rename module to lowercase

src/docker_modules/trimmomatic/0.36/Dockerfile

src/docker_modules/trimmomatic/0.36/docker_init.sh

src/docker_modules/urqt/d62c1f8/Dockerfile

src/docker_modules/urqt/d62c1f8/docker_init.sh

src/nf_modules/bedtools/fasta_from_bed.config

src/nf_modules/bedtools/fasta_from_bed.nf

src/nf_modules/bedtools/tests.sh

src/nf_modules/bowtie/indexing.config

src/nf_modules/bowtie/indexing.nf

src/nf_modules/bowtie/mapping_paired.config

src/nf_modules/bowtie/mapping_paired.nf

src/nf_modules/bowtie/mapping_single.config

src/nf_modules/bowtie/mapping_single.nf

src/nf_modules/bowtie/tests.sh

src/nf_modules/bowtie2/indexing.config

src/nf_modules/bowtie2/indexing.nf

src/nf_modules/bowtie2/mapping_paired.config

src/nf_modules/bowtie2/mapping_paired.nf

src/nf_modules/bowtie2/mapping_single.config

src/nf_modules/bowtie2/mapping_single.nf