diff --git a/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile
index 886026e91d9ec238c0a12a7544f4e60288513542..f8b1c5c048257ada6d0892dc787bd943aa2739b5 100644
--- a/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile
+++ b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile
@@ -2,7 +2,10 @@ FROM ubuntu:18.04
 MAINTAINER Laurent Modolo
 
 ENV BOWTIE2_VERSION=2.3.4.1
-ENV PACKAGES bowtie2=${BOWTIE2_VERSION}*
+ENV SAMTOOLS_VERSION=1.7
+ENV PACKAGES bowtie2=${BOWTIE2_VERSION}* \
+    samtools=${SAMTOOLS_VERSION}*
+
 
 RUN apt-get update && \
     apt-get install -y --no-install-recommends ${PACKAGES} && \