diff --git a/src/nf_modules/Kallisto/tests.sh b/src/nf_modules/Kallisto/tests.sh index ec20292ef0260d8a311c4ba5c0058d28a2c476e4..0f69fcc40a2cc72aba93094560b2a239d2d42a76 100755 --- a/src/nf_modules/Kallisto/tests.sh +++ b/src/nf_modules/Kallisto/tests.sh @@ -1,15 +1,15 @@ -nextflow src/nf_modules/Kallisto/indexing.nf \ +./nextflow src/nf_modules/Kallisto/indexing.nf \ -c src/nf_modules/Kallisto/indexing.config \ -profile docker \ --fasta "data/tiny_dataset/fasta/tiny_v2.fasta" -nextflow src/nf_modules/Kallisto/mapping_single.nf \ +./nextflow src/nf_modules/Kallisto/mapping_single.nf \ -c src/nf_modules/Kallisto/mapping_single.config \ -profile docker \ --index "results/mapping/index/tiny_v2.index" \ --fastq "data/tiny_dataset/fastq/tiny*_S.fastq" -nextflow src/nf_modules/Kallisto/mapping_paired.nf \ +./nextflow src/nf_modules/Kallisto/mapping_paired.nf \ -c src/nf_modules/Kallisto/mapping_paired.config \ -profile docker \ --index "results/mapping/index/tiny_v2.index" \