Compare revisions

src/.docker_modules/urqt/d62c1f8/Dockerfile

src/.docker_modules/urqt/d62c1f8/docker_init.sh

src/.singularity_in2p3

src/.singularity_psmn

src/1_JU28_59vs17_SNP_calling.sh

src/SNP_calling.config

src/SNP_calling.nf

src/docker_modules/BEDtools/2.25.0/docker_init.sh

src/docker_modules/BWA/0.7.17/docker_init.sh

src/docker_modules/Bowtie/1.2.2/docker_init.sh

src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile

src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/docker_init.sh

src/docker_modules/FastQC/0.11.5/docker_init.sh

src/docker_modules/GATK/4.0.8.1/docker_init.sh

src/docker_modules/HISAT2/2.0.0/docker_init.sh

src/docker_modules/HTSeq/0.8.0/docker_init.sh

src/docker_modules/Kallisto/0.43.1/docker_init.sh

src/docker_modules/Kallisto/0.44.0/docker_init.sh

src/docker_modules/MACS2/2.1.0/Dockerfile

src/docker_modules/MACS2/2.1.0/docker_init.sh