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src/nf_modules/cutadapt/adaptor_removal_paired.nf

src/nf_modules/cutadapt/adaptor_removal_single.config

src/nf_modules/cutadapt/adaptor_removal_single.nf

src/nf_modules/cutadapt/main.nf

src/nf_modules/cutadapt/tests.sh

src/nf_modules/cutadapt/trimming_paired.config

src/nf_modules/cutadapt/trimming_paired.nf

src/nf_modules/cutadapt/trimming_single.config

src/nf_modules/cutadapt/trimming_single.nf

src/nf_modules/danpos/main.nf

src/nf_modules/deeptools/main.nf

src/nf_modules/emase-zero/main.nf

src/nf_modules/emase/main.nf

src/nf_modules/fastp/main.nf

src/nf_modules/fastq_screen/main.nf

src/nf_modules/fastqc/main.nf

src/nf_modules/flexi_splitter/main.nf

src/nf_modules/flexi_splitter/marseq_flexi_splitter.yaml

src/nf_modules/flexi_splitter/toy_file_paired.yaml