.gitignore

.gitmodules

CHANGELOG.md

README.md

bin/.gitignore

doc/TP_computational_biologists.md

doc/TP_experimental_biologists.md

src/docker_modules/BEDtools/2.25.0/docker_init.sh

src/docker_modules/Bowtie/1.2.2/docker_init.sh

src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/docker_init.sh

src/docker_modules/FastQC/0.11.5/docker_init.sh

src/docker_modules/HISAT2/2.0.0/docker_init.sh

src/docker_modules/HTSeq/0.8.0/docker_init.sh

src/docker_modules/Kallisto/0.43.1/docker_init.sh

src/docker_modules/Kallisto/0.44.0/docker_init.sh

src/docker_modules/MACS2/2.1.0/docker_init.sh

src/docker_modules/MUSIC/6613c53/docker_init.sh

src/docker_modules/MultiQC/1.0/docker_init.sh

src/docker_modules/RSEM/1.3.0/docker_init.sh

src/docker_modules/SAMtools/1.7/docker_init.sh