diff --git a/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile
new file mode 100644
index 0000000000000000000000000000000000000000..886026e91d9ec238c0a12a7544f4e60288513542
--- /dev/null
+++ b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/Dockerfile
@@ -0,0 +1,9 @@
+FROM ubuntu:18.04
+MAINTAINER Laurent Modolo
+
+ENV BOWTIE2_VERSION=2.3.4.1
+ENV PACKAGES bowtie2=${BOWTIE2_VERSION}*
+
+RUN apt-get update && \
+    apt-get install -y --no-install-recommends ${PACKAGES} && \
+    apt-get clean
diff --git a/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/docker_init.sh b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/docker_init.sh
new file mode 100755
index 0000000000000000000000000000000000000000..85f25defe3aea4be79ec3b973906ef0dee600a74
--- /dev/null
+++ b/src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1/docker_init.sh
@@ -0,0 +1,2 @@
+#!/bin/sh
+docker build src/nf_modules/Bowtie2/2.3.4.1 -t 'bowtie2:2.3.4.1'