diff --git a/src/nf_modules/danpos/main.nf b/src/nf_modules/danpos/main.nf index e78d35c55b6d6dc578c5cde3cf77f57a0e217e0e..dfb00d6615aaafb3579b39d8e33c272c2870d3fc 100644 --- a/src/nf_modules/danpos/main.nf +++ b/src/nf_modules/danpos/main.nf @@ -38,7 +38,7 @@ process dpos_bam { tuple val(file_id), path(bam_ip), path(bam_wce) output: - tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${bam_ip.simpleName}*.wig"), path("${file_prefix}/${bam_wce.simpleName}*.wig"), emit: wig + tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${bam_ip.simpleName}*.wig"), emit: wig tuple val(file_id), path("${file_prefix}/*.positions.bed"), emit: bed script: @@ -212,7 +212,7 @@ process dpeak_bam { tuple val(file_id), path(bam_ip), path(bam_wce) output: - tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${bam_ip.simpleName}*.wig"), path("${file_prefix}/${bam_wce.simpleName}*.wig"), emit: wig + tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${bam_ip.simpleName}*.wig"), emit: wig tuple val(file_id), path("${file_prefix}/*.positions.bed"), path("${file_prefix}/*.summit.bed"), emit: bed tuple val(file_id), path("${file_prefix}/*.bed"), emit: bed @@ -275,7 +275,7 @@ process dpeak_wig { tuple val(file_id), path(wig_ip), path(wig_wce) output: - tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${wig_ip.simpleName}.bgsub.wig"), path("${file_prefix}/${wig_wce.simpleName}.wig"), emit: wig + tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${wig_ip.simpleName}.bgsub.wig"), emit: wig tuple val(file_id), path("${file_prefix}/*.positions.bed"), path("${file_prefix}/*.summit.bed"), emit: bed script: @@ -343,7 +343,7 @@ process dpeak_wigvswig { tuple val(file_id_b), path(wig_ip_b), path(wig_wce_b) output: - tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${wig_ip_a.simpleName}.bgsub.wig"), path("${file_prefix}/${wig_wce_a.simpleName}.wig"), emit: wig + tuple val(file_id), path("${file_prefix}/${wig_ip_a.simpleName}.bgsub.wig"), emit: wig tuple val(file_id), path("${file_prefix}/*.positions.bed"), path("${file_prefix}/*.summit.bed"), emit: bed script: