255:70 0/0:0,21,204:37 0/0:0,117,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,69,255:85 0/0:0,15,120:31 0/0:0,63,255:79 0/0:0,114,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,45,255:61
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chr12 6967835 . C A 999 . DP=117;VDB=0.0046;AF1=1;AC1=72;DP4=1,0,22,66;MQ=30;FQ=-32;PV4=0.26,1.1e-05,1,0.092 GT:PL:GQ 1/1:43,9,0:25 1/1:0,0,0:16 1/1:46,9,0:25 1/1:39,6,0:22 1/1:0,0,0:16 1/1:0,3,4:15 1/1:0,0,0:16 1/1:0,0,0:16 1/1:66,12,0:28 1/1:35,6,0:22 1/1:0,0,0:16 1/1:72,12,0:28 1/1:0,0,0:16 1/1:0,0,0:16 1/1:53,9,0:25 1/1:41,6,0:22 1/1:0,0,0:16 1/1:0,0,0:16 1/1:0,0,0:16 1/1:76,15,0:31 1/1:7,6,0:22 1/1:29,6,0:22 1/1:22,3,0:19 1/1:55,9,0:25 1/1:84,15,0:31 1/1:0,0,0:16 1/1:65,12,0:28 1/1:143,36,0:52 1/1:4,3,0:19 1/1:83,18,0:34 1/1:0,0,0:16 1/1:44,6,0:22 1/1:102,21,0:37 1/1:52,12,0:28 1/1:86,21,0:37 1/1:77,12,0:28
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chr12 6967871 . C A 999 . DP=330;VDB=0.0110;AF1=1;AC1=72;DP4=1,5,107,174;MQ=40;FQ=-38.5;PV4=0.41,1.4e-07,1,1 GT:PL:GQ 1/1:113,24,0:48 1/1:51,8,0:32 1/1:108,21,0:45 1/1:182,48,0:72 1/1:105,18,0:42 1/1:71,12,0:36 1/1:168,45,0:69 1/1:115,24,0:48 1/1:132,24,0:48 1/1:68,12,0:36 1/1:77,12,0:36 1/1:106,21,0:45 1/1:4,3,0:27 1/1:0,0,0:24 1/1:100,18,0:42 1/1:79,18,0:42 1/1:7,8,0:32 1/1:61,9,0:33 1/1:4,3,0:27 1/1:84,18,0:42 1/1:0,9,11:22 1/1:51,9,0:33 1/1:87,15,0:39 1/1:83,18,0:42 1/1:159,36,0:60 1/1:78,12,0:36 1/1:205,60,0:84 1/1:235,81,0:99 1/1:72,15,0:39 1/1:180,39,0:63 1/1:103,27,0:51 1/1:79,15,0:39 1/1:147,33,0:57 1/1:185,45,0:69 1/1:191,57,0:81 1/1:112,21,0:45
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chr12 6968007 . G A 35.6 . DP=793;VDB=0.0253;AF1=0.0144;AC1=1;DP4=419,190,8,3;MQ=28;FQ=35.7;PV4=1,3.5e-09,0.076,1 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,87,255:99 0/0:0,27,92:42 0/0:0,42,161:57 0/0:0,45,225:60 0/0:0,84,255:99 0/0:0,45,207:60 0/0:0,72,224:87 0/0:0,48,159:63 0/0:0,57,21:58 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,171:75 0/0:0,63,105:78 0/0:0,21,20:36 0/0:0,45,151:60 0/0:0,33,21:48 0/0:0,42,89:57 0/0:0,36,13:47 0/0:0,36,183:51 0/0:0,30,116:45 0/0:0,18,167:33 0/0:0,51,193:66 0/0:0,75,222:90 0/0:0,48,186:63 0/0:0,78,224:93 0/0:0,63,221:78 0/0:0,39,192:54 0/1:81,0,0:21 0/0:0,24,151:39 0/0:0,39,243:54 0/0:0,69,255:84 0/0:0,75,255:90 0/0:0,36,190:51
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chr12 6968269 . A T 999 . DP=660;VDB=0.0158;AF1=0.3249;G3=0.5856,0.09325,0.3211;HWE=5.96e-05;AC1=23;DP4=266,149,52,30;MQ=51;FQ=999;PV4=0.9,4.3e-117,1,0.1 GT:PL:GQ 1/1:77,10,0:5 1/1:117,27,0:21 0/1:27,2,0:6 1/1:72,7,0:3 1/1:67,20,0:14 1/1:68,8,0:4 1/1:100,15,0:9 1/1:67,10,0:5 0/1:44,5,0:4 0/1:30,1,0:6 1/1:94,21,0:15 0/0:0,36,240:36 0/1:16,3,0:5 0/0:0,0,0:3 0/0:0,15,44:15 0/0:0,39,225:39 0/0:0,6,32:7 0/0:0,54,255:54 0/0:0,27,170:27 0/0:0,18,164:18 0/0:0,24,135:24 0/0:0,12,78:12 0/1:8,0,51:8 0/0:0,36,246:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,48,255:48 0/0:0,69,255:69 0/0:0,161,255:99 0/1:52,0,219:52 0/0:0,96,255:96 0/0:0,72,255:72 0/0:0,54,255:54 0/1:27,0,150:27 0/0:0,123,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,42,255:42
chr12 6968279 . Gcacacacacacacacacacaca Gcacacacacacacacacaca 999 . INDEL;DP=637;VDB=0.0258;AF1=0.4173;G3=0.5537,0.07591,0.3704;HWE=5.46e-06;AC1=30;DP4=171,77,120,60;MQ=58;FQ=999;PV4=0.67,1,0.13,1 GT:PL:GQ 1/1:255,36,0:32 1/1:249,21,0:17 1/1:168,18,0:14 1/1:255,33,0:29 1/1:255,36,0:32 1/1:227,15,0:11 1/1:255,20,0:16 1/1:247,24,0:20 1/1:87,12,0:8 1/1:146,9,0:6 1/1:255,21,0:17 0/0:0,12,255:11 0/1:23,0,74:25 0/1:0,0,0:3 0/0:0,6,78:6 0/0:24,51,255:25 0/1:53,27,24:4 0/0:196,217,255:20 0/0:0,12,163:11 0/0:58,68,164:9 0/0:0,6,84:6 0/0:0,9,105:8 0/1:55,55,55:3 0/1:13,0,205:15 0/0:0,45,255:43 0/0:201,228,255:25 0/0:109,169,255:58 0/0:0,67,255:65 0/1:255,255,255:3 0/1:255,255,255:3 0/0:0,15,230:14 0/0:0,51,255:49 0/0:175,196,255:20 0/0:0,51,255:49 0/0:0,96,255:94 0/1:8,0,250:10
chr12 6968329 . C T 97.6 . DP=951;VDB=0.0278;AF1=0.01432;AC1=1;DP4=559,339,5,7;MQ=59;FQ=97.7;PV4=0.23,1.1e-25,0.44,1 GT:PL:GQ 0/0:0,123,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,163,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:93 0/1:143,0,212:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/0:0,24,194:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60 0/0:0,15,173:30 0/0:0,45,255:60 0/0:0,30,255:45 0/0:0,30,217:45 0/0:0,15,166:30 0/0:0,33,255:48 0/0:0,24,169:39 0/0:0,33,238:48 0/0:0,141,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,69,255:84 0/0:0,72,255:87 0/0:0,111,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,63,255:78
chr12 6968377 . cagga cAGGagga 999 . INDEL;DP=1011;VDB=0.0389;AF1=0.04309;AC1=3;DP4=503,407,11,11;MQ=60;FQ=999;PV4=0.67,1,1.5e-84,0.035 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,78,255:88 0/0:0,126,255:99 0/0:0,66,255:76 0/0:0,108,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,42,255:52 0/0:0,12,123:22 0/0:0,0,0:11 0/0:0,42,174:52 0/1:255,0,97:99 0/0:0,15,118:25 0/0:0,24,169:34 0/0:0,12,103:22 0/1:215,0,139:99 0/1:199,0,42:58 0/0:0,48,255:58 0/0:0,30,235:40 0/0:0,18,156:28 0/0:0,105,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,126,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,54,255:64 0/0:0,54,255:64 0/0:0,66,255:76 0/0:0,135,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:64
chr12 6968411 . C A 157 . DP=1002;VDB=0.0745;AF1=0.02282;G3=0.9714,2.714e-08,0.02857;HWE=0.00434;AC1=2;DP4=491,479,4,3;MQ=59;FQ=158;PV4=1,1,1.6e-23,0.33 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,78,255:92 0/0:0,120,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,66,255:80 0/0:0,15,158:29 0/0:0,0,0:14 0/0:0,42,255:56 0/0:0,72,255:86 0/0:0,27,251:41 0/0:0,33,255:47 1/1:221,21,0:4 0/0:0,39,255:53 0/0:0,18,192:32 0/0:0,48,255:62 0/0:0,42,255:56 0/0:0,27,228:41 0/0:0,129,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,72,255:86 0/0:0,132,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,84,255:98 0/0:0,66,255:80 0/0:0,42,255:56 0/0:0,72,255:86 0/0:0,126,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,42,255:56
chr12 6968547 . actct act 999 . INDEL;DP=894;VDB=0.0386;AF1=0.02875;G3=0.9714,7.535e-08,0.02857;HWE=0.00262;AC1=2;DP4=391,438,15,5;MQ=60;FQ=999;PV4=0.021,2.6e-07,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,69,255:81 0/0:0,78,255:90 0/0:0,81,255:93 0/0:0,60,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,12,191:24 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,45,255:57 0/0:0,15,215:27 0/0:0,66,255:78 0/0:0,15,240:27 0/0:0,36,255:48 0/0:0,12,209:24 0/0:0,42,255:54 0/0:0,18,255:30 0/0:0,30,255:42 0/0:0,87,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,123,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,129,255:99 1/1:255,60,0:42 0/0:0,24,255:36 0/0:0,78,255:90 0/0:0,99,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,21,255:33
chr12 6968548 . C A 999 . DP=866;VDB=0.0330;AF1=0.4896;G3=0.4394,0.149,0.4116;HWE=2.08e-05;AC1=35;DP4=157,159,219,270;MQ=60;FQ=999;PV4=0.19,8e-262,1,1 GT:PL:GQ 1/1:254,96,0:93 1/1:254,178,0:99 1/1:255,126,0:99 1/1:255,108,0:99 1/1:245,93,0:90 1/1:250,78,0:75 1/1:237,72,0:69 1/1:226,75,0:72 1/1:246,75,0:72 1/1:217,57,0:54 1/1:242,84,0:81 0/0:0,72,255:69 0/0:0,12,134:10 0/1:0,0,0:3 0/0:0,54,255:51 0/0:0,42,255:39 0/0:0,18,167:15 0/0:0,57,255:54 0/0:0,15,158:12 0/0:0,36,255:33 0/0:0,12,132:10 0/0:0,42,255:39 1/1:109,18,0:15 0/0:0,33,251:30 0/1:136,0,255:99 0/1:148,0,255:99 0/1:114,0,255:99 0/1:121,0,255:99 1/1:212,50,0:47 1/1:255,117,0:99 0/1:0,0,0:3 0/0:0,27,249:24 0/1:148,0,246:99 0/0:0,54,255:51 0/0:0,141,255:99 0/0:0,21,211:18
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chr12 6968764 . C A 999 . DP=953;VDB=0.0328;AF1=0.3144;G3=0.6857,2.745e-07,0.3143;HWE=4.12e-11;AC1=22;DP4=242,312,124,207;MQ=57;FQ=999;PV4=0.078,6.9e-05,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,57,0:51 1/1:255,138,0:99 1/1:255,139,0:99 1/1:255,90,0:84 1/1:255,108,0:99 1/1:255,84,0:78 1/1:255,63,0:57 1/1:255,69,0:63 1/1:255,69,0:63 1/1:255,48,0:42 1/1:255,99,0:93 0/0:0,63,255:63 0/0:0,24,86:24 0/0:0,0,0:3 0/0:0,81,255:81 0/0:0,36,193:36 0/0:0,27,110:27 0/0:0,45,255:45 0/0:0,30,114:30 0/0:0,75,255:75 0/0:0,30,112:30 0/0:0,63,255:63 0/0:0,48,255:48 0/0:0,27,241:27 0/0:0,114,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,90,255:90 0/0:0,90,255:90 0/0:0,42,255:42 0/0:0,54,255:54 0/0:0,114,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,60,255:60
chr12 6968774 . G T 999 . DP=929;VDB=0.0264;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=343,507,9,14;MQ=57;FQ=999;PV4=1,1.3e-39,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:75 0/0:0,141,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,87,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,75,255:87 0/0:0,69,255:81 0/0:0,51,255:63 0/0:0,114,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,24,70:36 0/0:0,0,0:12 0/0:0,72,255:84 0/0:0,36,157:48 0/0:0,30,72:42 0/0:0,57,255:69 0/0:0,24,69:36 0/0:0,66,255:78 0/0:0,24,93:36 0/0:0,84,255:96 0/1:118,0,147:99 0/0:0,33,255:45 0/1:110,0,255:98 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,39,255:51 0/0:0,57,255:69 0/0:0,102,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,57,255:69
chr12 6968891 . A C 999 . DP=834;VDB=0.0193;AF1=0.44;G3=0.4856,0.1439,0.3705;HWE=1.27e-05;AC1=32;DP4=168,235,74,141;MQ=36;FQ=999;PV4=0.084,0.0005,1,0.35 GT:PL:GQ 1/1:132,20,0:16 1/1:210,27,0:23 1/1:163,21,0:17 1/1:117,15,0:11 1/1:249,54,0:50 1/1:109,18,0:14 1/1:226,48,0:44 1/1:130,27,0:23 1/1:193,42,0:38 1/1:161,20,0:16 1/1:255,57,0:53 0/0:0,39,166:37 0/0:0,42,40:38 0/1:0,0,0:3 0/0:0,39,193:37 0/0:0,36,188:34 0/0:0,30,28:26 0/0:0,54,228:52 0/0:0,36,61:34 0/0:0,57,238:55 0/0:0,54,42:43 0/0:0,63,235:61 1/1:165,23,0:19 0/0:0,24,151:22 0/1:75,0,197:77 0/1:125,0,181:99 0/1:117,0,146:99 0/1:71,0,171:73 1/1:157,25,0:21 0/0:0,66,255:64 0/0:0,51,219:49 0/0:0,45,234:43 0/1:96,0,80:84 0/0:0,75,255:73 0/0:0,120,255:99 0/0:0,54,255:52
chr12 6968901 . T C 999 . DP=609;VDB=0.0255;AF1=0.3039;G3=0.6844,4.364e-08,0.3156;HWE=1.46e-10;AC1=22;DP4=38,295,28,74;MQ=32;FQ=999;PV4=0.00022,9.5e-05,0.072,0.13 GT:PL:GQ 1/1:68,7,0:3 1/1:142,33,0:26 1/1:151,42,0:35 1/1:86,18,0:12 1/1:163,33,0:26 1/1:108,18,0:12 1/1:88,15,0:9 1/1:110,24,0:17 1/1:154,30,0:23 1/1:100,15,0:9 1/1:132,21,0:15 0/0:0,33,125:34 0/0:0,27,15:21 0/0:0,0,0:3 0/0:0,24,124:25 0/0:0,30,94:31 0/0:0,21,13:18 0/0:0,27,134:28 0/0:0,15,22:16 0/0:0,36,164:37 0/0:0,21,19:20 0/0:0,57,204:58 0/0:0,42,137:43 0/0:0,9,51:10 0/0:0,51,185:52 0/0:0,63,214:64 0/0:0,78,226:79 0/0:0,54,179:55 0/0:0,48,145:49 0/0:0,60,187:61 0/0:0,54,188:55 0/0:0,33,173:34 0/0:0,18,114:19 0/0:0,48,188:49 0/0:0,93,208:94 0/0:0,45,199:46
chr12 6968936 . C G 999 . DP=596;VDB=0.0198;AF1=0.3105;G3=0.6746,8.362e-07,0.3254;HWE=3.45e-10;AC1=22;DP4=151,254,54,58;MQ=23;FQ=999;PV4=0.039,1.3e-97,0.046,1 GT:PL:GQ 1/1:102,11,0:6 1/1:99,18,0:12 1/1:142,34,0:28 1/1:108,32,0:26 1/1:154,32,0:26 1/1:57,9,0:4 1/1:95,15,0:9 1/1:61,21,0:15 1/1:101,30,0:24 1/1:65,9,0:4 1/1:126,23,0:17 0/0:0,18,108:19 0/0:0,9,11:9 0/0:0,0,0:3 0/0:0,12,92:13 0/0:0,27,211:27 0/0:0,15,17:15 0/0:0,24,157:24 0/0:0,0,0:3 0/0:0,18,95:19 0/0:0,12,14:12 0/0:0,66,208:66 0/0:0,75,204:75 0/0:0,15,89:16 0/0:0,69,214:69 0/0:0,78,216:78 0/0:0,93,209:93 0/0:0,84,219:84 0/0:0,75,182:75 0/0:0,81,255:81 0/0:0,123,255:99 0/0:0,39,213:39 0/0:0,27,144:27 0/0:0,72,241:72 0/0:0,90,212:90 0/0:0,45,194:45
chr12 6969057 . T C 999 . DP=673;VDB=0.0294;AF1=0.9224;G3=0.1652,2.222e-10,0.8348;HWE=1.13e-06;AC1=68;DP4=141,21,107,215;MQ=12;FQ=126;PV4=4.2e-31,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:61,42,0:49 1/1:71,11,0:18 1/1:35,23,0:30 1/1:17,9,0:16 1/1:37,10,0:17 1/1:53,7,0:14 1/1:113,42,0:49 1/1:132,42,0:49 1/1:180,45,0:52 1/1:43,12,0:19 1/1:50,36,0:43 0/0:0,66,59:39 1/1:0,24,13:8 1/1:0,0,0:8 1/1:37,4,0:11 1/1:9,12,0:19 1/1:0,45,10:10 1/1:0,13,14:5 1/1:0,60,8:12 1/1:1,3,0:10 1/1:0,30,12:9 1/1:73,20,0:27 1/1:48,23,0:30 1/1:13,5,0:12 1/1:68,32,0:39 1/1:103,60,0:67 1/1:87,44,0:51 1/1:94,45,0:52 1/1:55,31,0:38 1/1:89,50,0:57 1/1:35,12,0:19 1/1:51,12,0:19 1/1:60,11,0:18 1/1:92,30,0:37 0/0:0,54,158:41 1/1:43,18,0:25
chr12 6969203 . T C 6.64 . DP=1224;VDB=0.0296;AF1=0.01428;AC1=1;DP4=596,346,6,9;MQ=48;FQ=6.69;PV4=0.1,2.7e-10,0.31,1 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,69,255:85 0/0:0,87,255:99 0/0:0,81,248:97 0/0:0,138,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,50,225:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,69,255:85 0/0:0,105,255:99 0/0:0,54,238:70 0/0:0,33,58:49 0/0:0,0,0:17 0/0:0,69,255:85 0/0:0,54,246:70 0/0:0,30,78:46 0/0:0,45,224:61 0/0:0,30,141:46 0/0:0,54,175:70 0/0:0,33,95:49 0/0:0,78,255:94 0/0:0,48,255:64 0/0:0,27,208:43 0/0:0,154,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,196,255:99 0/0:0,96,255:99 0/1:51,0,255:35 0/0:0,143,255:99 0/0:0,60,232:76 0/0:0,27,223:43 0/0:0,54,254:70 0/0:0,132,255:99 0/0:0,72,255:88 0/0:0,51,255:67
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chr12 6969289 . caaaaaaaaaaaaaaaaaaaa caaaaaaaaaaaaaaaaaa 13.9 . INDEL;DP=687;VDB=0.0397;AF1=0.3615;G3=0.5809,2.314e-05,0.419;HWE=0.000433;AC1=26;DP4=18,22,21,21;MQ=45;FQ=-11.5;PV4=0.67,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:3 0/0:30,30,30:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,3,4:4 0/1:5,1,0:4 0/0:15,15,15:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:14,23,20:8 0/0:9,9,9:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,9,11:9 0/0:0,6,8:6 0/0:0,6,8:6 0/0:0,3,4:4 0/0:4,4,4:3 0/0:0,6,8:6 0/1:30,26,20:2 0/0:0,0,0:3 0/1:10,3,0:4 1/1:35,27,18:4 0/0:0,10,12:10 1/1:29,15,0:9 0/0:8,8,6:2 0/0:0,3,4:4 0/0:17,18,16:3 1/1:37,12,0:7 0/0:0,0,0:3 0/0:0,6,8:6 0/0:0,21,15:18 0/0:0,6,10:7 0/1:14,3,0:4
chr12 6969309 . ag a 999 . INDEL;DP=778;VDB=0.0355;AF1=0.1611;AC1=11;DP4=119,122,28,1;MQ=46;FQ=999;PV4=1.8e-07,0.00054,1,0.0018 GT:PL:GQ 0/1:23,3,0:8 0/1:34,2,0:9 0/1:41,2,0:9 0/1:77,5,0:6 0/1:8,1,0:4 0/0:0,9,24:13 0/1:19,0,0:9 0/0:0,0,0:5 0/0:0,6,31:11 0/0:0,6,10:10 0/1:27,0,0:10 0/0:0,39,110:43 0/1:9,3,0:3 0/0:0,0,0:5 0/0:0,0,87:6 0/0:0,33,123:37 0/0:0,24,104:28 0/0:0,36,196:40 0/0:0,24,133:28 0/0:0,16,185:20 0/0:0,15,101:19 0/1:23,0,53:19 0/0:0,0,0:5 0/0:0,18,146:22 0/0:0,18,143:22 0/0:0,54,221:58 0/0:0,21,109:25 0/0:0,4,86:9 0/0:0,9,9:13 0/0:0,37,255:41 0/0:0,41,236:45 0/0:0,24,155:28 0/0:3,0,49:4 0/0:0,26,192:30 0/0:0,18,108:22 0/0:0,2,120:7
chr12 6969315 . gaaaaa gAAAAaaaaa 999 . INDEL;DP=781;VDB=0.0319;AF1=0.159;G3=0.7631,1.386e-05,0.2369;HWE=0.000525;AC1=11;DP4=106,144,25,10;MQ=52;FQ=999;PV4=0.0018,6.8e-14,1,0.015 GT:PL:GQ 0/1:26,3,0:8 0/1:30,6,0:6 0/1:35,3,0:8 0/0:65,68,65:7 0/1:17,11,9:3 0/1:11,1,0:6 1/1:255,37,1:26 0/1:22,14,11:4 0/0:0,0,0:5 0/0:17,17,17:5 0/1:26,3,0:8 0/0:0,27,156:31 0/0:0,3,32:8 0/0:0,0,0:5 0/0:0,24,212:28 0/0:0,51,206:55 0/0:0,15,132:19 0/0:0,42,255:46 0/0:0,27,185:31 0/0:0,39,255:43 0/0:0,30,249:34 0/0:0,9,109:14 0/0:0,0,0:5 0/0:0,18,189:22 0/0:0,36,240:40 0/0:0,57,255:61 0/0:0,3,169:8 0/0:0,2,154:7 0/0:0,3,4:8 0/0:0,78,255:82 0/0:0,72,255:76 0/0:0,24,214:28 0/0:0,12,85:16 0/0:0,53,255:57 0/0:0,27,212:31 0/0:0,33,255:37
chr12 6969317 . aaaagaaagaaagaaa aAAAGaaagaaagaaagaaa 999 . INDEL;DP=783;VDB=0.0318;AF1=0.4369;G3=0.5097,0.1195,0.3707;HWE=4.13e-06;AC1=31;DP4=115,135,136,97;MQ=54;FQ=999;PV4=0.0082,1.5e-39,1,0.1 GT:PL:GQ 1/1:255,69,0:65 1/1:255,51,0:47 1/1:255,72,0:68 1/1:255,90,0:86 1/1:255,39,0:35 1/1:122,12,0:9 1/1:255,39,0:35 1/1:197,27,0:23 1/1:255,39,0:35 1/1:203,24,0:20 1/1:255,25,0:21 0/0:0,21,222:19 0/0:0,3,56:4 0/1:0,0,0:3 0/0:0,24,255:22 0/0:0,51,255:49 0/0:0,18,166:16 0/0:0,42,255:40 0/0:0,21,227:19 0/0:0,39,255:37 0/0:0,33,255:31 0/0:0,12,194:11 1/1:242,24,0:20 0/0:0,24,255:22 0/1:217,0,255:99 0/1:212,0,255:99 0/1:250,0,255:99 0/1:255,0,230:99 1/1:255,45,0:41 0/0:0,62,255:60 0/0:0,72,255:70 0/0:0,24,255:22 0/0:0,9,112:8 0/0:0,33,255:31 0/0:0,30,255:28 0/0:0,36,255:34
chr12 6969323 . aaga aAGAGaga 999 . INDEL;DP=805;VDB=0.0248;AF1=0.4455;G3=0.4875,0.1415,0.3711;HWE=1.31e-05;AC1=32;DP4=142,166,187,121;MQ=55;FQ=999;PV4=0.00037,1,1,0.43 GT:PL:GQ 1/1:255,75,0:71 1/1:255,63,0:59 1/1:255,93,0:89 1/1:255,135,0:99 1/1:255,47,0:43 1/1:206,15,0:11 1/1:255,42,0:38 1/1:255,36,0:32 1/1:255,51,0:47 1/1:255,57,24:29 1/1:255,42,0:38 0/0:0,33,255:31 0/0:0,9,101:8 0/1:0,0,0:3 0/0:0,30,255:28 0/0:0,63,255:61 0/0:0,21,211:19 0/0:0,60,255:58 0/0:0,27,249:25 0/0:0,45,255:43 0/0:0,45,255:43 0/0:0,12,220:10 1/1:255,27,0:23 0/0:0,27,255:25 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,239:99 1/1:255,47,0:43 0/0:0,58,255:56 0/0:0,93,255:91 0/0:0,27,255:25 0/1:14,0,120:16 0/0:0,36,255:34 0/0:0,27,255:25 0/0:0,39,255:37
chr12 6969325 . gaaa gAGAAaaa 999 . INDEL;DP=802;VDB=0.0228;AF1=0.3694;G3=0.5114,0.2242,0.2644;HWE=0.00318;AC1=26;DP4=152,169,146,106;MQ=55;FQ=999;PV4=0.015,1.4e-10,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,69,0:64 1/1:255,25,0:20 1/1:255,75,0:70 1/1:255,76,0:71 1/1:255,39,0:34 0/1:126,0,49:54 0/1:255,5,0:3 1/1:223,30,0:25 1/1:255,45,0:40 0/1:216,0,7:13 0/1:255,0,22:27 0/0:0,33,247:32 0/0:0,9,119:9 0/1:0,0,0:3 0/0:0,30,255:29 0/0:0,57,255:56 0/0:0,24,229:23 0/0:0,60,255:59 0/0:0,24,249:23 0/0:0,45,255:44 0/0:0,45,255:44 0/0:0,15,201:14 0/1:237,0,5:11 0/0:0,27,255:26 0/1:245,0,255:99 0/1:226,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,208:99 1/1:255,36,0:31 0/0:0,60,255:59 0/0:0,93,255:92 0/0:0,27,255:26 0/0:0,12,133:12 0/0:0,36,255:35 0/0:0,27,255:26 0/0:0,39,255:38
chr12 6969416 . G A 71.6 . DP=955;VDB=0.0276;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=438,384,9,4;MQ=41;FQ=71.6;PV4=0.28,2.6e-09,1,0.38 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:81 0/0:0,78,255:93 0/0:0,117,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,60,255:75 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,72,255:87 0/0:0,54,255:69 0/0:0,33,41:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,102,255:99 0/0:0,39,215:54 0/0:0,15,50:30 0/0:0,48,230:63 0/0:0,60,111:75 0/0:0,66,249:81 0/0:0,54,101:69 0/0:0,69,255:84 0/0:0,54,255:69 0/0:0,24,192:39 0/0:0,120,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,108,255:99 0/1:117,0,255:99 0/0:0,63,223:78 0/0:0,126,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,255:51 0/0:0,33,201:48 0/0:0,64,255:79 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72
chr12 6969422 . G T 999 . DP=728;VDB=0.0309;AF1=0.162;AC1=11;DP4=159,314,29,49;MQ=38;FQ=999;PV4=0.61,4.9e-41,1,1 GT:PL:GQ 0/1:47,0,130:43 1/1:221,45,0:35 0/1:91,0,162:87 0/0:1,0,158:5 0/1:53,0,105:49 0/1:97,0,25:35 0/1:89,0,38:48 0/1:104,0,72:82 0/0:0,54,255:58 0/1:127,0,98:99 1/1:155,51,0:41 0/0:0,69,222:73 0/0:0,51,26:40 0/0:0,0,0:5 0/0:0,93,255:97 0/0:0,51,177:55 0/0:0,36,46:40 0/0:0,42,167:46 0/0:0,66,107:70 0/0:0,66,231:70 0/0:0,33,107:37 0/0:0,45,204:49 0/0:0,30,194:34 0/0:0,18,149:22 0/0:0,63,255:67 0/0:0,81,255:85 0/0:0,69,255:73 0/0:0,75,255:79 0/0:0,21,152:25 0/0:0,81,245:85 0/0:0,27,185:31 0/0:0,24,183:28 0/0:0,24,170:28 0/0:0,60,255:64 0/0:0,36,255:40 0/0:0,48,255:52
chr12 6969465 . G A 999 . DP=683;VDB=0.0365;AF1=0.3149;G3=0.6851,1.039e-08,0.3149;HWE=4.25e-11;AC1=22;DP4=177,253,62,107;MQ=38;FQ=999;PV4=0.35,7.4e-123,1,1 GT:PL:GQ 1/1:196,60,0:54 1/1:176,36,0:30 1/1:189,42,0:36 1/1:203,45,0:39 1/1:204,51,0:45 1/1:162,28,0:22 1/1:155,30,0:24 1/1:178,42,0:36 1/1:209,60,0:54 1/1:168,36,0:30 1/1:224,57,0:51 0/0:0,42,151:42 0/0:0,39,17:24 0/0:0,0,0:3 0/0:0,72,234:72 0/0:0,57,180:57 0/0:0,33,25:29 0/0:0,42,195:42 0/0:0,30,32:30 0/0:0,66,255:66 0/0:0,15,17:15 0/0:0,54,255:54 0/0:0,48,255:48 0/0:0,27,180:27 0/0:0,72,255:72 0/0:0,99,255:99 0/0:0,87,255:87 0/0:0,66,255:66 0/0:0,54,255:54 0/0:0,138,255:99 0/0:0,36,199:36 0/0:0,27,228:27 0/0:0,27,195:27 0/0:0,63,255:63 0/0:0,33,249:33 0/0:0,57,255:57
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chr12 6969707 . A C 48.6 . DP=1202;VDB=0.0364;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=459,645,10,2;MQ=60;FQ=48.6;PV4=0.0055,2.9e-43,2.3e-27,0.44 GT:PL:GQ 0/0:0,108,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,199,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,81,255:96 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75 0/0:0,21,212:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,78,255:93 0/0:0,81,255:96 0/1:94,0,117:79 0/0:0,90,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,223:42 0/0:0,69,255:84 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,254:45 0/0:0,166,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,178,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,255:66 0/0:0,148,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,39,255:54
chr12 6969814 . A G 999 . DP=1122;VDB=0.0269;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=513,541,19,6;MQ=60;FQ=999;PV4=0.0078,0.00022,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,102,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,93,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,66,255:81 0/0:0,27,248:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,87,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,96,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,33,255:48 0/0:0,78,255:93 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,231:42 0/0:0,120,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,132,255:99 0/1:236,0,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,107,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,60,255:75
chr12 6970044 . A C 46.6 . DP=965;VDB=0.0404;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=449,460,14,7;MQ=59;FQ=46.6;PV4=0.13,1.5e-69,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,117,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,105,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,24,202:39 0/0:0,48,255:63 0/0:0,69,255:84 0/0:0,27,234:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,69,255:84 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,48,255:63 0/0:0,51,255:66 0/0:0,51,255:66 0/0:0,90,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,36,255:51 0/0:0,132,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,138,255:99 0/1:92,0,160:77 0/0:0,51,255:66 0/0:0,72,255:87 0/0:0,129,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,66,255:81
chr12 6970148 . G A 8.28 . DP=943;VDB=0.0198;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=297,376,1,6;MQ=57;FQ=8.34;PV4=0.14,9.3e-28,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,78,255:94 0/0:0,75,255:91 0/0:0,51,255:67 0/0:0,87,255:99 0/0:0,60,255:76 0/0:0,54,255:70 0/0:0,51,255:67 0/0:0,63,255:79 0/0:0,81,255:97 0/0:0,57,255:73 0/0:0,57,255:73 0/0:0,57,255:73 0/0:0,24,205:40 0/0:0,0,0:16 0/0:0,27,219:43 0/0:0,51,255:67 0/0:0,48,255:64 0/0:0,30,235:46 0/0:0,24,142:40 0/0:0,57,255:73 0/0:0,24,161:40 0/0:0,54,255:70 0/0:0,45,255:61 0/0:0,21,175:37 0/0:0,48,255:64 0/0:0,108,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,105,255:99 0/1:53,0,152:37 0/0:0,123,255:99 0/0:0,51,255:67 0/0:0,33,255:49 0/0:0,42,255:58 0/0:0,63,255:79 0/0:0,75,255:91 0/0:0,69,255:85
chr12 6970149 . C A 22.6 . DP=921;VDB=0.0151;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=268,373,3,6;MQ=57;FQ=22.7;PV4=0.74,5.3e-20,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:84 0/0:0,72,255:87 0/0:0,48,247:63 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,63,255:78 0/0:0,66,255:81 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,24,204:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,27,227:42 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60 0/0:0,30,225:45 0/0:0,24,143:39 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,156:39 0/0:0,54,255:69 0/0:0,42,255:57 0/0:0,21,181:36 0/0:0,39,255:54 0/0:0,96,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,102,255:99 0/1:68,0,149:53 0/0:0,123,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,33,255:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,60,255:75
chr12 6970207 . C T 66.6 . DP=931;VDB=0.0379;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=305,416,6,6;MQ=56;FQ=66.6;PV4=0.77,4.8e-22,0.00055,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:90 0/0:0,69,255:84 0/0:0,66,255:81 0/0:0,96,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,36,225:51 0/0:0,51,255:66 0/0:0,96,255:99 0/1:112,0,187:97 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,255:51 0/0:0,78,255:93 0/0:0,18,179:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/0:0,36,252:51 0/0:0,33,238:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,87,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,120,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,21,197:36 0/0:0,45,255:60 0/0:0,87,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78
chr12 6970216 . gaaaaaaaaaaaaa gAaaaaaaaaaaaaa 999 . INDEL;DP=878;VDB=0.0416;AF1=0.3486;G3=0.595,5.486e-06,0.405;HWE=1.21e-07;AC1=25;DP4=51,106,47,69;MQ=57;FQ=999;PV4=0.2,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:22,6,0:3 1/1:36,18,0:12 1/1:19,9,0:5 1/1:47,24,0:18 1/1:34,16,0:11 1/1:26,8,0:4 1/1:16,6,0:3 1/1:32,15,0:10 1/1:17,9,0:4 0/1:8,0,0:5 0/1:6,0,0:5 0/0:0,28,53:28 0/0:11,14,14:4 0/1:0,0,0:3 0/0:0,24,41:24 0/0:0,24,39:24 0/0:0,21,38:21 0/0:0,24,47:24 0/0:0,18,36:18 0/0:0,8,28:8 0/0:0,18,33:18 0/0:23,26,24:4 1/1:36,18,0:12 0/0:22,25,24:4 0/0:40,43,40:4 0/0:0,12,25:12 0/0:0,9,17:9 0/0:0,33,42:33 0/1:8,3,0:3 0/0:0,27,36:27 0/0:0,23,56:23 0/0:0,15,25:15 0/1:7,0,4:6 0/0:3,12,20:9 0/0:0,30,50:30 0/0:0,33,50:33
chr12 6970231 . tacatacaca taca 49.6 . INDEL;DP=865;VDB=0.0408;AF1=0.02548;G3=0.9629,1.545e-06,0.03708;HWE=0.0129;AC1=2;DP4=81,182,4,2;MQ=54;FQ=49.7;PV4=0.082,0.0046,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,6,47:19 0/0:0,3,15:16 0/0:0,0,0:13 0/0:0,0,0:13 0/0:0,36,255:49 0/0:0,9,89:22 0/0:0,0,0:13 0/0:0,0,0:13 0/0:0,0,0:13 0/0:0,0,0:13 0/0:0,3,39:16 0/0:0,60,255:73 0/0:0,12,89:25 0/0:0,0,0:13 0/0:0,39,254:52 0/0:0,42,255:55 0/0:0,27,151:40 0/0:0,36,255:49 0/0:0,27,176:40 0/0:0,21,177:34 0/0:0,39,204:52 0/0:0,27,202:40 0/0:0,0,0:13 0/0:0,12,125:25 0/0:0,30,203:43 0/0:0,51,255:64 0/0:0,30,192:43 0/0:0,69,255:82 0/1:115,15,0:5 0/0:0,24,125:37 0/0:0,66,255:79 0/0:0,12,142:25 0/0:0,15,177:28 0/0:16,16,16:13 0/0:0,42,255:55 0/0:0,51,255:64
chr12 6970235 . tacacacacacacacacacaca tACacacacacacacacacacaca 999 . INDEL;DP=912;VDB=0.0407;AF1=0.4052;G3=0.5728,0.06844,0.3587;HWE=7.33e-07;AC1=29;DP4=71,140,118,173;MQ=53;FQ=999;PV4=0.14,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,42,0:37 1/1:255,60,0:55 1/1:255,56,0:51 1/1:255,78,0:73 0/1:227,0,255:99 0/0:0,12,85:11 1/1:255,36,0:31 1/1:255,81,0:76 1/1:180,24,0:19 1/1:171,24,0:19 1/1:139,18,0:14 0/0:0,48,255:47 0/0:0,12,82:11 0/1:0,0,0:3 0/0:0,36,185:35 0/0:0,36,232:35 0/0:8,20,76:11 0/0:0,21,170:20 0/0:0,27,115:26 0/0:0,15,134:14 0/0:0,27,139:26 0/0:0,21,149:20 0/0:121,124,133:4 0/0:0,9,84:8 0/0:247,255,255:7 0/1:255,255,255:3 0/1:255,255,255:3 0/1:255,255,255:3 0/1:255,255,255:3 1/1:255,63,0:58 0/0:0,42,255:41 0/1:86,0,85:85 0/0:21,39,188:17 1/1:255,90,0:85 0/0:0,27,224:26 0/0:0,48,255:47
chr12 6970238 . acacac aCNcacac 999 . INDEL;DP=879;VDB=0.0431;AF1=0.3638;G3=0.6147,0.06158,0.3237;HWE=1.69e-07;AC1=26;DP4=72,141,88,123;MQ=52;FQ=999;PV4=0.11,1,0.33,1 GT:PL:GQ 1/1:255,42,0:37 1/1:255,60,0:55 1/1:255,56,0:51 1/1:255,78,0:73 0/1:228,0,255:99 0/0:0,12,87:12 1/1:255,39,0:34 1/1:255,81,0:76 1/1:184,24,0:19 1/1:171,24,0:19 1/1:141,18,0:13 0/0:0,48,255:47 0/0:0,12,84:12 0/1:0,0,0:3 0/0:0,36,198:35 0/0:0,39,234:38 0/0:0,12,76:12 0/0:0,21,169:20 0/0:0,27,115:26 0/0:0,12,129:12 0/0:0,27,139:26 0/0:0,21,153:20 0/0:0,3,17:4 0/0:0,9,85:9 0/0:0,33,204:32 0/0:0,48,255:47 0/0:0,24,181:23 0/0:0,69,255:68 0/1:0,0,0:3 1/1:255,63,0:58 0/0:0,42,255:41 0/1:82,0,46:51 0/0:0,18,176:18 1/1:255,74,0:69 0/0:0,24,216:23 0/0:0,48,255:47
chr12 6970247 . cacacacacatatacacacacatata cAAacacacacatatacacacacatata 999 . INDEL;DP=1116;VDB=0.0425;AF1=0.1118;AC1=8;DP4=208,256,45,36;MQ=49;FQ=999;PV4=0.091,2.9e-53,1,1 GT:PL:GQ 0/1:19,0,162:13 0/1:58,0,119:52 0/1:59,0,66:53 0/1:27,0,215:21 0/0:0,12,255:18 0/0:13,25,120:18 0/1:11,0,87:6 0/1:47,0,91:41 0/0:0,9,37:15 0/0:6,0,87:3 0/0:3,0,107:5 0/0:0,63,255:69 0/0:0,15,86:21 0/0:0,0,0:7 0/0:0,51,237:57 0/0:0,57,255:63 0/0:0,24,115:30 0/0:0,42,188:48 0/0:0,36,140:42 0/0:0,33,188:39 0/0:0,27,119:33 0/0:0,39,210:45 0/0:0,24,89:30 0/0:0,18,108:24 0/0:0,99,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:41,59,131:24 0/0:0,99,255:99 0/0:0,24,146:30 0/0:0,0,142:7 0/0:0,81,255:87 0/0:0,24,173:30 0/0:0,30,255:36 0/1:68,0,117:62 0/0:0,30,255:36 0/0:0,72,255:78
chr12 6970253 . ca cAAa 125 . INDEL;DP=1182;VDB=0.0425;AF1=0.09383;AC1=7;DP4=259,319,37,28;MQ=49;FQ=125;PV4=0.067,2.4e-50,1,1 GT:PL:GQ 0/0:5,0,177:4 0/1:58,0,121:51 0/1:39,0,147:32 0/1:21,0,246:14 0/0:0,15,255:22 0/0:0,12,115:19 0/1:26,0,132:19 0/1:34,0,133:27 0/0:0,0,72:8 0/0:0,9,144:16 0/0:0,30,155:37 0/0:0,72,255:79 0/0:0,24,113:31 0/0:0,0,0:7 0/0:0,75,255:82 0/0:0,60,255:67 0/0:0,24,115:31 0/0:0,57,218:64 0/0:0,48,182:55 0/0:0,48,232:55 0/0:0,42,157:49 0/0:0,54,255:61 0/0:0,27,118:34 0/0:0,24,110:31 0/0:0,111,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,18,155:25 0/0:0,120,255:99 0/0:0,42,254:49 0/0:0,37,185:44 0/0:0,102,255:99 0/0:0,24,191:31 0/0:0,33,255:40 0/1:52,0,138:45 0/0:0,30,255:37 0/0:0,81,255:88
chr12 6970267 . catatatacacatatatatacacata catatatacacata 999 . INDEL;DP=1275;VDB=0.0417;AF1=0.02864;AC1=2;DP4=345,443,8,13;MQ=51;FQ=999;PV4=0.66,0.061,0.0033,0.0025 GT:PL:GQ 0/0:0,54,255:66 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,12,206:24 0/0:0,60,255:72 0/0:0,90,255:99 0/0:0,30,255:42 0/0:0,36,255:48 0/0:0,69,255:81 0/0:0,66,255:78 0/0:0,24,92:36 0/0:0,0,0:12 0/0:0,72,255:84 0/0:0,54,255:66 0/0:0,21,124:33 0/0:0,66,255:78 0/0:0,54,228:66 0/0:0,54,255:66 0/0:0,27,89:39 0/1:55,0,255:43 0/0:0,45,255:57 0/0:0,23,255:35 0/0:0,141,255:99 0/0:0,151,255:99 0/1:255,0,161:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,39,255:51 0/0:0,30,255:42 0/0:0,66,255:78 0/0:0,30,255:42 0/0:0,90,255:99
chr12 6970273 . T C 236 . DP=1271;VDB=0.0199;AF1=0.02859;AC1=2;DP4=464,648,6,22;MQ=50;FQ=236;PV4=0.033,0.0048,1,0.25 GT:PL:GQ 0/0:0,87,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,18,152:30 0/0:0,96,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,72,255:84 0/0:0,102,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,39,147:51 0/0:0,0,0:12 0/0:0,84,255:96 0/0:0,84,255:96 0/0:0,30,117:42 0/0:0,87,255:99 0/0:0,84,226:96 0/0:0,60,221:72 0/0:0,36,95:48 0/0:0,29,255:41 0/0:0,60,255:72 0/0:0,26,184:38 0/0:0,190,255:99 0/0:0,214,255:99 0/0:0,27,255:39 0/0:0,193,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,111,255:99 0/1:133,0,70:88 0/0:0,39,255:51 0/0:0,129,255:99 0/0:0,45,255:57 0/1:164,0,198:99
chr12 6970278 . A G 999 . DP=1242;VDB=0.0353;AF1=0.3044;G3=0.6857,6.311e-08,0.3143;HWE=1.36e-10;AC1=22;DP4=327,423,133,205;MQ=51;FQ=999;PV4=0.21,0.00094,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,75,0:68 1/1:255,116,0:99 1/1:255,89,0:82 1/1:255,154,0:99 1/1:255,107,0:99 0/1:186,3,0:5 1/1:255,48,0:41 1/1:255,105,0:98 1/1:255,66,0:59 1/1:255,45,0:38 1/1:255,39,0:32 0/0:0,90,255:91 0/0:0,36,127:37 0/0:0,0,0:3 0/0:0,78,255:79 0/0:0,87,255:88 0/0:0,24,111:25 0/0:0,72,255:73 0/0:0,84,228:85 0/0:0,60,253:61 0/0:0,33,89:34 0/0:0,69,255:70 0/0:0,60,255:61 0/0:0,36,185:37 0/0:0,187,255:99 0/0:0,223,255:99 0/0:0,96,255:97 0/0:0,193,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,45,255:46 0/0:0,36,255:37 0/0:0,123,255:99 0/0:0,48,255:49 0/0:0,93,255:94
chr12 6970349 . G A 999 . DP=1018;VDB=0.0396;AF1=0.02868;AC1=2;DP4=417,552,18,6;MQ=59;FQ=999;PV4=0.0027,0.098,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,141,255:99 0/1:225,0,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,81,255:93 0/0:0,108,255:99 0/0:0,75,255:87 0/1:203,0,139:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,9,97:21 0/0:0,0,0:12 0/0:0,63,255:75 0/0:0,60,255:72 0/0:0,27,228:39 0/0:0,81,255:93 0/0:0,30,255:42 0/0:0,42,255:54 0/0:0,33,255:45 0/0:0,48,255:60 0/0:0,54,255:66 0/0:0,27,221:39 0/0:0,157,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,54,255:66 0/0:0,114,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:72
chr12 6970377 . T A 22.7 . DP=843;VDB=0.0179;AF1=0.01461;AC1=1;DP4=415,382,13,7;MQ=57;FQ=22.8;PV4=0.27,5.9e-117,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,255:51 0/0:0,81,255:96 0/0:0,30,255:45 0/0:0,6,74:21 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60 0/0:0,6,40:21 0/0:0,81,255:96 0/0:0,6,42:21 0/0:0,33,205:48 0/0:0,21,156:36 0/0:0,24,226:39 0/0:0,33,255:48 0/0:0,27,232:42 0/0:0,135,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,123,255:99 0/1:68,0,151:53 0/0:0,77,255:92 0/0:0,52,255:67 0/0:0,48,255:63 0/0:0,81,255:96 0/0:0,123,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:54
chr12 6970382 . A T 999 . DP=828;VDB=0.0300;AF1=0.1311;AC1=9;DP4=346,329,72,49;MQ=56;FQ=999;PV4=0.11,6.1e-269,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:86 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:65 0/0:0,63,255:68 0/0:0,48,255:53 0/0:0,36,255:41 0/0:0,75,255:80 0/0:0,24,203:29 0/0:0,6,41:12 0/0:0,0,0:6 0/0:0,42,255:47 0/0:0,42,255:47 0/0:0,9,35:14 0/0:0,72,255:77 0/0:0,6,40:12 0/0:0,27,139:32 0/0:0,18,108:23 0/0:0,24,222:29 1/1:115,33,0:22 0/0:0,27,230:32 0/1:100,0,255:95 0/1:77,0,255:72 0/1:52,0,255:47 0/1:59,0,255:54 1/1:152,81,0:70 0/0:0,73,255:78 0/0:0,36,255:41 0/0:0,48,255:53 0/1:60,0,255:55 0/0:0,126,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,36,255:41
chr12 6970442 . att at 106 . INDEL;DP=839;VDB=0.0373;AF1=0.01439;AC1=1;DP4=440,329,4,4;MQ=57;FQ=106;PV4=0.73,0.038,0.18,0.49 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,78,255:93 0/0:0,45,255:60 0/1:159,0,187:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,45,255:60 0/0:0,51,255:66 0/0:0,30,255:45 0/0:0,15,153:30 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/0:0,9,97:24 0/0:0,72,255:87 0/0:0,21,194:36 0/0:0,27,200:42 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,12,139:27 0/0:0,154,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,123,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,21,221:36 0/0:0,87,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,54,255:69
chr12 6970483 . G A 50.6 . DP=909;VDB=0.0172;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=356,430,2,9;MQ=58;FQ=50.7;PV4=0.12,5.1e-13,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,93,255:99 0/0:0,70,255:85 0/1:96,0,255:81 0/0:0,108,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,72,255:87 0/0:0,96,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/0:0,27,209:42 0/0:0,12,115:27 0/0:0,0,0:15 0/0:0,60,255:75 0/0:0,45,255:60 0/0:0,21,180:36 0/0:0,54,255:69 0/0:0,21,165:36 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,15,124:30 0/0:0,184,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,66,255:81 0/0:0,24,181:39 0/0:0,63,255:78 0/0:0,126,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,54,255:69
chr12 6970524 . G T 54.6 . DP=929;VDB=0.0254;AF1=0.01437;AC1=1;DP4=358,507,4,10;MQ=59;FQ=54.7;PV4=0.42,1.2e-41,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,99,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,75,255:90 0/1:100,0,195:85 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,45,255:60 0/0:0,9,86:24 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,12,129:27 0/0:0,63,255:78 0/0:0,18,194:33 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,24,196:39 0/0:0,151,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,27,251:42 0/0:0,36,229:51 0/0:0,126,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,66,255:81
chr12 6970710 . G A 70.6 . DP=993;VDB=0.0308;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=449,497,8,12;MQ=60;FQ=70.7;PV4=0.65,1.3e-68,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,129,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,27,225:42 0/0:0,75,255:90 0/0:0,99,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,78,255:93 0/0:0,60,255:75 0/0:0,36,255:51 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,54,255:69 0/0:0,36,236:51 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,72,255:87 0/0:0,36,255:51 0/0:0,108,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,12,128:27 0/0:0,108,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,105,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/1:116,0,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,54,255:69
chr12 6970759 . C A 67.6 . DP=1331;VDB=0.0579;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=481,606,6,8;MQ=57;FQ=67.6;PV4=1,2.1e-16,0.021,0.068 GT:PL:GQ 0/0:0,123,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,86,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,72,255:87 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,255:51 0/0:0,81,255:96 0/0:0,78,255:93 0/0:0,51,255:66 0/0:0,0,0:15 0/1:113,0,255:98 0/0:0,60,255:75 0/0:0,66,255:81 0/0:0,117,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,81,255:96 0/0:0,72,255:87 0/0:0,123,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,24,215:39 0/0:0,102,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,72,255:87 0/0:0,177,255:99 0/0:0,187,255:99 0/0:0,78,255:93
chr12 6970776 . T A 999 . DP=1027;VDB=0.0346;AF1=0.4286;G3=0.4857,0.1715,0.3429;HWE=6.77e-05;AC1=31;DP4=255,311,159,256;MQ=59;FQ=999;PV4=0.036,0,1,1 GT:PL:GQ 1/1:226,105,0:99 1/1:225,117,0:99 1/1:228,114,0:99 1/1:237,99,0:95 1/1:218,87,0:83 1/1:208,57,0:53 1/1:161,48,0:44 1/1:173,66,0:62 1/1:199,60,0:56 1/1:159,36,0:32 1/1:205,72,0:68 0/0:0,66,255:64 0/0:0,45,255:43 0/1:0,0,0:3 0/0:0,81,255:79 0/0:0,69,255:67 0/0:0,69,255:67 0/0:0,96,255:94 0/0:0,54,255:52 0/0:0,63,255:61 0/0:0,57,255:55 0/0:0,93,255:91 1/1:203,84,0:80 0/0:0,24,224:22 0/1:164,0,251:99 0/1:128,0,255:99 0/1:109,0,245:99 0/1:131,0,255:99 0/1:141,0,255:99 0/0:0,84,255:82 0/0:0,73,255:71 0/0:0,45,255:43 0/1:97,0,152:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,211,255:99 0/0:0,60,255:58
chr12 6970819 . A G 51.6 . DP=962;VDB=0.0509;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=408,525,6,3;MQ=60;FQ=51.6;PV4=0.19,2.9e-25,0.29,0.38 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,81,255:96 0/0:0,48,255:63 0/0:0,51,255:66 0/0:0,54,255:69 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,0,0:15 0/0:0,69,255:84 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:60 0/1:97,0,245:82 0/0:0,24,195:39 0/0:0,72,255:87 0/0:0,81,255:96 0/0:0,24,221:39 0/0:0,157,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,48,255:63 0/0:0,51,255:66 0/0:0,163,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,45,255:60
chr12 6970842 . A G 999 . DP=934;VDB=0.0377;AF1=0.04283;AC1=3;DP4=361,480,10,8;MQ=59;FQ=999;PV4=0.34,1,8e-07,0.17 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:94 0/0:0,96,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,57,255:67 0/0:0,60,255:70 0/0:0,54,255:64 0/0:0,51,255:61 0/0:0,48,255:58 0/0:0,63,255:73 0/0:0,45,255:55 0/0:0,39,255:49 0/0:0,0,0:11 0/0:0,90,255:99 0/1:160,0,221:99 0/0:0,51,255:61 0/0:0,108,255:99 0/0:0,42,255:52 0/1:182,0,138:99 0/1:38,0,141:28 0/0:0,60,255:70 0/0:0,69,255:79 0/0:0,30,244:40 0/0:0,181,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,102,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,45,255:55 0/0:0,69,255:79 0/0:0,123,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,36,254:46
chr12 6970976 . A G 77.6 . DP=1416;VDB=0.0153;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=541,705,7,5;MQ=31;FQ=77.6;PV4=0.38,1.3e-09,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,126,255:99 0/0:0,117,234:99 0/0:0,151,207:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,117,215:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,102,255:99 0/1:123,0,140:99 0/0:0,90,243:99 0/0:0,78,203:93 0/0:0,108,254:99 0/0:0,99,211:99 0/0:0,42,131:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,93,194:99 0/0:0,108,214:99 0/0:0,48,114:63 0/0:0,129,255:99 0/0:0,39,207:54 0/0:0,96,165:99 0/0:0,63,114:78 0/0:0,87,201:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,45,122:60 0/0:0,148,255:99 0/0:0,226,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,178,255:99 0/0:0,126,208:99 0/0:0,154,221:99 0/0:0,114,219:99 0/0:0,78,184:93 0/0:0,36,173:51 0/0:0,141,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,66,221:81
chr12 6971191 . C T 29.6 . DP=590;VDB=0.0172;AF1=0.01436;AC1=1;DP4=272,216,5,4;MQ=25;FQ=29.7;PV4=1,8.7e-08,0.48,1 GT:PL:GQ 0/0:0,27,88:42 0/0:0,18,60:33 0/0:0,24,75:39 0/0:0,24,41:39 0/0:0,30,60:45 0/0:0,18,50:33 0/0:0,12,49:27 0/0:0,33,64:48 0/0:0,24,66:39 0/0:0,18,44:33 0/0:0,33,73:48 0/0:0,57,73:72 0/0:0,45,170:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,33,93:48 0/0:0,60,210:75 0/0:0,36,112:51 0/0:0,36,78:51 0/0:0,33,54:48 0/0:0,21,83:36 0/0:0,39,46:54 0/0:0,75,255:90 0/0:0,48,193:63 0/0:0,15,65:30 0/0:0,72,219:87 0/1:75,0,173:60 0/0:0,63,248:78 0/0:0,78,255:93 0/0:0,51,188:66 0/0:0,57,215:72 0/0:0,63,243:78 0/0:0,30,157:45 0/0:0,33,164:48 0/0:0,90,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,48,242:63
chr12 6971205 . A C 999 . DP=733;VDB=0.0134;AF1=0.3117;G3=0.6857,5.498e-08,0.3143;HWE=6.2e-11;AC1=22;DP4=267,217,59,48;MQ=32;FQ=999;PV4=1,4.9e-68,1.3e-08,1 GT:PL:GQ 1/1:92,33,0:27 1/1:94,27,0:21 1/1:106,30,0:24 1/1:58,33,0:27 1/1:94,39,0:33 1/1:101,27,0:21 1/1:67,15,0:9 1/1:82,27,0:21 1/1:133,39,0:33 1/1:62,15,0:9 1/1:73,33,0:27 0/0:0,69,176:69 0/0:0,54,191:54 0/0:0,0,0:3 0/0:0,36,157:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,39,137:39 0/0:0,48,160:48 0/0:0,36,119:36 0/0:0,27,116:27 0/0:0,48,96:48 0/0:0,87,255:87 0/0:0,66,255:66 0/0:0,9,74:10 0/0:0,87,255:87 0/0:0,87,255:87 0/0:0,57,255:57 0/0:0,78,255:78 0/0:0,57,220:57 0/0:0,99,255:99 0/0:0,72,255:72 0/0:0,36,179:36 0/0:0,42,221:42 0/0:0,102,255:99 0/0:0,84,255:84 0/0:0,60,255:60
chr12 6971212 . G C 999 . DP=668;VDB=0.0270;AF1=0.914;G3=0.05715,0.0573,0.8855;HWE=0.00542;AC1=66;DP4=35,50,260,232;MQ=36;FQ=999;PV4=0.06,9.9e-122,4.7e-10,1 GT:PL:GQ 1/1:108,36,0:43 1/1:95,27,0:34 1/1:99,33,0:40 1/1:95,42,0:49 1/1:94,39,0:46 1/1:88,24,0:31 1/1:131,27,0:34 1/1:122,33,0:40 1/1:139,42,0:49 1/1:62,15,0:22 1/1:80,36,0:43 1/1:186,42,0:49 1/1:150,33,0:40 1/1:0,0,0:8 1/1:153,42,0:49 1/1:213,66,0:73 1/1:113,21,0:28 1/1:177,36,0:43 1/1:139,27,0:34 1/1:115,24,0:31 1/1:137,27,0:34 1/1:225,87,0:94 1/1:216,63,0:70 1/1:84,15,0:22 1/1:211,84,0:91 1/1:214,87,0:94 1/1:202,66,0:73 1/1:232,72,0:79 1/1:192,66,0:73 1/1:230,102,0:99 1/1:219,78,0:85 0/1:34,0,137:47 1/1:191,45,0:52 0/0:0,102,255:89 0/0:0,84,255:71 0/1:79,0,234:92
chr12 6971236 . T G 999 . DP=850;VDB=0.0316;AF1=0.1001;AC1=7;DP4=337,327,36,32;MQ=42;FQ=999;PV4=0.8,1,0.32,0.24 GT:PL:GQ 0/0:0,60,220:67 0/0:0,60,222:67 0/0:0,69,255:76 0/0:0,66,207:73 0/0:0,51,169:58 0/0:0,39,206:46 0/0:0,45,253:52 0/0:0,63,250:70 0/0:0,54,252:61 0/0:0,48,205:55 0/0:0,60,199:67 0/0:0,57,251:64 0/0:0,24,161:31 0/0:0,0,0:7 0/1:164,0,78:91 0/1:140,0,171:99 0/0:0,30,122:37 0/1:97,0,73:84 0/0:0,57,219:64 0/1:95,0,76:85 0/1:50,0,89:43 0/0:0,93,255:99 0/0:0,69,255:76 0/0:0,15,89:22 0/0:0,93,255:99 0/1:198,0,240:99 0/0:0,69,255:76 0/0:0,90,255:97 0/0:0,78,255:85 0/0:0,108,255:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,33,210:40 0/1:148,0,175:99 0/0:0,90,255:97 0/0:0,81,255:88 0/0:0,84,255:91
chr12 6971242 . tcaaaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaa tcaaaacaaaacaaaacaaaacaaaa 999 . INDEL;DP=889;VDB=0.0428;AF1=0.9076;AC1=66;DP4=102,45,219,169;MQ=47;FQ=999;PV4=0.0075,5.3e-13,1,1 GT:PL:GQ 1/1:214,9,0:16 1/1:255,15,0:22 1/1:255,10,0:17 1/1:255,9,0:16 0/1:120,0,65:58 0/1:127,0,84:77 1/1:255,8,0:15 1/1:255,18,0:25 1/1:255,25,0:32 1/1:171,9,0:16 1/1:225,5,0:12 1/1:245,7,0:14 1/1:0,3,4:6 1/1:0,0,0:7 0/1:82,0,255:95 1/1:255,8,0:15 1/1:0,6,3:9 1/1:107,11,7:11 1/1:0,11,8:8 1/1:94,12,9:10 1/1:0,4,4:7 1/1:255,54,0:61 1/1:255,54,0:61 1/1:116,9,0:16 1/1:255,69,0:76 1/1:255,90,0:97 1/1:255,39,0:46 1/1:255,45,0:52 1/1:255,39,0:46 1/1:255,78,0:85 1/1:255,30,0:37 1/1:246,144,138:13 1/1:255,27,0:34 1/1:255,47,9:45 0/0:0,57,255:44 1/1:255,255,255:7
chr12 6971263 . caaaacaaaaaa caaaaa 999 . INDEL;DP=1003;VDB=0.0383;AF1=0.5526;AC1=40;DP4=233,106,246,165;MQ=50;FQ=999;PV4=0.012,0.0013,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,23,0:21 1/1:255,37,0:35 1/1:255,32,0:30 1/1:255,18,0:16 0/1:255,0,70:72 0/1:255,0,71:73 1/1:255,16,0:14 1/1:255,32,0:30 1/1:255,48,0:46 1/1:255,18,0:16 1/1:255,10,0:9 0/1:100,0,112:99 0/0:0,33,235:29 0/1:0,0,0:3 0/1:8,0,255:12 0/1:126,0,180:99 0/0:0,39,136:35 0/1:13,0,169:17 0/0:0,57,143:53 0/1:21,0,93:25 0/0:0,42,152:38 0/1:178,0,81:83 0/1:255,0,124:99 0/1:107,0,37:39 0/1:249,0,217:99 0/1:255,0,103:99 0/1:199,0,136:99 0/1:255,0,57:59 0/1:127,0,91:93 0/1:255,0,76:78 0/1:255,0,141:99 0/1:56,0,124:60 0/1:231,0,95:97 0/1:228,0,134:99 0/0:0,90,255:86 0/1:120,0,97:99
chr12 6971264 . aaaacaaa aaaa 999 . INDEL;DP=853;VDB=0.0376;AF1=0.3105;G3=0.38,0.62,1.497e-07;HWE=0.00232;AC1=22;DP4=281,110,125,107;MQ=49;FQ=999;PV4=8.4e-06,2.5e-35,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,24,34:24 0/0:0,30,56:30 0/0:0,19,59:20 0/1:28,2,0:6 0/0:0,25,94:25 0/0:0,30,118:30 0/1:76,0,18:24 0/0:0,10,22:11 0/0:0,5,32:7 0/0:0,9,11:9 0/0:0,20,15:18 0/1:137,0,244:99 0/0:0,33,255:33 0/0:0,0,0:3 0/1:24,0,255:24 0/1:185,0,255:99 0/0:0,45,214:45 0/1:27,0,255:27 0/0:0,57,182:57 0/1:79,0,131:79 0/0:0,32,228:32 0/1:255,0,135:99 0/1:255,0,255:99 0/1:56,0,123:56 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:200,0,195:99 0/1:255,0,179:99 0/1:255,0,204:99 0/1:149,0,255:99 0/1:72,0,246:72 0/1:255,0,209:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,87,255:87 0/1:171,0,230:99
chr12 6971268 . caaaaaaaaa caaaa 999 . INDEL;DP=814;VDB=0.0327;AF1=0.4659;AC1=33;DP4=211,88,188,105;MQ=52;FQ=999;PV4=0.11,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:28,37,29:3 0/0:27,33,28:3 0/0:36,57,37:4 1/1:44,23,13:7 0/0:34,52,35:4 0/0:65,71,65:3 1/1:89,17,13:3 0/0:13,22,17:5 0/0:31,34,31:2 0/0:25,28,25:2 0/0:25,61,28:6 0/1:127,0,20:24 0/0:0,33,73:31 0/1:0,0,0:3 0/1:23,0,37:25 0/1:158,0,25:29 0/1:38,0,14:18 0/1:29,0,32:30 0/0:0,32,43:29 0/1:29,0,19:22 0/0:0,48,52:45 0/1:169,4,7:7 0/1:255,0,14:18 0/1:57,5,10:9 0/1:255,0,30:34 0/1:255,0,11:15 0/1:218,0,26:30 0/1:165,0,10:14 0/1:133,15,24:13 1/1:255,16,0:13 1/1:255,12,0:9 0/1:59,0,27:31 0/1:231,0,26:30 0/1:255,0,8:12 0/0:0,90,80:80 0/1:143,0,16:20
chr12 6971273 . A C 6.71 . DP=1002;VDB=0.0174;AF1=0.01456;AC1=1;DP4=409,239,6,2;MQ=49;FQ=6.76;PV4=0.72,5.3e-05,1,0.28 GT:PL:GQ 0/0:0,18,15:34 0/0:0,12,11:28 0/0:0,24,18:40 0/0:0,24,35:40 0/0:0,21,29:37 0/0:0,6,7:22 0/0:0,27,65:43 0/0:0,15,30:31 0/0:0,9,27:25 0/0:0,9,11:25 0/0:0,48,57:64 0/0:0,75,255:91 0/0:0,36,255:52 0/0:0,0,0:16 0/0:0,75,255:91 0/0:0,96,255:99 0/0:0,39,148:55 0/0:0,78,255:94 0/0:0,78,183:94 0/0:0,36,199:52 0/0:0,78,226:94 0/0:0,39,189:55 0/0:0,84,255:99 0/0:0,18,129:34 0/0:0,132,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,90,228:99 0/0:0,54,212:70 0/0:0,75,251:91 0/0:0,126,234:99 0/1:51,0,17:33 0/0:0,42,207:58 0/0:0,51,250:67 0/0:0,78,255:94 0/0:0,114,255:99 0/0:0,93,238:99
chr12 6971376 . C T 112 . DP=992;VDB=0.0322;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=556,313,15,8;MQ=59;FQ=112;PV4=1,4.7e-20,1,0.13 GT:PL:GQ 0/0:0,48,255:63 0/0:0,111,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,111,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,144,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,72,255:87 0/0:0,99,255:99 0/0:0,48,244:63 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,36,255:51 0/0:0,0,0:15 0/0:0,57,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,30,251:45 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,63,255:78 0/0:0,33,255:48 0/0:0,84,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,21,180:36 0/0:0,105,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,102,255:99 0/1:157,0,238:99 0/0:0,80,255:95 0/0:0,154,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,78,255:93 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:84
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chr12 6971449 . T C 999 . DP=996;VDB=0.0371;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.67e-07,0.3143;HWE=4.11e-11;AC1=22;DP4=343,317,189,98;MQ=60;FQ=999;PV4=8.6e-05,2.3e-06,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,78,0:72 1/1:255,90,0:84 1/1:255,126,0:99 1/1:255,78,0:72 1/1:255,114,0:99 1/1:173,33,0:27 1/1:255,57,0:51 1/1:255,63,0:57 1/1:255,90,0:84 1/1:255,72,0:66 1/1:255,57,0:51 0/0:0,84,255:84 0/0:0,42,255:42 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:57 0/0:0,90,255:90 0/0:0,39,255:39 0/0:0,90,255:90 0/0:0,24,241:24 0/0:0,93,255:93 0/0:0,48,255:48 0/0:0,78,255:78 0/0:0,54,255:54 0/0:0,39,255:39 0/0:0,108,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,208,255:99 0/0:0,60,255:60 0/0:0,78,255:78 0/0:0,36,255:36 0/0:0,87,255:87 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,255:75
chr12 6971510 . T A 999 . DP=1662;VDB=0.0012;AF1=0.3276;G3=0.3253,0.6747,1.369e-12;HWE=0.000504;AC1=23;DP4=438,520,262,358;MQ=46;FQ=999;PV4=0.18,2.6e-13,0,1 GT:PL:GQ 0/1:71,0,255:71 0/1:25,0,255:25 0/1:39,0,255:39 0/1:42,0,255:42 0/0:0,11,255:11 0/1:13,0,255:13 0/1:43,0,255:43 0/1:33,0,255:33 0/1:24,0,255:24 0/1:50,0,209:50 0/1:29,0,255:29 0/0:0,15,255:15 0/0:0,27,176:27 0/0:0,0,0:3 0/1:13,0,255:13 0/0:0,21,255:21 0/0:0,25,242:25 0/0:0,22,255:22 0/0:0,23,255:23 0/0:0,7,255:8 0/0:0,8,168:9 0/1:27,0,255:27 0/1:49,0,255:49 0/1:31,0,180:31 0/0:0,28,255:28 0/1:20,0,255:20 0/1:28,0,255:28 0/0:0,12,255:12 0/0:0,22,255:22 0/1:15,0,255:15 0/1:57,0,255:57 0/1:20,0,255:20 0/1:51,0,240:51 0/1:2,0,255:4 0/1:33,0,255:33 0/1:58,0,239:58
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chr12 6971592 . ataactaa ataa 999 . INDEL;DP=911;VDB=0.0406;AF1=0.0634;AC1=4;DP4=376,424,25,20;MQ=59;FQ=999;PV4=0.29,6.1e-11,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:81 0/0:0,72,255:81 0/0:0,111,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,48,255:57 0/0:0,48,255:57 0/0:0,87,255:96 0/0:0,42,255:51 0/0:0,102,255:99 0/0:0,48,255:57 0/0:7,0,190:4 0/0:0,0,0:9 0/0:0,36,255:45 0/0:0,48,255:57 0/0:0,30,255:39 0/0:0,93,255:99 0/0:0,6,106:15 0/0:0,63,255:72 0/0:0,39,255:48 0/1:194,0,102:99 0/1:250,0,255:99 0/0:0,24,255:33 0/0:0,163,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,63,255:72 0/0:0,163,255:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,69,255:78 0/0:0,51,255:60 0/0:0,105,255:99 0/0:0,78,255:87 0/0:0,33,255:42
chr12 6971707 . T C 79.7 . DP=959;VDB=0.0178;AF1=0.0146;AC1=1;DP4=280,541,3,6;MQ=60;FQ=79.7;PV4=1,0.00028,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:78 0/0:0,71,255:86 0/0:0,93,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,99,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,36,247:51 0/0:0,75,255:90 0/0:0,51,255:66 0/0:0,3,33:18 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,78,255:93 0/0:0,30,245:45 0/0:0,81,255:96 0/0:0,39,255:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,30,255:45 0/0:0,36,255:51 0/0:0,54,255:69 0/0:0,6,69:21 0/0:0,132,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,126,255:99 0/1:125,0,255:99 0/0:0,30,254:45 0/0:0,51,255:66 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,33,244:48
chr12 6971875 . G A 999 . DP=947;VDB=0.0420;AF1=0.8997;G3=0.08571,0.02865,0.8856;HWE=0.000125;AC1=65;DP4=43,53,375,396;MQ=58;FQ=999;PV4=0.52,2.6e-201,0.00092,1 GT:PL:GQ 1/1:239,87,0:94 1/1:230,90,0:97 1/1:255,111,0:99 1/1:255,120,0:99 1/1:255,117,0:99 1/1:245,90,0:97 1/1:187,42,0:49 1/1:242,69,0:76 1/1:228,63,0:70 1/1:246,72,0:79 1/1:221,60,0:67 1/1:233,66,0:73 1/1:71,12,0:19 1/1:0,0,0:7 1/1:221,63,0:70 1/1:235,81,0:88 1/1:128,21,0:28 1/1:217,63,0:70 1/1:163,33,0:40 1/1:240,75,0:82 1/1:177,42,0:49 1/1:236,60,0:67 1/1:211,60,0:67 1/1:134,21,0:28 1/1:248,102,0:99 1/1:255,102,0:99 1/1:246,129,0:99 1/1:255,117,0:99 1/1:243,87,0:94 1/1:255,123,0:99 1/1:205,57,0:64 0/1:107,0,195:99 1/1:207,51,0:58 0/0:0,105,255:92 0/0:0,63,255:50 0/0:0,90,255:77
chr12 6971995 . G T 999 . DP=760;VDB=0.0320;AF1=0.3711;G3=0.571,0.115,0.314;HWE=3.92e-06;AC1=27;DP4=202,270,96,132;MQ=40;FQ=999;PV4=0.87,0.00028,2.2e-07,1 GT:PL:GQ 1/1:175,39,0:34 1/1:191,54,0:49 1/1:226,45,0:40 1/1:255,66,0:61 1/1:237,60,0:55 1/1:161,51,0:46 1/1:243,51,0:46 1/1:227,42,0:37 1/1:255,48,0:43 1/1:68,15,0:10 1/1:255,72,0:67 0/0:0,90,255:89 0/0:0,12,47:12 0/1:0,0,0:3 0/0:0,54,255:53 0/0:0,75,255:74 0/0:0,24,160:23 0/0:0,57,255:56 0/0:0,33,175:32 0/0:0,93,255:92 0/0:0,51,188:50 0/1:93,0,153:94 0/1:106,0,132:99 0/0:0,36,242:35 0/0:0,102,255:99 0/1:195,0,248:99 0/1:131,0,226:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,75,255:74 0/0:0,120,255:99 0/0:0,39,255:38 0/0:0,33,237:32 0/0:0,42,255:41 0/0:0,96,255:95 0/0:0,72,255:71 0/0:0,63,255:62
chr12 6972034 . G A 131 . DP=799;VDB=0.0151;AF1=0.0294;G3=0.9707,5.503e-08,0.02932;HWE=0.00275;AC1=2;DP4=447,247,19,15;MQ=21;FQ=131;PV4=0.36,0.1,0.16,0.019 GT:PL:GQ 0/0:0,61,40:69 0/0:0,32,87:44 0/0:0,60,59:72 0/0:0,60,86:72 0/0:0,75,68:87 0/0:0,66,86:78 0/0:0,43,75:55 0/0:0,45,105:57 0/0:0,18,56:30 0/0:0,27,67:39 0/0:0,70,139:82 0/0:0,57,195:69 0/0:0,9,12:21 0/0:0,0,0:12 0/0:0,48,146:60 0/0:0,48,102:60 0/0:0,3,4:15 0/0:0,45,112:57 0/0:0,3,4:15 0/0:0,54,233:66 0/0:0,15,17:27 0/0:0,60,144:72 0/0:0,66,171:78 0/0:0,45,124:57 0/0:0,169,222:99 0/0:0,101,173:99 0/0:0,67,148:79 0/0:0,148,255:99 0/0:0,57,185:69 0/0:0,123,228:99 0/0:0,45,184:57 0/0:0,33,132:45 0/0:0,69,207:81 1/1:197,37,0:19 0/0:0,58,236:70 0/0:0,69,223:81
chr12 6972111 . C G 16.7 . DP=807;VDB=0.0221;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=278,316,6,3;MQ=40;FQ=16.7;PV4=0.32,5.8e-16,0.05,0.24 GT:PL:GQ 0/0:0,57,210:72 0/0:0,59,255:74 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/0:0,81,255:96 0/0:0,63,245:78 0/0:0,27,156:42 0/0:0,63,228:78 0/0:0,33,232:48 0/0:0,24,169:39 0/0:0,48,233:63 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,128:48 0/0:0,0,0:16 0/1:62,0,36:46 0/0:0,51,246:66 0/0:0,18,124:33 0/0:0,48,255:63 0/0:0,27,147:42 0/0:0,60,254:75 0/0:0,21,140:36 0/0:0,51,254:66 0/0:0,48,235:63 0/0:0,24,158:39 0/0:0,75,255:90 0/0:0,84,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,90,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,69,255:84 0/0:0,42,236:57 0/0:0,24,149:39 0/0:0,42,205:57 0/0:0,75,255:90 0/0:0,30,165:45 0/0:0,45,255:60
chr12 6972120 . G A 999 . DP=795;VDB=0.0321;AF1=0.08579;AC1=6;DP4=264,321,22,25;MQ=44;FQ=999;PV4=0.88,0.12,1.6e-05,0.32 GT:PL:GQ 0/0:0,45,214:52 0/0:0,72,255:79 0/0:0,87,255:94 0/0:0,75,255:82 0/0:0,90,255:97 0/0:0,51,248:58 0/0:0,27,191:34 0/0:0,60,255:67 0/0:0,42,255:49 0/0:0,30,240:37 0/0:0,45,245:52 0/0:0,69,255:76 0/1:40,0,64:33 0/0:0,0,0:8 0/0:0,39,226:46 0/0:0,66,255:73 0/0:0,18,130:25 0/0:0,48,255:55 0/0:0,39,243:46 0/0:0,63,255:70 0/0:0,27,202:34 0/1:98,0,156:91 0/1:95,0,145:88 0/0:0,24,163:31 0/0:0,81,255:88 0/1:106,0,187:99 0/1:153,0,197:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,81,255:88 0/0:0,84,255:91 0/0:0,57,255:64 0/0:0,24,163:31 0/1:55,0,136:48 0/0:0,72,255:79 0/0:0,33,175:40 0/0:0,51,255:58
chr12 6972154 . T C 999 . DP=892;VDB=0.0335;AF1=0.3149;G3=0.6857,1.288e-08,0.3143;HWE=4.42e-11;AC1=22;DP4=217,248,87,144;MQ=55;FQ=999;PV4=0.028,2.3e-42,1,1 GT:PL:GQ 1/1:242,63,0:57 1/1:250,66,0:60 1/1:255,81,0:75 1/1:252,93,0:87 1/1:255,102,0:96 1/1:217,42,0:36 1/1:158,24,0:18 1/1:217,57,0:51 1/1:200,39,0:33 1/1:218,48,0:42 1/1:252,69,0:63 0/0:0,57,255:57 0/0:0,27,200:27 0/0:0,0,0:3 0/0:0,39,255:39 0/0:0,84,255:84 0/0:0,33,211:33 0/0:0,51,255:51 0/0:0,36,223:36 0/0:0,69,255:69 0/0:0,33,241:33 0/0:0,54,255:54 0/0:0,48,255:48 0/0:0,12,120:13 0/0:0,105,255:99 0/0:0,75,255:75 0/0:0,84,255:84 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:87 0/0:0,93,255:93 0/0:0,72,255:72 0/0:0,33,198:33 0/0:0,36,255:36 0/0:0,75,255:75 0/0:0,33,243:33 0/0:0,54,255:54
chr12 6972162 . caaaaaaaaaaaa caaaaaaaaaaa 999 . INDEL;DP=872;VDB=0.0409;AF1=0.3372;G3=0.6586,5.174e-07,0.3414;HWE=1.54e-10;AC1=24;DP4=109,169,109,177;MQ=58;FQ=999;PV4=0.8,1,0.0013,1 GT:PL:GQ 1/1:59,63,0:52 1/1:49,25,0:19 1/1:70,66,0:59 1/1:80,87,0:73 1/1:62,54,0:47 1/1:49,36,0:30 1/1:25,8,0:4 1/1:47,45,0:37 1/1:55,30,0:24 1/1:53,42,0:36 1/1:78,72,0:65 0/0:33,43,37:8 0/0:0,15,24:15 0/1:0,0,0:3 0/0:0,21,25:21 0/0:0,39,38:38 0/0:6,16,18:10 0/0:50,53,50:4 0/0:8,11,12:4 0/0:0,51,69:51 0/0:18,24,23:6 0/0:0,39,61:39 0/0:12,24,24:11 0/0:0,15,25:15 0/0:0,47,37:41 0/0:26,44,35:13 0/0:0,73,75:72 0/0:0,31,51:31 0/0:0,53,61:53 0/0:0,78,77:77 0/0:0,33,56:33 0/0:0,21,38:21 0/0:0,13,34:13 0/0:0,37,51:37 0/0:0,33,57:33 0/0:0,33,58:33
chr12 6972216 . C A 67.6 . DP=921;VDB=0.0184;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=360,448,5,7;MQ=58;FQ=67.6;PV4=1,1.1e-16,0.21,0.076 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,96,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,63,255:78 0/0:0,69,255:84 0/0:0,54,255:69 0/0:0,90,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,27,218:42 0/0:0,0,0:15 0/1:113,0,165:98 0/0:0,45,255:60 0/0:0,36,255:51 0/0:0,78,255:93 0/0:0,51,255:66 0/0:0,78,255:93 0/0:0,57,255:72 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,15,149:30 0/0:0,135,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,54,255:69 0/0:0,81,255:96 0/0:0,45,255:60 0/0:0,45,255:60
chr12 6972265 . C T 999 . DP=888;VDB=0.0237;AF1=0.02885;AC1=2;DP4=366,385,9,12;MQ=41;FQ=999;PV4=0.66,1.3e-10,0.5,1 GT:PL:GQ 0/1:129,0,202:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,99,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,63,195:75 0/0:0,75,255:87 0/1:111,0,160:99 0/0:0,36,205:48 0/0:0,96,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,21,20:33 0/0:0,0,0:12 0/0:0,30,190:42 0/0:0,36,193:48 0/0:0,21,144:33 0/0:0,57,255:69 0/0:0,9,37:21 0/0:0,48,216:60 0/0:0,12,63:24 0/0:0,48,251:60 0/0:0,39,225:51 0/0:0,9,89:21 0/0:0,120,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,84,255:96 0/0:0,45,255:57 0/0:0,57,255:69 0/0:0,102,255:99 0/0:0,48,250:60 0/0:0,60,247:72
chr12 6972353 . G A 138 . DP=819;VDB=0.0424;AF1=0.01997;AC1=1;DP4=391,287,13,9;MQ=40;FQ=138;PV4=1,1,0.0002,1 GT:PL:GQ 0/0:0,36,210:50 0/0:0,87,255:99 0/0:0,78,255:92 0/0:0,84,255:98 0/0:0,72,255:86 0/0:0,45,255:59 0/0:0,60,255:74 0/1:182,0,164:99 0/0:0,51,255:65 0/0:0,57,255:71 0/0:0,63,255:77 0/0:0,66,165:80 0/0:0,36,72:50 0/0:0,0,0:14 0/0:0,36,116:50 0/0:0,60,161:74 0/0:0,54,142:68 0/0:0,58,255:72 0/0:0,63,117:77 0/0:12,0,148:4 0/0:0,22,64:36 0/0:0,45,255:59 0/0:0,45,255:59 0/0:0,9,97:23 0/0:0,84,255:98 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:89 0/0:0,90,255:99 0/0:0,84,255:98 0/0:0,66,255:80 0/0:0,36,249:50 0/0:0,27,225:41 0/0:0,36,255:50 0/0:0,105,255:99 0/0:0,48,255:62 0/0:0,42,255:56
chr12 6972385 . A G 999 . DP=660;VDB=0.0252;AF1=0.3134;G3=0.6855,1.898e-08,0.3145;HWE=4.86e-11;AC1=22;DP4=274,83,101,42;MQ=46;FQ=999;PV4=0.17,0.079,3.3e-05,1 GT:PL:GQ 1/1:179,27,0:21 1/1:255,51,0:45 1/1:213,39,0:33 1/1:162,27,0:21 1/1:138,21,0:15 1/1:206,30,0:24 1/1:198,25,0:19 1/1:255,63,0:57 1/1:209,27,0:21 1/1:168,20,0:14 1/1:255,60,0:54 0/0:0,51,195:51 0/0:0,18,18:18 0/0:0,0,0:3 0/0:0,24,139:24 0/0:0,33,174:33 0/0:0,21,38:21 0/0:0,69,255:69 0/0:0,30,84:30 0/0:0,21,151:21 0/0:0,33,69:33 0/0:0,36,255:36 0/0:0,27,227:27 0/0:0,18,151:18 0/0:0,63,202:63 0/0:0,72,255:72 0/0:0,51,240:51 0/0:0,50,255:50 0/0:0,47,255:47 0/0:0,75,255:75 0/0:0,42,222:42 0/0:0,33,222:33 0/0:0,36,255:36 0/0:0,70,255:70 0/0:0,42,193:42 0/0:0,30,247:30
chr12 6972465 . A C 42.6 . DP=786;VDB=0.0152;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=276,345,2,5;MQ=37;FQ=42.7;PV4=0.47,1.5e-06,1,1 GT:PL:GQ 0/1:88,0,158:73 0/0:0,57,255:72 0/0:0,60,255:75 0/0:0,60,255:75 0/0:0,90,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,48,250:63 0/0:0,75,255:90 0/0:0,48,255:63 0/0:0,33,213:48 0/0:0,72,255:87 0/0:0,51,244:66 0/0:0,15,21:30 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,195:60 0/0:0,45,222:60 0/0:0,24,19:39 0/0:0,30,159:45 0/0:0,21,21:36 0/0:0,42,227:57 0/0:0,30,29:45 0/0:0,45,255:60 0/0:0,69,255:84 0/0:0,18,162:33 0/0:0,138,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,60,255:75 0/0:0,108,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,87,255:99 0/0:0,42,244:57 0/0:0,24,209:39 0/0:0,39,255:54 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,233:51
chr12 6972550 . T A 7.52 . DP=2258;VDB=0.0276;AF1=0.02183;AC1=2;DP4=311,245,14,5;MQ=50;FQ=7.59;PV4=0.16,3.2e-12,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,15,32:30 0/0:0,33,79:48 0/0:0,18,83:33 0/0:0,36,139:51 0/0:0,18,85:33 0/0:0,30,103:45 0/0:0,33,102:48 0/0:0,18,71:33 0/0:0,12,72:27 0/0:0,24,89:39 0/0:0,9,45:24 0/0:0,63,255:78 0/0:0,6,44:21 0/0:0,0,0:15 0/0:0,33,190:48 0/0:0,57,255:72 0/0:0,24,138:39 0/0:0,81,255:96 0/0:0,30,158:45 0/0:0,57,255:72 0/0:0,21,147:36 0/0:2,0,147:13 0/0:12,0,89:5 0/0:0,39,255:54 0/1:50,0,248:35 0/0:0,111,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,13,255:28 0/0:0,111,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,247:69 0/0:0,66,255:81 0/0:0,87,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,3,107:18
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chr12 6972870 . AATGAA AATGAAATTAAGGATATGAA 999 . INDEL;DP=884;VDB=0.0372;AF1=0.317;G3=0.6857,4.279e-08,0.3143;HWE=5.29e-11;AC1=23;DP4=339,231,97,63;MQ=60;FQ=999;PV4=0.86,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,42,0:36 1/1:255,33,0:27 1/1:255,60,0:54 1/1:255,33,0:27 1/1:255,66,0:60 1/1:255,36,0:30 1/1:255,63,0:57 1/1:255,39,0:33 1/1:255,30,0:24 1/1:255,24,0:18 1/1:255,54,0:48 0/0:0,66,255:66 0/0:0,9,146:10 0/0:0,0,0:3 0/0:0,81,255:81 0/0:0,81,255:81 0/0:0,9,169:10 0/0:0,81,255:81 0/0:0,27,255:27 0/0:0,54,255:54 0/0:0,24,255:24 0/0:0,54,255:54 0/0:0,36,255:36 0/0:0,39,255:39 0/0:0,114,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,114,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,163,255:99 0/0:0,54,255:54 0/0:0,72,255:72 0/0:0,78,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,36,255:36
chr12 6973006 . C T 999 . DP=1044;VDB=0.0380;AF1=0.3144;G3=0.6857,2.749e-07,0.3143;HWE=4.12e-11;AC1=22;DP4=321,352,148,188;MQ=60;FQ=999;PV4=0.28,0.0016,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,93,0:87 1/1:255,99,0:93 1/1:255,120,0:99 1/1:255,90,0:84 1/1:255,117,0:99 1/1:255,54,0:48 1/1:255,111,0:99 1/1:255,105,0:99 1/1:255,69,0:63 1/1:255,60,0:54 1/1:255,87,0:81 0/0:0,69,255:69 0/0:0,48,255:48 0/0:0,0,0:3 0/0:0,63,255:63 0/0:0,72,255:72 0/0:0,27,247:27 0/0:0,84,255:84 0/0:0,21,203:21 0/0:0,66,255:66 0/0:0,33,255:33 0/0:0,90,255:90 0/0:0,60,255:60 0/0:0,39,255:39 0/0:0,148,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,57,255:57 0/0:0,54,255:54 0/0:0,69,255:69 0/0:0,123,255:99 0/0:0,66,255:66 0/0:0,48,255:48
chr12 6973070 . A C 90.6 . DP=1120;VDB=0.0456;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=519,549,8,6;MQ=60;FQ=90.6;PV4=0.6,3.9e-21,0.23,0.22 GT:PL:GQ 0/0:0,141,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,66,255:81 0/0:0,87,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,30,218:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,30,255:45 0/0:0,96,255:99 0/0:0,30,255:45 0/1:136,0,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,105,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,27,237:42 0/0:0,166,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,220,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,45,255:60 0/0:0,135,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,48,255:63
chr12 6973187 . C T 72.2 . DP=985;VDB=0.0548;AF1=0.02857;AC1=2;DP4=396,534,6,13;MQ=60;FQ=72.3;PV4=0.48,8.6e-74,1,0.1 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:81 0/0:0,144,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,141,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,51,255:63 0/0:0,69,255:81 0/0:0,51,255:63 0/0:0,75,255:87 0/0:0,69,255:81 0/0:0,60,255:72 0/0:0,0,0:12 0/0:0,69,255:81 0/1:78,0,238:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,84,255:96 0/0:0,24,235:36 0/0:0,72,255:84 0/1:55,0,110:43 0/0:0,69,255:81 0/0:0,81,255:93 0/0:0,39,255:51 0/0:0,111,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,78,255:90 0/0:0,51,255:63 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,60,255:72
chr12 6973245 . C G 115 . DP=933;VDB=0.0357;AF1=0.02859;AC1=2;DP4=395,465,11,15;MQ=60;FQ=115;PV4=0.84,1.9e-79,0.46,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,132,255:99 0/1:103,0,159:91 0/0:0,102,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,75,255:87 0/1:73,0,224:61 0/0:0,63,255:75 0/0:0,45,255:57 0/0:0,57,255:69 0/0:0,60,255:72 0/0:0,36,255:48 0/0:0,0,0:12 0/0:0,36,255:48 0/0:0,54,255:66 0/0:0,45,255:57 0/0:0,75,255:87 0/0:0,36,255:48 0/0:0,60,255:72 0/0:0,51,255:63 0/0:0,57,255:69 0/0:0,72,255:84 0/0:0,18,187:30 0/0:0,120,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,39,255:51 0/0:0,120,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,54,255:66
chr12 6973272 . A G 76.6 . DP=988;VDB=0.0268;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=437,494,6,5;MQ=57;FQ=76.6;PV4=0.76,2e-23,1.1e-06,0.45 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,90,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,84,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,60,255:75 0/0:0,45,255:60 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,233:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,36,255:51 0/0:0,90,255:99 0/1:122,0,130:99 0/0:0,54,255:69 0/0:0,27,233:42 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,66,255:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,27,248:42 0/0:0,126,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,148,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,60,255:75
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chr12 6973363 . caaaaaa caaaaa 999 . INDEL;DP=893;VDB=0.0405;AF1=0.2138;G3=0.7169,0.1403,0.1428;HWE=0.00142;AC1=15;DP4=283,364,69,57;MQ=56;FQ=999;PV4=0.025,1,3.2e-74,0.24 GT:PL:GQ 0/0:0,102,169:99 0/0:0,51,144:54 0/0:0,75,163:78 0/0:0,90,165:93 0/0:0,84,163:87 0/0:0,48,121:51 0/0:0,36,113:39 0/0:0,57,148:60 0/0:0,99,165:99 0/0:0,36,119:39 0/0:0,54,154:57 1/1:120,54,0:45 0/1:17,0,47:15 0/0:0,0,0:4 0/1:66,0,52:59 0/1:75,0,46:55 0/1:59,0,46:52 1/1:160,66,0:57 1/1:114,36,0:27 1/1:134,45,0:36 1/1:124,36,0:27 0/0:0,75,158:78 0/0:0,54,129:57 0/0:0,24,103:27 0/0:0,126,170:99 0/1:95,0,83:89 0/0:0,84,169:87 0/0:0,87,174:90 0/0:0,72,167:75 0/0:0,190,193:99 0/0:0,99,168:99 0/0:0,24,98:27 0/0:0,45,144:48 0/0:0,87,169:90 0/0:0,75,165:78 0/0:0,45,143:48
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chr12 6973413 . G C 30.6 . DP=946;VDB=0.0311;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=422,419,3,1;MQ=57;FQ=30.6;PV4=0.62,1,4.6e-07,0.43 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,84,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,75,255:90 0/0:0,66,255:81 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,208:42 0/1:76,0,103:61 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,255:60 0/0:0,72,255:87 0/0:0,45,253:60 0/0:0,66,255:81 0/0:0,27,177:42 0/0:0,78,255:93 0/0:0,45,255:60 0/0:0,87,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,30,255:45 0/0:0,96,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,48,255:63 0/0:0,30,251:45 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,48,255:63
chr12 6973418 . T C 134 . DP=971;VDB=0.0291;AF1=0.02858;AC1=2;DP4=423,424,9,11;MQ=57;FQ=134;PV4=0.82,5.5e-33,1,0.48 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,93,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,78,255:90 0/0:0,72,255:84 0/0:0,78,255:90 0/0:0,63,255:75 0/0:0,66,255:78 0/0:0,27,217:39 0/0:0,27,224:39 0/0:0,0,0:12 0/0:0,42,255:54 0/0:0,72,255:84 0/0:0,39,249:51 0/0:0,69,255:81 0/0:0,27,197:39 0/0:0,69,255:81 0/0:0,48,255:60 0/0:0,72,255:84 0/0:0,63,255:75 0/0:0,27,237:39 0/0:0,108,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,75,255:87 0/1:117,0,178:99 0/0:0,39,255:51 0/0:0,96,255:99 0/0:0,87,255:99 0/1:78,0,184:66
chr12 6973454 . G A 999 . DP=976;VDB=0.0291;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=353,391,21,24;MQ=57;FQ=999;PV4=1,1.6e-42,1,1 GT:PL:GQ 0/1:176,0,255:99 0/0:0,41,255:51 0/0:0,81,255:91 0/1:183,0,100:99 0/0:0,48,255:58 0/0:0,30,235:40 0/0:0,69,255:79 0/0:0,54,255:64 0/1:122,0,163:99 0/0:0,48,255:58 0/0:0,81,255:91 0/0:0,69,255:79 0/0:0,45,255:55 0/0:0,0,0:11 0/0:0,42,255:52 0/0:0,63,255:73 0/0:0,48,255:58 0/0:0,66,255:76 0/0:0,36,255:46 0/0:0,51,255:61 0/0:0,42,255:52 0/0:0,75,255:85 0/0:0,87,255:97 0/0:0,24,224:34 0/0:0,99,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,132,255:99 0/0:0,84,255:94 0/0:0,57,255:67 0/0:0,27,219:37 0/0:0,81,255:91 0/0:0,75,255:85 0/0:0,57,255:67
chr12 6973460 . G C 999 . DP=980;VDB=0.0328;AF1=0.1551;AC1=11;DP4=309,358,72,65;MQ=56;FQ=999;PV4=0.19,1,1,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,255:99 1/1:255,18,0:8 0/1:238,0,255:99 0/0:0,63,255:67 0/1:243,0,95:99 0/1:72,0,144:68 0/1:255,0,121:99 0/1:213,0,177:99 0/0:0,22,255:26 0/1:169,0,181:99 1/1:255,78,0:68 0/0:0,69,255:73 0/0:0,42,255:46 0/0:0,0,0:5 0/0:0,45,255:49 0/0:0,66,255:70 0/0:0,54,255:58 0/0:0,57,255:61 0/0:0,39,242:43 0/0:0,42,255:46 0/0:0,33,245:37 0/0:0,78,255:82 0/0:0,87,255:91 0/0:0,30,250:34 0/0:0,114,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,75,255:79 0/0:0,141,255:99 0/0:0,90,255:94 0/0:0,57,255:61 0/0:0,24,189:28 0/0:0,87,255:91 0/0:0,72,255:76 0/0:0,54,255:58
chr12 6973476 . G A 999 . DP=971;VDB=0.0328;AF1=0.09379;AC1=7;DP4=370,377,32,24;MQ=55;FQ=999;PV4=0.33,1,5.4e-23,0.14 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,72,255:79 0/0:0,21,195:28 0/0:0,69,255:76 0/0:0,54,255:61 0/0:0,60,255:67 0/0:0,24,227:31 0/0:0,84,255:91 0/1:189,0,187:99 0/1:30,0,175:23 0/0:0,0,0:7 0/0:0,51,255:58 0/1:156,0,162:99 0/0:0,42,235:49 1/1:255,60,0:47 0/0:0,36,188:43 0/0:0,36,255:43 0/1:8,0,93:4 0/0:0,75,255:82 0/0:0,99,255:99 0/0:0,30,237:37 0/0:0,120,255:99 0/1:134,0,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,90,255:97 0/0:0,105,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,255:46 0/0:0,24,189:31 0/0:0,96,255:99 0/0:0,57,255:64 0/0:0,57,255:64
chr12 6973484 . G A 118 . DP=961;VDB=0.0329;AF1=0.04226;G3=0.9428,0.02861,0.02854;HWE=0.0227;AC1=3;DP4=410,375,8,7;MQ=54;FQ=118;PV4=1,1,3e-16,4.2e-05 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:95 0/0:0,69,255:80 0/0:0,24,216:35 0/0:0,60,255:71 0/0:0,51,255:62 0/0:0,63,255:74 0/0:0,30,250:41 0/0:0,78,255:89 0/0:0,72,255:83 0/0:0,36,171:47 0/0:0,0,0:11 0/0:0,48,255:59 0/0:0,51,255:62 0/1:54,0,75:43 0/0:0,60,255:71 1/1:143,30,0:14 0/0:0,24,212:35 0/0:0,36,106:47 0/0:0,81,255:92 0/0:0,96,255:99 0/0:0,30,239:41 0/0:0,117,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:56 0/0:0,24,193:35 0/0:0,93,255:99 0/0:0,51,255:62 0/0:0,51,255:62
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chr12 6974669 . G A 123 . DP=1114;VDB=0.0313;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=416,611,16,11;MQ=60;FQ=123;PV4=0.072,4.2e-35,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,154,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,87,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/0:0,63,255:78 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,36,255:51 0/0:0,75,255:90 0/0:0,75,255:90 0/0:0,33,255:48 0/0:0,163,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,114,255:99 0/1:168,0,255:99 0/0:0,187,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,96,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:99
chr12 6974737 . C A 42.6 . DP=1084;VDB=0.0272;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=391,599,1,6;MQ=60;FQ=42.6;PV4=0.26,5.6e-06,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,169,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,96,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,60,255:75 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,54,255:69 0/0:0,111,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,0,0:15 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,51,255:66 0/0:0,69,255:84 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,69,255:84 0/0:0,75,255:90 0/0:0,87,255:99 0/0:0,21,199:36 0/0:0,181,255:99 0/0:0,172,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,81,255:96 0/1:88,0,105:73 0/0:0,72,255:87 0/0:0,57,255:72 0/0:0,123,255:99 0/0:0,87,255:99
chr12 6974852 . A G 999 . DP=1000;VDB=0.0316;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=372,521,18,25;MQ=60;FQ=999;PV4=1,6.6e-78,1,1 GT:PL:GQ 0/1:120,0,255:99 0/0:0,69,255:79 0/0:0,90,255:99 0/1:83,0,255:73 0/0:0,138,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,72,255:82 0/1:79,0,255:69 0/0:0,81,255:91 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:73 0/0:0,21,207:31 0/0:0,0,0:11 0/0:0,54,255:64 0/0:0,66,255:76 0/0:0,36,255:46 0/0:0,39,255:49 0/0:0,36,255:46 0/0:0,54,255:64 0/0:0,36,255:46 0/0:0,84,255:94 0/0:0,69,255:79 0/0:0,27,244:37 0/0:0,157,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,144,255:99 0/0:0,78,255:88 0/0:0,33,255:43 0/0:0,54,255:64 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,81,255:91
chr12 6974917 . T A 77.5 . DP=855;VDB=0.0356;AF1=0.07686;AC1=5;DP4=308,334,11,15;MQ=60;FQ=77.8;PV4=0.69,5.2e-51,0.00036,1 GT:PL:GQ 0/0:0,30,255:38 0/0:0,102,255:99 0/0:0,28,255:36 0/1:45,0,12:26 0/0:3,0,255:6 0/1:24,0,125:16 0/1:35,0,147:27 0/1:40,0,212:32 0/1:30,6,0:8 0/0:0,24,189:32 0/0:0,60,255:68 0/0:0,72,255:80 0/0:0,18,197:26 0/0:0,0,0:8 0/0:0,63,255:71 0/0:0,69,255:77 0/0:0,54,255:62 0/0:0,33,255:41 0/0:0,42,255:50 0/0:0,39,255:47 0/0:0,36,253:44 0/0:0,75,255:83 0/0:0,72,255:80 0/0:0,12,113:20 0/0:0,132,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,27,227:35 0/0:0,154,255:99 0/0:0,45,255:53 0/0:0,9,110:17 0/0:0,48,255:56 0/0:0,69,255:77 0/0:0,75,255:83 0/0:0,57,255:65
chr12 6975063 . C T 999 . DP=1007;VDB=0.0403;AF1=0.7567;G3=0.2286,0.02863,0.7428;HWE=4.4e-08;AC1=55;DP4=134,99,316,318;MQ=60;FQ=999;PV4=0.047,0.021,0.0017,0.26 GT:PL:GQ 1/1:255,123,0:99 1/1:255,99,0:99 1/1:255,135,0:99 1/1:255,84,0:86 1/1:255,96,0:98 1/1:200,24,0:26 1/1:255,63,0:65 1/1:255,75,0:77 1/1:255,96,0:98 1/1:255,39,0:41 1/1:255,108,0:99 1/1:252,39,0:41 1/1:165,15,0:17 1/1:0,0,0:4 1/1:255,66,0:68 1/1:255,63,0:65 1/1:255,30,0:32 1/1:255,36,0:38 1/1:199,21,0:23 1/1:255,51,0:53 1/1:255,33,0:35 1/1:255,78,0:80 1/1:255,63,0:65 1/1:194,21,0:23 1/1:255,175,0:99 1/1:255,102,0:99 1/1:255,98,0:99 0/1:196,0,255:99 0/0:0,102,255:94 0/0:0,99,255:91 0/0:0,93,228:85 0/0:0,33,255:25 0/0:0,57,255:49 0/0:0,102,255:94 0/0:0,33,255:25 0/0:0,60,255:52
chr12 6975458 . C A 81.6 . DP=1031;VDB=0.0388;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=425,514,9,4;MQ=59;FQ=81.6;PV4=0.098,1.6e-26,0.26,0.42 GT:PL:GQ 0/0:0,78,255:93 0/0:0,103,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,93,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,81,255:96 0/0:0,23,255:38 0/0:0,15,168:30 0/0:0,0,0:15 0/0:0,42,255:57 0/0:0,75,255:90 0/0:0,24,231:39 0/0:0,63,255:78 0/0:0,30,255:45 0/0:0,33,255:48 0/0:0,30,255:45 0/0:0,69,255:84 0/0:0,48,255:63 0/0:0,36,255:51 0/0:0,160,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,148,255:99 0/1:127,0,197:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,96,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,48,255:63
chr12 6975500 . atcttttctttt atctttt 999 . INDEL;DP=918;VDB=0.0377;AF1=0.05458;AC1=4;DP4=298,171,19,18;MQ=52;FQ=999;PV4=0.16,5.5e-05,0.0055,1 GT:PL:GQ 0/0:0,42,255:51 0/0:0,66,255:75 0/0:0,57,255:66 0/0:0,69,255:78 0/0:0,54,255:63 0/0:0,42,255:51 0/0:0,60,255:69 0/0:0,30,250:39 0/0:0,39,255:48 0/0:0,27,220:36 0/0:0,33,252:42 0/0:0,18,142:27 0/0:0,3,32:13 0/0:0,0,0:10 0/0:0,15,116:24 0/0:0,21,186:30 0/0:0,6,53:16 0/0:0,54,255:63 0/0:0,18,132:27 0/0:0,30,255:39 0/0:0,18,89:27 0/0:0,15,153:24 0/1:32,0,28:23 0/0:0,18,175:27 0/0:0,50,255:59 0/0:0,45,255:54 0/0:0,48,255:57 0/0:3,0,255:7 0/1:136,0,118:99 0/1:109,0,255:99 0/1:10,0,255:3 0/0:0,30,239:39 0/0:0,18,218:27 0/0:0,40,255:49 0/0:0,33,255:42 0/0:0,18,127:27
chr12 6975503 . ttttcttt tttt 999 . INDEL;DP=918;VDB=0.0384;AF1=0.08961;AC1=6;DP4=302,190,24,21;MQ=51;FQ=999;PV4=0.34,5.2e-06,0.44,1 GT:PL:GQ 0/0:0,48,255:55 0/0:0,51,255:58 0/0:0,60,255:67 0/0:0,75,255:82 0/0:0,39,255:46 0/0:0,48,255:55 0/0:0,60,255:67 0/0:0,6,226:13 0/0:0,42,255:49 0/0:0,33,216:40 0/0:5,0,220:4 0/0:0,21,145:28 0/0:0,6,35:13 0/0:0,0,0:8 0/0:0,15,107:22 0/0:0,21,183:28 0/0:0,6,53:13 0/0:0,57,255:64 0/0:0,18,132:25 0/0:0,11,216:18 0/0:0,18,89:25 0/0:0,15,135:22 0/1:40,0,33:33 0/0:0,9,158:16 0/1:40,0,255:33 0/1:9,0,221:4 0/0:0,5,255:12 0/1:79,0,255:72 0/0:0,12,141:19 0/0:0,37,255:44 0/1:72,0,255:65 0/0:0,30,227:37 0/1:30,0,186:23 0/0:0,14,255:21 0/0:0,42,244:49 0/0:0,18,120:25
chr12 6975507 . ctttttttttttttttttttt ctttttttttttttttt,cttttttttttttttt,ctttttttttttttttttt 999 . INDEL;DP=877;VDB=0.0375;AF1=1;AC1=72;DP4=36,39,117,47;MQ=36;FQ=-37.4;PV4=0.00077,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:0,3,4,3,4,4,3,4,4,4:11 1/1:19,20,12,34,15,21,4,0,15,0:19 1/1:15,11,6,25,9,17,6,0,15,0:16 1/1:0,21,11,21,11,11,5,11,11,5:16 1/1:17,10,6,23,9,18,9,0,16,4:16 1/1:10,16,12,16,12,12,3,9,9,0:15 1/1:20,29,21,29,21,21,5,15,15,0:19 1/1:34,15,11,37,17,34,26,0,30,15:16 1/1:0,9,10,9,10,10,9,10,10,10:10 1/1:5,8,7,8,7,7,1,3,3,0:13 1/1:42,34,31,45,34,42,15,4,21,0:15 1/1:12,1,0,15,3,14,15,3,14,14:13 1/1:0,0,0,0,0,0,0,0,0,0:12 1/1:0,0,0,0,0,0,0,0,0,0:12 1/1:5,8,7,8,7,7,1,3,3,0:13 1/1:0,3,4,3,4,4,3,4,4,4:11 1/1:0,0,0,0,0,0,0,0,0,0:12 1/1:0,9,11,9,11,11,9,11,11,11:9 1/1:0,3,4,3,4,4,3,4,4,4:11 1/1:15,1,0,18,3,17,18,3,17,17:13 1/1:0,6,7,6,7,7,6,7,7,7:11 1/1:10,10,10,10,10,10,3,3,3,0:12 1/1:78,37,25,53,0,47,78,37,53,78:23 1/1:25,16,13,28,16,25,12,0,16,4:15 1/1:69,11,4,77,17,69,65,0,71,58:18 1/1:105,19,0,99,16,93,104,5,95,97:30 1/1:99,27,0,105,42,99,101,15,106,94:38 1/1:68,9,0,71,9,66,73,14,69,67:20 1/1:132,147,133,9,30,0,147,133,30,133:23 1/1:132,124,117,18,15,0,147,123,45,132:18 1/1:70,9,2,61,0,55,74,13,57,68:18 1/1:20,20,20,20,20,20,6,6,6,0:12 1/1:59,10,0,62,15,59,62,15,59,59:21 1/1:5,0,0,17,3,13,9,0,12,9:12 1/1:0,9,7,9,7,7,1,6,6,3:13 1/1:4,10,7,10,7,7,1,6,6,0:14
chr12 6975524 . ttttg t 94.8 . INDEL;DP=968;VDB=0.0374;AF1=0.1168;AC1=8;DP4=194,104,32,14;MQ=36;FQ=95.3;PV4=0.62,3.6e-06,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,12,51:18 0/0:0,22,75:28 0/0:0,24,91:30 0/0:0,63,111:69 0/0:0,10,62:16 0/0:0,27,105:33 0/0:0,33,108:39 0/0:0,4,57:10 0/0:0,36,105:42 0/0:0,15,41:21 0/0:0,1,35:8 0/0:0,4,39:10 0/0:0,3,4:9 0/0:0,0,0:7 0/0:0,9,18:15 0/0:0,18,62:24 0/0:0,0,0:7 0/0:0,27,58:33 0/0:0,3,4:9 0/0:2,0,39:5 0/0:0,9,9:15 0/0:0,12,22:18 0/1:24,0,14:18 0/1:8,0,14:4 0/1:27,0,62:21 0/1:38,0,36:32 0/0:0,6,77:12 0/1:23,0,89:17 0/0:0,39,83:45 0/0:0,0,85:7 0/1:36,0,83:30 0/0:0,12,52:18 0/1:45,0,13:25 0/0:0,22,115:28 0/0:0,30,81:36 0/0:0,24,74:30
chr12 6975527 . tg t 4.3 . INDEL;DP=901;VDB=0.0343;AF1=0.09284;AC1=7;DP4=103,85,13,0;MQ=26;FQ=4.57;PV4=0.00075,0.18,1,1 GT:PL:GQ 0/1:16,0,16:8 0/0:0,27,47:36 0/0:0,12,21:21 0/0:0,36,53:45 0/0:8,0,7:4 0/1:19,0,34:10 0/1:16,0,13:8 0/0:0,15,54:24 0/0:0,15,38:24 0/0:0,3,4:12 0/0:0,3,11:12 0/0:0,9,29:18 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,9,18:18 0/0:0,9,37:18 0/0:0,0,0:10 0/0:0,15,35:24 0/0:0,3,4:12 0/0:0,6,20:15 0/0:0,6,7:15 0/0:0,12,22:21 0/0:0,18,36:27 0/0:0,3,4:12 0/0:1,0,74:9 0/0:0,33,83:42 0/0:0,33,79:42 0/0:0,39,143:48 0/0:0,32,92:41 0/0:0,30,151:39 0/0:0,27,120:36 0/1:18,0,25:9 0/0:0,3,28:12 0/1:23,0,116:14 0/0:0,21,68:30 0/0:0,21,73:30
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chr12 6975569 . G T 999 . DP=962;VDB=0.0046;AF1=0.299;G3=0.3399,0.6601,1.245e-13;HWE=0.00162;AC1=21;DP4=350,139,139,137;MQ=20;FQ=999;PV4=5.9e-09,4.3e-195,2.2e-19,1 GT:PL:GQ 0/1:35,0,40:34 0/0:0,32,121:33 0/1:8,0,90:8 0/1:15,0,70:14 0/1:6,0,87:6 0/1:28,0,12:18 0/0:0,6,100:8 0/1:18,0,92:17 0/1:14,0,175:13 0/1:19,0,45:18 0/1:19,0,83:18 0/0:0,0,111:3 0/0:0,18,8:14 0/0:0,0,0:3 0/0:0,4,45:6 0/0:0,5,57:7 0/0:0,30,6:14 0/1:20,0,39:19 0/0:0,15,9:13 0/0:0,5,117:7 0/0:0,28,8:15 0/1:11,0,165:11 0/1:1,0,124:3 0/1:10,0,19:10 0/1:24,0,173:23 0/0:0,6,205:8 0/0:0,9,116:10 0/1:40,0,180:39 0/0:0,2,180:5 0/1:42,0,167:41 0/1:8,0,199:8 0/1:2,0,139:4 0/1:25,0,47:24 0/1:41,0,116:40 0/0:0,0,117:3 0/0:0,16,142:17
chr12 6975570 . T C 999 . DP=961;VDB=0.0210;AF1=0.1546;AC1=11;DP4=370,267,106,13;MQ=20;FQ=999;PV4=1e-11,1,1,1 GT:PL:GQ 0/1:25,0,41:21 0/1:103,5,0:6 0/1:87,0,16:26 0/1:65,0,28:38 0/1:90,0,7:17 0/0:4,0,32:3 0/1:73,0,1:12 0/1:103,0,20:30 0/1:166,0,20:30 0/1:36,0,19:27 0/1:78,0,22:32 0/0:0,63,157:67 0/0:0,36,11:26 0/0:0,0,0:5 0/0:0,48,57:52 0/0:0,60,98:64 0/0:0,60,8:23 0/0:0,39,93:43 0/0:0,24,13:25 0/0:0,57,129:61 0/0:0,39,11:26 0/0:0,81,219:85 0/0:0,54,179:58 0/0:0,15,51:19 0/0:0,114,218:99 0/0:0,114,239:99 0/0:0,69,166:73 0/0:0,114,250:99 0/0:0,117,202:99 0/0:0,72,205:76 0/0:0,75,245:79 0/0:0,36,182:40 0/0:0,33,109:37 0/0:0,90,186:94 0/0:0,54,190:58 0/0:0,57,162:61
chr12 6975658 . T C 999 . DP=867;VDB=0.0329;AF1=0.6883;G3=0.198,0.231,0.5709;HWE=0.00756;AC1=50;DP4=94,135,154,323;MQ=50;FQ=999;PV4=0.023,0.13,0.0052,1 GT:PL:GQ 1/1:255,81,0:81 1/1:255,132,0:99 1/1:255,87,0:87 1/1:255,81,0:81 1/1:255,99,0:99 1/1:255,45,0:45 1/1:255,58,0:58 1/1:255,48,0:48 1/1:255,81,0:81 1/1:255,51,0:51 1/1:192,30,0:30 0/0:0,57,255:51 0/1:60,0,44:44 1/1:0,0,0:3 1/1:197,30,0:30 0/1:99,0,107:99 1/1:96,15,0:16 0/0:0,36,235:30 1/1:118,21,0:21 1/1:255,51,0:51 0/0:0,12,119:7 1/1:255,57,0:57 1/1:255,48,0:48 1/1:255,33,0:33 1/1:255,54,0:54 0/1:222,0,254:99 1/1:255,84,0:84 0/1:155,0,220:99 0/1:231,0,255:99 0/1:152,0,255:99 0/1:155,0,193:99 0/0:0,54,230:48 0/1:123,0,129:99 0/0:0,81,255:75 0/0:0,66,255:60 0/0:0,45,255:39
chr12 6975686 . ttct tt 53.7 . INDEL;DP=995;VDB=0.0410;AF1=0.01653;AC1=1;DP4=136,189,10,26;MQ=44;FQ=53.7;PV4=0.11,2.8e-05,1.4e-05,0.099 GT:PL:GQ 0/0:0,21,94:36 0/0:0,39,121:54 0/0:0,18,108:33 0/0:3,0,53:12 0/0:0,6,23:21 0/0:0,21,99:36 0/0:0,39,115:54 0/0:0,6,22:21 0/1:106,0,2:23 0/0:0,3,17:18 0/0:0,9,25:24 0/0:0,45,144:60 0/0:0,21,84:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,24,96:39 0/0:0,39,107:54 0/0:0,12,53:27 0/0:0,45,122:60 0/0:0,6,40:21 0/0:0,27,103:42 0/0:0,24,94:39 0/0:0,12,66:27 0/0:0,5,31:20 0/0:0,12,62:27 0/0:0,5,47:20 0/0:0,42,153:57 0/0:0,8,103:23 0/0:0,10,62:25 0/0:0,40,159:55 0/0:0,8,106:23 0/0:0,45,154:60 0/0:0,33,115:48 0/0:0,29,125:44 0/0:0,36,153:51 0/0:0,56,141:71 0/0:0,30,143:45
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chr12 6975777 . G A 999 . DP=1012;VDB=0.0289;AF1=0.07955;G3=0.8856,0.0579,0.05646;HWE=0.00932;AC1=6;DP4=414,403,15,23;MQ=32;FQ=999;PV4=0.19,0.0046,1,0.21 GT:PL:GQ 0/0:0,94,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,66,219:74 0/0:0,102,253:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,185:50 0/0:0,60,192:68 0/0:0,51,220:59 0/0:0,81,255:89 0/0:0,69,231:77 0/0:0,78,255:86 0/0:0,93,187:99 0/0:0,39,24:43 0/0:0,0,0:8 0/0:0,57,140:65 0/0:0,63,137:71 0/0:0,57,27:48 0/0:0,69,150:77 0/0:0,66,11:32 0/0:0,63,156:71 0/0:0,63,14:35 1/1:250,34,0:20 0/0:0,72,207:80 1/1:106,15,0:4 0/1:35,0,187:27 0/0:0,90,255:98 0/1:46,0,60:38 0/0:0,111,255:99 0/0:0,45,179:53 0/0:0,123,255:99 0/0:0,45,180:53 0/0:0,66,255:74 0/0:0,36,181:44 0/0:0,138,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,45,255:53
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chr12 6975878 . G A 999 . DP=907;VDB=0.0396;AF1=0.2987;G3=0.5717,0.2543,0.174;HWE=0.0243;AC1=21;DP4=308,352,74,117;MQ=57;FQ=999;PV4=0.058,6.5e-217,7.1e-21,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:76 0/0:0,105,255:99 0/0:0,93,255:94 0/0:0,129,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,81,255:82 0/0:0,75,255:76 0/0:0,63,255:64 0/0:0,66,255:67 0/0:0,45,255:46 0/0:0,51,255:52 0/0:0,87,255:88 0/1:43,0,7:14 0/0:0,0,0:3 1/1:161,57,0:50 0/1:48,0,202:47 1/1:84,21,0:14 0/0:0,48,255:49 1/1:85,18,0:12 1/1:137,33,0:26 0/1:23,0,18:20 1/1:179,48,0:41 0/0:0,54,255:55 1/1:113,24,0:17 0/1:118,0,255:99 0/0:0,160,255:99 0/1:89,0,251:88 0/0:0,111,255:99 0/1:142,0,223:99 0/1:113,0,255:99 0/1:53,0,255:52 0/0:0,39,255:40 0/1:136,0,171:99 0/0:0,75,255:76 0/0:0,57,255:58 0/0:0,57,255:58
chr12 6975995 . attttttttt aTttttttttt 44.7 . INDEL;DP=817;VDB=0.0412;AF1=0.04362;AC1=3;DP4=277,317,17,25;MQ=56;FQ=44.9;PV4=0.52,1,1,0.25 GT:PL:GQ 0/0:0,69,98:79 0/0:0,117,113:99 0/0:0,84,95:94 0/0:0,69,103:79 0/0:0,51,80:61 0/0:0,42,83:52 0/0:0,66,104:76 0/0:0,78,103:88 0/0:0,54,97:64 0/0:0,18,54:28 0/0:0,51,96:61 0/0:0,57,99:67 0/0:0,12,40:22 0/0:0,0,0:11 0/0:0,36,81:46 0/0:0,39,59:49 0/0:0,18,41:28 0/0:0,48,91:58 0/0:0,21,49:31 0/0:0,48,89:58 0/0:0,12,40:22 0/0:0,39,83:49 0/1:44,0,13:28 0/0:0,9,30:19 0/0:0,69,98:79 0/1:31,0,43:21 0/1:52,2,0:15 0/0:0,81,107:91 0/0:0,60,93:70 0/0:0,90,109:99 0/0:0,72,96:82 0/0:0,39,83:49 0/0:0,63,83:73 0/0:0,46,84:56 0/0:0,84,104:94 0/0:0,45,83:55
chr12 6976004 . T A 999 . DP=788;VDB=0.0375;AF1=0.4387;G3=0.4772,0.1288,0.3941;HWE=6.27e-05;AC1=32;DP4=131,164,65,27;MQ=57;FQ=999;PV4=1.4e-05,7.5e-110,1,1 GT:PL:GQ 1/1:100,30,0:26 1/1:81,15,0:11 1/1:60,15,0:11 1/1:78,18,0:14 1/1:95,27,0:23 1/1:71,18,0:14 1/1:36,6,0:4 1/1:118,30,0:26 1/1:81,18,0:14 1/1:43,9,0:6 0/1:51,2,0:4 0/0:0,60,255:58 0/0:0,6,50:6 0/1:0,0,0:3 1/1:23,6,0:4 0/1:12,0,164:14 0/1:15,3,0:3 0/0:0,51,255:49 0/1:0,0,0:3 1/1:43,9,0:6 0/0:0,12,68:10 0/1:20,0,107:22 0/1:16,0,24:18 0/0:0,9,94:8 0/0:0,13,255:11 0/0:0,51,255:49 0/0:0,36,182:34 0/0:0,99,255:97 0/1:25,0,231:27 0/0:0,56,255:54 0/0:0,26,185:24 0/0:0,42,255:40 0/0:0,15,222:13 0/0:0,78,255:76 0/0:0,102,255:99 0/0:0,45,255:43
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chr12 6976390 . AAAACAAACAAACAAA AAAACAAACAAA 999 . INDEL;DP=754;VDB=0.0409;AF1=0.01459;AC1=1;DP4=309,272,9,10;MQ=59;FQ=999;PV4=0.65,0.00043,0.47,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,54,255:69 0/0:0,63,255:78 0/0:0,63,255:78 0/0:0,48,255:63 0/0:0,36,255:51 0/0:0,51,255:66 0/0:0,45,255:60 0/0:0,36,255:51 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,255:66 0/0:0,6,93:21 0/0:0,0,0:15 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,255:48 0/0:0,24,255:39 0/0:0,39,255:54 0/0:0,48,255:63 0/0:0,42,255:57 0/0:0,33,255:48 0/0:0,75,255:90 0/0:0,78,255:93 0/0:0,9,133:24 0/0:0,87,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,72,255:87 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,87,255:99 0/0:0,12,220:27 0/0:0,27,255:42 0/0:0,42,255:57 0/1:255,0,0:21 0/0:0,63,255:78 0/0:0,18,255:33
chr12 6976464 . C G 999 . DP=858;VDB=0.0290;AF1=0.07086;G3=0.8857,0.06446,0.04984;HWE=0.0439;AC1=5;DP4=296,329,22,17;MQ=55;FQ=999;PV4=0.32,5.1e-20,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,66,255:74 0/0:0,51,255:59 0/0:0,75,255:83 0/0:0,51,255:59 0/0:0,30,218:38 0/0:0,60,255:68 0/0:0,87,255:95 0/0:0,63,255:71 0/0:0,36,251:44 0/0:0,72,255:80 0/0:0,48,245:56 0/0:0,27,135:35 0/0:0,0,0:9 0/0:0,54,254:62 0/0:0,48,245:56 0/0:0,42,153:50 0/0:0,57,214:65 0/0:0,24,108:32 0/0:0,57,255:65 0/0:0,54,197:62 1/1:139,21,0:8 0/0:0,57,255:65 0/1:48,6,0:9 0/1:162,0,190:99 0/0:0,108,255:99 0/1:157,0,208:99 0/0:0,72,255:80 0/0:0,39,234:47 0/0:0,93,255:99 0/0:0,48,255:56 0/0:0,39,255:47 0/0:0,30,230:38 0/0:0,93,255:99 0/0:0,54,255:62 0/0:0,51,255:59
chr12 6976574 . T C 999 . DP=767;VDB=0.0324;AF1=0.2715;G3=0.6853,0.08634,0.2284;HWE=4.77e-06;AC1=19;DP4=301,240,89,87;MQ=54;FQ=999;PV4=0.26,2.1e-146,1,1 GT:PL:GQ 0/1:143,0,137:99 1/1:194,42,0:35 1/1:210,54,0:47 0/1:165,0,255:99 1/1:202,66,0:59 1/1:202,63,0:56 1/1:178,39,0:32 1/1:222,60,0:53 0/1:105,0,101:99 1/1:107,18,0:11 1/1:208,54,0:47 0/0:0,57,255:58 0/0:0,33,249:34 0/0:0,0,0:3 0/0:0,78,255:79 0/0:0,75,255:76 0/0:0,33,252:34 0/0:0,63,255:64 0/0:0,66,255:67 0/0:0,51,255:52 0/0:0,48,255:49 0/0:0,72,255:73 0/0:0,66,255:67 0/0:0,9,82:11 0/0:0,117,255:99 0/0:0,78,255:79 0/0:0,78,255:79 0/0:0,96,255:97 0/0:0,81,255:82 0/0:0,54,255:55 0/0:0,30,245:31 0/0:0,39,255:40 0/0:0,48,255:49 0/0:0,99,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,54,255:55
chr12 6976634 . G T 999 . DP=815;VDB=0.0282;AF1=0.1465;AC1=10;DP4=360,249,33,49;MQ=36;FQ=999;PV4=0.0013,3.6e-126,1,1 GT:PL:GQ 0/1:123,0,82:93 0/1:87,9,0:4 0/1:33,0,117:28 0/0:0,66,255:71 0/1:58,0,207:53 0/1:12,0,131:8 0/1:74,0,47:57 0/1:66,0,82:61 0/0:0,75,255:80 0/1:26,0,144:21 1/1:107,21,0:11 0/0:0,72,227:77 0/0:0,33,24:35 0/0:0,0,0:6 0/0:0,78,230:83 0/0:0,57,134:62 0/0:0,66,10:25 0/0:0,48,113:53 0/0:0,54,14:29 0/0:0,54,232:59 0/0:0,54,18:33 0/0:0,60,255:65 0/0:0,78,255:83 0/0:0,6,69:11 0/0:0,75,255:80 0/0:0,99,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,93,255:98 0/0:0,60,255:65 0/0:0,72,255:77 0/0:0,36,255:41 0/0:0,24,201:29 0/0:0,15,139:20 0/0:0,84,255:89 0/0:0,57,255:62 0/0:0,69,255:74
chr12 6976682 . G A 999 . DP=704;VDB=0.0295;AF1=0.1095;AC1=8;DP4=292,178,40,31;MQ=27;FQ=999;PV4=0.36,2.2e-83,1,1 GT:PL:GQ 0/1:125,0,82:94 0/1:102,8,0:6 0/1:34,0,80:28 0/0:0,53,252:59 0/1:21,0,152:15 0/0:0,15,44:21 0/1:16,0,53:10 0/1:25,0,48:19 0/0:0,66,210:72 0/0:0,11,129:17 0/1:98,10,0:4 0/0:0,30,173:36 0/0:0,18,19:24 0/0:0,0,0:7 0/0:0,42,159:48 0/0:0,21,61:27 0/0:0,18,19:24 0/0:0,36,94:42 0/0:0,24,23:30 0/0:0,18,88:24 0/0:0,9,11:15 0/0:0,45,249:51 0/0:0,69,255:75 0/0:0,6,68:12 0/0:0,81,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,60,255:66 0/0:0,78,255:84 0/0:0,48,222:54 0/0:0,63,242:69 0/0:0,30,204:36 0/0:0,15,84:21 0/0:0,21,92:27 0/0:0,75,220:81 0/0:0,30,184:36 0/0:0,48,255:54
chr12 6976698 . caaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa caaaaaaaaaaaaaaaaaaa,caaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 999 . INDEL;DP=642;VDB=0.0337;AF1=1;AC1=72;DP4=48,5,53,26;MQ=33;FQ=-35.7;PV4=0.0017,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:51,34,28,28,0,16:12 1/1:39,35,31,10,0,0:10 1/1:10,6,3,9,0,7:9 1/1:33,4,0,31,0,28:10 1/1:6,8,1,12,0,5:13 1/1:4,10,8,0,3,0:8 1/1:8,0,0,14,3,12:7 1/1:12,1,0,15,3,14:8 1/1:14,3,0,15,1,12:9 1/1:4,7,6,7,6,6:7 1/1:19,19,19,9,9,0:7 1/1:5,0,1,14,4,12:6 1/1:0,6,8,6,8,8:5 1/1:0,0,0,0,0,0:7 1/1:0,3,4,3,4,4:6 1/1:0,12,5,12,5,5:10 1/1:0,0,0,0,0,0:7 1/1:0,0,0,0,0,0:7 1/1:0,3,4,3,4,4:6 1/1:0,3,2,3,2,2:7 1/1:0,3,4,3,4,4:6 1/1:13,13,13,3,3,0:7 1/1:51,10,0,49,5,46:16 1/1:0,0,0,0,0,0:7 1/1:72,12,1,65,0,60:17 1/1:44,10,0,47,15,44:16 1/1:3,9,6,9,6,6:9 1/1:1,7,5,7,5,5:8 1/1:6,6,6,7,7,4:7 1/1:12,12,12,12,12,12:7 1/1:0,9,6,9,6,6:8 1/1:13,13,13,3,3,0:7 1/1:7,6,3,13,6,8:9 1/1:0,18,12,18,12,12:6 1/1:0,9,9,9,9,9:6 1/1:14,8,5,8,0,5:9
chr12 6976739 . A G 12.8 . DP=875;VDB=0.0147;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=308,436,3,8;MQ=56;FQ=12.9;PV4=0.54,8.9e-31,0.13,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,66,255:82 0/0:0,69,255:85 0/0:0,87,255:99 0/0:0,39,246:55 0/0:0,69,255:85 0/0:0,66,255:82 0/0:0,60,255:76 0/0:0,51,255:67 0/0:0,72,255:88 0/0:0,69,255:85 0/0:0,39,255:55 0/0:0,0,0:16 0/0:0,72,255:88 0/0:0,54,255:70 0/0:0,24,227:40 0/0:0,84,255:99 0/0:0,60,255:76 0/0:0,39,255:55 0/0:0,63,255:79 0/1:58,0,255:42 0/0:0,57,255:73 0/0:0,18,180:34 0/0:0,126,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,75,255:91 0/0:0,78,255:94 0/0:0,66,255:82 0/0:0,90,255:99 0/0:0,39,255:55 0/0:0,21,176:37 0/0:0,36,255:52 0/0:0,93,255:99 0/0:0,48,255:64 0/0:0,60,255:76
chr12 6976757 . CAT C 999 . INDEL;DP=877;VDB=0.0257;AF1=0.01445;AC1=1;DP4=313,313,7,10;MQ=60;FQ=999;PV4=0.62,1,5.3e-09,0.00041 GT:PL:GQ 0/0:0,68,255:83 0/0:0,57,255:72 0/1:255,0,59:80 0/0:0,60,255:75 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,245:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,60,255:75 0/0:0,54,255:69 0/0:0,36,250:51 0/0:0,23,255:38 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,223:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/0:0,30,222:45 0/0:0,93,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,213:48 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,39,246:54 0/0:0,12,122:27 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,69,255:84 0/0:0,51,255:66 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,21,168:36 0/0:0,5,185:20 0/0:0,57,255:72 0/0:0,60,255:75 0/0:0,51,255:66
chr12 6976790 . C T 29.3 . DP=867;VDB=0.0304;AF1=0.02855;AC1=2;DP4=478,285,5,2;MQ=55;FQ=29.4;PV4=1,1.8e-11,0.016,0.078 GT:PL:GQ 0/0:0,114,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,72,255:84 0/0:0,117,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,48,255:60 0/0:0,78,255:90 0/0:0,84,255:96 0/0:0,63,255:75 0/0:0,75,255:87 0/0:0,96,255:99 0/0:0,48,255:60 0/0:0,15,144:27 0/0:0,0,0:13 0/0:0,48,255:60 0/0:0,36,255:48 0/1:35,0,173:23 0/0:0,72,255:84 0/0:0,21,171:33 0/1:55,0,80:43 0/0:0,51,255:63 0/0:0,63,255:75 0/0:0,48,255:60 0/0:0,15,149:27 0/0:0,108,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,42,255:54 0/0:0,54,255:66 0/0:0,42,255:54 0/0:0,75,255:87 0/0:0,60,255:72 0/0:0,69,255:81
chr12 6976797 . ATTtg ATTTGTTtg 999 . INDEL;DP=833;VDB=0.0322;AF1=0.1877;AC1=13;DP4=243,131,44,34;MQ=56;FQ=999;PV4=0.16,1,2.9e-19,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:66 0/0:0,39,255:42 0/0:0,18,152:21 0/1:29,0,255:26 0/1:139,0,159:99 0/0:0,21,144:24 0/0:0,21,163:24 0/0:0,42,255:45 0/1:147,0,246:99 0/1:81,0,119:78 0/0:0,48,255:51 0/0:0,2,255:6 0/0:0,12,117:15 0/0:0,0,0:5 0/0:0,25,233:28 0/0:0,30,246:33 0/0:0,12,111:15 0/0:0,54,255:57 0/0:0,18,115:21 0/0:0,6,59:10 0/0:0,24,147:27 0/1:94,0,100:91 0/1:7,0,153:5 0/0:0,9,80:13 0/0:0,27,242:30 0/0:0,84,255:87 0/1:45,0,229:42 0/1:18,0,140:15 0/1:250,0,84:93 0/1:255,0,240:99 0/0:0,21,175:24 0/1:131,0,102:99 0/1:126,0,61:70 0/0:0,21,157:24 0/0:0,54,255:57 0/1:124,0,184:99
chr12 6976799 . Ttg TTGtg 999 . INDEL;DP=847;VDB=0.0342;AF1=0.563;AC1=41;DP4=67,71,180,112;MQ=50;FQ=999;PV4=0.012,1,1,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,250:99 0/1:237,0,140:99 0/1:236,0,36:38 0/0:79,124,255:41 0/1:255,255,255:3 0/1:255,0,29:31 0/1:255,0,14:16 0/1:255,0,48:50 0/1:193,163,255:34 1/1:255,249,237:10 1/1:255,6,0:5 0/1:47,0,148:51 1/1:4,3,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:106,106,106:3 0/1:10,0,110:14 1/1:17,3,0:3 0/0:0,39,255:35 0/1:0,3,4:2 1/1:43,3,0:4 0/1:0,0,0:3 1/1:255,131,110:19 0/1:214,214,214:3 0/1:81,81,81:3 0/1:255,255,255:3 0/0:0,60,255:56 0/1:254,255,255:3 0/1:182,182,182:3 0/1:255,255,255:3 0/1:255,255,255:3 0/1:76,0,33:35 1/1:255,205,198:6 1/1:255,161,149:10 1/1:255,42,0:40 0/0:0,51,255:47 1/1:255,230,227:4
chr12 6976800 . tgcg tg 99.8 . INDEL;DP=846;VDB=0.0323;AF1=0.07544;AC1=5;DP4=133,95,8,3;MQ=54;FQ=100;PV4=0.53,1,1,0.24 GT:PL:GQ 0/1:69,0,255:61 0/0:0,21,185:29 0/0:0,15,103:23 0/0:0,63,255:71 0/0:0,6,35:14 0/1:13,0,87:6 0/0:0,33,111:41 0/0:0,18,77:26 0/1:63,0,164:55 0/0:0,9,82:17 0/0:7,0,86:4 0/0:0,27,185:35 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,18,140:26 0/0:0,18,148:26 0/0:0,3,13:11 0/0:0,4,241:12 0/0:0,6,23:14 0/0:0,0,0:8 0/0:0,6,30:14 0/0:0,6,58:14 0/0:0,3,29:11 0/0:0,3,32:11 0/0:0,27,178:35 0/0:0,72,255:80 0/0:0,21,167:29 0/0:0,18,128:26 0/0:0,0,0:8 0/1:38,0,192:30 0/0:0,18,144:26 0/0:0,3,16:11 0/0:0,9,75:17 0/0:0,9,54:17 0/0:0,51,255:59 0/0:0,12,97:20
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chr12 6976808 . tgtg tGTGCgtg 999 . INDEL;DP=916;VDB=0.0395;AF1=0.1661;AC1=12;DP4=264,207,88,50;MQ=53;FQ=999;PV4=0.12,2.2e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/0:12,75,255:67 0/0:0,48,255:52 0/0:0,39,229:43 0/0:0,4,255:9 0/1:141,0,169:99 0/0:0,45,200:49 0/0:17,62,185:49 0/0:21,72,216:55 0/1:155,0,255:99 0/1:72,0,159:68 0/0:28,76,255:52 0/0:0,10,242:14 0/0:0,9,91:13 0/0:0,0,0:5 0/0:0,24,221:28 0/0:0,30,215:34 0/0:0,12,104:16 0/0:0,57,255:61 0/0:0,21,106:25 0/0:9,24,86:19 0/0:0,15,91:19 0/1:62,0,215:58 0/1:11,0,162:8 0/0:0,12,95:16 0/0:0,34,255:38 0/0:0,111,255:99 0/1:24,0,243:20 0/0:4,0,145:3 0/1:255,0,70:80 0/1:239,0,226:99 0/0:0,33,225:37 0/1:148,0,125:99 0/1:122,0,106:99 0/0:57,96,238:43 0/0:0,51,255:55 0/1:118,0,219:99
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chr12 6976816 . tgtgtg tGTGTGCgtgtg 999 . INDEL;DP=909;VDB=0.0386;AF1=0.1519;AC1=11;DP4=229,199,61,38;MQ=52;FQ=999;PV4=0.15,1,0.048,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:67 0/0:0,36,255:40 0/0:0,33,204:37 0/1:34,0,255:30 0/0:0,24,151:28 0/0:13,53,192:44 0/0:0,39,127:43 0/0:2,44,191:46 0/0:0,48,255:52 0/1:171,0,139:99 0/0:42,66,201:28 0/0:0,39,255:43 0/0:0,6,58:11 0/0:0,0,0:6 0/1:8,0,154:5 0/0:0,36,233:40 0/0:0,12,98:17 0/0:0,57,255:61 0/0:0,12,25:17 0/0:0,18,93:23 0/0:0,15,91:20 0/1:28,0,202:24 0/1:167,0,138:99 0/1:66,0,63:61 0/1:164,0,230:99 0/0:0,108,255:99 0/1:135,0,235:99 0/1:122,0,170:99 0/0:0,18,128:23 0/0:0,33,255:37 0/0:0,28,239:32 0/0:12,36,168:28 0/0:8,23,116:20 0/1:11,1,108:7 0/0:0,57,255:61 0/1:59,0,190:55
chr12 6976826 . t tGTGTGTGG 999 . INDEL;DP=877;VDB=0.0403;AF1=0.06166;AC1=4;DP4=168,224,30,25;MQ=50;FQ=999;PV4=0.11,1,6.9e-06,0.25 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:75 0/0:0,30,158:39 0/0:0,24,140:33 0/0:0,66,255:75 0/0:0,18,103:27 0/0:0,39,168:48 0/0:0,42,143:51 0/0:0,33,133:42 0/0:0,51,214:60 0/0:6,6,114:9 0/0:0,30,178:39 0/0:0,42,187:51 0/0:0,9,80:18 0/0:0,0,0:9 0/0:0,30,214:39 0/0:0,45,205:54 0/0:0,18,148:27 0/0:0,60,241:69 0/0:0,18,106:27 0/0:0,21,155:30 0/0:0,12,80:21 0/0:0,57,222:66 0/1:103,0,110:94 0/0:0,3,29:12 0/0:0,28,237:37 0/1:91,0,205:82 0/1:130,0,180:99 0/1:101,0,132:92 0/0:0,9,72:18 0/0:0,18,131:27 0/0:0,30,208:39 0/0:4,22,121:27 0/0:29,41,115:21 0/0:0,2,118:11 0/0:0,60,252:69 0/0:0,42,239:51
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chr12 6977053 . T G 999 . DP=833;VDB=0.0416;AF1=0.3852;G3=0.4857,0.2575,0.2568;HWE=0.0066;AC1=28;DP4=265,214,142,113;MQ=58;FQ=999;PV4=0.94,1,0.042,1 GT:PL:GQ 0/0:0,57,255:56 0/0:0,60,255:59 0/0:0,117,255:99 0/0:0,84,255:83 0/0:0,84,255:83 0/0:0,81,255:80 0/0:0,54,255:53 0/0:0,45,255:44 0/0:0,51,255:50 0/0:0,39,255:38 0/0:0,66,255:65 0/0:0,54,255:53 0/1:116,0,132:99 0/1:0,0,0:3 1/1:255,36,0:31 0/1:234,0,203:99 1/1:235,30,0:25 0/0:0,42,255:41 1/1:233,27,0:22 1/1:255,54,0:49 0/1:121,0,105:99 1/1:255,51,0:46 1/1:255,78,0:73 1/1:197,21,0:16 1/1:255,78,0:73 0/1:255,0,204:99 1/1:255,93,0:88 0/1:255,0,255:99 0/1:94,0,245:95 0/1:255,0,184:99 0/1:124,0,165:99 0/0:0,30,236:29 0/1:61,0,204:62 0/0:0,123,255:99 0/0:0,72,255:71 0/0:0,54,255:53
chr12 6977068 . G C 999 . DP=839;VDB=0.0429;AF1=0.08558;AC1=6;DP4=359,365,34,36;MQ=58;FQ=999;PV4=0.9,1.9e-84,0.00055,0.0085 GT:PL:GQ 0/0:0,45,255:52 0/0:0,84,255:91 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:85 0/0:0,105,255:99 0/0:0,87,255:94 0/0:0,48,255:55 0/0:0,45,255:52 0/0:0,63,255:70 0/0:0,54,255:61 0/0:0,63,255:70 0/0:0,54,255:61 0/0:0,27,245:34 0/0:0,0,0:8 0/0:0,42,255:49 0/0:0,69,255:76 0/0:0,27,255:34 0/0:0,51,255:58 1/1:157,33,0:20 0/0:0,63,255:70 0/0:0,39,255:46 0/0:0,72,255:79 0/0:0,81,255:88 0/0:0,27,242:34 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:67 0/0:0,96,255:99 0/0:0,160,255:99 0/1:120,0,255:99 0/1:188,0,240:99 0/1:161,0,201:99 0/0:0,30,255:37 0/1:127,0,172:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,78,255:85 0/0:0,48,255:55
chr12 6977078 . C G 999 . DP=841;VDB=0.0273;AF1=0.05716;AC1=4;DP4=326,384,36,30;MQ=58;FQ=999;PV4=0.2,0.0014,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,42,255:51 0/0:0,81,255:90 0/0:0,87,255:96 0/0:0,84,255:93 0/0:0,87,255:96 0/0:0,81,255:90 0/0:0,48,255:57 0/0:0,51,255:60 0/0:0,69,255:78 0/0:0,54,255:63 0/0:0,54,255:63 0/0:0,57,255:66 0/0:0,21,214:30 0/0:0,0,0:10 0/0:0,45,255:54 0/0:0,78,255:87 0/0:0,39,255:48 0/0:0,54,255:63 0/0:0,36,255:45 0/0:0,48,255:57 0/0:0,48,255:57 0/0:0,66,255:75 0/0:0,75,255:84 0/0:0,27,234:36 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:69 0/0:0,84,255:93 0/1:255,0,255:99 0/1:255,0,204:99 0/1:230,0,255:99 0/1:182,0,255:99 0/0:0,36,255:45 0/0:0,54,255:63 0/0:0,120,255:99 0/0:0,81,255:90 0/0:0,39,255:48
chr12 6977104 . Atttttttt ATtttttttt 15.9 . INDEL;DP=1063;VDB=0.0438;AF1=0.02828;AC1=2;DP4=427,367,19,12;MQ=55;FQ=16.1;PV4=0.47,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,104:88 0/0:0,90,89:99 0/0:0,51,92:64 0/0:0,99,114:99 0/1:55,0,22:38 0/1:29,0,26:17 0/0:0,66,74:79 0/0:0,51,101:64 0/0:0,66,109:79 0/0:0,28,73:41 0/0:0,66,90:79 0/0:0,66,98:79 0/0:0,24,61:37 0/0:0,0,0:13 0/0:0,69,89:82 0/0:0,99,96:99 0/0:0,27,58:40 0/0:0,51,104:64 0/0:0,30,69:43 0/0:0,39,79:52 0/0:0,51,84:64 0/0:0,78,108:91 0/0:0,60,88:73 0/0:0,39,76:52 0/0:0,105,121:99 0/0:0,117,104:99 0/0:0,87,101:99 0/0:0,151,90:99 0/0:0,114,95:99 0/0:0,105,103:99 0/0:0,90,106:99 0/0:0,24,66:37 0/0:0,66,107:79 0/0:0,93,115:99 0/0:0,87,86:99 0/0:0,33,77:46
chr12 6977164 . C A 999 . DP=1053;VDB=0.0210;AF1=0.02859;AC1=2;DP4=467,450,19,14;MQ=58;FQ=999;PV4=0.48,1.7e-30,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,105,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,48,255:60 0/0:0,108,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,63,255:75 0/0:0,114,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,30,195:42 0/0:0,0,0:12 0/0:0,60,255:72 0/0:0,93,255:99 0/0:0,39,208:51 0/0:0,66,255:78 0/0:0,21,149:33 0/0:0,48,255:60 0/0:0,48,255:60 0/0:0,60,255:72 0/0:0,63,255:75 0/0:0,48,255:60 0/0:0,138,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,163,255:99 0/1:191,0,241:99 0/0:0,87,255:99 0/1:132,0,164:99 0/0:0,21,148:33 0/0:0,54,255:66 0/0:0,81,255:93 0/0:0,93,255:99 0/0:0,63,255:75
chr12 6977243 . taaaaaaaaa taaaaaaaa 102 . INDEL;DP=909;VDB=0.0403;AF1=0.07454;G3=0.8843,0.06704,0.04863;HWE=0.0445;AC1=5;DP4=308,187,46,40;MQ=56;FQ=102;PV4=0.15,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,35,68:43 0/0:0,31,52:39 0/0:0,37,64:45 0/0:0,40,74:48 0/0:0,41,73:49 0/0:0,63,88:71 0/0:0,54,94:62 0/0:0,20,61:28 0/0:0,61,84:69 0/0:0,24,49:32 0/0:0,48,60:56 0/0:0,39,77:47 0/0:0,6,14:14 0/0:0,0,0:8 0/0:0,39,81:47 0/0:0,57,82:65 0/0:0,15,34:23 0/0:0,51,74:59 0/0:0,21,41:29 0/0:0,42,81:50 0/0:0,21,51:29 0/0:0,33,65:41 1/1:87,48,0:34 0/0:0,27,69:35 0/1:33,0,33:25 0/1:40,0,29:32 0/1:52,5,0:9 0/0:0,84,83:92 0/0:0,66,64:74 0/0:0,48,91:56 0/0:0,75,60:79 0/0:0,6,14:14 0/0:0,33,74:41 0/0:0,51,76:59 0/0:0,52,87:60 0/0:0,9,30:17
chr12 6977251 . aat a 71.6 . INDEL;DP=947;VDB=0.0411;AF1=0.04556;AC1=3;DP4=380,234,15,12;MQ=55;FQ=71.8;PV4=0.55,1,1,0.003 GT:PL:GQ 0/0:0,69,74:79 0/0:0,59,53:69 0/0:0,60,56:70 0/0:0,72,86:82 0/0:0,87,69:93 0/0:0,66,99:76 0/0:0,57,84:67 0/0:0,42,71:52 0/0:0,87,82:97 0/0:0,33,65:43 0/0:0,51,59:61 0/0:0,42,102:52 0/0:0,12,25:22 0/0:0,0,0:11 0/0:0,42,98:52 0/0:0,63,108:73 0/0:0,21,67:31 0/0:0,57,134:67 0/0:0,36,100:46 0/0:0,54,98:64 0/0:0,24,68:34 0/0:0,39,96:49 0/1:76,12,0:6 0/0:0,33,91:43 0/0:0,46,92:56 0/1:67,0,57:57 0/1:19,0,86:9 0/0:0,108,115:99 0/0:0,72,95:82 0/0:0,69,134:79 0/0:0,84,101:94 0/0:0,9,34:19 0/0:0,45,131:55 0/0:0,72,97:82 0/0:0,84,136:94 0/0:0,9,51:19
chr12 6977252 . A T 999 . DP=944;VDB=0.0305;AF1=0.1417;AC1=10;DP4=273,199,10,17;MQ=51;FQ=999;PV4=0.045,4.3e-34,1,1 GT:PL:GQ 0/1:7,0,4:4 0/1:32,1,0:10 0/1:36,0,0:11 0/1:22,0,19:17 0/1:9,1,0:4 0/1:65,10,0:3 0/1:42,9,0:4 0/1:31,0,2:13 0/1:15,0,7:10 0/0:0,6,20:11 0/0:0,0,3:6 0/0:0,45,252:50 0/0:0,12,64:17 0/0:0,0,0:6 0/0:0,48,247:53 0/0:0,78,255:83 0/0:0,27,139:32 0/0:0,63,255:68 0/0:0,39,181:44 0/0:0,63,247:68 0/0:0,30,219:35 0/0:0,54,255:59 0/0:0,3,4:8 0/0:0,36,255:41 0/0:0,75,255:80 0/0:0,50,255:55 0/0:0,39,255:44 0/0:0,132,255:99 0/0:0,78,255:83 0/0:0,69,255:74 0/0:0,99,255:99 0/0:0,21,119:26 0/0:0,54,255:59 0/0:0,78,255:83 0/0:0,102,255:99 0/0:0,18,185:23
chr12 6977279 . C T 136 . DP=914;VDB=0.0338;AF1=0.02889;G3=0.9714,1.256e-07,0.02857;HWE=0.00265;AC1=2;DP4=472,298,19,8;MQ=56;FQ=136;PV4=0.42,1.8e-31,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:78 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:63 0/0:0,93,255:99 0/0:0,51,255:63 0/0:0,54,255:66 0/0:0,54,245:66 0/0:0,6,26:18 0/0:0,0,0:12 0/0:0,48,255:60 0/0:0,60,255:72 0/0:0,33,135:45 0/0:0,78,255:90 0/0:0,42,167:54 0/0:0,30,198:42 0/0:0,39,182:51 0/0:0,48,255:60 0/0:0,54,255:66 0/0:0,33,250:45 0/0:0,99,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,93,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,9,104:21 0/0:0,51,255:63 1/1:203,78,0:60 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,255:54
chr12 6977294 . G A 999 . DP=976;VDB=0.0161;AF1=0.05731;AC1=4;DP4=459,341,36,26;MQ=57;FQ=999;PV4=1,1.2e-53,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:84 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,81,255:90 0/0:0,87,255:96 0/0:0,72,255:81 0/0:0,87,255:96 0/0:0,57,255:66 0/0:0,48,255:57 0/0:0,60,255:69 0/0:0,12,87:21 0/0:0,0,0:10 0/0:0,57,255:66 0/0:0,66,255:75 0/0:0,33,160:42 0/0:0,57,255:66 0/0:0,42,168:51 0/0:0,42,255:51 0/0:0,48,229:57 0/0:0,45,255:54 0/0:0,48,255:57 0/0:0,36,255:45 0/0:0,96,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,163,255:99 0/1:137,0,175:99 0/1:164,0,252:99 0/1:203,0,175:99 0/0:0,15,157:24 0/1:87,0,241:78 0/0:0,84,255:93 0/0:0,90,255:99 0/0:0,45,255:54
chr12 6977335 . G A 114 . DP=1013;VDB=0.0279;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=477,428,9,5;MQ=60;FQ=114;PV4=0.43,2.3e-19,0.16,1 GT:PL:GQ 0/0:0,72,255:87 0/0:0,154,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,63,255:78 0/1:159,0,180:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,90,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,21,207:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,21,181:36 0/0:0,72,255:87 0/0:0,27,255:42 0/0:0,48,255:63 0/0:0,33,255:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,255:69 0/0:0,51,255:66 0/0:0,84,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,27,242:42 0/0:0,63,255:78 0/0:0,132,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,48,255:63
chr12 6977477 . G A 36.6 . DP=1104;VDB=0.0274;AF1=0.01432;AC1=1;DP4=637,400,15,4;MQ=60;FQ=36.7;PV4=0.15,4.2e-69,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,78,255:93 0/1:82,0,255:67 0/0:0,72,255:87 0/0:0,72,255:87 0/0:0,54,255:69 0/0:0,21,191:36 0/0:0,0,0:15 0/0:0,45,255:60 0/0:0,39,255:54 0/0:0,12,124:27 0/0:0,78,255:93 0/0:0,42,255:57 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,239:39 0/0:0,36,255:51 0/0:0,30,253:45 0/0:0,54,255:69 0/0:0,132,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,220,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,126,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,24,236:39
chr12 6977527 . C T 999 . DP=1139;VDB=0.0401;AF1=0.178;AC1=13;DP4=570,413,78,42;MQ=60;FQ=999;PV4=0.17,6.1e-129,2.4e-06,0.079 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,42,255:46 0/0:0,99,255:99 0/0:0,42,255:46 0/1:85,0,23:33 0/0:0,0,0:5 1/1:175,42,0:32 0/1:120,0,172:99 0/1:68,9,0:3 0/0:0,81,255:85 0/0:0,39,255:43 1/1:207,57,0:47 0/1:55,0,226:51 0/0:0,45,255:49 0/0:0,36,255:40 0/0:0,45,255:49 0/0:0,126,255:99 0/0:0,190,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,255,255:99 0/1:189,0,240:99 0/1:115,0,255:99 0/1:89,0,255:85 0/0:0,63,255:67 0/1:93,0,223:89 0/0:0,132,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,33,250:37
chr12 6977570 . tagtacacaaag tAGTACACAAagtacacaaag 999 . INDEL;DP=1184;VDB=0.0403;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=587,437,5,9;MQ=60;FQ=999;PV4=0.17,1,1.6e-18,1 GT:PL:GQ 0/0:0,111,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,126,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,117,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,18,255:33 0/0:0,0,0:15 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,27,255:42 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,255:51 0/0:0,63,255:78 0/0:0,30,255:45 0/0:0,69,255:84 0/0:0,33,255:48 0/0:0,30,255:45 0/0:0,126,255:99 0/0:0,193,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,181,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,151,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,33,255:48 0/0:0,72,255:87 0/0:0,108,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,42,255:57
chr12 6977635 . T C 999 . DP=985;VDB=0.0203;AF1=0.02863;G3=0.9714,4.457e-08,0.02857;HWE=0.00259;AC1=2;DP4=259,509,8,12;MQ=60;FQ=999;PV4=0.63,1.6e-15,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:72 0/0:0,93,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,84,255:96 0/0:0,166,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,81,255:93 0/0:0,69,255:81 0/0:0,114,255:99 0/0:0,33,255:45 0/0:0,57,255:69 0/0:0,72,255:84 0/0:0,21,211:33 0/0:0,0,0:12 0/0:0,54,255:66 0/0:0,48,255:60 0/0:0,12,123:24 0/0:0,90,255:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,57,255:69 0/0:0,27,252:39 0/0:0,54,255:66 0/0:0,36,255:48 0/0:0,42,255:54 0/0:0,72,255:84 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,51,255:63 0/0:0,81,255:93 0/0:0,48,255:60 0/0:0,66,255:78 1/1:234,60,0:42 0/0:0,72,255:84 0/0:0,39,255:51
chr12 6977646 . T C 999 . DP=1015;VDB=0.0308;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=325,506,17,20;MQ=60;FQ=999;PV4=0.49,8.1e-110,1,1 GT:PL:GQ 0/1:89,0,255:79 0/0:0,105,255:99 0/0:0,111,255:99 0/1:99,0,255:89 0/0:0,181,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,84,255:94 0/0:0,66,255:76 0/1:129,0,255:99 0/0:0,39,255:49 0/0:0,54,255:64 0/0:0,81,255:91 0/0:0,24,238:34 0/0:0,0,0:11 0/0:0,57,255:67 0/0:0,45,255:55 0/0:0,21,208:31 0/0:0,105,255:99 0/0:0,48,255:58 0/0:0,63,255:73 0/0:0,39,255:49 0/0:0,54,255:64 0/0:0,36,255:46 0/0:0,42,255:52 0/0:0,78,255:88 0/0:0,114,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,69,255:79 0/0:0,75,255:85 0/0:0,87,255:97 0/0:0,51,255:61 0/0:0,78,255:88 0/0:0,69,255:79 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,255:52
chr12 6977675 . T C 124 . DP=1103;VDB=0.0156;AF1=0.02858;G3=0.9714,3.374e-08,0.02857;HWE=0.00258;AC1=2;DP4=433,541,13,16;MQ=60;FQ=124;PV4=1,8e-74,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,102,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,105,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,69,255:81 0/0:0,81,255:93 0/0:0,24,228:36 0/0:0,0,0:12 0/0:0,42,255:54 0/0:0,63,255:75 0/0:0,36,255:48 0/0:0,114,255:99 0/0:0,42,255:54 0/0:0,66,255:78 0/0:0,39,255:51 0/0:0,54,255:66 0/0:0,36,255:48 0/0:0,36,255:48 0/0:0,102,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,184,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,57,255:69 0/0:0,72,255:84 1/1:191,84,0:66 0/0:0,102,255:99 0/0:0,60,255:72
chr12 6977747 . C T 999 . DP=1113;VDB=0.0373;AF1=0.05714;AC1=4;DP4=510,487,31,45;MQ=60;FQ=999;PV4=0.095,2.4e-189,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,126,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:81 0/0:0,72,255:81 0/0:0,30,255:39 0/0:0,0,0:10 0/0:0,45,255:54 0/0:0,78,255:87 0/0:0,51,255:60 0/0:0,60,255:69 0/0:0,51,255:60 0/0:0,81,255:90 0/0:0,39,255:48 0/0:0,72,255:81 0/0:0,60,255:69 0/0:0,42,255:51 0/0:0,96,255:99 0/0:0,196,255:99 0/0:0,135,255:99 0/1:151,0,255:99 0/1:87,0,238:78 0/1:110,0,255:99 0/1:73,0,255:64 0/0:0,48,255:57 0/0:0,63,255:72 0/0:0,141,255:99 0/0:0,69,255:78 0/0:0,57,255:66
chr12 6977836 . A C 354 . DP=1219;VDB=0.0226;AF1=0.02857;AC1=2;DP4=523,633,8,13;MQ=60;FQ=354;PV4=0.66,0.44,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,123,255:99 0/0:0,199,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,187,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,78,255:90 0/0:0,93,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,78,255:90 0/0:0,75,255:87 0/0:0,30,255:42 0/0:0,0,0:12 0/0:0,75,255:87 0/0:0,81,255:93 0/0:0,63,255:75 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:63 0/0:0,81,255:93 0/0:0,63,255:75 0/0:0,111,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,45,255:57 0/0:0,123,255:99 0/0:0,169,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,175,255:99 0/0:0,217,255:99 0/0:0,90,255:99 0/1:207,0,189:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,105,255:99 0/1:208,0,247:99
chr12 6978038 . C T 999 . DP=1008;VDB=0.0337;AF1=0.04286;AC1=3;DP4=427,510,18,20;MQ=60;FQ=999;PV4=0.87,1.5e-74,1,1 GT:PL:GQ 0/1:145,0,221:99 0/0:0,87,255:97 0/0:0,76,255:86 0/1:101,0,255:91 0/0:0,175,255:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,72,255:82 0/0:0,123,255:99 0/1:74,0,255:64 0/0:0,48,255:58 0/0:0,108,255:99 0/0:0,66,255:76 0/0:0,33,255:43 0/0:0,0,0:11 0/0:0,84,255:94 0/0:0,78,255:88 0/0:0,30,240:40 0/0:0,84,255:94 0/0:0,48,255:58 0/0:0,81,255:91 0/0:0,42,255:52 0/0:0,105,255:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,33,255:43 0/0:0,81,255:91 0/0:0,196,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,33,255:43 0/0:0,63,255:73 0/0:0,90,255:99 0/0:0,78,255:88 0/0:0,54,255:64
chr12 6978072 . T C 113 . DP=1021;VDB=0.0169;AF1=0.02827;AC1=2;DP4=441,501,10,8;MQ=60;FQ=114;PV4=0.48,4.8e-31,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,138,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,66,255:78 0/0:0,87,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,54,255:66 0/0:0,102,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,24,233:36 0/0:0,0,0:13 0/0:0,75,255:87 0/0:0,78,255:90 0/0:0,27,255:39 0/0:0,84,255:96 0/0:0,63,255:75 0/0:0,75,255:87 0/0:0,57,255:69 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:90 0/1:29,0,178:17 0/1:145,0,252:99 0/0:0,187,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,39,255:51 0/0:0,36,255:48 0/0:0,51,255:63 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,45,255:57
chr12 6978140 . GT G 115 . INDEL;DP=909;VDB=0.0400;AF1=0.1552;AC1=11;DP4=84,111,1,19;MQ=60;FQ=116;PV4=0.00051,4.9e-11,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,51,255:55 0/1:33,0,67:29 0/0:0,12,93:16 0/0:0,60,255:64 0/0:0,12,102:16 0/0:0,9,88:14 0/0:0,12,105:16 0/1:41,6,0:6 0/0:0,45,255:49 0/0:0,3,32:8 0/1:31,0,42:27 0/0:3,0,67:4 0/0:0,12,95:16 0/0:0,0,0:5 0/0:0,9,79:14 0/0:0,9,90:14 0/0:0,12,91:16 0/0:0,2,105:7 0/0:0,6,63:11 0/1:15,3,0:6 0/0:0,12,91:16 0/0:0,9,110:14 0/1:24,0,73:20 0/0:0,3,28:8 0/1:20,0,68:16 0/1:31,0,23:26 0/1:14,0,88:10 0/0:0,15,117:19 0/0:0,12,90:16 0/1:32,0,54:28 0/0:0,0,0:5 0/0:0,12,133:16 0/0:0,9,103:14 0/0:0,96,255:99 0/0:0,42,255:46 0/0:0,30,251:34
chr12 6978141 . TCCCCCCCCC TCCCCCCCC,TCCCCCCC 999 . INDEL;DP=885;VDB=0.0409;AF1=0.8719;AC1=63;DP4=47,52,270,323;MQ=60;FQ=999;PV4=0.74,1,0.32,0.14 GT:PL:GQ 0/1:47,0,24,89,84,82:19 1/1:104,66,0,104,66,104:71 1/1:95,75,0,95,75,95:80 0/1:30,0,31,72,70,69:26 1/1:112,90,0,112,90,112:95 1/1:96,51,0,96,51,96:56 1/1:87,38,0,90,48,88:43 1/1:96,63,0,96,63,96:68 0/1:21,0,43,57,67,73:31 1/1:94,48,0,94,48,94:53 1/1:92,63,0,92,63,92:68 1/1:89,42,0,89,42,89:47 1/1:49,18,0,49,18,49:23 1/1:0,0,0,0,0,0:6 1/1:92,63,0,92,63,92:68 1/1:87,48,0,87,48,87:53 1/1:65,30,0,65,30,65:35 1/1:91,43,0,94,54,92:48 1/1:92,45,0,92,45,92:50 1/1:85,39,0,85,39,85:44 1/1:42,15,0,42,15,42:20 1/1:103,69,0,103,69,103:74 1/1:100,57,0,100,57,100:62 1/1:59,21,0,59,21,59:26 1/1:102,90,0,102,90,102:95 1/1:112,111,0,112,111,112:99 1/1:100,57,0,100,57,100:62 1/1:177,191,146,76,0,22:46 1/1:145,131,95,68,0,41:41 1/1:138,130,66,80,0,53:69 1/1:140,140,116,61,0,7:29 0/1:23,0,9,32,24,38:5 1/1:24,0,2,30,17,34:5 0/0:0,90,102,90,102,102:78 0/0:0,45,82,45,82,82:34 0/1:39,0,18,60,48,65:13
chr12 6978166 . C T 22.6 . DP=913;VDB=0.0581;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=322,494,5,1;MQ=60;FQ=22.7;PV4=0.039,6.4e-13,0.011,0.048 GT:PL:GQ 0/0:0,117,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,93,255:99 0/0:0,84,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,66,255:81 0/0:0,90,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,238:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/1:68,0,159:53 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,78,255:93 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,216:45 0/0:0,96,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,93,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,111,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,24,219:39 0/0:0,54,255:69 0/0:0,87,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,54,255:69
chr12 6978186 . T A 999 . DP=922;VDB=0.0555;AF1=0.1427;G3=0.8001,0.1143,0.08568;HWE=0.00704;AC1=10;DP4=294,449,43,63;MQ=60;FQ=999;PV4=0.83,7.2e-117,1,0.022 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,93,255:98 0/0:0,54,255:59 0/0:0,75,255:80 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,254:65 0/0:0,66,255:71 0/0:0,81,255:86 0/0:0,96,255:99 0/0:0,60,255:65 0/0:0,75,255:80 1/1:222,78,0:67 0/1:34,0,150:29 0/0:0,0,0:6 0/0:0,63,255:68 0/1:126,0,116:99 0/0:0,39,229:44 1/1:205,69,0:58 1/1:146,30,0:19 0/0:0,54,255:59 0/1:86,0,184:81 0/0:0,99,255:99 0/0:0,69,255:74 0/0:0,30,232:35 0/0:0,105,255:99 0/1:169,0,255:99 0/0:0,57,255:62 0/0:0,108,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,81,255:86 0/0:0,36,255:41 0/0:0,57,255:62 0/0:0,81,255:86 0/0:0,66,255:71 0/0:0,57,255:62
chr12 6978193 . G A 999 . DP=914;VDB=0.0314;AF1=0.0715;AC1=5;DP4=331,445,30,33;MQ=60;FQ=999;PV4=0.51,0.012,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,135,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,63,255:71 0/0:0,81,255:89 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:65 0/0:0,60,255:68 0/0:0,78,255:86 0/0:0,105,255:99 0/0:0,54,255:62 0/0:0,78,255:86 0/0:0,81,255:89 0/0:0,15,172:23 0/0:0,0,0:9 0/0:0,57,255:65 0/0:0,51,255:59 0/0:0,30,187:38 0/0:0,69,255:77 0/0:0,45,255:53 0/0:0,51,255:59 0/0:0,42,255:50 0/0:0,96,255:99 0/0:0,72,255:80 0/0:0,30,238:38 0/0:0,87,255:95 0/0:0,148,255:99 0/0:0,75,255:83 1/1:255,96,0:82 0/1:237,0,250:99 0/1:87,0,255:79 0/1:159,0,255:99 0/0:0,39,255:47 0/0:0,48,255:56 0/0:0,72,255:80 0/0:0,66,255:74 0/0:0,51,255:59
chr12 6978232 . A C 999 . DP=960;VDB=0.0377;AF1=0.7282;G3=0.2,0.143,0.6569;HWE=0.000228;AC1=53;DP4=94,122,289,388;MQ=60;FQ=999;PV4=0.87,1e-232,1,1 GT:PL:GQ 1/1:208,120,0:99 1/1:192,78,0:79 1/1:204,99,0:99 1/1:213,123,0:99 1/1:217,132,0:99 1/1:162,42,0:43 1/1:197,63,0:64 1/1:197,75,0:76 1/1:197,102,0:99 1/1:155,45,0:46 1/1:194,78,0:79 0/0:0,54,255:47 0/1:30,0,48:37 1/1:0,0,0:3 1/1:164,51,0:52 0/1:61,0,147:68 1/1:132,33,0:34 0/0:0,93,255:86 0/0:0,69,255:62 1/1:150,48,0:49 0/1:82,0,233:89 1/1:200,81,0:82 1/1:174,78,0:79 1/1:79,15,0:16 1/1:197,105,0:99 0/1:109,0,255:99 1/1:202,111,0:99 1/1:200,80,0:81 1/1:213,120,0:99 1/1:201,114,0:99 1/1:183,48,0:49 0/0:0,57,255:50 0/1:107,0,140:99 0/0:0,81,255:74 0/0:0,63,255:56 0/0:0,69,255:62
chr12 6978347 . G A 67.6 . DP=821;VDB=0.0394;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=256,391,7,7;MQ=60;FQ=67.6;PV4=0.43,5.1e-25,1,0.3 GT:PL:GQ 0/0:0,51,255:66 0/0:0,75,255:90 0/0:0,30,243:45 0/0:0,45,255:60 0/0:0,84,255:99 0/0:0,24,207:39 0/0:0,45,255:60 0/0:0,69,255:84 0/0:0,48,255:63 0/0:0,30,192:45 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,27,239:42 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,66,255:81 0/0:0,33,255:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,48,255:63 0/1:113,0,218:98 0/0:0,63,255:78 0/0:0,27,221:42 0/0:0,84,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,87,255:99 0/0:0,33,238:48 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,218:42 0/0:0,57,255:72 0/0:0,75,255:90 0/0:0,42,255:57 0/0:0,63,255:78
chr12 6978509 . C T 999 . DP=854;VDB=0.0300;AF1=0.2715;G3=0.6857,0.08576,0.2286;HWE=4.11e-06;AC1=19;DP4=216,282,71,119;MQ=60;FQ=999;PV4=0.17,1.9e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/1:137,0,212:99 1/1:255,48,0:41 1/1:255,65,0:58 0/1:210,0,153:99 1/1:255,60,0:53 1/1:214,36,0:29 1/1:235,33,0:26 1/1:255,60,0:53 0/1:139,0,86:93 1/1:245,42,0:35 1/1:255,61,0:54 0/0:0,51,255:52 0/0:0,51,255:52 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:58 0/0:0,57,255:58 0/0:0,24,213:25 0/0:0,63,255:64 0/0:0,33,255:34 0/0:0,45,255:46 0/0:0,48,255:49 0/0:0,60,255:61 0/0:0,69,255:70 0/0:0,24,183:25 0/0:0,63,255:64 0/0:0,99,255:99 0/0:0,93,255:94 0/0:0,93,255:94 0/0:0,66,255:67 0/0:0,66,255:67 0/0:0,69,255:70 0/0:0,69,255:70 0/0:0,36,255:37 0/0:0,63,255:64 0/0:0,66,255:67 0/0:0,42,255:43
chr12 6978514 . A G 999 . DP=877;VDB=0.0311;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.673e-07,0.3143;HWE=4.11e-11;AC1=22;DP4=192,274,107,129;MQ=60;FQ=999;PV4=0.33,2.6e-110,1,1 GT:PL:GQ 1/1:208,72,0:66 1/1:197,60,0:54 1/1:232,111,0:99 1/1:202,69,0:63 1/1:198,66,0:60 1/1:135,42,0:36 1/1:155,36,0:30 1/1:221,69,0:63 1/1:206,54,0:48 1/1:160,39,0:33 1/1:197,90,0:84 0/0:0,57,255:57 0/0:0,45,255:45 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:48 0/0:0,45,255:45 0/0:0,33,255:33 0/0:0,48,255:48 0/0:0,45,255:45 0/0:0,48,255:48 0/0:0,48,255:48 0/0:0,57,255:57 0/0:0,60,255:60 0/0:0,24,184:24 0/0:0,69,255:69 0/0:0,96,255:96 0/0:0,96,255:96 0/0:0,102,255:99 0/0:0,69,255:69 0/0:0,51,255:51 0/0:0,75,255:75 0/0:0,66,255:66 0/0:0,36,255:36 0/0:0,69,255:69 0/0:0,66,255:66 0/0:0,45,255:45
chr12 6978626 . G A 999 . DP=832;VDB=0.0288;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=317,328,10,31;MQ=60;FQ=999;PV4=0.002,8e-46,1,1 GT:PL:GQ 0/1:86,0,81:75 0/0:0,60,255:70 0/0:0,78,255:88 0/1:164,0,250:99 0/0:0,66,255:76 0/0:0,27,211:37 0/0:0,54,255:64 0/0:0,51,255:61 0/1:101,0,238:91 0/0:0,30,234:40 0/0:0,60,255:70 0/0:0,72,255:82 0/0:0,27,226:37 0/0:0,0,0:11 0/0:0,69,255:79 0/0:0,60,255:70 0/0:0,57,255:67 0/0:0,69,255:79 0/0:0,30,252:40 0/0:0,51,255:61 0/0:0,48,255:58 0/0:0,81,255:91 0/0:0,51,255:61 0/0:0,27,234:37 0/0:0,108,255:99 0/0:0,69,255:79 0/0:0,75,255:85 0/0:0,84,255:94 0/0:0,57,255:67 0/0:0,90,255:99 0/0:0,51,255:61 0/0:0,39,255:49 0/0:0,36,255:46 0/0:0,51,255:61 0/0:0,51,255:61 0/0:0,57,255:67
chr12 6978693 . A G 999 . DP=793;VDB=0.0419;AF1=0.9714;G3=0.02857,4.052e-08,0.9714;HWE=0.00259;AC1=70;DP4=8,12,274,385;MQ=60;FQ=999;PV4=1,2.1e-49,0.37,1 GT:PL:GQ 1/1:235,72,0:84 1/1:187,48,0:60 1/1:215,45,0:57 1/1:229,87,0:99 1/1:227,51,0:63 1/1:143,21,0:33 1/1:227,45,0:57 1/1:215,54,0:66 1/1:215,42,0:54 1/1:171,30,0:42 1/1:254,93,0:99 1/1:245,54,0:66 1/1:163,45,0:57 1/1:0,0,0:12 1/1:222,45,0:57 1/1:244,66,0:78 1/1:189,45,0:57 1/1:255,84,0:96 1/1:218,54,0:66 1/1:197,36,0:48 1/1:195,45,0:57 1/1:234,63,0:75 1/1:250,72,0:84 1/1:114,15,0:27 1/1:255,93,0:99 1/1:255,111,0:99 1/1:237,75,0:87 1/1:247,84,0:96 1/1:248,72,0:84 1/1:255,111,0:99 1/1:204,42,0:54 1/1:186,33,0:45 1/1:191,39,0:51 1/1:131,21,0:33 0/0:0,60,255:42 1/1:243,84,0:96
chr12 6979064 . T G 999 . DP=807;VDB=0.0290;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.752e-07,0.3143;HWE=4.13e-11;AC1=22;DP4=270,195,131,86;MQ=60;FQ=999;PV4=0.62,7.9e-68,0.11,1 GT:PL:GQ 1/1:208,90,0:84 1/1:159,60,0:54 1/1:172,45,0:39 1/1:206,63,0:57 1/1:214,69,0:63 1/1:146,30,0:24 1/1:158,45,0:39 1/1:205,66,0:60 1/1:147,45,0:39 1/1:174,39,0:33 1/1:212,96,0:90 0/0:0,63,255:63 0/0:0,27,214:27 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:48 0/0:0,81,255:81 0/0:0,36,232:36 0/0:0,36,241:36 0/0:0,45,255:45 0/0:0,90,255:90 0/0:0,48,255:48 0/0:0,57,255:57 0/0:0,69,255:69 0/0:0,24,179:24 0/0:0,102,255:99 0/0:0,84,255:84 0/0:0,78,255:78 0/0:0,78,255:78 0/0:0,81,255:81 0/0:0,78,255:78 0/0:0,36,231:36 0/0:0,36,255:36 0/0:0,48,246:48 0/0:0,57,224:57 0/0:0,48,255:48 0/0:0,45,255:45
chr12 6979275 . A G 999 . DP=827;VDB=0.0356;AF1=0.9714;G3=0.02857,4.706e-08,0.9714;HWE=0.0026;AC1=70;DP4=9,9,318,347;MQ=60;FQ=999;PV4=1,7.5e-39,0.36,1 GT:PL:GQ 1/1:226,63,0:75 1/1:186,36,0:48 1/1:186,36,0:48 1/1:255,75,0:87 1/1:255,120,0:99 1/1:197,51,0:63 1/1:231,60,0:72 1/1:228,54,0:66 1/1:254,60,0:72 1/1:211,45,0:57 1/1:234,60,0:72 1/1:255,84,0:96 1/1:157,30,0:42 1/1:0,0,0:12 1/1:243,63,0:75 1/1:244,69,0:81 1/1:109,18,0:30 1/1:204,48,0:60 1/1:211,45,0:57 1/1:173,42,0:54 1/1:154,27,0:39 1/1:229,57,0:69 1/1:241,66,0:78 1/1:114,18,0:30 1/1:243,66,0:78 1/1:255,96,0:99 1/1:236,78,0:90 1/1:255,93,0:99 1/1:237,81,0:93 1/1:250,66,0:78 1/1:223,63,0:75 1/1:174,33,0:45 1/1:148,13,0:25 1/1:240,72,0:84 0/0:0,51,255:33 1/1:255,81,0:93
chr12 6979310 . G A 999 . DP=1013;VDB=0.0299;AF1=0.05854;AC1=4;DP4=454,384,22,32;MQ=60;FQ=999;PV4=0.067,5.9e-97,1,0.46 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,57,255:66 0/0:0,72,255:81 0/0:0,93,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,60,255:69 0/0:0,75,255:84 0/0:0,48,255:57 0/0:0,123,255:99 0/0:0,51,255:60 0/0:0,123,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,63,255:72 0/0:0,0,0:9 0/0:0,57,255:66 0/0:0,60,255:69 0/0:0,48,255:57 0/0:0,42,253:51 0/0:0,51,255:60 0/0:0,54,255:63 0/0:0,39,255:48 0/1:112,0,194:99 0/0:0,108,255:99 0/1:34,6,0:9 0/1:99,0,255:90 0/0:0,105,255:99 0/1:141,0,230:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,66,255:75 0/0:0,36,255:45 0/0:0,54,255:63 0/0:0,72,255:81 0/0:0,54,255:63 0/0:0,99,255:99
chr12 6979400 . C G 79.3 . DP=966;VDB=0.0184;AF1=0.02856;AC1=2;DP4=499,404,7,6;MQ=60;FQ=79.4;PV4=1,7.9e-21,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,123,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,63,233:75 0/0:0,60,255:72 0/0:0,66,255:78 0/0:0,114,255:99 0/0:0,51,255:63 0/0:0,123,255:99 0/0:0,75,255:87 0/0:0,51,255:63 0/0:0,0,0:13 0/0:0,72,255:84 0/0:0,75,255:87 0/0:0,36,255:48 0/0:0,60,255:72 0/0:0,48,255:60 0/0:0,60,255:72 0/0:0,30,255:42 0/0:0,60,255:72 0/0:0,120,255:99 0/0:0,12,123:24 0/0:0,135,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,72,255:84 0/0:0,102,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,57,255:69 0/1:36,0,115:24 0/1:104,0,255:92 0/0:0,51,255:63 0/0:0,87,255:99 0/0:0,84,255:96
chr12 6979422 . C G 151 . DP=971;VDB=0.0336;AF1=0.01449;AC1=1;DP4=490,398,12,9;MQ=60;FQ=151;PV4=1,5.2e-26,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,78,255:93 0/0:0,129,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,54,195:69 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/1:196,0,153:99 0/0:0,42,255:57 0/0:0,129,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,45,255:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,81,255:96 0/0:0,60,255:75 0/0:0,36,255:51 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,60,255:75 0/0:0,117,255:99 0/0:0,3,36:18 0/0:0,117,255:99 0/0:0,166,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,225:39 0/0:0,72,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,72,255:87
chr12 6979483 . C T 61.6 . DP=920;VDB=0.0333;AF1=0.01431;AC1=1;DP4=442,402,3,13;MQ=60;FQ=61.7;PV4=0.0098,1.3e-31,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,99,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,45,255:60 0/0:0,75,255:90 0/0:0,63,255:78 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,243:42 0/0:0,135,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,57,255:72 0/0:0,0,0:15 0/0:0,75,255:90 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,33,255:48 0/0:0,90,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,255:54 0/0:0,108,255:99 0/0:0,12,135:27 0/0:0,123,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,33,255:48 0/0:0,51,255:66 0/0:0,126,255:99 0/0:0,63,255:78 0/1:107,0,242:92
chr12 6979542 . C T 999 . DP=940;VDB=0.0371;AF1=0.04297;AC1=3;DP4=483,320,26,23;MQ=60;FQ=999;PV4=0.37,1,1,1 GT:PL:GQ 0/1:255,0,229:99 0/0:0,69,255:79 0/0:0,99,255:99 0/1:255,0,156:99 0/0:0,60,255:70 0/0:0,27,201:37 0/0:0,39,255:49 0/0:0,63,255:73 0/1:247,0,222:99 0/0:0,21,210:31 0/0:0,75,255:85 0/0:0,99,255:99 0/0:0,54,255:64 0/0:0,0,0:11 0/0:0,66,255:76 0/0:0,96,255:99 0/0:0,51,255:61 0/0:0,78,255:88 0/0:0,63,255:73 0/0:0,102,255:99 0/0:0,39,255:49 0/0:0,54,255:64 0/0:0,87,255:97 0/0:0,12,117:22 0/0:0,117,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,81,255:91 0/0:0,72,255:82 0/0:0,18,183:28 0/0:0,69,255:79 0/0:0,69,255:79 0/0:0,72,255:82 0/0:0,60,255:70
chr12 6979598 . C T 126 . DP=1005;VDB=0.0378;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=472,410,11,5;MQ=59;FQ=126;PV4=0.31,6.8e-15,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,117,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,90,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,27,227:42 0/0:0,30,255:45 0/0:0,90,255:99 0/1:171,0,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,78,255:93 0/0:0,75,255:90 0/0:0,45,255:60 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,36,255:51 0/0:0,72,255:87 0/0:0,48,255:63 0/0:0,75,255:90 0/0:0,57,255:72 0/0:0,102,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,36,253:51 0/0:0,84,255:99 0/0:0,132,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,96,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,33,255:48 0/0:0,42,255:57 0/0:0,72,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,75,255:90
chr12 6979649 . C T 80.6 . DP=1000;VDB=0.0308;AF1=0.01429;AC1=1;DP4=419,519,11,5;MQ=60;FQ=80.6;PV4=0.075,1.5e-18,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,81,255:96 0/0:0,75,255:90 0/0:0,99,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,36,255:51 0/0:0,54,255:69 0/0:0,132,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,84,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,60,255:75 0/0:0,27,250:42 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,84,255:99 0/0:0,33,255:48 0/0:0,99,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,48,255:63 0/0:0,78,255:93 0/0:0,172,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,60,255:75 0/1:126,0,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,45,255:60 0/0:0,111,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,72,255:87
chr12 6979650 . cata ca 999 . INDEL;DP=999;VDB=0.0428;AF1=0.02857;AC1=2;DP4=411,500,10,9;MQ=60;FQ=999;PV4=0.64,0.00075,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,75,255:87 0/0:0,66,255:78 0/0:0,102,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,39,255:51 0/0:0,54,255:66 0/0:0,123,255:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,66,255:78 0/0:0,69,255:81 0/0:0,81,255:93 0/0:0,42,255:54 0/0:0,0,0:12 0/0:0,51,255:63 0/0:0,60,255:72 0/0:0,27,255:39 0/0:0,63,255:75 0/0:0,42,255:54 0/0:0,78,255:90 0/0:0,33,255:45 0/0:0,93,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,78,255:90 0/0:0,163,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,63,255:75 0/0:0,148,255:99 0/0:0,99,255:99 0/1:236,0,222:99 0/0:0,45,255:57 0/0:0,105,255:99 0/0:0,96,255:99 0/1:255,0,255:99
chr12 6979664 . C T 999 . DP=1092;VDB=0.0400;AF1=0.2571;AC1=18;DP4=355,449,121,118;MQ=60;FQ=999;PV4=0.089,2.5e-209,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,120,255:99 0/0:0,90,255:92 0/0:0,105,255:99 0/0:0,165,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,42,183:44 0/0:0,63,255:65 0/0:0,114,255:99 0/0:0,226,255:99 0/0:0,69,255:71 0/0:0,87,255:89 0/0:0,78,255:80 0/1:89,0,220:87 0/0:0,0,0:3 1/1:211,51,0:43 0/1:147,0,227:99 1/1:143,33,0:25 0/0:0,78,255:80 0/0:0,36,255:38 1/1:225,72,0:64 0/1:68,0,147:66 0/1:134,0,255:99 0/1:136,0,255:99 0/0:0,57,255:59 0/0:0,102,255:99 0/1:186,0,255:99 0/1:165,0,255:99 0/1:160,0,255:99 0/1:143,0,176:99 0/1:211,0,255:99 0/1:175,0,155:99 0/0:0,45,255:47 0/1:59,0,231:57 0/0:0,114,255:99 0/0:0,93,255:95 0/0:0,63,255:65
chr12 6979769 . T C 999 . DP=1033;VDB=0.0350;AF1=0.3142;G3=0.6857,2.694e-07,0.3143;HWE=4.12e-11;AC1=22;DP4=312,330,116,202;MQ=60;FQ=999;PV4=0.00043,0.01,1,1 GT:PL:GQ 1/1:255,69,0:63 1/1:255,75,0:69 1/1:255,111,0:99 1/1:255,90,0:84 1/1:255,129,0:99 1/1:255,105,0:99 1/1:255,72,0:66 1/1:255,75,0:69 1/1:255,75,0:69 1/1:224,27,0:21 1/1:255,123,0:99 0/0:0,81,255:81 0/0:0,63,255:63 0/0:0,0,0:3 0/0:0,81,255:81 0/0:0,84,255:84 0/0:0,33,255:33 0/0:0,57,255:57 0/0:0,33,255:33 0/0:0,63,255:63 0/0:0,60,255:60 0/0:0,114,255:99 0/0:0,87,255:87 0/0:0,33,255:33 0/0:0,166,255:99 0/0:0,160,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,72,255:72 0/0:0,66,255:66 0/0:0,51,255:51 0/0:0,87,255:87 0/0:0,63,255:63 0/0:0,54,255:54
chr12 6979864 . C T 999 . DP=781;VDB=0.0319;AF1=0.2573;AC1=18;DP4=106,363,48,131;MQ=60;FQ=999;PV4=0.26,1.2e-47,0.024,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:68 0/0:0,39,255:41 0/0:0,54,255:56 0/0:0,48,211:50 0/0:0,51,255:53 0/0:0,36,204:38 0/0:0,36,229:38 0/0:0,57,255:59 0/0:0,63,255:65 0/0:0,18,145:20 0/0:0,39,255:41 0/0:0,48,255:50 0/1:47,0,128:45 0/0:0,0,0:3 1/1:207,39,0:31 0/1:73,0,238:71 1/1:215,48,0:40 0/0:0,33,245:35 0/0:0,57,255:59 1/1:229,66,0:58 0/1:41,0,149:39 0/1:38,0,200:36 0/0:0,27,214:29 1/1:157,30,0:22 0/1:112,0,255:99 0/0:0,129,255:99 0/1:198,0,115:99 0/0:0,75,255:77 0/1:125,0,100:99 0/1:177,0,75:83 0/1:180,0,99:99 0/0:0,72,255:74 0/1:106,0,65:73 0/0:0,66,255:68 0/0:0,69,255:71 0/0:0,24,170:26
chr12 6979880 . G A 138 . DP=811;VDB=0.0149;AF1=0.01463;AC1=1;DP4=177,497,5,15;MQ=60;FQ=138;PV4=1,1.1e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,54,231:69 0/0:0,39,255:54 0/0:0,78,255:93 0/0:0,69,255:84 0/0:0,60,255:75 0/0:0,45,245:60 0/0:0,42,255:57 0/0:0,54,255:69 0/0:0,75,255:90 0/0:0,15,145:30 0/0:0,90,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,30,249:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,36,255:51 0/0:0,54,255:69 0/0:0,57,255:72 0/0:0,27,203:42 0/0:0,60,255:75 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,57,255:72 0/0:0,36,255:51 0/0:0,30,197:45 0/0:0,111,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,87,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,1,255:16 0/1:183,0,140:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,36,228:51 0/0:0,78,255:93 0/0:0,48,255:63 0/0:0,27,181:42
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chr12 6980002 . A G 999 . DP=795;VDB=0.0257;AF1=0.3099;G3=0.6857,3.425e-08,0.3143;HWE=5.84e-11;AC1=22;DP4=246,217,69,83;MQ=60;FQ=999;PV4=0.11,1,0.013,1 GT:PL:GQ 1/1:255,57,0:51 1/1:109,12,0:7 1/1:255,51,0:45 1/1:255,51,0:45 1/1:190,24,0:18 1/1:196,21,0:15 1/1:205,27,0:21 1/1:255,57,0:51 1/1:255,81,0:75 1/1:193,21,0:15 1/1:255,54,0:48 0/0:0,57,255:57 0/0:0,42,255:42 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:57 0/0:0,39,255:39 0/0:0,30,231:30 0/0:0,57,255:57 0/0:0,48,255:48 0/0:0,78,255:78 0/0:0,33,255:33 0/0:0,99,255:99 0/0:0,66,255:66 0/0:0,39,255:39 0/0:0,69,255:69 0/0:0,102,255:99 0/0:0,78,255:78 0/0:0,84,255:84 0/0:0,66,255:66 0/0:0,63,255:63 0/0:0,21,156:22 0/0:0,33,255:33 0/0:0,60,255:60 0/0:0,48,255:48 0/0:0,66,255:66 0/0:0,54,255:54
chr12 6980050 . C T 999 . DP=733;VDB=0.0291;AF1=0.07121;AC1=5;DP4=251,317,24,27;MQ=60;FQ=999;PV4=0.77,1.1e-65,0.00093,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:68 0/0:0,21,143:29 0/0:0,45,255:53 0/0:0,75,255:83 0/0:0,39,251:47 0/0:0,15,152:23 0/0:0,18,157:26 0/0:0,60,255:68 0/0:0,102,255:99 0/0:0,42,255:50 0/0:0,57,255:65 0/0:0,48,255:56 0/0:0,36,255:44 0/0:0,0,0:9 0/0:0,51,255:59 0/0:0,57,255:65 0/0:0,57,255:65 0/0:0,51,255:59 0/0:0,45,255:53 0/0:0,63,255:71 0/0:0,33,255:41 0/1:136,0,237:99 0/0:0,72,255:80 1/1:138,30,0:16 0/1:142,0,156:99 0/0:0,51,255:59 0/1:109,0,209:99 0/0:0,42,255:50 0/0:0,54,255:62 0/0:0,78,255:86 0/0:0,21,167:29 0/0:0,45,255:53 0/0:0,66,255:74 0/0:0,60,255:68 0/0:0,60,255:68 0/0:0,69,255:77
chr12 6980268 . C T 999 . DP=530;VDB=0.0172;AF1=0.05722;AC1=4;DP4=173,279,6,8;MQ=60;FQ=999;PV4=0.78,1.5e-05,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,39,255:48 0/0:0,24,176:33 0/0:0,42,189:51 0/1:39,0,38:30 0/0:0,39,255:48 0/1:125,0,15:30 0/1:59,0,136:50 0/0:0,30,253:39 0/0:0,27,198:36 0/1:37,0,14:25 0/0:0,42,255:51 0/0:0,45,255:54 0/0:0,30,255:39 0/0:0,0,0:10 0/0:0,42,255:51 0/0:0,45,255:54 0/0:0,39,255:48 0/0:0,51,255:60 0/0:0,24,229:33 0/0:0,54,255:63 0/0:0,54,255:63 0/0:0,63,255:72 0/0:0,51,255:60 0/0:0,27,219:36 0/0:0,72,255:81 0/0:0,75,255:84 0/0:0,51,255:60 0/0:0,45,255:54 0/0:0,39,255:48 0/0:0,54,255:63 0/0:0,45,255:54 0/0:0,42,255:51 0/0:0,15,139:24 0/0:0,30,255:39 0/0:0,54,255:63 0/0:0,39,190:48
chr12 6980312 . G A 999 . DP=591;VDB=0.0338;AF1=0.2699;G3=0.6857,0.08603,0.2283;HWE=4.65e-06;AC1=19;DP4=155,214,42,60;MQ=60;FQ=999;PV4=0.91,4.5e-10,1,1 GT:PL:GQ 0/1:122,0,139:99 1/1:232,30,0:23 1/1:169,24,0:17 0/1:79,0,129:78 1/1:233,36,0:29 1/1:237,36,0:29 1/1:200,27,0:20 1/1:254,42,0:35 0/1:96,0,142:95 1/1:172,18,0:11 1/1:196,33,0:26 0/0:0,30,255:31 0/0:0,24,224:25 0/0:0,0,0:3 0/0:0,36,255:37 0/0:0,63,255:64 0/0:0,30,225:31 0/0:0,45,255:46 0/0:0,24,203:25 0/0:0,69,255:70 0/0:0,30,234:31 0/0:0,63,255:64 0/0:0,39,234:40 0/0:0,24,201:25 0/0:0,54,255:55 0/0:0,87,255:88 0/0:0,54,255:55 0/0:0,36,255:37 0/0:0,39,222:40 0/0:0,39,255:40 0/0:0,54,255:55 0/0:0,42,255:43 0/0:0,39,255:40 0/0:0,36,255:37 0/0:0,39,255:40 0/0:0,45,220:46
chr12 6980366 . C T 999 . DP=662;VDB=0.0295;AF1=0.0429;AC1=3;DP4=189,402,9,12;MQ=60;FQ=999;PV4=0.34,1e-18,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:70 0/0:0,45,255:55 0/0:0,63,255:73 0/0:0,84,255:94 0/0:0,45,255:55 0/0:0,24,212:34 0/0:0,36,255:46 0/0:0,48,255:58 0/0:0,81,255:91 0/0:0,36,251:46 0/0:0,75,255:85 0/0:0,39,200:49 0/0:0,48,220:58 0/0:0,0,0:11 0/0:0,21,195:31 0/0:0,54,255:64 0/0:0,27,198:37 0/0:0,51,255:61 0/0:0,36,255:46 0/0:0,63,255:73 0/0:0,42,255:52 0/0:0,45,253:55 0/0:0,48,255:58 0/0:0,24,220:34 0/0:0,102,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,72,255:82 0/1:46,0,146:36 0/1:139,0,150:99 0/1:73,0,173:63 0/0:0,33,255:43 0/0:0,42,255:52 0/0:0,63,255:73 0/0:0,81,255:91 0/0:0,18,169:28
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chr12 6980668 . G A 999 . DP=831;VDB=0.0326;AF1=0.1572;AC1=11;DP4=417,195,90,22;MQ=60;FQ=999;PV4=0.0097,4.6e-68,1,1 GT:PL:GQ 0/1:161,0,196:99 1/1:186,60,0:50 0/1:126,0,207:99 0/1:34,0,159:30 0/1:154,0,196:99 0/0:0,27,213:31 0/1:135,0,118:99 0/1:52,0,204:48 0/0:0,36,255:40 0/1:45,0,88:41 1/1:222,60,0:50 0/0:0,81,255:85 0/0:0,36,255:40 0/0:0,0,0:5 0/0:0,66,255:70 0/0:0,93,255:97 0/0:0,51,255:55 0/0:0,63,255:67 0/0:0,27,238:31 0/0:0,60,255:64 0/0:0,30,255:34 0/0:0,72,255:76 0/0:0,66,255:70 0/0:0,33,242:37 0/0:0,84,255:88 0/0:0,96,255:99 0/0:0,45,255:49 0/0:0,93,255:97 0/0:0,54,255:58 0/0:0,78,255:82 0/0:0,66,255:70 0/0:0,36,255:40 0/0:0,54,255:58 0/0:0,63,255:67 0/0:0,51,255:55 0/0:0,75,255:79
chr12 6980842 . G T 999 . DP=1012;VDB=0.0225;AF1=0.04299;AC1=3;DP4=514,338,37,10;MQ=60;FQ=999;PV4=0.013,0.00053,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,96,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,120,255:99 0/0:0,69,255:79 0/0:0,54,255:64 0/0:0,27,228:37 0/0:0,84,255:94 0/0:0,69,255:79 0/0:0,60,255:70 0/0:0,39,255:49 0/0:0,117,255:99 0/0:0,93,255:99 0/0:0,18,186:28 0/0:0,0,0:11 0/0:0,87,255:97 0/0:0,69,255:79 0/0:0,24,245:34 0/0:0,42,255:52 0/0:0,57,255:67 0/0:0,105,255:99 0/0:0,45,255:55 0/0:0,66,255:76 0/0:0,120,255:99 0/0:0,27,196:37 0/0:0,108,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,117,255:99 0/1:255,0,249:99 0/1:242,0,196:99 0/0:0,105,255:99 0/1:81,0,5:22 0/0:0,63,255:73 0/0:0,75,255:85 0/0:0,99,255:99 0/0:0,120,255:99 0/0:0,102,255:99
chr12 6980848 . G A 999 . DP=993;VDB=0.0370;AF1=0.2943;G3=0.572,0.2614,0.1666;HWE=0.0345;AC1=21;DP4=394,266,138,83;MQ=60;FQ=999;PV4=0.48,0.017,0.46,0.32 GT:PL:GQ 0/0:0,84,255:85 0/0:0,72,255:73 0/0:0,123,255:99 0/0:0,60,255:61 0/0:0,63,255:64 0/0:0,27,228:28 0/0:0,90,255:91 0/0:0,66,255:67 0/0:0,69,255:70 0/0:0,36,248:37 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:91 0/1:20,0,162:19 0/0:0,0,0:3 1/1:255,81,0:74 0/1:135,0,255:99 1/1:255,27,0:20 0/0:0,48,255:49 0/0:0,54,255:55 1/1:255,99,0:92 0/1:79,0,255:78 0/1:255,0,147:99 0/0:0,114,255:99 1/1:228,33,0:26 0/1:183,0,255:99 0/0:0,108,255:99 0/1:195,0,255:99 0/1:219,0,255:99 1/1:255,99,0:92 0/1:255,0,255:99 1/1:61,9,0:4 0/0:0,60,255:61 0/1:212,0,178:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,105,255:99
chr12 6980896 . T C 999 . DP=888;VDB=0.0305;AF1=0.08582;AC1=6;DP4=372,296,54,50;MQ=60;FQ=999;PV4=0.53,3.7e-54,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,63,255:70 0/0:0,66,255:73 0/0:0,78,255:85 0/0:0,42,255:49 0/0:0,72,255:79 0/0:0,36,218:43 0/0:0,54,255:61 0/0:0,81,255:88 0/0:0,63,255:70 0/0:0,39,252:46 0/0:0,75,255:82 0/0:0,105,255:99 0/0:0,42,255:49 0/0:0,0,0:8 0/0:0,51,255:58 0/0:0,48,255:55 0/0:0,54,255:61 0/0:0,60,255:67 0/0:0,33,255:40 0/0:0,90,255:97 0/0:0,15,161:22 0/0:0,51,255:58 1/1:235,90,0:77 0/0:0,24,180:31 0/1:148,0,255:99 0/1:170,0,232:99 0/1:159,0,250:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,57,255:64 0/1:185,0,188:99 0/0:0,24,192:31 0/0:0,69,255:76 0/0:0,51,255:58 0/0:0,84,255:91 0/0:0,114,255:99 0/0:0,99,255:99
chr12 6980960 . C T 999 . DP=975;VDB=0.0478;AF1=0.1857;AC1=13;DP4=397,359,64,57;MQ=60;FQ=999;PV4=1,8.6e-128,1.5e-12,0.48 GT:PL:GQ 0/0:0,93,255:96 0/0:0,69,255:72 0/0:0,78,255:81 0/0:0,78,255:81 0/0:0,75,255:78 0/0:0,57,255:60 0/0:0,39,255:42 0/0:0,90,255:93 0/0:0,90,255:93 0/0:0,30,243:33 0/0:0,108,255:99 0/0:0,72,255:75 0/1:74,0,133:71 0/0:0,0,0:5 1/1:190,51,0:42 0/1:88,0,202:85 1/1:107,33,0:24 0/0:0,39,255:42 0/0:0,24,236:27 1/1:214,66,0:57 0/1:53,0,249:50 0/0:0,84,255:87 0/0:0,114,255:99 0/0:0,42,255:45 0/0:0,114,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,102,255:99 0/1:149,0,166:99 0/1:109,0,255:99 0/1:112,0,181:99 0/0:0,51,255:54 0/1:104,0,247:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,87,255:90
chr12 6980968 . C A 999 . DP=952;VDB=0.0234;AF1=0.04287;AC1=3;DP4=427,406,15,17;MQ=60;FQ=999;PV4=0.72,4e-49,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,102,255:99 0/0:0,72,255:82 0/0:0,72,255:82 0/0:0,72,255:82 0/0:0,75,255:85 0/0:0,48,255:58 0/0:0,48,255:58 0/0:0,87,255:97 0/0:0,87,255:97 0/0:0,21,193:31 0/0:0,117,255:99 0/0:0,63,255:73 0/0:0,36,255:46 0/0:0,0,0:11 0/0:0,51,255:61 0/0:0,48,255:58 0/0:0,36,255:46 0/0:0,60,255:70 0/0:0,33,255:43 0/0:0,66,255:76 0/0:0,48,255:58 0/0:0,87,255:97 0/0:0,117,255:99 0/0:0,42,255:52 0/0:0,129,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,96,255:99 0/1:138,0,255:99 0/1:78,0,217:68 0/0:0,102,255:99 0/1:97,0,206:87 0/0:0,51,255:61 0/0:0,66,255:76 0/0:0,93,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,75,255:85
chr12 6981018 . C T 999 . DP=1027;VDB=0.0257;AF1=0.07126;AC1=5;DP4=339,569,28,29;MQ=60;FQ=999;PV4=0.091,2.2e-66,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,123,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,102,255:99 0/0:0,90,255:98 0/0:0,90,255:98 0/0:0,51,255:59 0/0:0,60,255:68 0/0:0,105,255:99 0/0:0,69,255:77 0/0:0,30,201:38 0/0:0,114,255:99 0/0:0,72,255:80 0/0:0,45,255:53 0/0:0,0,0:9 0/0:0,78,255:86 0/0:0,51,255:59 0/0:0,24,233:32 0/0:0,66,255:74 0/0:0,54,255:62 0/0:0,117,255:99 0/0:0,48,255:56 0/1:113,0,237:99 0/0:0,99,255:99 1/1:157,33,0:19 0/1:134,0,255:99 0/0:0,120,255:99 0/1:133,0,247:99 0/0:0,129,255:99 0/0:0,84,255:92 0/0:0,126,255:99 0/0:0,63,255:71 0/0:0,42,255:50 0/0:0,96,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,90,255:98
chr12 6981257 . A G 999 . DP=827;VDB=0.0384;AF1=0.9856;AC1=71;DP4=5,9,295,409;MQ=60;FQ=999;PV4=0.79,4e-36,0.32,1 GT:PL:GQ 1/1:195,46,0:61 1/1:227,108,0:99 1/1:231,111,0:99 1/1:223,63,0:78 1/1:230,75,0:90 1/1:188,51,0:66 1/1:207,60,0:75 1/1:203,57,0:72 1/1:210,54,0:69 1/1:150,27,0:42 1/1:223,96,0:99 1/1:171,42,0:57 1/1:39,6,0:21 1/1:0,0,0:15 1/1:191,57,0:72 1/1:176,51,0:66 1/1:117,21,0:36 1/1:206,66,0:81 1/1:146,33,0:48 1/1:211,63,0:78 1/1:110,24,0:39 1/1:200,60,0:75 1/1:179,51,0:66 1/1:172,36,0:51 1/1:226,93,0:99 1/1:242,117,0:99 1/1:234,114,0:99 1/1:213,78,0:93 1/1:241,87,0:99 1/1:221,99,0:99 1/1:193,54,0:69 1/1:109,21,0:36 1/1:155,33,0:48 1/1:193,84,0:99 0/1:30,0,239:51 1/1:168,42,0:57
chr12 6981279 . G A 70.6 . DP=852;VDB=0.0339;AF1=0.0143;AC1=1;DP4=315,415,4,6;MQ=59;FQ=70.6;PV4=1,9.9e-14,0.033,0.15 GT:PL:GQ 0/0:0,90,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,105,255:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,81,255:96 0/0:0,54,255:69 0/0:0,48,255:63 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,39,255:54 0/0:0,69,255:84 0/0:0,57,255:72 0/0:0,15,166:30 0/0:0,0,0:15 0/0:0,48,255:63 0/0:0,66,255:81 0/0:0,42,255:57 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,60,255:75 0/0:0,45,255:60 0/0:0,54,255:69 0/0:0,60,255:75 0/0:0,30,244:45 0/0:0,84,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,123,255:99 0/1:116,0,241:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,114,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,36,255:51 0/0:0,45,255:60 0/0:0,75,255:90 0/0:0,48,255:63 0/0:0,54,255:69
chr12 6981383 . T C 58.6 . DP=677;VDB=0.0176;AF1=0.01433;AC1=1;DP4=261,290,2,6;MQ=60;FQ=58.7;PV4=0.29,4e-06,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,33,253:48 0/0:0,27,217:42 0/0:0,57,255:72 0/0:0,51,255:66 0/0:0,45,255:60 0/0:0,21,177:36 0/0:0,48,255:63 0/0:0,75,255:90 0/0:0,36,255:51 0/0:0,21,175:36 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,218:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,54,255:69 0/0:0,66,255:81 0/0:0,39,255:54 0/0:0,48,255:63 0/0:0,42,255:57 0/0:0,30,251:45 0/0:0,12,124:27 0/0:0,60,255:75 0/0:0,60,255:75 0/0:0,18,139:33 0/0:0,75,255:90 0/0:0,111,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,51,255:66 0/0:0,24,154:39 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,36,255:51 0/1:104,0,138:89 0/0:0,69,255:84 0/0:0,42,255:57 0/0:0,45,255:60
chr12 6981423 . C A 125 . DP=729;VDB=0.0278;AF1=0.0282;AC1=2;DP4=262,312,14,11;MQ=60;FQ=125;PV4=0.32,3.6e-21,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,51,255:63 0/0:0,60,255:72 0/0:0,66,255:78 0/0:0,39,255:51 0/0:0,30,239:42 0/0:0,30,217:42 0/0:0,39,255:51 0/0:0,57,255:69 0/0:0,30,236:42 0/0:0,15,134:27 0/0:0,78,255:90 0/0:0,45,255:57 0/0:0,15,133:27 0/0:0,0,0:13 0/0:0,48,255:60 0/0:0,45,255:57 0/0:0,39,255:51 0/0:0,75,255:87 0/0:0,30,222:42 0/0:0,39,255:51 0/0:0,21,204:33 0/0:0,51,255:63 0/0:0,78,255:90 0/0:0,33,254:45 0/0:0,87,255:99 0/0:0,105,255:99 0/0:0,60,255:72 0/1:26,0,255:14 0/0:0,8,192:20 0/0:0,29,255:41 0/1:159,0,9:27 0/0:0,45,255:57 0/0:0,42,255:54 0/0:0,90,255:99 0/0:0,54,255:66 0/0:0,72,255:84
chr12 6981676 . C T 159 . DP=957;VDB=0.0404;AF1=0.01434;AC1=1;DP4=450,384,7,5;MQ=60;FQ=159;PV4=1,0.16,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,72,255:87 0/0:0,132,255:99 0/0:0,90,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,54,255:69 0/0:0,99,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,45,255:60 0/0:0,126,255:99 0/0:0,60,255:75 0/0:0,42,255:57 0/0:0,0,0:15 0/0:0,72,255:87 0/0:0,87,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,42,255:57 0/0:0,30,255:45 0/0:0,72,255:87 0/0:0,60,255:75 0/0:0,63,255:78 0/0:0,117,255:99 0/0:0,30,241:45 0/0:0,102,255:99 0/0:0,117,255:99 0/0:0,111,255:99 0/1:204,0,235:99 0/0:0,81,255:96 0/0:0,129,255:99 0/0:0,75,255:90 0/0:0,48,255:63 0/0:0,45,255:60 0/0:0,9,255:24 0/0:0,39,255:54 0/0:0,96,255:99
chr12 6981731 . G A 999 . DP=1009;VDB=0.0404;AF1=0.6311;G3=0.2556,0.2301,0.5143;HWE=0.00272;AC1=46;DP4=210,145,362,193;MQ=59;FQ=999;PV4=0.068,0.13,3e-06,1 GT:PL:GQ 1/1:255,54,0:53 1/1:255,63,0:62 1/1:255,141,0:99 1/1:255,138,0:99 1/1:255,111,0:99 1/1:255,63,0:62 1/1:255,54,0:53 1/1:255,102,0:99 1/1:255,78,0:77 1/1:248,36,0:35 1/1:255,102,0:99 0/0:0,87,255:82 0/1:184,0,198:99 0/1:0,0,0:3 1/1:255,63,0:62 0/1:248,0,255:99 1/1:255,78,0:77 0/0:0,39,255:34 0/0:0,66,255:61 1/1:255,63,0:62 0/1:79,0,189:84 0/1:173,0,255:99 0/0:0,132,255:99 1/1:236,27,0:26 0/1:239,0,223:99 0/0:0,141,255:99 0/1:255,0,255:99 1/1:255,60,0:59 1/1:255,72,0:71 0/1:255,0,193:99 1/1:255,72,0:71 0/0:0,42,255:37 0/1:188,0,132:99 0/0:0,12,253:8 0/0:0,54,255:49 0/0:0,129,255:99
chr12 6981746 . C T 999 . DP=998;VDB=0.0377;AF1=0.08564;AC1=6;DP4=553,307,34,29;MQ=59;FQ=999;PV4=0.11,0.00011,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:73 0/0:0,51,255:58 0/0:0,132,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,114,255:99 0/0:0,57,255:64 0/0:0,48,255:55 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:91 0/0:0,39,255:46 0/0:0,81,255:88 0/0:0,90,255:97 0/0:0,51,255:58 0/0:0,0,0:8 0/0:0,72,255:79 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:85 0/0:0,39,255:46 0/0:0,72,255:79 0/0:0,75,255:82 0/0:0,45,255:52 0/1:138,0,255:99 0/0:0,120,255:99 1/1:255,36,0:23 0/1:220,0,232:99 0/0:0,148,255:99 0/1:255,0,255:99 0/0:0,48,255:55 0/0:0,72,255:79 0/0:0,84,255:91 0/0:0,72,255:79 0/0:0,39,255:46 0/1:164,0,151:99 0/0:0,57,255:64 0/0:0,69,255:76 0/0:0,126,255:99
chr12 6981762 . acacactcacac acacac 999 . INDEL;DP=939;VDB=0.0408;AF1=0.2191;AC1=15;DP4=281,154,55,36;MQ=59;FQ=999;PV4=0.47,0.31,7.1e-61,1 GT:PL:GQ 0/0:0,15,120:18 0/0:0,15,175:18 0/0:0,48,255:51 0/1:45,0,16:24 0/0:0,39,255:42 0/0:0,3,60:7 0/0:0,3,60:7 0/0:0,30,238:33 0/0:0,30,255:33 0/0:0,0,0:4 0/0:0,24,138:27 0/0:0,102,255:99 0/1:196,0,174:99 0/0:0,0,0:4 1/1:255,60,0:51 0/1:213,0,255:99 1/1:255,51,0:42 0/0:0,39,255:42 0/0:0,54,255:57 1/1:255,48,0:39 0/1:151,0,255:99 0/0:0,72,255:75 0/0:0,108,255:99 0/0:0,0,0:4 0/0:0,48,255:51 0/0:0,135,255:99 0/0:0,40,255:43 0/1:16,0,51:14 0/1:248,0,36:45 0/1:197,0,255:99 0/1:203,0,12:21 0/0:0,24,255:27 0/0:0,18,255:21 0/0:0,66,255:69 0/0:0,63,255:66 0/0:0,135,255:99
chr12 6981766 . actc ac 999 . INDEL;DP=836;VDB=0.0410;AF1=0.2683;G3=0.6141,0.2341,0.1518;HWE=0.0362;AC1=19;DP4=253,140,87,37;MQ=60;FQ=999;PV4=0.28,6.9e-12,0.089,1 GT:PL:GQ 0/0:0,6,77:8 0/0:0,9,85:11 0/0:0,15,191:16 1/1:255,75,0:68 0/0:0,27,255:28 0/1:196,0,13:20 0/1:190,0,39:46 0/0:0,18,173:19 0/0:0,15,143:16 1/1:101,9,0:4 0/0:0,3,29:6 0/0:0,102,255:99 0/0:0,12,173:14 0/0:0,0,0:3 0/0:0,0,0:3 0/0:0,48,255:49 0/0:0,0,0:3 0/0:0,42,255:43 0/0:0,57,255:58 0/0:0,0,0:3 0/0:0,27,255:28 0/1:255,0,255:99 0/0:0,108,255:99 1/1:255,36,0:29 0/1:255,0,255:99 0/0:0,135,255:99 0/1:255,0,255:99 0/1:67,0,25:32 1/1:255,36,0:29 0/0:0,36,255:37 1/1:203,21,0:14 0/0:0,27,255:28 0/1:229,0,216:99 0/0:0,66,255:67 0/0:0,63,255:64 0/0:0,135,255:99
chr12 6981768 . tcacacac tCAcacacac 999 . INDEL;DP=700;VDB=0.0386;AF1=0.4327;G3=0.5413,0.0271,0.4316;HWE=4.35e-08;AC1=31;DP4=212,115,166,61;MQ=60;FQ=999;PV4=0.042,1,0.16,1 GT:PL:GQ 1/1:255,60,0:56 1/1:255,42,0:38 1/1:255,141,0:99 1/1:255,57,0:53 1/1:255,78,0:74 1/1:255,24,0:20 1/1:103,6,0:4 1/1:255,60,0:56 1/1:255,90,0:86 1/1:189,12,0:8 1/1:255,63,0:59 0/0:0,96,255:94 0/0:0,15,157:13 0/1:0,0,0:3 0/1:0,0,0:3 0/1:18,0,255:20 0/1:0,0,0:3 0/0:0,33,255:31 0/0:0,48,255:46 0/1:32,3,0:4 0/0:0,27,255:25 0/0:0,18,255:16 0/0:0,96,255:94 0/1:0,0,0:3 0/0:0,60,255:58 0/0:0,123,255:99 0/0:0,69,255:67 1/1:255,30,0:26 0/1:0,0,0:3 0/0:0,33,255:31 0/1:0,0,0:3 0/0:0,21,229:19 0/0:0,24,237:22 0/0:0,54,255:52 0/0:0,51,255:49 0/0:0,123,255:99
chr12 6981770 . ac aCCc 999 . INDEL;DP=938;VDB=0.0403;AF1=0.2469;AC1=18;DP4=269,144,122,45;MQ=60;FQ=999;PV4=0.078,8.8e-135,1,1 GT:PL:GQ 0/1:92,0,76:83 0/1:98,0,24:32 0/1:70,0,15:23 1/1:67,16,0:9 0/1:115,0,40:48 1/1:91,24,0:16 0/1:18,0,34:16 0/1:102,0,49:57 1/1:79,11,0:5 0/1:32,6,0:4 0/1:145,0,6:14 0/0:0,105,255:99 0/0:0,36,255:38 0/0:0,0,0:4 0/0:0,3,31:6 0/0:0,48,255:50 0/0:0,24,177:26 0/0:0,39,255:41 0/0:0,54,255:56 0/0:0,3,32:6 0/0:0,33,255:35 0/0:0,78,255:80 0/0:0,114,255:99 0/0:0,0,0:4 0/0:0,60,255:62 0/0:0,135,255:99 0/0:0,69,255:71 1/1:61,15,0:8 0/0:0,15,91:17 0/0:0,39,255:41 0/0:0,0,0:4 0/0:0,24,255:26 0/0:0,24,255:26 0/0:0,66,255:68 0/0:0,54,255:56 0/0:0,129,255:99
chr12 6981774 . ac aCCc 999 . INDEL;DP=961;VDB=0.0398;AF1=0.2426;AC1=17;DP4=274,138,119,42;MQ=59;FQ=999;PV4=0.09,6.1e-132,1,1 GT:PL:GQ 0/1:78,0,97:76 0/1:106,0,63:71 1/1:99,48,0:40 0/1:83,0,7:15 1/1:142,57,0:49 0/1:72,0,14:22 0/1:30,6,0:4 0/1:104,0,25:33 1/1:112,11,0:5 1/1:59,12,0:5 0/1:101,0,12:20 0/0:0,105,255:99 0/0:0,45,255:47 0/0:0,0,0:4 0/0:0,3,31:6 0/0:0,54,255:56 0/0:0,30,193:32 0/0:0,45,255:47 0/0:0,48,255:50 0/0:0,12,109:14 0/0:0,33,255:35 0/0:0,75,255:77 0/0:0,108,255:99 0/0:0,0,0:4 0/0:0,63,255:65 0/0:0,138,255:99 0/0:0,72,255:74 0/1:60,0,14:22 0/0:0,6,58:9 0/0:0,39,255:41 0/0:0,3,30:6 0/0:0,21,255:23 0/0:0,24,255:26 0/0:0,57,255:59 0/0:0,51,255:53 0/0:0,126,255:99
chr12 6981810 . C T 999 . DP=1577;VDB=0.0002;AF1=0.3481;G3=0.2475,0.7525,1.193e-15;HWE=9.21e-05;AC1=25;DP4=543,328,307,283;MQ=46;FQ=999;PV4=9.9e-05,0,0,1 GT:PL:GQ 0/1:14,0,255:14 0/1:11,0,255:12 0/0:0,13,255:13 0/1:28,0,255:28 0/1:36,0,233:36 0/1:31,0,186:31 0/1:15,0,245:15 0/1:16,0,255:16 0/1:26,0,255:26 0/1:17,0,206:17 0/0:0,5,255:6 0/1:4,0,255:6 0/0:0,26,255:26 0/1:0,0,0:3 0/0:0,6,255:7 0/0:0,17,255:17 0/1:6,0,255:7 0/1:29,0,255:29 0/1:5,0,242:6 0/0:0,19,255:19 0/1:20,0,249:20 0/1:2,0,255:4 0/1:36,0,255:36 0/1:0,0,211:3 0/1:24,0,255:24 0/1:9,0,255:10 0/1:17,0,255:17 0/0:0,28,255:28 0/1:21,0,248:21 0/0:0,13,255:13 0/1:9,0,255:10 0/1:11,0,172:12 0/1:26,0,255:26 0/0:0,24,255:24 0/1:28,0,255:28 0/1:6,0,255:7
chr12 6981855 . T G 999 . DP=886;VDB=0.0335;AF1=0.3143;G3=0.6857,2.72e-07,0.3143;HWE=4.13e-11;AC1=22;DP4=288,278,155,112;MQ=58;FQ=999;PV4=0.054,1.9e-127,8.6e-06,1 GT:PL:GQ 1/1:249,78,0:72 1/1:255,90,0:84 1/1:255,96,0:90 1/1:255,99,0:93 1/1:255,78,0:72 1/1:208,45,0:39 1/1:172,30,0:24 1/1:215,45,0:39 1/1:255,84,0:78 1/1:173,36,0:30 1/1:255,95,0:89 0/0:0,81,255:81 0/0:0,36,255:36 0/0:0,0,0:3 0/0:0,51,255:51 0/0:0,81,255:81 0/0:0,36,221:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,36,255:36 0/0:0,66,255:66 0/0:0,48,255:48 0/0:0,111,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,24,209:24 0/0:0,96,255:96 0/0:0,126,255:99 0/0:0,48,255:48 0/0:0,84,255:84 0/0:0,96,255:96 0/0:0,75,255:75 0/0:0,54,255:54 0/0:0,36,255:36 0/0:0,51,255:51 0/0:0,62,255:62 0/0:0,57,255:57 0/0:0,141,255:99
chr12 6981868 . T C 999 . DP=922;VDB=0.0060;AF1=0.1333;AC1=9;DP4=409,384,33,47;MQ=57;FQ=999;PV4=0.08,0.0013,1.5e-35,5e-20 GT:PL:GQ 0/0:0,20,255:25 0/0:0,57,255:62 0/0:0,14,255:19 0/0:0,8,255:13 0/0:0,90,255:95 0/0:0,29,255:34 0/0:0,3,214:9 0/0:0,25,255:30 0/0:0,80,255:85 0/0:1,0,212:6 0/0:0,93,255:98 0/0:0,84,255:89 0/1:19,0,201:14 0/0:0,0,0:6 0/1:52,0,211:47 0/0:0,21,255:26 0/1:124,0,90:99 0/0:0,72,255:77 0/0:0,45,255:50 0/1:149,0,255:99 0/1:29,0,255:24 0/0:0,64,255:69 0/0:0,114,255:99 0/0:0,18,160:23 0/1:42,0,255:37 0/0:0,120,255:99 0/1:52,0,255:47 0/1:66,0,231:61 0/0:0,48,229:53 0/1:14,0,255:9 0/0:0,48,255:53 0/0:0,33,255:38 0/0:0,17,255:22 0/0:0,78,255:83 0/0:0,51,255:56 0/0:0,144,255:99
chr12 6981868 . tacac tACACTCACacac 999 . INDEL;DP=922;VDB=0.0408;AF1=0.57;G3=0.2821,0.2595,0.4584;HWE=0.0145;AC1=41;DP4=166,161,101,92;MQ=59;FQ=999;PV4=0.79,1,1.8e-07,1 GT:PL:GQ 1/1:60,3,0:4 1/1:192,15,0:13 1/1:78,9,0:8 1/1:16,3,0:4 1/1:39,6,0:6 1/1:26,3,0:4 1/1:91,6,0:6 1/1:60,3,0:4 1/1:92,6,0:6 0/1:30,30,30:3 1/1:161,15,0:13 0/0:0,81,255:77 0/1:41,0,151:45 0/1:0,0,0:3 1/1:255,39,0:37 0/1:255,0,255:99 1/1:116,18,0:16 0/0:0,69,255:65 0/0:0,42,255:38 1/1:255,57,0:55 0/1:0,1,255:5 0/1:255,0,255:99 0/0:0,111,255:99 1/1:212,12,0:11 0/1:255,0,255:99 0/0:0,114,255:99 0/1:255,0,255:99 1/1:255,72,0:70 1/1:255,78,0:76 0/1:255,0,255:99 1/1:255,36,0:34 0/0:0,33,255:29 0/1:255,0,255:99 0/0:0,75,255:71 0/0:0,51,255:47 0/0:0,138,255:99
chr12 6981870 . cacgtac cac 999 . INDEL;DP=908;VDB=0.0405;AF1=0.4224;G3=0.4497,0.2136,0.3367;HWE=0.0035;AC1=30;DP4=189,192,41,27;MQ=58;FQ=999;PV4=0.11,3.5e-11,0.19,0.003 GT:PL:GQ 1/1:110,6,0:4 1/1:255,24,0:20 1/1:218,15,0:11 1/1:255,15,0:11 1/1:142,9,0:6 1/1:169,9,0:6 1/1:236,15,0:11 1/1:110,6,0:4 1/1:255,21,0:17 0/1:60,3,0:4 1/1:255,33,0:29 0/0:0,81,255:79 0/0:0,18,211:16 0/1:0,0,0:3 0/1:119,0,82:86 0/1:78,0,255:80 0/1:10,0,160:12 0/0:0,75,255:73 0/0:0,42,255:40 0/1:19,0,255:21 0/0:0,5,255:5 0/1:0,0,255:4 0/0:0,111,255:99 0/1:31,3,0:4 0/0:0,63,255:61 0/0:0,114,255:99 0/0:0,36,255:34 0/0:0,15,204:14 0/1:48,3,0:4 0/0:0,36,255:34 0/1:54,0,54:54 0/0:0,36,255:34 0/1:22,0,255:24 0/0:0,78,255:76 0/0:0,54,255:52 0/0:0,138,255:99
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chr12 6981891 . gcacacac gcac 999 . INDEL;DP=868;VDB=0.0389;AF1=0.2646;G3=0.6857,3.641e-07,0.3143;HWE=5.71e-09;AC1=19;DP4=213,238,8,36;MQ=58;FQ=999;PV4=0.00019,1.8e-34,1,0.48 GT:PL:GQ 1/1:79,12,0:6 1/1:151,9,0:4 1/1:140,24,0:17 1/1:92,12,0:6 1/1:58,9,0:4 1/1:225,15,0:8 0/1:110,6,0:4 0/1:68,6,0:4 1/1:54,9,0:4 0/1:65,6,0:4 1/1:117,24,0:17 0/0:0,63,255:64 0/0:0,36,255:37 0/0:0,0,0:3 0/0:0,42,255:43 0/0:0,39,255:40 0/0:0,69,255:70 0/0:0,72,255:73 0/0:0,60,255:61 0/0:0,54,255:55 0/0:0,45,255:46 0/0:0,75,255:76 0/0:0,123,255:99 0/0:0,6,120:8 0/0:0,84,255:85 0/0:0,93,255:94 0/0:0,45,255:46 0/0:0,21,255:22 0/0:0,12,137:14 0/0:0,45,255:46 0/0:0,18,255:20 0/0:0,39,255:40 0/0:0,30,255:31 0/0:0,81,255:82 0/0:0,57,255:58 0/0:0,144,255:99
chr12 6981893 . acacactcacac acacac 999 . INDEL;DP=864;VDB=0.0390;AF1=0.07373;G3=0.8889,2.216e-06,0.1111;HWE=0.000622;AC1=5;DP4=219,243,2,8;MQ=58;FQ=999;PV4=0.11,0.018,1,1 GT:PL:GQ 0/1:117,6,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 1/1:241,15,0:3 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/1:151,9,0:6 0/0:0,0,0:9 0/0:0,0,0:9 0/0:0,63,255:71 0/0:0,36,255:44 0/0:0,0,0:9 0/0:0,45,255:53 0/0:0,42,255:50 0/0:0,78,255:86 0/0:0,75,255:83 0/0:0,66,255:74 0/0:0,54,255:62 0/0:0,45,255:53 0/0:0,78,255:86 0/0:0,126,255:99 0/0:0,6,120:14 0/0:0,84,255:92 0/0:0,90,255:98 0/0:0,45,255:53 0/0:0,24,255:32 0/0:0,15,208:23 0/0:0,45,255:53 0/0:0,18,255:26 0/0:0,39,255:47 0/0:0,30,255:38 0/0:0,81,255:89 0/0:0,48,255:56 0/0:0,154,255:99
chr12 6981895 . acactcac acac 999 . INDEL;DP=818;VDB=0.0394;AF1=0.2742;G3=0.6857,6.662e-07,0.3143;HWE=2.25e-09;AC1=20;DP4=222,244,15,41;MQ=58;FQ=999;PV4=0.0042,3.1e-10,1,1 GT:PL:GQ 1/1:202,12,0:6 1/1:151,9,0:4 1/1:255,27,0:20 1/1:255,27,0:20 1/1:151,9,0:4 1/1:226,15,0:8 0/1:110,6,0:4 1/1:148,9,0:4 1/1:177,12,0:6 0/1:105,6,0:4 1/1:255,36,0:29 0/0:0,66,255:67 0/0:0,36,255:37 0/0:0,0,0:3 0/0:0,45,255:46 0/0:0,45,255:46 0/0:0,75,255:76 0/0:0,75,255:76 0/0:0,66,255:67 0/0:0,60,255:61 0/0:0,48,255:49 0/0:0,75,255:76 0/0:0,126,255:99 0/0:0,6,120:8 0/0:0,84,255:85 0/0:0,87,255:88 0/0:0,45,255:46 0/0:0,24,255:25 0/0:0,15,163:16 0/0:0,45,255:46 0/0:0,18,255:19 0/0:0,42,255:43 0/0:0,30,255:31 0/0:0,84,255:85 0/0:0,48,255:49 0/0:0,154,255:99
chr12 6981899 . tcacacac tcacac 102 . INDEL;DP=639;VDB=0.0402;AF1=0.0211;AC1=1;DP4=215,249,4,6;MQ=58;FQ=102;PV4=0.76,0.011,7.5e-42,0.42 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,57,255:71 0/0:0,39,255:53 0/0:0,0,0:14 0/0:0,54,255:68 0/0:0,42,255:56 0/1:153,0,255:99 0/0:0,75,255:89 0/0:0,75,255:89 0/0:0,54,255:68 0/0:0,57,255:71 0/0:0,78,255:92 0/0:0,126,255:99 0/0:0,6,119:20 0/0:0,81,255:95 0/0:0,90,255:99 0/0:0,45,255:59 0/0:0,24,212:38 0/0:0,15,132:29 0/0:0,45,255:59 0/0:0,18,255:32 0/0:0,48,255:62 0/0:0,30,255:44 0/0:0,81,255:95 0/0:0,51,255:65 0/0:0,144,255:99
chr12 6981947 . G A 999 . DP=936;VDB=0.0289;AF1=0.01432;AC1=1;DP4=342,519,6,6;MQ=60;FQ=999;PV4=0.56,0.17,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,66,255:81 0/0:0,63,255:78 0/0:0,72,255:87 0/0:0,120,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,30,229:45 0/0:0,45,255:60 0/1:228,0,210:99 0/0:0,33,246:48 0/0:0,105,255:99 0/0:0,66,255:81 0/0:0,66,255:81 0/0:0,0,0:15 0/0:0,93,255:99 0/0:0,72,255:87 0/0:0,105,255:99 0/0:0,69,255:84 0/0:0,69,255:84 0/0:0,81,255:96 0/0:0,51,255:66 0/0:0,99,255:99 0/0:0,126,255:99 0/0:0,12,128:27 0/0:0,123,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,96,255:99 0/0:0,63,255:78 0/0:0,78,255:93 0/0:0,90,255:99 0/0:0,18,177:33 0/0:0,39,255:54 0/0:0,30,255:45 0/0:0,66,255:81 0/0:0,60,255:75 0/0:0,175,255:99
chr12 6981982 . T C 105 . DP=935;VDB=0.0240;AF1=0.02873;AC1=2;DP4=303,520,2,11;MQ=60;FQ=105;PV4=0.15,5.3e-08,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,60,255:72 0/0:0,84,255:96 0/0:0,72,255:84 0/0:0,75,255:87 0/0:0,93,255:99 0/0:0,51,255:63 0/1:82,0,141:70 0/0:0,48,255:60 0/0:0,54,255:66 0/1:84,0,108:72 0/0:0,117,255:99 0/0:0,108,255:99 0/0:0,60,255:72 0/0:0,0,0:12 0/0:0,81,255:93 0/0:0,72,255:84 0/0:0,81,255:93 0/0:0,66,255:78 0/0:0,60,255:72 0/0:0,48,255:60 0/0:0,60,255:72 0/0:0,90,255:99 0/0:0,84,255:96 0/0:0,9,88:21 0/0:0,114,255:99 0/0:0,123,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,78,255:90 0/0:0,87,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,12,133:24 0/0:0,30,255:42 0/0:0,27,214:39 0/0:0,87,255:99 0/0:0,51,255:63 0/0:0,163,255:99
chr12 6981992 . C T 999 . DP=926;VDB=0.0556;AF1=0.1443;G3=0.7987,0.1156,0.08571;HWE=0.00743;AC1=10;DP4=240,483,60,58;MQ=59;FQ=999;PV4=0.00027,1.2e-05,0.00029,0.02 GT:PL:GQ 0/0:0,69,255:74 0/0:0,81,255:86 0/0:0,69,255:74 0/0:0,78,255:83 0/0:0,99,255:99 0/0:0,51,255:56 0/0:0,42,247:47 0/0:0,54,255:59 0/0:0,60,255:65 0/0:0,39,255:44 0/0:0,132,255:99 1/1:255,108,0:97 0/1:234,0,176:99 0/0:0,0,0:6 0/0:0,63,255:68 0/1:129,0,255:99 0/0:0,61,255:66 1/1:255,69,0:58 1/1:255,45,0:34 0/0:0,39,255:44 0/1:167,0,220:99 0/0:0,87,255:92 0/0:0,90,255:95 0/0:0,12,133:17 0/0:0,111,255:99 0/1:213,0,255:99 0/0:0,111,255:99 0/0:0,81,255:86 0/0:0,90,255:95 0/0:0,102,255:99 0/0:0,6,77:11 0/0:0,33,255:38 0/0:0,27,234:32 0/0:0,81,255:86 0/0:0,48,255:53 0/0:0,141,255:99
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chr12 6982018 . ac aCACGc 999 . INDEL;DP=919;VDB=0.0426;AF1=0.08172;AC1=6;DP4=195,239,6,18;MQ=59;FQ=999;PV4=0.06,3e-13,9.9e-12,0.5 GT:PL:GQ 0/0:0,18,199:26 0/0:0,6,108:14 0/1:9,0,48:4 0/0:9,11,59:10 0/1:241,0,50:64 0/1:174,12,0:4 0/0:0,0,0:8 0/0:0,6,90:14 0/1:16,3,0:6 0/1:13,3,0:4 0/0:4,0,122:5 0/0:0,132,255:99 0/0:0,39,255:47 0/0:0,0,0:8 0/0:0,9,92:17 0/0:0,24,255:32 0/0:0,24,255:32 0/0:0,66,255:74 0/0:0,57,255:65 0/0:0,6,89:14 0/0:0,33,255:41 0/0:0,36,255:44 0/0:0,90,255:98 0/0:0,3,56:11 0/0:0,105,255:99 0/0:0,141,255:99 0/0:0,73,255:81 0/0:0,0,0:8 0/0:0,3,173:11 0/0:0,78,255:86 0/0:11,14,39:11 0/0:0,33,255:41 0/0:0,12,169:20 0/0:0,75,255:83 0/0:0,45,255:53 0/0:0,129,255:99
chr12 6982020 . gcacaca gCAcacaca 999 . INDEL;DP=921;VDB=0.0418;AF1=0.6234;G3=0.2571,0.2331,0.5098;HWE=0.00304;AC1=45;DP4=173,188,127,272;MQ=58;FQ=999;PV4=7.8e-06,1,8.7e-18,1 GT:PL:GQ 1/1:255,57,0:56 1/1:255,69,0:68 1/1:255,75,0:74 1/1:255,99,0:98 1/1:255,45,0:44 1/1:255,39,0:38 1/1:255,36,0:35 1/1:255,51,0:50 1/1:255,45,0:44 1/1:255,42,0:41 1/1:255,132,0:99 0/0:0,123,255:99 0/1:93,0,255:98 0/1:0,0,0:3 1/1:255,48,0:47 0/1:255,0,223:99 1/1:255,45,0:44 0/0:0,63,255:58 0/0:0,57,255:52 1/1:255,57,0:56 0/1:104,0,219:99 0/1:255,0,253:99 0/0:0,84,255:79 1/1:164,9,0:9 0/1:239,0,255:99 0/0:0,129,255:99 0/1:255,0,255:99 1/1:255,36,0:35 1/1:255,72,0:71 0/1:255,0,255:99 1/1:98,6,0:6 0/0:0,36,255:31 0/1:219,0,99:99 0/0:0,72,255:67 0/0:0,42,255:37 0/0:0,120,255:99
chr12 6982022 . ac aCCc 999 . INDEL;DP=941;VDB=0.0415;AF1=0.3405;AC1=24;DP4=202,242,80,172;MQ=59;FQ=999;PV4=0.0004,8.4e-215,0.00014,1 GT:PL:GQ 0/1:101,0,28:34 0/1:104,0,52:58 0/1:84,0,6:12 1/1:98,9,0:5 0/1:82,0,29:35 0/1:52,0,52:51 1/1:97,24,0:18 0/1:90,4,0:4 0/1:70,0,18:24 0/1:68,0,2:9 0/1:86,0,33:39 0/0:0,129,255:99 0/0:0,45,255:45 0/1:0,0,0:3 0/1:55,0,105:55 0/1:41,0,255:41 0/0:0,15,128:15 0/0:0,66,255:66 0/0:0,60,255:60 0/1:68,0,71:68 0/0:0,30,255:30 0/1:69,0,255:69 0/0:0,93,255:93 0/1:32,0,20:25 0/0:0,49,255:49 0/0:0,141,255:99 0/1:29,0,255:29 0/1:72,0,27:33 0/1:80,0,42:48 0/1:45,0,255:45 0/1:1,0,75:4 0/0:0,39,255:39 0/1:16,0,162:16 0/0:0,75,255:75 0/0:0,42,255:42 0/0:0,123,255:99
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chr12 6982026 . atg a 999 . INDEL;DP=950;VDB=0.0416;AF1=0.1034;AC1=7;DP4=204,254,2,9;MQ=59;FQ=999;PV4=0.12,0.012,1,6.8e-06 GT:PL:GQ 0/0:0,3,18:10 0/1:79,0,81:73 0/1:34,0,74:28 0/1:90,0,17:29 0/0:0,12,70:18 0/1:80,0,60:70 0/0:0,3,24:10 0/0:0,3,18:10 0/0:0,6,95:13 0/0:0,3,27:10 0/0:0,15,93:21 0/0:0,132,255:99 0/0:0,51,255:57 0/0:0,0,0:7 0/1:8,0,255:4 0/0:0,27,255:33 0/1:20,0,118:14 0/0:0,72,255:78 0/0:0,60,255:66 0/1:44,0,106:38 0/0:0,36,255:42 0/0:0,7,255:14 0/0:0,99,255:99 0/0:0,9,105:16 0/0:0,111,255:99 0/0:0,138,255:99 0/0:0,84,255:90 0/0:0,15,213:21 0/0:0,3,53:10 0/0:0,54,255:60 0/0:0,18,189:24 0/0:0,42,255:48 0/0:0,15,229:21 0/0:0,72,255:78 0/0:0,42,255:48 0/0:0,126,255:99
chr12 6982073 . T C 999 . DP=849;VDB=0.0274;AF1=0.6385;G3=0.2446,0.2417,0.5138;HWE=0.00557;AC1=46;DP4=159,202,124,290;MQ=51;FQ=999;PV4=5.3e-05,0.3,1.5e-29,1 GT:PL:GQ 1/1:255,45,0:44 1/1:255,60,0:59 1/1:255,87,0:86 1/1:255,108,0:99 1/1:255,66,0:65 1/1:255,54,0:53 1/1:225,27,0:26 1/1:255,69,0:68 1/1:211,45,0:44 1/1:255,48,0:47 1/1:255,102,0:99 0/0:0,87,255:82 0/1:148,0,177:99 0/1:0,0,0:3 1/1:224,36,0:35 0/1:58,0,255:63 1/1:255,54,0:53 0/0:0,75,255:70 0/0:0,36,253:31 1/1:187,24,0:23 0/1:71,0,159:76 0/1:183,0,255:99 0/0:0,135,255:99 1/1:159,15,0:15 0/1:116,0,255:99 0/0:0,138,255:99 0/1:170,0,240:99 1/1:255,57,0:56 1/1:255,75,0:74 0/1:255,0,255:99 1/1:255,36,0:35 0/0:0,36,255:31 0/1:165,0,110:99 0/1:0,1,250:6 0/0:0,48,255:43 0/0:0,108,255:99
chr12 6982080 . T G 94.4 . DP=869;VDB=0.0100;AF1=0.07266;AC1=5;DP4=275,485,16,21;MQ=50;FQ=94.7;PV4=0.39,1.8e-25,0.00019,3.3e-10 GT:PL:GQ 0/1:36,0,205:28 0/0:0,57,255:65 0/0:0,64,255:72 0/0:0,38,255:46 0/0:0,60,255:68 0/0:0,57,255:65 0/0:0,27,209:35 0/0:0,45,255:53 0/0:0,39,245:47 0/0:0,45,255:53 0/0:0,96,255:99 0/0:0,84,255:92 0/0:0,42,255:50 0/0:0,0,0:9 0/1:12,0,186:5 0/0:0,72,255:80 0/0:0,42,232:50 0/0:0,69,255:77 0/0:0,42,214:50 0/1:13,0,156:6 0/0:0,21,148:29 0/0:0,61,255:69 0/0:0,138,255:99 0/0:0,15,158:23 0/0:0,94,255:99 0/0:0,144,255:99 0/0:0,65,255:73 0/0:0,35,244:43 0/1:56,0,255:48 0/0:0,100,255:99 0/1:63,0,203:55 0/0:0,45,255:53 0/1:10,0,201:4 0/0:0,45,255:53 0/0:0,54,255:62 0/0:0,114,255:99
chr12 6982086 . ac aCATGc 999 . INDEL;DP=878;VDB=0.0388;AF1=0.7031;G3=0.2168,0.06856,0.7147;HWE=0.00316;AC1=51;DP4=45,35,16,29;MQ=56;FQ=999;PV4=0.04,1e-33,0.42,2.2e-11 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0:3 0/1:0,3,11:4 1/1:0,0,0:3 1/1:27,6,0:7 1/1:81,15,0:16 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:16,3,0:5 1/1:0,0,0:3 1/1:25,6,0:7 1/1:0,0,0:3 1/1:51,12,0:13 1/1:0,0,0:3 1/1:0,0,0:3 1/1:7,0,0:3 1/1:26,3,0:5 1/1:30,3,0:5 1/1:29,3,0:5 1/1:32,3,0:5 1/1:77,9,0:10 0/1:0,3,4:2 1/1:32,3,0:5 1/1:47,6,0:7 1/1:0,0,0:3 1/1:38,9,0:10 1/1:40,5,0:7 1/1:64,2,0:4 0/1:0,3,4:2 1/1:17,3,0:5 1/1:60,15,0:16 1/1:0,0,0:3 0/0:0,12,255:7 0/1:16,0,155:23 0/0:0,39,255:32 0/0:0,60,255:53 0/0:0,84,255:77
chr12 6982087 . c cAT 999 . INDEL;DP=878;VDB=0.0389;AF1=0.8755;G3=0.0909,0.06254,0.8466;HWE=0.00101;AC1=63;DP4=43,34,167,286;MQ=52;FQ=999;PV4=0.0023,1,8.8e-05,0.43 GT:PL:GQ 1/1:130,18,0:23 1/1:255,26,0:31 1/1:255,45,0:50 1/1:255,66,0:71 1/1:255,45,0:50 1/1:246,36,0:41 1/1:229,21,0:26 1/1:255,33,0:38 1/1:127,15,0:20 1/1:255,24,0:29 1/1:255,54,0:59 1/1:255,90,0:95 1/1:191,27,0:32 1/1:0,0,0:6 1/1:85,3,0:9 1/1:255,51,0:56 1/1:71,21,0:26 1/1:255,78,0:83 1/1:229,48,0:53 1/1:97,9,0:15 1/1:89,8,0:14 1/1:255,51,0:56 1/1:255,129,0:99 1/1:0,0,0:6 1/1:255,75,0:80 1/1:255,134,0:99 1/1:255,63,0:68 1/1:244,18,0:23 1/1:255,116,92:29 1/1:255,69,0:74 1/1:0,0,0:6 0/1:255,0,255:99 0/1:42,0,132:53 0/0:0,31,255:20 0/0:0,63,255:52 0/0:0,78,255:67
chr12 6982088 . G A 11.4 . DP=818;VDB=0.0075;AF1=0.0407;AC1=3;DP4=254,424,2,14;MQ=49;FQ=11.6;PV4=0.063,6.5e-19,1,0.21 GT:PL:GQ 0/0:0,42,197:53 0/0:0,48,255:59 0/0:0,62,255:73 0/0:0,117,255:99 0/0:0,48,230:59 0/0:0,48,213:59 0/0:0,27,210:38 0/0:0,60,255:71 0/0:0,57,245:68 0/0:0,27,225:38 0/0:0,87,255:98 0/0:0,90,255:99 0/0:0,27,178:38 0/0:0,0,0:11 0/0:10,0,159:4 0/0:0,51,255:62 0/0:0,18,50:29 0/0:0,66,255:77 0/0:0,48,225:59 0/0:5,0,90:7 0/0:0,12,106:23 0/0:0,81,255:92 0/0:0,126,255:99 0/0:0,9,92:20 0/0:0,96,255:99 0/0:0,148,255:99 0/0:0,63,255:74 0/0:0,19,194:30 0/1:39,0,187:28 0/0:0,93,255:99 0/0:4,0,158:8 0/0:0,48,255:59 0/1:29,0,174:18 0/0:0,45,255:56 0/0:0,63,255:74 0/0:0,117,255:99
chr12 6982088 . gcacacac gcacac 206 . INDEL;DP=818;VDB=0.0387;AF1=0.03687;AC1=2;DP4=49,46,5,10;MQ=55;FQ=206;PV4=0.27,0.21,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,11:14 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,6,31:17 0/0:0,6,62:17 0/0:0,0,0:11 0/0:0,6,7:17 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,25:14 0/0:0,15,116:26 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,4:14 0/0:0,3,17:14 0/0:0,3,56:14 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,21,66:32 0/0:0,6,43:17 0/0:0,3,4:14 0/0:0,0,0:11 0/0:0,6,42:17 0/0:0,0,0:11 0/0:0,24,255:35 0/0:0,12,133:23 0/0:0,36,255:47 0/0:0,63,255:74 0/1:255,0,255:99
chr12 6982096 . G A 89.6 . DP=856;VDB=0.0178;AF1=0.07433;AC1=5;DP4=246,413,10,19;MQ=49;FQ=90;PV4=0.85,3.7e-37,0.38,1 GT:PL:GQ 0/0:0,33,166:41 0/0:0,72,255:80 0/0:0,114,255:99 0/0:0,90,255:98 0/0:0,42,222:50 0/0:0,63,218:71 0/0:0,39,214:47 0/0:0,75,245:83 0/1:46,0,113:38 0/0:0,24,191:32 0/0:0,102,255:99 0/0:0,84,255:92 0/0:0,21,118:29 0/0:0,0,0:8 0/1:38,2,17:25 0/0:0,39,255:47 0/0:0,3,26:11 0/0:0,63,255:71 0/0:0,57,238:65 0/1:39,0,22:30 0/0:0,3,26:11 0/0:0,93,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,12,127:20 0/0:0,108,255:99 0/0:0,154,255:99 0/0:0,84,255:92 0/0:0,39,198:47 0/0:0,7,189:15 0/1:39,0,255:31 0/0:0,4,117:12 0/0:0,45,255:53 0/1:21,0,107:13 0/0:0,39,255:47 0/0:0,60,255:68 0/0:0,126,255:99
chr12 6982098 . acacacacgcacacacgcacaca acacacacgcacaca 53.5 . INDEL;DP=863;VDB=0.0407;AF1=0.126;AC1=9;DP4=57,74,6,3;MQ=53;FQ=54;PV4=0.3,4.3e-05,0.069,0.0048 GT:PL:GQ 0/0:0,9,11:15 0/0:0,9,16:15 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,6,7:12 0/0:0,3,4:9 0/0:9,6,0:4 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,18,179:24 0/1:19,0,22:14 0/0:0,0,0:6 0/0:0,3,4:9 0/1:20,0,43:15 0/1:57,6,0:7 0/0:0,9,90:15 0/0:0,30,251:36 0/0:0,0,0:6 0/0:0,0,0:6 0/0:0,6,88:12 0/0:0,18,229:24 0/0:0,0,0:6 0/0:0,12,139:18 0/0:0,30,163:36 0/0:0,18,210:24 0/0:0,0,0:6 0/1:10,1,0:5 0/0:0,9,61:15 0/1:44,6,0:7 0/0:0,21,255:27 0/0:0,9,88:15 0/0:0,33,255:39 0/0:0,48,255:54 0/0:0,90,255:96
chr12 6982100 . A T 3.99 . DP=860;VDB=0.0152;AF1=0.01494;AC1=1;DP4=221,351,0,6;MQ=51;FQ=4.03;PV4=0.087,0.035,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,33,118:50 0/0:0,45,208:62 0/0:0,54,194:71 0/0:0,69,184:86 0/0:0,33,124:50 0/0:0,45,154:62 0/0:0,27,114:44 0/0:0,30,161:47 0/1:47,0,51:30 0/0:0,12,92:29 0/0:0,66,210:83 0/0:0,84,255:99 0/0:0,15,98:32 0/0:0,0,0:17 0/0:0,21,86:38 0/0:0,42,255:59 0/0:0,3,26:20 0/0:0,60,253:77 0/0:0,48,222:65 0/0:0,6,41:23 0/0:0,6,28:23 0/0:0,93,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,12,79:29 0/0:0,114,255:99 0/0:0,157,255:99 0/0:0,87,255:99 0/0:0,30,142:47 0/0:0,6,23:23 0/0:0,60,255:77 0/0:0,9,39:26 0/0:0,42,255:59 0/0:0,27,165:44 0/0:0,45,255:62 0/0:0,66,255:83 0/0:0,120,255:99
chr12 6982106 . G T 101 . DP=815;VDB=0.0304;AF1=0.08113;AC1=6;DP4=192,276,4,16;MQ=53;FQ=102;PV4=0.066,2.3e-12,0.17,1.3e-07 GT:PL:GQ 0/0:0,9,70:17 0/0:0,9,22:17 0/1:48,0,114:40 0/1:59,0,105:51 0/1:10,0,61:4 0/0:6,15,70:17 0/0:0,15,99:23 0/1:37,0,54:29 0/0:0,39,196:47 0/1:30,0,23:22 0/1:14,0,98:7 0/0:0,69,255:77 0/0:0,24,175:32 0/0:0,0,0:8 0/0:0,21,129:29 0/0:0,33,255:41 0/0:0,3,31:11 0/0:0,66,255:74 0/0:0,39,203:47 0/0:0,9,63:17 0/0:0,6,68:14 0/0:0,44,255:52 0/0:0,138,255:99 0/0:0,12,128:20 0/0:0,79,255:87 0/0:0,151,255:99 0/0:0,52,255:60 0/0:0,24,140:32 0/0:0,30,187:38 0/0:0,63,255:71 0/0:0,24,199:32 0/0:0,33,255:41 0/0:0,33,229:41 0/0:0,39,255:47 0/0:0,60,255:68 0/0:0,129,255:99
chr12 6982108 . acacacgcac aCACGCACACACGCACGcacacgcac 999 . INDEL;DP=829;VDB=0.0369;AF1=0.2166;G3=0.728,0.0008459,0.2711;HWE=0.000179;AC1=15;DP4=66,85,32,46;MQ=52;FQ=999;PV4=0.78,1,2.5e-05,1 GT:PL:GQ 0/0:0,9,11:12 0/0:13,12,11:4 0/0:11,12,0:2 0/0:0,0,0:4 0/1:10,3,0:4 0/0:4,3,0:3 0/0:0,6,7:9 0/1:28,3,0:7 0/0:9,9,9:4 0/1:11,3,0:4 0/0:4,3,0:3 0/0:0,27,255:30 0/0:55,67,165:15 0/0:0,0,0:4 0/0:169,169,169:4 0/1:81,70,109:9 0/0:114,114,114:4 0/0:0,18,149:21 0/0:0,36,255:39 0/0:72,72,72:4 0/0:0,6,95:9 0/0:16,25,150:12 0/0:0,27,255:30 0/0:0,0,0:4 0/0:69,84,246:18 0/0:0,30,241:33 0/0:13,34,242:24 0/1:155,121,115:5 1/1:255,46,18:19 0/0:61,74,196:16 1/1:250,33,8:16 0/0:0,24,255:27 0/0:67,76,145:12 0/0:0,36,255:39 0/0:0,57,255:60 0/0:0,84,255:87
chr12 6982112 . acgcac acac 77.6 . INDEL;DP=800;VDB=0.0355;AF1=0.07678;AC1=5;DP4=87,104,6,3;MQ=55;FQ=78;PV4=0.31,0.0013,1,0.091 GT:PL:GQ 0/0:0,9,11:17 0/0:0,9,16:17 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,6,7:14 0/0:0,3,4:11 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,0,0:8 0/0:0,30,255:38 0/0:0,15,173:23 0/0:0,0,0:8 0/0:11,17,52:14 0/0:0,9,107:17 0/0:0,12,101:20 0/0:0,24,208:32 0/0:0,36,255:44 0/0:0,9,84:17 0/0:0,15,173:23 0/1:13,0,156:6 0/0:0,27,255:35 0/1:78,6,0:9 0/1:31,0,240:23 0/0:0,42,255:50 0/1:45,0,255:37 0/0:0,9,90:17 0/0:0,18,103:26 0/0:0,18,191:26 0/0:0,3,17:11 0/0:0,27,255:35 0/0:0,9,97:17 0/0:0,45,255:53 0/0:0,60,255:68 0/0:0,84,255:92
chr12 6982114 . gcac gCACGCACACAcac 3.72 . INDEL;DP=783;VDB=0.0362;AF1=0.0903;AC1=6;DP4=93,107,6,7;MQ=56;FQ=3.96;PV4=1,3.7e-05,0.31,1 GT:PL:GQ 0/0:0,9,11:19 0/0:0,6,8:16 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,6,7:16 0/0:0,3,4:13 0/0:9,6,0:7 0/0:0,0,0:10 0/0:0,0,0:10 0/0:0,30,255:40 0/0:0,15,196:25 0/0:0,0,0:10 0/1:19,0,34:10 0/1:19,0,95:10 0/0:0,9,90:19 0/0:0,27,226:37 0/0:0,36,255:46 0/0:4,0,72:7 0/0:0,15,182:25 0/0:0,15,216:25 0/0:0,30,255:40 0/0:0,0,0:10 0/0:0,7,252:17 0/0:0,45,255:55 0/0:0,24,255:34 0/1:26,0,75:16 0/0:0,4,81:14 0/0:0,5,219:15 0/1:21,3,0:8 0/0:0,27,255:37 0/0:0,9,121:19 0/0:0,45,255:55 0/0:0,34,255:44 0/0:0,102,255:99
chr12 6982121 . T C 999 . DP=735;VDB=0.0259;AF1=0.04319;AC1=3;DP4=259,368,7,20;MQ=51;FQ=999;PV4=0.16,7.8e-15,0.014,1 GT:PL:GQ 0/1:91,0,145:81 0/0:0,30,189:40 0/0:0,96,255:99 0/1:95,0,103:85 0/0:0,12,73:22 0/0:0,33,187:43 0/0:0,30,203:40 0/0:0,57,199:67 0/1:96,0,84:85 0/0:0,12,92:22 0/0:0,51,197:61 0/0:0,66,255:76 0/0:0,36,228:46 0/0:0,0,0:11 0/0:0,42,255:52 0/0:0,66,255:76 0/0:0,27,237:37 0/0:0,60,255:70 0/0:0,48,244:58 0/0:0,33,232:43 0/0:0,24,217:34 0/0:0,75,255:85 0/0:0,123,255:99 0/0:0,9,95:19 0/0:0,90,255:99 0/0:0,135,255:99 0/0:0,75,255:85 0/0:0,33,218:43 0/0:0,72,255:82 0/0:0,105,255:99 0/0:0,45,230:55 0/0:0,42,255:52 0/0:0,39,255:49 0/0:0,45,255:55 0/0:0,66,255:76 0/0:0,108,255:99
chr12 6982126 . accattc ac 104 . INDEL;DP=753;VDB=0.0357;AF1=0.04277;G3=0.926,8.976e-06,0.07399;HWE=0.0257;AC1=3;DP4=119,146,2,2;MQ=57;FQ=105;PV4=1,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:11 0/0:0,3,13:14 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/1:33,3,0:13 0/1:148,9,0:8 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,0,0:11 0/0:0,48,255:59 0/0:0,21,187:32 0/0:0,0,0:11 0/0:0,18,170:29 0/0:0,21,203:32 0/0:0,30,226:41 0/0:0,48,255:59 0/0:0,39,255:50 0/0:0,18,176:29 0/0:0,24,240:35 0/0:0,27,253:38 0/0:0,39,255:50 0/0:0,6,68:17 0/0:0,30,237:41 0/0:0,57,255:68 0/0:0,33,255:44 0/0:0,15,150:26 0/0:0,27,190:38 0/0:0,33,251:44 0/0:0,3,25:14 0/0:0,36,255:47 0/0:0,9,90:20 0/0:0,51,255:62 0/0:0,81,255:92 0/0:0,78,255:89
chr12 6982133 . acacactcaca acaca 157 . INDEL;DP=767;VDB=0.0382;AF1=0.01902;AC1=1;DP4=131,170,4,1;MQ=57;FQ=157;PV4=0.17,0.16,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,0,0:14 0/0:0,3,20:17 0/0:0,9,14:23 0/0:0,0,0:14 0/0:0,6,110:20 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,0,0:14 0/0:0,3,4:17 0/0:0,39,255:53 0/0:0,24,255:38 0/0:0,0,0:14 0/0:0,18,249:32 0/0:0,27,255:41 0/0:0,39,255:53 0/0:0,33,255:47 0/0:0,30,255:44 0/0:0,33,255:47 0/0:0,24,255:38 0/0:0,30,255:44 0/0:0,48,255:62 0/0:0,6,107:20 0/0:0,45,255:59 0/0:0,60,255:74 0/0:0,45,255:59 0/0:0,27,255:41 0/0:0,42,255:56 0/0:0,36,255:50 0/0:0,15,218:29 0/0:0,36,255:50 0/1:209,0,90:99 0/0:0,57,255:71 0/0:0,75,255:89 0/0:0,87,255:99
chr12 6982135 . acactcac aCACTcactcac 999 . INDEL;DP=774;VDB=0.0385;AF1=0.296;G3=0.6857,1.522e-07,0.3143;HWE=5.76e-10;AC1=21;DP4=134,160,17,58;MQ=58;FQ=999;PV4=0.00034,1.5e-24,1,1 GT:PL:GQ 1/1:203,18,0:12 1/1:156,24,0:17 1/1:252,51,0:44 1/1:196,27,0:20 0/1:60,3,0:5 1/1:208,12,0:6 1/1:129,12,0:6 1/1:175,18,0:12 1/1:126,18,0:12 1/1:134,12,0:6 1/1:233,30,0:23 0/0:0,45,255:46 0/0:0,24,255:25 0/0:0,0,0:3 0/0:0,18,244:19 0/0:0,24,255:25 0/0:0,45,255:46 0/0:0,33,255:34 0/0:0,18,221:19 0/0:0,33,255:34 0/0:0,24,255:25 0/0:0,30,255:31 0/0:0,48,255:49 0/0:0,6,85:8 0/0:0,42,255:43 0/0:0,60,255:61 0/0:0,42,255:43 0/0:0,30,255:31 0/0:0,39,255:40 0/0:0,36,255:37 0/0:0,12,141:13 0/0:0,36,255:37 0/0:0,9,131:10 0/0:0,57,255:58 0/0:0,75,255:76 0/0:0,96,255:97
chr12 6982139 . tcaca tCACAcaca 999 . INDEL;DP=786;VDB=0.0389;AF1=0.3034;G3=0.6857,4.336e-07,0.3143;HWE=2.84e-10;AC1=22;DP4=188,231,27,96;MQ=57;FQ=999;PV4=3.4e-06,1,1.1e-08,1 GT:PL:GQ 1/1:255,33,0:26 1/1:255,33,0:26 1/1:255,81,0:74 1/1:255,42,0:35 0/1:60,3,0:5 1/1:208,12,0:6 1/1:255,30,0:23 1/1:255,33,0:26 1/1:255,36,0:29 1/1:221,15,0:9 1/1:255,51,0:44 0/0:0,69,255:70 0/0:0,27,255:28 0/0:0,0,0:3 0/0:0,21,255:22 0/0:0,51,255:52 0/0:0,48,255:49 0/0:0,45,255:46 0/0:0,33,255:34 0/0:0,33,255:34 0/0:0,30,255:31 0/0:0,51,255:52 0/0:0,111,255:99 0/0:0,6,89:7 0/0:0,84,255:85 0/0:0,135,255:99 0/0:0,63,255:64 0/0:0,33,255:34 0/0:0,51,255:52 0/0:0,54,255:55 0/0:0,21,209:22 0/0:0,39,255:40 0/0:0,9,151:10 0/0:0,57,255:58 0/0:0,78,255:79 0/0:0,108,255:99
chr12 6982143 . atg aCACATtg 999 . INDEL;DP=816;VDB=0.0387;AF1=0.2062;G3=0.7065,0.1492,0.1444;HWE=0.0065;AC1=15;DP4=213,260,15,37;MQ=57;FQ=999;PV4=0.027,8.8e-36,1,1 GT:PL:GQ 1/1:148,18,0:10 0/1:69,0,42:51 1/1:145,30,0:21 1/1:141,21,0:12 0/0:1,0,84:4 0/1:46,0,24:32 1/1:94,9,0:3 0/1:113,0,31:40 0/1:55,0,6:15 1/1:78,9,0:3 0/1:148,0,9:18 0/0:0,75,255:78 0/0:0,33,255:36 0/0:0,0,0:4 0/0:0,30,255:33 0/0:0,57,255:60 0/0:0,48,255:51 0/0:0,57,255:60 0/0:0,36,255:39 0/0:0,39,255:42 0/0:0,33,255:36 0/0:0,60,255:63 0/0:0,111,255:99 0/0:0,6,86:9 0/0:0,84,255:87 0/0:0,144,255:99 0/0:0,63,255:66 0/0:0,33,255:36 0/0:0,63,255:66 0/0:0,57,255:60 0/0:0,45,255:48 0/0:0,42,255:45 0/0:0,12,170:15 0/0:0,60,255:63 0/0:0,87,255:90 0/0:0,111,255:99
chr12 6982248 . T A 116 . DP=657;VDB=0.0135;AF1=0.0287;AC1=2;DP4=190,409,2,15;MQ=60;FQ=116;PV4=0.11,2.1e-25,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,39,255:51 0/0:0,45,255:57 0/0:0,36,255:48 0/1:89,0,178:77 0/0:0,42,255:54 0/0:0,27,154:39 0/0:0,21,149:33 0/0:0,48,255:60 0/0:0,51,199:63 0/1:88,0,17:35 0/0:0,78,255:90 0/0:0,75,255:87 0/0:0,39,229:51 0/0:0,0,0:12 0/0:0,45,255:57 0/0:0,78,255:90 0/0:0,45,255:57 0/0:0,66,255:78 0/0:0,57,255:69 0/0:0,39,255:51 0/0:0,24,239:36 0/0:0,93,255:99 0/0:0,99,255:99 0/0:0,9,107:21 0/0:0,102,255:99 0/0:0,81,255:93 0/0:0,66,255:78 0/0:0,60,255:72 0/0:0,81,255:93 0/0:0,63,255:75 0/0:0,42,255:54 0/0:0,30,253:42 0/0:0,27,221:39 0/0:0,51,255:63 0/0:0,42,255:54 0/0:0,66,255:78
chr12 6982273 . G T 107 . DP=579;VDB=0.0404;AF1=0.01448;AC1=1;DP4=208,314,5,4;MQ=60;FQ=107;PV4=0.49,0.064,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,36,241:51 0/0:0,12,124:27 0/0:0,6,253:21 0/0:0,36,222:51 0/0:0,42,255:57 0/0:0,27,190:42 0/0:0,15,128:30 0/0:0,36,255:51 0/0:0,45,233:60 0/0:0,18,139:33 0/0:0,54,255:69 0/0:0,72,255:87 0/0:0,30,233:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,48,255:63 0/0:0,66,255:81 0/0:0,45,255:60 0/0:0,57,255:72 0/0:0,42,255:57 0/0:0,24,227:39 0/0:0,18,183:33 0/0:0,81,255:96 0/0:0,84,255:99 0/0:0,12,128:27 0/0:0,81,255:96 0/0:0,93,255:99 0/0:0,57,255:72 0/1:152,0,156:99 0/0:0,39,255:54 0/0:0,78,255:93 0/0:0,27,228:42 0/0:0,27,244:42 0/0:0,36,255:51 0/0:0,48,255:63 0/0:0,30,245:45 0/0:0,63,255:78
chr12 6982289 . CGG CG 999 . INDEL;DP=522;VDB=0.0410;AF1=0.07323;AC1=5;DP4=179,203,29,29;MQ=60;FQ=999;PV4=0.67,1,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,24,168:32 0/0:0,15,133:23 0/0:0,33,203:41 0/0:0,18,140:26 0/0:0,30,210:38 0/0:0,33,166:41 0/0:0,6,60:14 0/0:0,27,189:35 0/0:0,39,207:47 0/0:0,9,69:17 0/0:0,36,209:44 0/0:0,66,255:74 0/0:0,27,202:35 0/0:0,0,0:9 0/0:0,7,226:15 0/0:0,48,255:56 0/0:0,48,255:56 0/0:0,51,255:59 0/0:0,30,192:38 0/0:0,33,212:41 0/0:0,15,117:23 0/0:0,57,255:65 1/1:255,78,0:64 0/0:0,9,78:17 0/1:146,0,197:99 0/1:197,0,218:99 0/1:147,0,186:99 0/0:0,21,165:29 0/0:0,33,207:41 0/0:0,66,255:74 0/0:0,27,196:35 0/0:0,21,167:29 0/0:0,42,251:50 0/0:0,45,252:53 0/0:0,21,159:29 0/0:0,48,255:56
chr12 6982298 . G A 999 . DP=514;VDB=0.0404;AF1=0.9712;G3=0.02857,1.677e-07,0.9714;HWE=0.00268;AC1=70;DP4=4,9,205,214;MQ=60;FQ=999;PV4=0.26,7.8e-20,1,1 GT:PL:GQ 1/1:115,24,0:36 1/1:126,21,0:33 1/1:167,27,0:39 1/1:143,24,0:36 1/1:140,24,0:36 1/1:122,27,0:39 1/1:70,12,0:24 1/1:138,21,0:33 1/1:130,24,0:36 1/1:40,6,0:18 1/1:183,36,0:48 1/1:219,60,0:72 1/1:120,21,0:33 1/1:0,0,0:12 1/1:181,39,0:51 1/1:200,45,0:57 1/1:184,42,0:54 1/1:218,51,0:63 1/1:151,27,0:39 1/1:163,33,0:45 1/1:115,21,0:33 1/1:191,45,0:57 1/1:212,84,0:96 1/1:73,12,0:24 1/1:238,72,0:84 1/1:242,93,0:99 1/1:229,63,0:75 1/1:153,24,0:36 1/1:165,36,0:48 1/1:231,75,0:87 1/1:141,24,0:36 1/1:150,27,0:39 1/1:184,42,0:54 1/1:191,39,0:51 0/0:0,39,255:21 1/1:186,36,0:48
chr12 6982304 . C G 50.6 . DP=512;VDB=0.0103;AF1=0.01448;AC1=1;DP4=221,214,1,10;MQ=60;FQ=50.7;PV4=0.011,1.5e-14,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,27,210:42 0/0:0,24,207:39 0/0:0,27,195:42 0/0:0,24,215:39 0/0:0,24,191:39 0/0:0,30,184:45 0/0:0,9,111:24 0/0:0,21,170:36 0/0:0,30,227:45 0/0:0,6,55:21 0/0:0,36,255:51 0/0:0,60,255:75 0/0:0,30,243:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,42,255:57 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,27,232:42 0/0:0,30,251:45 0/0:0,21,167:36 0/1:96,0,54:74 0/0:0,90,255:99 0/0:0,15,142:30 0/0:0,72,255:87 0/0:0,90,255:99 0/0:0,57,255:72 0/0:0,21,205:36 0/0:0,33,216:48 0/0:0,81,255:96 0/0:0,30,246:45 0/0:0,30,243:45 0/0:0,39,255:54 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57 0/0:0,42,255:57
chr12 6982318 . T C 999 . DP=517;VDB=0.0315;AF1=0.2874;G3=0.7059,5.147e-08,0.2941;HWE=2.37e-10;AC1=21;DP4=188,154,38,41;MQ=60;FQ=999;PV4=0.32,1.3e-33,1,1 GT:PL:GQ 1/1:124,30,0:23 1/1:112,18,0:11 1/1:130,24,0:17 1/1:106,21,0:14 1/1:150,30,0:23 1/1:118,21,0:14 1/1:71,12,0:6 1/1:112,21,0:14 1/1:128,24,0:17 0/0:0,0,0:3 1/1:162,33,0:26 0/0:0,51,255:52 0/0:0,33,252:34 0/0:0,0,0:3 0/0:0,36,248:37 0/0:0,39,255:40 0/0:0,48,255:49 0/0:0,45,255:46 0/0:0,24,215:25 0/0:0,21,150:22 0/0:0,36,241:37 0/0:0,24,177:25 0/0:0,93,255:94 0/0:0,27,189:28 0/0:0,57,255:58 0/0:0,87,255:88 0/0:0,57,255:58 0/0:0,27,197:28 0/0:0,39,229:40 0/0:0,69,255:70 0/0:0,27,188:28 0/0:0,24,209:25 0/0:0,39,255:40 0/0:0,45,255:46 0/0:0,45,230:46 0/0:0,33,211:34
chr12 6982347 . G C 999 . DP=534;VDB=0.0390;AF1=0.2549;AC1=18;DP4=161,205,44,45;MQ=60;FQ=999;PV4=0.41,1,0.26,0.36 GT:PL:GQ 0/0:0,39,255:41 0/0:0,33,254:35 0/0:0,30,255:32 0/0:0,36,255:38 0/0:0,42,255:44 0/0:0,21,181:23 0/0:0,18,147:20 0/0:0,18,175:20 0/0:0,27,231:29 0/0:0,21,182:23 0/0:0,54,255:56 0/0:0,57,255:59 0/1:110,0,129:99 0/0:0,0,0:4 1/1:255,42,0:34 0/1:76,0,147:74 1/1:163,15,0:8 0/0:0,54,255:56 0/0:0,18,174:20 1/1:210,24,0:16 0/1:172,0,62:70 0/1:187,0,28:36 0/0:0,66,255:68 1/1:207,24,0:16 0/1:99,0,250:97 0/0:0,99,255:99 0/1:184,0,172:99 0/0:0,27,215:29 0/1:150,0,86:94 0/1:63,0,255:61 0/1:103,0,134:99 0/0:0,39,255:41 0/1:101,0,144:99 0/0:0,72,255:74 0/0:0,57,255:59 0/0:0,48,255:50
chr12 6982547 . C T 101 . DP=535;VDB=0.0129;AF1=0.04343;AC1=3;DP4=202,221,7,5;MQ=60;FQ=101;PV4=0.56,7.4e-11,1,0.27 GT:PL:GQ 0/1:34,0,74:24 0/0:0,21,200:31 0/0:0,18,166:28 0/1:65,0,149:55 0/0:0,30,224:40 0/0:0,6,68:17 0/0:0,30,220:40 0/0:0,15,134:25 0/1:75,0,20:36 0/0:0,9,91:19 0/0:0,24,206:34 0/0:0,39,255:49 0/0:0,18,172:28 0/0:0,0,0:11 0/0:0,57,255:67 0/0:0,45,255:55 0/0:0,33,255:43 0/0:0,63,255:73 0/0:0,33,228:43 0/0:0,75,255:85 0/0:0,48,255:58 0/0:0,24,181:34 0/0:0,48,255:58 0/0:0,33,255:43 0/0:0,45,255:55 0/0:0,48,255:58 0/0:0,57,255:67 0/0:0,45,255:55 0/0:0,39,255:49 0/0:0,99,255:99 0/0:0,30,206:40 0/0:0,15,166:25 0/0:0,54,255:64 0/0:0,42,255:52 0/0:0,36,255:46 0/0:0,60,255:70
chr12 6982565 . A C 86.7 . DP=524;VDB=0.0225;AF1=0.01468;AC1=1;DP4=207,207,5,7;MQ=60;FQ=86.8;PV4=0.77,6e-07,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,12,103:27 0/0:0,18,162:33 0/0:0,18,137:33 0/0:0,36,235:51 0/0:0,15,117:30 0/0:0,3,29:18 0/0:0,24,174:39 0/0:0,12,121:27 0/0:0,18,150:33 0/0:0,9,77:24 0/0:0,15,122:30 0/0:0,33,230:48 0/0:0,24,223:39 0/0:0,0,0:15 0/0:0,51,255:66 0/0:0,45,255:60 0/0:0,33,255:48 0/0:0,66,255:81 0/0:0,39,255:54 0/0:0,66,255:81 0/0:0,48,255:63 0/0:0,33,241:48 0/0:0,63,255:78 0/0:0,33,255:48 0/0:0,48,255:63 0/0:0,60,255:75 0/0:0,48,255:63 0/0:0,48,255:63 0/0:0,39,228:54 0/1:132,0,255:99 0/0:0,27,221:42 0/0:0,12,138:27 0/0:0,45,255:60 0/0:0,36,239:51 0/0:0,39,235:54 0/0:0,72,255:87
chr12 6982600 . CCT C 999 . INDEL;DP=501;VDB=0.0385;AF1=0.01445;AC1=1;DP4=219,233,7,4;MQ=60;FQ=999;PV4=0.37,9.8e-05,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,9,122:24 0/0:0,27,255:42 0/0:0,24,255:39 0/0:0,42,255:57 0/0:0,27,255:42 0/0:0,9,117:24 0/0:0,24,255:39 0/0:0,27,255:42 0/0:0,15,202:30 0/0:0,15,199:30 0/0:0,30,255:45 0/0:0,36,255:51 0/0:0,33,255:48 0/0:0,0,0:15 0/0:0,66,255:81 0/0:0,42,255:57 0/0:0,33,255:48 0/0:0,69,255:84 0/0:0,36,255:51 0/0:0,87,255:99 0/0:0,36,255:51 0/0:0,36,255:51 0/0:0,60,255:75 0/0:0,18,176:33 0/0:0,57,255:72 0/0:0,63,255:78 0/0:0,54,255:69 0/1:255,0,255:99 0/0:0,51,255:66 0/0:0,78,255:93 0/0:0,27,255:42 0/0:0,15,216:30 0/0:0,39,255:54 0/0:0,51,255:66 0/0:0,30,255:45 0/0:0,57,255:72
chr12 6982612 . G A 999 . DP=468;VDB=0.0385;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,214,199;MQ=60;FQ=-42.9 GT:PL:GQ 1/1:85,9,0:37 1/1:225,24,0:52 1/1:223,27,0:55 1/1:217,33,0:61 1/1:167,18,0:46 1/1:33,3,0:31 1/1:128,18,0:46 1/1:255,33,0:61 1/1:140,18,0:46 1/1:180,21,0:49 1/1:205,24,0:52 1/1:163,30,0:58 1/1:255,33,0:61 1/1:0,0,0:28 1/1:255,57,0:85 1/1:254,30,0:58 1/1:255,51,0:79 1/1:255,60,0:88 1/1:255,33,0:61 1/1:255,69,0:97 1/1:132,15,0:43 1/1:253,36,0:64 1/1:255,60,0:88 1/1:129,15,0:43 1/1:255,48,0:76 1/1:255,51,0:79 1/1:255,54,0:82 1/1:255,63,0:91 1/1:158,27,0:55 1/1:255,66,0:94 1/1:217,24,0:52 1/1:173,18,0:46 1/1:231,27,0:55 1/1:255,57,0:85 1/1:255,33,0:61 1/1:255,54,0:82
chr12 6982705 . G C 108 . DP=502;VDB=0.0146;AF1=0.04327;AC1=3;DP4=188,262,4,10;MQ=60;FQ=108;PV4=0.41,7e-31,1,1 GT:PL:GQ 0/0:0,18,182:28 0/0:0,36,255:46 0/0:0,27,197:37 0/0:0,30,255:40 0/0:0,27,239:37 0/0:0,6,64:17 0/0:0,15,150:25 0/0:0,15,130:25 0/0:0,24,224:34 0/0:0,18,162:28 0/0:0,30,234:40 0/0:0,39,255:49 0/0:0,24,240:34 0/0:0,0,0:11 0/0:0,63,255:73 0/0:0,54,255:64 0/0:0,45,255:55 0/0:0,39,255:49 0/0:0,27,250:37 0/0:0,108,255:99 0/0:0,54,255:64 0/0:0,54,255:64 0/0:0,63,255:73 0/0:0,21,179:31 0/0:0,42,255:52 0/0:0,57,255:67 0/0:0,42,255:52 0/1:34,0,138:24 0/1:59,0,126:49 0/0:0,66,255:76 0/1:88,0,17:33 0/0:0,45,255:55 0/0:0,42,255:52 0/0:0,51,255:61 0/0:0,69,255:79 0/0:0,66,255:76
chr12 6982755 . C T 999 . DP=482;VDB=0.0278;AF1=0.2604;G3=0.6837,0.09159,0.2247;HWE=2.05e-05;AC1=19;DP4=154,202,38,30;MQ=60;FQ=999;PV4=0.063,1.3e-39,1,1 GT:PL:GQ 0/1:40,0,63:38 1/1:185,36,0:28 1/1:187,33,0:25 0/1:49,0,194:47 1/1:137,24,0:17 1/1:70,12,0:6 1/1:109,15,0:8 1/1:152,24,0:17 0/1:70,0,44:51 0/1:41,6,0:4 1/1:150,24,0:17 0/0:0,45,255:47 0/0:0,42,255:44 0/0:0,0,0:3 0/0:0,57,255:59 0/0:0,63,255:65 0/0:0,54,255:56 0/0:0,57,255:59 0/0:0,57,255:59 0/0:0,75,255:77 0/0:0,30,255:32 0/0:0,48,255:50 0/0:0,60,255:62 0/0:0,21,181:23 0/0:0,36,246:38 0/0:0,39,246:41 0/0:0,33,255:35 0/0:0,18,173:20 0/0:0,15,125:17 0/0:0,33,252:35 0/0:0,3,37:6 0/0:0,45,255:47 0/0:0,39,255:41 0/0:0,36,244:38 0/0:0,66,255:68 0/0:0,57,255:59
chr12 6982777 . G A 61.7 . DP=471;VDB=0.0356;AF1=0.01474;AC1=1;DP4=188,220,1,3;MQ=60;FQ=61.8;PV4=0.63,1,1,0.17 GT:PL:GQ 0/0:0,27,228:42 0/0:0,27,233:42 0/0:0,39,255:54 0/0:0,54,255:69 0/0:0,42,255:57 0/0:0,21,163:36 0/0:0,18,175:33 0/0:0,39,255:54 0/0:0,21,187:36 0/0:0,3,33:18 0/0:0,21,188:36 0/0:0,42,255:57 0/0:0,30,255:45 0/0:0,0,0:15 0/0:0,36,240:51 0/0:0,69,255:84 0/0:0,39,255:54 0/0:0,60,255:75 0/0:0,39,255:54 0/0:0,78,255:93 0/0:0,24,221:39 0/0:0,30,246:45 0/0:0,54,255:69 0/0:0,21,182:36 0/0:0,45,255:60 0/0:0,18,171:33 0/0:0,27,209:42 0/0:0,27,203:42 0/0:0,6,66:21 0/1:107,0,130:92 0/0:0,6,68:21 0/0:0,45,255:60 0/0:0,39,255:54 0/0:0,30,234:45 0/0:0,60,255:75 0/0:0,72,255:87
chr12 6982872 . C G 999 . DP=361;VDB=0.0296;AF1=0.2951;G3=0.6857,2.152e-07,0.3143;HWE=3.04e-10;AC1=21;DP4=81,156,25,51;MQ=59;FQ=999;PV4=0.89,0.095,0.21,1 GT:PL:GQ 1/1:102,9,0:4 1/1:255,42,0:35 1/1:137,18,0:12 1/1:255,33,0:26 1/1:124,12,0:6 1/1:194,21,0:14 1/1:145,15,0:9 1/1:150,18,0:12 1/1:193,24,0:17 0/1:69,6,0:3 1/1:232,30,0:23 0/0:0,27,213:28 0/0:0,9,105:10 0/0:0,0,0:3 0/0:0,39,193:40 0/0:0,39,255:40 0/0:0,21,176:22 0/0:0,36,248:37 0/0:0,24,189:25 0/0:0,39,255:40 0/0:0,33,223:34 0/0:0,33,255:34 0/0:0,27,238:28 0/0:0,21,200:22 0/0:0,54,255:55 0/0:0,45,255:46 0/0:0,33,255:34 0/0:0,27,215:28 0/0:0,33,255:34 0/0:0,27,237:28 0/0:0,24,213:25 0/0:0,24,215:25 0/0:0,24,194:25 0/0:0,30,240:31 0/0:0,21,208:22 0/0:0,21,149:22
chr12 6982875 . C A 999 . DP=343;VDB=0.0336;AF1=0.1781;G3=0.7395,0.1542,0.1063;HWE=0.0159;AC1=13;DP4=83,156,16,41;MQ=59;FQ=999;PV4=0.43,1,0.028,0.0054 GT:PL:GQ 0/0:0,9,106:13 0/0:0,42,255:46 0/0:0,18,138:22 0/0:0,33,246:37 0/0:0,12,118:16 0/0:0,18,175:22 0/0:0,15,133:19 0/0:0,18,138:22 0/0:0,21,181:25 0/0:0,6,69:10 0/0:0,24,196:28 0/0:0,27,220:31 0/1:73,6,0:5 0/0:0,0,0:5 1/1:190,36,0:26 0/1:97,0,157:93 1/1:185,21,0:12 0/0:0,30,229:34 0/0:0,21,180:25 1/1:255,33,0:23 0/1:181,0,43:53 0/0:0,33,253:37 0/0:0,21,191:25 0/0:0,21,199:25 0/0:0,57,255:61 0/0:0,42,255:46 0/0:0,33,255:37 0/0:0,27,206:31 0/0:0,27,225:31 0/1:121,0,114:99 0/1:47,0,139:43 0/0:0,21,195:25 0/1:95,0,110:91 0/0:0,27,217:31 0/0:0,21,214:25 0/0:0,24,159:28
chr12 6982972 . G A 999 . DP=236;VDB=0.0014;AF1=1;AC1=72;DP4=0,4,9,12;MQ=48;FQ=-27.1;PV4=0.26,2.3e-06,1,1 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:0,3,4:8 1/1:18,0,5:5 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:15,3,0:12 1/1:13,3,0:12 1/1:0,3,4:8 1/1:13,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:15,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:28,6,0:15 1/1:0,0,0:9 1/1:13,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:0,0,0:9 1/1:14,3,0:12 1/1:29,6,0:15 1/1:14,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:28,6,0:15 1/1:0,0,0:9 1/1:0,3,5:7 1/1:14,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:14,3,0:12 1/1:0,0,0:9 1/1:26,6,0:15 1/1:31,6,0:15 1/1:0,0,0:9
chr12 6982983 . gt g 138 . INDEL;DP=245;VDB=0.0028;AF1=0.9272;AC1=67;DP4=0,2,8,4;MQ=55;FQ=-30.4;PV4=0.16,0.0076,1,1 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 0/1:0,3,14:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:15,3,0:8 1/1:0,0,0:5 1/1:48,6,0:10 1/1:0,0,0:5 1/1:16,3,0:8 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:14,3,0:8 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:0,3,5:4 1/1:37,6,0:10 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5 1/1:43,9,0:13 1/1:25,6,0:10 1/1:0,0,0:5 1/1:0,0,0:5
chr12 6982984 . tgg tg,tGgg 999 . INDEL;DP=233;VDB=0.0022;AF1=1;AC1=72;DP4=0,2,64,83;MQ=55;FQ=-37.3;PV4=0.51,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,3,14,3,14,14:5 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:25,25,25,6,6,0:15 1/1:14,14,14,3,3,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:112,12,0,112,12,112:27 1/1:68,6,0,68,6,68:21 1/1:0,0,0,0,0,0:15 1/1:112,12,0,112,12,112:27 1/1:77,9,0,77,9,77:24 1/1:60,6,0,60,6,60:21 1/1:171,21,0,171,21,171:36 1/1:29,3,0,29,3,29:18 1/1:93,9,0,93,9,93:24 1/1:34,3,0,34,3,34:18 1/1:122,12,0,122,12,122:27 1/1:202,27,0,202,27,202:42 1/1:111,12,0,111,12,111:27 1/1:188,24,0,188,24,188:39 1/1:240,36,0,240,36,240:51 1/1:180,24,0,180,24,180:39 1/1:254,42,0,254,42,254:57 1/1:107,10,0,110,15,108:25 1/1:193,27,0,193,27,193:42 1/1:91,9,0,91,9,91:24 1/1:100,12,0,100,12,100:27 1/1:182,24,0,182,24,182:39 1/1:241,51,0,241,51,241:66 1/1:162,21,0,162,21,162:36 1/1:136,15,0,136,15,136:30
chr12 6982985 . g gA 999 . INDEL;DP=79;VDB=0.0019;AF1=1;AC1=72;DP4=0,2,17,34;MQ=57;FQ=-36.2;PV4=1,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:80,6,0:17 1/1:73,6,0:17 1/1:138,12,0:23 1/1:233,15,0:26 1/1:71,6,0:17 1/1:163,15,0:26 1/1:107,12,0:23 1/1:211,21,0:32 1/1:190,18,0:29 1/1:136,15,0:26 1/1:130,15,0:26 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,3,5:9 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11 1/1:0,0,0:11
chr12 6983033 . G A 120 . DP=433;VDB=0.0141;AF1=0.0433;AC1=3;DP4=208,151,7,8;MQ=60;FQ=121;PV4=0.43,3.5e-23,0.26,1 GT:PL:GQ 0/1:25,0,112:15 0/0:0,42,255:52 0/0:0,36,255:46 0/1:37,0,152:27 0/0:0,36,255:46 0/0:0,27,197:37 0/0:0,12,131:22 0/1:131,0,119:99 0/0:0,3,188:14 0/0:0,15,154:25 0/0:0,33,255:43 0/0:0,30,191:40 0/0:0,24,182:34 0/0:0,0,0:11 0/0:0,12,105:22 0/0:0,42,255:52 0/0:0,24,176:34 0/0:0,54,255:64 0/0:0,18,179:28 0/0:0,21,165:31 0/0:0,18,135:28 0/0:0,36,238:46 0/0:0,27,229:37 0/0:0,15,152:25 0/0:0,51,255:61 0/0:0,45,255:55 0/0:0,66,255:76 0/0:0,51,255:61 0/0:0,21,164:31 0/0:0,39,255:49 0/0:0,21,204:31 0/0:0,24,203:34 0/0:0,39,255:49 0/0:0,57,255:67 0/0:0,33,247:43 0/0:0,36,238:46
chr12 6983068 . AGGG AGGGG 999 . INDEL;DP=440;VDB=0.0351;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,109,78;MQ=60;FQ=-47.2 GT:PL:GQ 1/1:89,12,0:37 1/1:199,33,0:58 1/1:121,15,0:40 1/1:50,9,0:34 1/1:116,21,0:46 1/1:40,6,0:31 1/1:19,3,0:28 1/1:103,15,0:40 1/1:61,9,0:34 1/1:56,6,0:31 1/1:83,12,0:37 1/1:170,21,0:46 1/1:133,21,0:46 1/1:0,0,0:25 1/1:95,12,0:37 1/1:164,21,0:46 1/1:127,18,0:43 1/1:142,18,0:43 1/1:137,18,0:43 1/1:157,27,0:52 1/1:97,12,0:37 1/1:113,18,0:43 1/1:62,9,0:34 1/1:77,12,0:37 1/1:149,30,0:55 1/1:107,12,0:37 1/1:154,24,0:49 1/1:146,24,0:49 1/1:23,3,0:28 1/1:151,21,0:46 1/1:126,15,0:40 1/1:68,12,0:37 1/1:143,21,0:46 1/1:131,21,0:46 1/1:111,18,0:43 1/1:80,12,0:37
chr12 6983071 . G GC 35.1 . INDEL;DP=455;VDB=0.0362;AF1=0.8903;AC1=64;DP4=1,0,6,0;MQ=60;FQ=-29.7;PV4=1,1,1,1 GT:PL:GQ 1/1:14,3,0:6 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:14,3,0:6 0/1:0,3,13:5 1/1:0,0,0:4 1/1:16,3,0:6 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:16,3,0:6 1/1:0,0,0:4 1/1:27,6,0:9 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4 1/1:0,0,0:4
chr12 6983082 . G A 999 . DP=456;VDB=0.0318;AF1=0.0626;AC1=4;DP4=239,126,18,8;MQ=59;FQ=999;PV4=0.83,4e-36,0.4,1 GT:PL:GQ 0/0:0,48,239:57 0/0:0,60,255:69 0/0:0,39,234:48 0/0:0,39,255:48 0/0:0,45,255:54 0/0:0,12,99:21 0/0:0,6,68:15 0/0:0,33,221:42 0/0:0,33,255:42 0/0:0,15,155:24 0/0:0,33,236:42 0/0:0,24,208:33 0/0:0,30,212:39 0/0:0,0,0:9 0/0:0,27,197:36 0/0:0,39,255:48 0/0:0,33,218:42 0/0:0,36,255:45 0/0:0,12,130:21 0/0:0,63,255:72 0/0:0,12,116:21 0/1:24,0,80:15 0/0:0,27,243:36 0/1:72,12,0:5 0/1:85,0,155:76 0/0:0,51,255:60 0/1:118,0,148:99 0/0:0,42,255:51 0/0:0,27,209:36 0/0:0,51,255:60 0/0:0,24,216:33 0/0:0,27,224:36 0/0:0,54,255:63 0/0:0,33,255:42 0/0:0,33,239:42 0/0:0,27,211:36
chr12 6983096 . AGGG AGGGG 999 . INDEL;DP=449;VDB=0.0388;AF1=1;AC1=72;DP4=0,0,16,13;MQ=56;FQ=-36.7 GT:PL:GQ 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:13,3,0:15 1/1:27,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:14,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:32,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:82,9,0:21 1/1:66,6,0:18 1/1:55,6,0:18 1/1:120,12,0:24 1/1:33,3,0:15 1/1:86,9,0:21 1/1:33,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:14,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:14,3,0:15 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12 1/1:46,6,0:18 1/1:0,0,0:12 1/1:24,6,0:18 1/1:14,3,0:15 1/1:46,6,0:18 1/1:0,0,0:12 1/1:0,0,0:12
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