diff --git a/src/nf_modules/fastp/main.nf b/src/nf_modules/fastp/main.nf index 7b5d9b56f012d57f6a7a4fb36efb2aa358c83d87..2593eefecab24037db7d80f213b83db29e0092b4 100644 --- a/src/nf_modules/fastp/main.nf +++ b/src/nf_modules/fastp/main.nf @@ -39,9 +39,9 @@ process fastp_default { tuple val(file_id), path(reads) output: - tuple val(file_id), path("*.fastq.gz"), emit: fastq - tuple val(file_id), path("*.html"), emit: html - tuple val(file_id), path("*.json"), emit: report + tuple val(file_id), path("*_trim.fastq.gz"), emit: fastq + tuple val(file_id), path("${file_prefix}.html"), emit: html + tuple val(file_id), path("${file_prefix}_fastp.json"), emit: report script: if (file_id instanceof List){ @@ -91,9 +91,9 @@ process fastp_accel_1splus { tuple val(file_id), path(reads) output: - tuple val(file_id), path("*.fastq.gz"), emit: fastq - tuple val(file_id), path("*.html"), emit: html - tuple val(file_id), path("*.json"), emit: report + tuple val(file_id), path("*_trim.fastq.gz"), emit: fastq + tuple val(file_id), path("${file_prefix}.html"), emit: html + tuple val(file_id), path("${file_prefix}_fastp.json"), emit: report script: if (file_id instanceof List){