diff --git a/src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile b/src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile index ab3f2e0b5945f0087f9c6f8bb52ac1ba471184c7..0f4ac75e48b5390714a22765c93939b72650b47e 100644 --- a/src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile +++ b/src/docker_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile @@ -1,4 +1,4 @@ -FROM sambamba:0.6.7 +FROM ubuntu:18.04 MAINTAINER Laurent Modolo ENV BOWTIE2_VERSION=2.3.4.1 @@ -10,21 +10,3 @@ ENV PACKAGES bowtie2=${BOWTIE2_VERSION}* \ RUN apt-get update && \ apt-get install -y --no-install-recommends ${PACKAGES} && \ apt-get clean - -ENV PACKAGES curl=7.58.0* \ - ca-certificates=20180409 \ - build-essential=12.4* \ - zlib1g-dev=1:1.2.11* - -RUN apt-get update && \ - apt-get install -y --no-install-recommends ${PACKAGES} && \ - apt-get clean - -ENV SAMBLASTER_VERSION=0.1.24 -RUN curl -k -L https://github.com/GregoryFaust/samblaster/releases/download/v.${SAMBLASTER_VERSION}/samblaster-v.${SAMBLASTER_VERSION}.tar.gz -o samblaster-v.${SAMBLASTER_VERSION}.tar.gz && \ -tar xvf samblaster-v.${SAMBLASTER_VERSION}.tar.gz && \ -cd samblaster-v.${SAMBLASTER_VERSION}/ && \ -make && \ -cp samblaster /usr/bin && \ -cd .. && \ -rm -R samblaster-v.${SAMBLASTER_VERSION}/