nf_modules: update ccin2p3 config

src/nf_modules/samtools/sort_bams.config

src/nf_modules/samtools/split_bams.config

src/nf_modules/sratoolkit/fastqdump.config

src/nf_modules/urqt/trimming_paired.config

src/nf_modules/urqt/trimming_single.config