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1.5 1.15 KiB
#%Module1.0####################################################################
##
## PSMN: $Id: 1.3.1 1539 2017-01-24 10:29:49Z ltaulell $
##
###############################################################################
# for Tcl script use only
set     version         1.5
set     modname         SAMtools
set     osarch          "Debian 7"
set     modroot         /Xnfs/site/lbmcdb/communs_data/modules/apps/SAMtools/1.5

setenv  LAST_MODULE     $modname/$version

###############################################################################
proc ModulesHelp { } {
        global modname version osarch
        puts stderr "\nThis set the environment variables for $modname $version - $osarch."
}


module-whatis   "loads $modname $version ($osarch) environment"
###############################################################################

# conflict
conflict $modname

if [ module-info mode load ] {
  prereq Base/psmn
}

prepend-path    PATH            $modroot/bin
prepend-path    LD_LIBRARY_PATH $modroot/lib
prepend-path    INCLUDE         $modroot/include/htslib
prepend-path    MANPATH         $modroot/share/man
setenv          SAMTOOLS_PATH   $modroot/bin